tenta

Question 1

Hur binds BPG till hemoglobin? Hur skiljer sig bindningen av BPG mellan fetalt hemoglobin och adult hemoglobin?

Answer 1

BPG binder till deoxyhemoglobin och lägger sig i hålrummet och korsbinder 2 betasubenheter.
Detta genom att binda till ett antal sidokedjor i His och Lys (pos laddade). BPG är en starkt negativt laddad molekyl.
Funktionen är att förhindra upptag av avsläppt syre.
Fetala hemoglobinet har gammasubenheter istället för betasubenheter. Istället för histidin finns det nu Serin –> BPG binder inte lika starkt till Serin.
Det fetala Hb binder således bättre till syre/ högre affinitet.

Question 2

Uppgift 1CG1
De olika kolatomerna i ribos och deoxyribos numreras som 1’, 2’, 3’, 4’ och 5’.

Till vilken position är basen kopplad?

På vilken position sitter en –OH grupp i ribos men inte i deoxyribos?

Answer 2

Basen är kopplad till 1´kolet.

I deoxyribos är en H kopplad till 2´kolet men i ribos sitter en OH grupp på 2´kolet.

Question 3

Bilden ovan visar en schematisk skiss av polypeptidkedjan hos ett tänkt enzym, med det aktiva centret inom den fyllda cirkeln. Vi tänker oss nu att en punktmutation introducerar ett translationsstopp vid den lodräta pilen. Nämn ett (bara ett) tänkbart sätt på vilket enzymets funktion skulle kunna påverkas av mutationen, och motivera svaret helt kort.

Answer 3

Ett translationsstopp vid pilen leder till att kanalen in till aktiva sätet förstörs/försvinner. Denna kanal är viktig för enzymets substratspecificitet. Utan denna klyfta kommer det bli svårare att hitta rätt substrat.
(Key and lock strukturen försvinner.)

Question 4

Vad är ett lipoprotein? Beskriv hur det är uppbyggt.

Answer 4

Lipoprotein är en liten komplex molekyl som är viktig för transport av lipider.
Uppbyggnad:
Kärna: TAG + kolesterol + esterbindningar.
Omges av: Fosfolipider (micell) insprängt finns även amfipatiska aminosyror som är “adresslappar”.

Question 5

Vilka signaler och proteiner är involverade i terminering av proteinsyntes? Beskriv också deras exakta roll i denna process.

Answer 5

I P-site i ribosomen finns tRNA som är bundet till ett färdigt protein.
I A-site landar en release faktro ( 2 st i prokaryoter och 1 st i eukaryoter).
Releasefactors har 2 funktioner:
- är specifika proteiner som känner igen någon av stoppkodonen (UAG, UUA, UGA).
- Hydrolyserar peptidbindningen mellan tRNA och polypeptidkedjan. Proteinet lossnar. Sedan lossnar tRNA och ribosomenheterna.

Question 6

Proteiner förs till _______ för nedbrytning efter de har fått ___________ bundit till sig. Ange vad som saknas

Answer 6

proteasomen…..polyubiquitin

Question 7

Which of the following is/are true about transformation?

a) Naked bacterial DNA from the environment is transferred into a bacterium.
b) Integration of the transferred DNA into the host genome may be necessary.
c) All bacteria can be transformed.
d) Is one way in which antibiotic resistance can spread amongst bacteria.

Answer 7

a, b och d är rätt.

Question 8

Redogör för gelfiltrering.

Answer 8

Gelfiltrering är ett sätt att selektera proteiner med avseende på storlek.
Proteiner/provet tillsätts i en kolonn med ex dextrankulor. Dessa dextrankulor innehåller små porer där små molekyler kan ta sig in medan stora molekyler istället kommer passera dessa kulor.
Detta gör att små molekylers passage genom kolonnen bromsas upp.
Stora proteiner kommer komma ut ut kolonnen före de små.
I slutet av kolonnen mäts med hjälp av ljus, storleken så att man kan avgöra när selekteringen är klar.

Question 9

Vilket/vilka av följande alternativ beskriver en viktig funktion för 5’ cap hos eukaryot mRNA?

a) Skyddar mRNA från degradering
b) Skyddar mot felaktig splicing
c) Stimulerar translation
d) Stimulerar syntes av polyA-svansen

Answer 9

rätt svar, a.

