Réparation ADN (2.2.3)

Question 1

comment l’ADN peut être “brisé”

Answer 1

• erreur de réplication
• lésion par:
  1. métabolisme (pH, ROS)
  2. composés chimiques environnants
  3. radiations UV ou RX

Question 2

d’où viennent certaines maladies héréditaires comme la fibrose kystique

Answer 2

erreur de l’ADN polymérase non corrigée
mutation dans la réplication de l’ADN
mutation non réparée et transmise dans cellules germinales => héritées par la descendance

Question 3

Un cancer peut comprendre jusqu’à ___ mutations dans l’ADN d’une même cellule de type ____

Answer 3

4-5 mutations/cellule somatique

Question 4

Méthode de réparation durant la synthèse de l’ADN

Answer 4

Proofreading aka correction Co-réplicationnelle aka Correction sur épreuve

Question 5

que fait la réparation par proofreading et qui en est responsable

Answer 5

ADN polymérase vérifie et fait de l’autocorrection

comme quant tu révises ta dissertation

Question 6

réparation après la réplication de mésappariement de l’ADN

Answer 6

DNA Mismatch Repair System

Question 7

que fait le DNA Mismatch Repair System?

Answer 7

reconnait les nucléotides mal incorporés, en fait l’excision et la réparation

Question 8

Réparation où les bases mutés par déamination, dépurination, radiation (UV dimères de thymine)

Answer 8

Excision repair/Réparation des lésions par excision par des NUCLÉASES

Question 9

À la suite d’une procédure d’excision de nucléotide mal répliqué, que se passe-t-il et qui s’occupe de cette étape?

Answer 9

repolymérisation de l’ADN par ADN polymérase de réparation et ligation

Question 10

comment on peut spot un mauvais appariement de nucléotides?

Answer 10

torsion/trou/déformation de la double hélice

ponts hydrogène différents

Question 11

Dans la réparation d’une double hélice d’ADN qu’est-ce qui est la matrice?

Answer 11

brin resté intacte

Question 12

action de l’ADN polymérase quand elle procède à une correction co-réplicationnelle (proofreading)

Answer 12

activité exonucléase: recule, enlève le lien phosphodiester du mauvais nucléotide pour le détacher

ON EFFACE ET ON RECOMMENCE, COMME QUAND ON BACKSPACE ET RÉÉCRIT EN CORRIGEANT UN TXT

Question 13

VRAI OU FAUX, L’ADN polymérase a seulement un site catalytique de polymérisation

Answer 13

faux, aussi un site d’édition pour l’excision et la correction

Question 14

vers où se dirigent les nucléotides mal formés pendant la réplication de l’adn

Answer 14

site d’édition

Question 15

quand a-t-on besoin d’un mécanisme post-réplicationnel?

Answer 15

si lésion après la réplication

si adn polymerase ne spot pas d’erreur

Question 16

comment le système post-réplicationnel de mésappariement détecte un défaut (DNA mismatch repair)

Answer 16

protéines spécifiques voient une distorsion dans la double hélice

Question 17

comment agit le DNA mismatch repair

Answer 17

1. reconnaissance par protéines spécifiques
2. dégradation du segment où mauvais nucléotide par exonucléase Exo1 après la
3. ADN polymérase et ligase réparent la lacune

Question 18

Comment E.Coli distingue brin vieux et nouveau

Answer 18

vieux = méthylé, nouveau non

Question 19

Comment eucaryote distingue brin vieux et nouveau

Answer 19

vieux = méthylé, nouveau non-méthylé et porte des Nicks

Question 20

c’est quoi un Nick

Answer 20

coupure du simple brin, discontinuité sans phosphodiester (qui sera patché par une ligase)

Question 21

clive à l’intérieur de la molécule d’ADN

a) endonucléase
b) exonucléase

Answer 21

a) endonucléase

Question 22

L’endonucléase produit quoi si elle n’agit que sur un simple brin

Answer 22

Nick

Question 23

L’exonucléase produit quoi si elle agit sur un double brin

Answer 23

Coupure

Question 24

quel type d’enzyme digère un brin d’ADN un nucléotide à la fois dans la direction 5’ à 3’ ?

Answer 24

exonucléase

Question 25

quelle contrainte porte l’exonucléase pour bien agir

Answer 25

Doit avoir un bout 5’ - 3’ de libre pour agir, elle n’agit pas à l’INT de l’ADN

Question 26

Dépurination

Answer 26

collisions thermiques entre molécules => perte de purines (A-G) pour certains nucléotides

Question 27

vrai ou faux, la dépurination entraîne un bris du squelette phosphodiester de l’ADN

Answer 27

faux, juste des lésions, PERTE DE BASES (dents manquantes)

Question 28

si le brin de départ a un A manquant par mutation précédente ou erreur de réplication mais porte un T correspondant, est-il possible qu’un nouveau brin formé ne porte aucune mutation et “regagne” le A manquant dans son brin matrice

Answer 28

oui, possible qu’un soit 100% chill et l’autre ait perdu T donc ni A (comme matrice) ni T

Question 29

désamination

Answer 29

cytosil (C) switch pour uracil (U) => s’associe à adenine (A)

Question 30

vrai ou faux, la désamination entraîne, tout comme la dépurination, la perte d’une base

Answer 30

faux, pas de perte de base, un changement de molécule
C appartient à l’ADN
U appartient à l’ARN (remplace T de l’ADN)
ADN devient ARN

Question 31

comment les rayons UV du soleil peuvent endommager l’ADN

Answer 31

covalent bond entre 2 thymines collées => dimérisation des thymines

Question 32

Réparation des Lésions par Excision (action)

Answer 32

1. erreur reconnu
2. partie affectée est excisée
3. adn polymérase ajoute bons nucléotides
4. ligase patch les nicks