Question 10

Describe how RNA is replaced with DNA during Okazaki fragment maturation.

Answer 10

(Prokaryot)
DNA polymeras I med sin 5´till 3´ exonukleasaktivitet klyver RNA-primer och adderar dNTP med sin 5´till 3´polymeras aktivitet.

Question 11

vad är substrat och produkt av proteinet som kodas av lacZ i lac-operon?

Answer 11

Substrat: Laktos
Produkt: galaktos och glukos.

Question 12

Vilket/vilka av följande påståenden om RNA polymeras är korrekt(a)?

a) Syntetiserar RNA i 3’ till 5’ riktning
b) Använder enkelsträngat DNA som mall.
c) Använder ATP, GTP, CTP och TTP som byggstenar.
d) Behöver en primer för att starta RNA syntes.

Answer 12

Rätt svar: B

Question 13

När ett litet protein som ribonukleas denatureras kommer det snabbt att återfå samma tertiärstruktur som innan denaturering om det överförs till vattenlösning utan denaturerande komponenter. Hur kommer det sig?

Answer 13

Proteinveckningen går alltid mot energiminimum. Väckas med hjälp av hydrofoba effekten. Alltså avskärmar sina hydrofoba delar ifrån vattnet. Det kostar energi att exponera hydrofoba ytor mot vatten då det kräver att vattnet omarrangeras.
Tertiärstrukturen är alltså reversibel.
En liten molekyl har lättare att väckas. Stora proteiner är mer komplexa och kan behöva väckningshjälp.

Question 14

Välj ut helt nödvändiga komponenter för en prokaryot kloningsvektor:

a) Kozak sequence
b) Selektionsmarkör
c) LacZ gen
d) Polylinker

Answer 14

Rätt svar: B och D

Question 15

Beskriv nukleasomens uppbyggnad. Ange vilka komponenter som ingår och hur de är organiserade.

Answer 15

Nukleosomen organiserar kromatinstrukturen i något som kallas beads on a string, vilket är den första nivån av strukturorganisering (packning).
Det finns 4 kategorier av histoner som bygger upp nukleosomen; H2A, H2B, H3 och H4. Dessa kommer att bilda octamera mer 2 histoner från varje kategori.

DNA kommer att lindas runt denna octamera strukturen med 1,75 varv eller 145 bp.
DNA som är negativt kommer dessutom att ha histonsvansarna som är positivt laddade runt sig vilket kommer att packa strukturen ännu mer.
H1-histon protein kommer att låsa fast runt lindat DNA så att det inte kan släppa, genom att binda till linker DNA.
Genom att packa DNA på detta sättet så kan man skydda DNA från att skadas på olika sätt. Dessutom kan man reglera transkription på detta sätt.

Question 16

Vilken typ av bindning bryter nukleaser? Vad skiljer endonukleaser från exonukleaser?

Answer 16

Nukleaser är enzymer som kan bryta fosfodiesterbindningar.
Endonukleaser kan klyva stora delar av en RNA- eller DNA-kedja i mitten. Exonukleaser klyver nukleotider en åt gången på antingen 5´eller 3´änden.

Question 17

Beskriv hur signalen för initiering av translation i eukaryoter och prokarypter skiljer sig åt.

Answer 17

Prokaryoter: Shine-Dalgarno sekvens och formylmethionin. mRNA transporteras med IF2.
Eukaryoter: Metionin AUG. Transporteras med hjälp av eEIF4-grupp.

Question 18

Vad består termineringssekvensen i prokaryot transkription av?

Answer 18

stem loop structure med poly-U svans

Question 19

Describe what a primase is and explain why it is required during bacterial DNA replication.

Answer 19

För att DNA-polymeraset ska kunna syntetisera en ny DNA sträng så krävs först en primer som den kan börja jobba ifrån. En primer är en kort RNA sekvens som syntetiseras av ett RNA-polymeras som kallas Primas.

Question 20

Vad är ubiquitin?

Answer 20

Ubiquitin är ett protein beståendes av 76 aminosyror.

En viktig uppgift som ubiquitin har är att märka de proteiner som ska brytas ner i proteasomen.
Ubiquitin kommer att binda in till en Lysin i proteinet som ska brytas ned, via sin C-terminala domän. Därefter kommer ytterligare en ubiquitin att binda in till det första ubiquitinet och det bildas som en kedja av ubiquitin. När minst 4 st ubiquitin adderats till det protein som ska brytas ned, så kommer det utgöra en markör om att proteinet ska brytas ned.

Question 21

Ange vilken egenskap som metoden baseras på när du separerar proteiner med ultracentrifugering.

Answer 21

Densitet

Question 22

Vad är Doskompensation?

Answer 22

Processen där genprodukterna från X-kromosomerna görs lika stora mellan däggdjurs honor och hanar.
En av kvinnans X-kromosomer inaktiveras.

Question 23

Hur transporteras CO2, hur binder det till Hb?

Answer 23

50% av CO2 transporteras som H2CO3 i plasma, resterande 50 % binder till hemoglobinet.
CO2 binder till N-terminal aminosyra i varje subenhet.
(4 subenheter–> 4 CO2 transporteras av 1 hb).

Question 24

Vad innebär sjukdomen Talassemi?

orsaken

Answer 24

Man saknar alfa- eller beta-subenheter.

Den kooperativa regleringen fungerar lite sämre. –> sämre funktion.

Question 25

Beskriv BPG-effekten.

Answer 25

BPG binder till deoxyhemoglobin och lägger sig i hålrummet och korsbinder 2 betasubenheter. Detta genom att binda till ett antal sidokedjor i His och Lys. BPG-= stark negativ molekyl.
Funktion: hindrar upptag av avsläppt syre.
I lungor har vi stort syretryck–> oxyhemoglobin –> hålrummet försvinner –> BPG slängs ur.

Question 26

Ge ett exempel på ett reaktionssteg i chymotrypsin-katalyserad proteolys där livslängden hos en intermediär förlängs. Förklara kortfattat hur stabiliseringen uppnås.

Answer 26

I reaktion 1 kommer Serin att ha en högt reaktiv O som kan göra en nukleofil attack på karbonylkolet i peptiden. Detta kommer att bilda en tetrahedron vilket är en instabil intermediär (första övergångstillståndet). Nukleofila attacken var dubbelbunden men kommer nu vara enkelbunden.
Detta gör syret i peptiden mycket reaktivt, laddat och ostabilt.
Oxanionhålan i enzymet har NH vilket kommer att vätebinda till det reaktiva syret vilket då kommer att stabilisera det.

Question 27

Vad är proteolys? Förklara hur det går till.

Answer 27

Proteolys innebär nedbrytningen av proteiner i en cell. Detta sker med hjälp av proteasomen som är en organell som bryter ner proteiner som blivit märkta med ubiquitin.
Först måste proteinet märkas för nedbrytning. Detta görs med hjälp av ubiquitin (som är ett protein bestående av 76 aminosyror).
Ub kommer att kopplas via sin C-terminal till NH-gruppen på sidokedjan hos Lysin på målproteinet. När minst 4 st ub kopplats så kommer proteinet kännas igen av proteasomen
proteasomen kommer att ta in proteinet genom ett av sina cap´s. Proteinet åker sedan ned i proteasomen och sedan in i dess 20S hålighet som den har.
I 20S håligheten så finns det proteolytiska enzym som kan bryta ner proteinet. När det är klart kommer aminosyrorna i Ub åka ut genom capen.
Ub och aminosyrorna kan sedan återanvändas.

Question 28

Lac-repressorn och catabolic activator protein (CAP) är proteiner som är involverade i regleringen av transkription av lac-operon i E.coli. Beskriv hur dessa två proteiner reglerar transkription av lac-operonet.

Answer 28

Lac-repressorn binder vanligtvis till operatorn i lac-operonet och på så sätt inhiberar det uttryck av genen.
Vid närvaro av laktos kommer formen allolaktos att förekomma och binda in till lac-repressorn som en co-inducer, så att den släpper och slutar att inhibera genen.
CAP hjälper RNA-polymeras att binda till promotorn. CAP kommer endast aktiveras av cAMP, vilket är en molekyl som endast förekommer vid brist av glukos.
Således kan genen endast uttryckas vid brist på glukos och tillgång på laktos. I annat fall kommer den vara avstängd.

Question 29

Vad menas med kompetens och transformation? (gällande bakterier)

Answer 29

Transformation innebär att man inkorporerar in nytt fritt DNA från sin yttre miljö till sitt genom.
Detta kan dock inte genomföras av alla bakterier, utan endast av kompetenta bakterier.
Vissa bakterier är naturligt kompetenta, andra kan göras tillfälligt kompetenta med hjälp av ex saltet kalciumklorid.

Question 30

Efter transkription måste RNA processas för attskapa ett moget mRNA. Moget mRNA har en modifiering i 3´änden. Vilken funktionell betydelse har denna?

Answer 30

Denna modifiering är polyadenylering, vilket är en process där man lägger till en svans på mRNA med massor av nukleotider med kvävebasen adenin.
Denna funktion tros dels avgöra livslängden på mRNAt genom att poly(A)svansen skyddar mRNA från degradering.
PolyA-svansen är också viktig vid initiering av translation eftersom den tillsammans med 5´cap signalerar till ribosomen att mRNA är moget och intakt.

Question 31

När man ska bestämma den 3-dimensionella strukturen hos ett protein använder man sig främst av metoderna röntgenkristallografi och NMR (Nuclear Magnetic Resonance). Ange en fördel och en nackdel men respektive metod.

Answer 31

NMR:
Fördel= Bilden tas när proteinerna finns i en lösning, vilket både är enkelt (de behöver ej tas ut) men också bra eftersom de då visas i sin naturliga form.
Nackdel= dålig upplösning.

Röntgenkristallografi:
Fördel= Bättre upplösning, vilket gör att de kan användas även på större protein.
Nackdel= Kräver kristalliserade protein vilket kan påverka strukturen och ev ge missvisande bild.

Question 32

Beskriv den sekundärstruktur som dominerar i proteiner som kan bilda amyloid. Vad kallas det smittämne som orsakar Kuru, Creuzfeldts-Jacobs sjukdom samt “galna ko-sjukan”. Vad består det av?

Answer 32

Sekundärstrukturen som dominerar i amyloida proteiner kallas betaflak. Den består av olika lager aminosyror som antingen ligger parallellt eller antiparallellt mot varandra.
Det är vanligast att de ligger antiparallellt eftersom det ger rakare/starkare bindningar.

Smittämnet heter prioner, det består av en typ av sjukdomsalstrande proteiner som kan överföra felveckning till friska proteiner.

Question 33

Omegafettsyra är idag mycket populärt. Vad är en omegafettsyra?

Answer 33

En omegafettsyra är en omättad eller fleromättad fettsyra. Omega avser det kol som är mest distalt från karboxylgruppen. Kombinerat med ett tal kan placeringen på dubbelbindningen utläsas.
Ex omega3-fettsyra= dubbelbindningen mellan 3:e och 4:e kolet räknat från omegakolet.

Question 34

En katalysator (och därför också ett enzym) kommer alltid vara i samma tillstånd före som efter katalys.
Gäller samma sak för Co-enzym?
ge ex.

Answer 34

Nej, Co-enzymkan ändra tillstånd under katalys.
Ex elektronförflyttning med hjälp av NAD+ /NADH.
NADH NAD+ +H+ + 2e-
Det kan vara så att det ej finns energi för att föra tillbaks/ange elektronerna.
co-enzymerna kan därför behöva få sin funktion återställd (via citroncyracykeln) eller behöva nyproduceras (via intag av vitaminer).

Question 35

Vad heter det enzym som kan bilda deoxyribonukleotider från ribonukleotider?

Answer 35

Ribonukleotidreduktas.

Question 36

Vilken är mekanismen för kolmonoxidförgiftning?

Answer 36

CO binder mycket starkare till järnatomen i hemoglobin än vad O2 gör, vilket gör att O2 ej kan binda in till den järnatom som CO bundit till.
Utöver att ockupera ett bindningsställe i hb från att binda till O2 orsakar dessutom CO sådana förändringar i hb´s struktur att ifall det sitter O2 på något av de andra 3 bindningsställena i hb kommer denna O2 att hållas fast stenhårt i hb, som då inte heller kan avge de O2 molekyler den bär på till kroppens vävnader.
Detta leder till inre kvävning och död (om ej beh).

Question 37

Förklara syftet med agaros-gelelektrofores och beskriv hur metoden går till.

Answer 37

Syftet med agaros-gelelektrofores är att uppskatta storlekar på de DNA-molekyler man har i ett prov.
Man gjuter en agarosgel med ett antal brunnar.
I en av brunnarna tillsätts en stege, en lösning med några olika DNA-molekyler av kända storlekar. I övriga brunnar tillsätts de prov man vill undersöka.
En spänning läggs över gelen och brunnarna.
DNA (prover och stege) kommer då att vandra i gelen. Små molekyler vandrar snabbare än stora.
Dvs korta DNA-segment kommer vandra längre än långa DNA segment. (stora bromsas av friktion).
När proverna vandrat kan dessa analyseras tex med hjälp av UV-ljus ifall proverna gjorts flourescerande (ex med Midori Green).
Utifrån detta kan proverna jämföras med stegen för att uppskatta molekylens storlek.

Question 38

Förklara funktionen av 5´- 3´polymeras och 5´- 3´exonukleas aktiviteten av DNA-polymeras I gällande okazakifragmenter.

Answer 38

• Varje okazakifragment startar med en RNA-primer som behöver ersättas med DNA för att replikationen ska färdigställas.
• 5´- 3´exonukleas tar bort RNA-primern och 5´-3´polymeras sätter sedan dit dNTP´s, så att glappet i DNA-strängen fylls.
  Ligas ser sedan till att DNA strängen fogas samman.

Question 39

Vad fyller en stem loop för funktion vid transkription?

Answer 39

Under transkription kan mRNA transkriptet bilda en form av stem loop –> hairpin loop som är rik på Guanin och Cytosin och följs av AU-rika sekvenser.
Denna stem loop kommer att utgöra ett steriskt hinder för RNA-polymeraset då transkriptionen försöker fortsätta framåt. Detta gör att transkriptionsbubblan kommer nystas upp och traqnskriptionen kommer termineras.
Dess funktion är alltså TERMINERING av transkription.

Question 40

Vad är en stem loop?

Answer 40

stem loop är en struktur hos RNA där det besparar med sig själv, ofta i en sekvens rik på Guanin och Cytosin.

Question 41

Vilken betydelse har restriktionsenzymer för genöverföring i bakterier?
Förklara kort skillnaden mellan “bekteriofag” och “profag”.

Answer 41

Restriktionsenzymer klyver DNA vid specifika sekvenser.
De kan användas av bakterier som försvar mot främmande nukleinsyror som kan klyvas sönder av restriktionsenzymer.
De kan även användas inom kloning då de klyver DNA vid specifika restriktions sites.

En bakteriofag är ett virus som infekterar bakterier. Det kan vara enbart lytiska fager som förstör bakteriegenomet hos värdcellen, eller temperata fager som kan växla mellan lysogen och lytisk cykel.

En profag är en temperat fag i sin lysogena cykel som lyckas inkorporera sin arvsmassa i värdcellens genom.

Question 42

Vilken metod skulle du använda för att bestämma om en patient är bärare av en viss genetisk sjukdom?

Answer 42

Southern Blot.
Metoden syftar till att påvisa förekomsten av en specifik sekvens av DNA i en lösning av DNA-molekylen.
Om vi vet hur den genetiska sjukdomens gensekvens ser ut kan vi i en southern blot konstruera en radioaktivt märkt komplementär sekvens och vi kan då detektera huruvida den genetiska sjukdomens sekvens finns i patientens DNA eller inte.

Question 43

Varför använder RNA Uracil medan DNA använder Tymin?

Answer 43

Då RNA är vår genetiska arvsmassa är det viktigt att replikation sker med stor exakthet.
Kvävebasen cytosin kan spontant deamineras till uracil. Genom att använda Tymin underlättas korrigering av deaminerade cytosin så DNA-polymeraser “korrekturläser” genom.
Då ett Uracil stöts på så klyvs det bort och ersätts med cytosin.
Detta minskar antalet mutationer i DNA och gör det därmed mera stabilt och lämpligt som arvsmassa.
DNA replikation blir mer exakt.
Hade Uracil använts hade DNAts replikation inte blivit lika exakt pga försämrad proof-reading.

I RNA krävs inte samma noggrannhet då ett felaktigt RNA-transkript ändå kommer degraderas efter användning. dvs RNA har en begränsad livslängd.
Uracil är “billigare” än Tymin dvs kräver mindre energi att syntetisera och lämpar sig därför bra för RNA att använda.

Question 44

NAD+ och ATP är 2 molekyler som ibland förekommer i enzymkatalyserade reaktioner.

a) Vad kallas sådana molekyler med ett gemensamt namn?
b) Vad är definitionen på molekyler med detta namn?

Answer 44

a) Co-enzym

b) En organisk molekyl som binder till ett enzym för att bidra till dess katalytiska förmåga.

Question 45

Både NAD+ och ATP hjälper till att överföra någonting i sina respektive reaktioner.

a) Vad överför NAD+?
b) Vad överför ATP?

Answer 45

a) NAD+ agerar oxidationsmedel och tar upp en elektron vid elektronöverföring i en redoxreaktion.
b) ATP donerar en fosfatgrupp och blir ADP då ett kinas fosforylerar en molekyl.

Question 46

Varför behöver kroppen glukos?

Answer 46

För att producera energi/ATP.

Question 47

Hur mycket glukos behöver kroppen per dygn?

Answer 47

3g/kg/dygn.

Question 48

I vilken form och vart lagras glukos?

Answer 48

I form av glykogen ffa i levern.

Question 49

Förklara begreppen essentiell respektive icke-essentiell aminosyra.
Namnge och beskriv två proteinsjukdomar kopplade till undernäring/felnäring.

Answer 49

Essentiella aminosyror = kan ej syntetiseras i kroppen. Det är därför viktigt att få i sig dessa via kosten.
Ickeessentiella aminosyror kan syntetiseras i kroppen.

2 ex på sjukdomar: Marasmus och kwasiorkor.
Marasmus= brist på både aminosyror och kalorier.
Kwasiorkor= Brist på aminosyror men tillräckligt kaloriintag.

Question 50

Hur påverkas fettsyrans fluiditet av:

a) kedjelängden
b) antalet dubbelbindningar

Answer 50

a) Ju längre kedjelängd desto högre smältpunkt –> lägre fluiditet.
b) Ju fler dubbelbindningar desto lägre smältpunkt –> högre fluiditet.

Question 51

Plasmidlabb: Redogör för vad som sker vid heat-shock transformation.

Answer 51

Vi har en egen-designad plasmid som vi vill föra in i en bakterie för att kunna använda bakteriens snabba förökning, för att klona fram en gen av intresse (som vi sedan kommer splicea in i bakterien).
För att lyckas med första steget använder vi heat-shock. Vi blandar plasmider med bakteriebuljong och lägger på is i ca 10 min. Sedan värmer vi hastigt upp den till 37 grader. Den plötsliga värmeskillnaden gör att bakteriens yttermembran blir mer permeabelt och plasmiden kan ta sig in i bakterien.

Question 52

Förklara vilken roll Drosha och Dicer har i miRNA och siRNA biogenes.

Answer 52

Både Drosha (RNAse i kärna) och Dicer (cytoplasmatiskt RNAse) är endonukleaser och Dicer är senare även en del av RISC-komplexet (RNA-induced silencing complex).

miRNA: är formade som hairpin-struktur i en längre RNA-strand. Drosha klipper bort denna struktur från RNA. Dicer klipper sedan bort “huvudet” av hairpin-strukturen.

siRNA: Formas från dubbelsträngat RNA och behöver inte drosha, dicer klarar sig själv.
Klipper (på två ställen) ut en dubbelsträngad RNA sekvens.

Question 53

Förklara varför operatorsekvensen i lac-operonet finns nedströms promotorsekvensen.

Answer 53

Polymeras-komplexet binder till promotorn och lac-repressorn binder till operatorn.
För att lac-repressorn ska kunna blockera polymeraset och negativt reglera genuttrycket - vilket är dess uppgift, så måste det binda nedströms om promotorn.

Question 54

SWI/SNF-komplexet kan flytta och ta bort nukleosomer. Vad är det som styr detta komplex till rätt plats vid aktivering av transkription?

Answer 54

Det är dess bromodomän (del av komplexet) som styr det.
Bromodomänen känner av acetylerade histonsvansar, så efter att en aktivator bundit till linker-DNA och rekryterat HAT(histonacetyltransferas) att acetylera histonerna omkriung sig kommer de att attrahera SWI/SNF via bromodomänen.
De flyttar sedan på histoner/nukleosomer så att DNA-polymeras friläggs och RNA-polymeras II + transkriptionsfaktorer med hjälp av mediatorn kan bindas in och sätta igång.

Question 55

Vilken enzymatisk aktivitet återfinns i telomeras?

Answer 55

Reverst transkriptas/omvänt transkriptas. Kan syntetisera DNA med RNA som mall.

Question 56

Redogör för molekylära bakgrunden till sickle-cell anemi.

Answer 56

Orsakas av en mutation i hemoglobinets betasubenheter. 6:e aminosyran glutamat som är hydrofilt har bytts ut mot Valin som är hydrofobt.
Detta leder till att betasubenheten får en hydrofob fläck som “klibbar” ihop med andra betasubenheters mutation och det bildas långa utfällningar.
Erytrocyterna kommer få en annan form - skärform.
och kommer vara skörare och mer flexibla, vilket gör att de fastnar i blodkärl.
Sjukdomen orsakar svår smärta, vävnadsskador, multiorgansvikt och tidig död.

Question 57

Enzymer kan inte ändra på jämviktskonstanten för en reaktion. I princip innebär detta att enzymer inte kan katalysera bildningen av produkter med högre fri energi än substratets. Dock finns det ett knep som enzymer använder för att tillverka ämnen med hög fri energi. Vad går det knepet ut på?

Answer 57

Enzymer kan katalysera en reaktion jämter en annan reaktion med högre energi och använda energin som bildas från tex ATP –> ADP +Pi

“Koppliing, summan blir neg delta G”

Question 58

Fett lagras ffa i adipocyter. i vilken form lagras fettet?

Answer 58

Triacylglycerol (TAG)

Question 59

Redogör för skillnader mellan N-länkade och O-länkade glykaner.

Answer 59

N-länkade glykaner innebär att glykanen är bunden till ett protein via kvävet på aspargins sidokedja.
O-länkade är bundna till ett protein via syret på sidokedjan hos ett serin eller treonin.

Question 60

Vilken roll spelar mediatorn vid transkriptionell aktivering?

Answer 60

Mediatorn fungerar som en slags brygga mellan aktivatorer och RNA-polymeras II.

Question 61

Ange i en mening vad bakteriell konjugering är. Beskriv huvudstegen i denna process.

Answer 61

• Bakteriell konjugering är en horisontell typ av genöverföring där DNA från en bakterie förs vidare till en annan via direktkontakt (pili).
• Två bakterier kommer ha direktkontakt genom pilus. Ifall ex plasmid-DNA ska överföras kommer en sträng av plasmid DNA föras över via pilus till den andra bakterien.
  Där kan det bildas en komplementär sträng så det blir ett dubbelsträngat DNA. Ibakterien som ger ifrån sig DNA bildas också en ny komplementär sträng.

Question 62

Vad innebär korrekturläsning? Beskriv hur det fungerar genom att utgå från DNA-polymeras III.

Answer 62

Korrekturläsning (proof reading) innebär att i samband med replikation kontrolleras att rätt nukleotid har adderats till den DNA sträng som håller på att bildas.
DNA-polymeras III har dels polymerasaktivitet som syntetiserar den nya DNA-strängen , men har även 3´- 5´exonukleasaktivitet.
Ifall fel nukleotid skulle råka adderas kan DNA-polymeras III upptäcka detta och ta bort den nukleotiden med sin 3´- 5´exonukleasaktivitet, för att sedan kunna addera rätt nukleotid.

Question 63

Hur påverkas hb av

a) CO2?
b) H+
c) BPG

Answer 63

a) CO2:
Om det finns CO2 kommer det påverka hb på två sätt.
CO2 kommer i en jämvikt att ge upphov till bikarbonatjoner och vätejoner. Dessa vätejoner kommer att binda till hb och stabilisera deoxyformen. vilket leder till minskad affinitet för syre.
CO2 kan också binda in till N-terminalen hos respektive subenhet hos hb och bilda en karbamatjon som är negativt laddad. Detta leder också till att vissa saltbryggor återskapas vilket också resulterar i att deoxyformen stabiliseras och affinitet för syre minskar.

b) H+: Om mängden H+ ökar kommer vätejoner kunna binda in till ytliga histidiner hos subenheterna på en hemoglobinmolekyl. Detta gör att saltbryggor återskapas och deoxyformen stabiliseras, minskad affinitet för syre.
c) BPG: kommer också att minska affiniteten för syre. När syre avges ute i vävnaderna så kommer BPG korsbinda subenheterna i det hålrum som finns när hemoglobin befinner sig i deoxyform och på så sätt stabilisera denna. detta leder till minskad affinitet för syre och förhindrar att syre tas upp när det just avgetts.