Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

BMA135 Antibiotika Och Resistens > Resistens hos grampositiver > Flashcards

Resistens hos grampositiver Flashcards

1
Q

Beskriv S. aureus genom - genomic islands? virulensfaktorer? insertion sequences? transposoner?

A

Flera genomic islands - flera av dem via horisontell genöverföring, vissa från andra arter

Många virulensfaktorer

Många kopior av IS och TNS

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Ge exempel på virulensfaktorer hos s.aureus

A

Flera olika komplex på ytan fö att kunna binda in till vävnader exempelvis

Skyddande enzymer

Toxiner

Koagulas - ger clot i blodet pga nedbrutet fibrinogen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Hur fungerar blaZ-genen hos s.aureus? Var sitter den i genomet?

A

blaZ: hydrolyserar penicillin till penicillinsyra (inaktiv)

Sitter på en transposon på en plasmid

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Vad betyder BORSA?

A

Borderline oxacillin resistent S. aureus. Har MIC 4-8mg/L

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Vad är mekanismen för S.aureus resistens mot betalaktamantibiotika?

A

Ändrat PBP.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Vilka PBP har S.aureus normalt?

A

PBP1, PBP2, PBP3, PBP4

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Vilket PBP har MRSA? Var i genomet sitter generna och hur är de uppbyggda?

A

PBP2a (även kallat PBP2’)

Generna sitter på SCCmec-kassetten, i formen mecI-mecR-mecA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Vilka betalaktamantibiotika är undantagen från den totala betalaktamresistens som MRSA har?

A

Ceftobiprol och ceftarolin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

På vilka mobila genetiska element finner man resistensgener för S.aureus?

A

På insertion sequences, transposoner och plasmider. De innehåller ofta många resistensgener samtidigt

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Ge några exempel på resistensgener som S.aureus kan ha och vilka antibiotika som de ger resistens mot

A

blaZ: penicillin
dfrA, dfrK: trimetoprim
ermC: erytromycin (kan även ge klindamycin)
tetK, tetL: tetracykliner
MecA: betalaktamer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Hur vanligt är det med resistenta s.aureus i Sverige?

A

Överlag låg resistens, några enstaka procent.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Vilken är resistensmekanismen för S.aureus och betalaktamantibiotika?

A

Förändrat PBP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Vilka är resistensmekanismerna för S.aureus och fluorokinoloner?

A

Förändrat gyras (GyrA/GyrB gener) och effluxpumpar

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Vilka är resistensmekanismerna för S.aureus och aminoglykosider?

A

Modifierad ribosom

Inaktivering via enzymer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Vilken är resistensmekanismen för S.aureus och glykopeptider?

A

Förändrad målstruktur (alanin till laktat)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Vilket operon är oftast anledningen till glykopeptidresistensen hos S.aureus?

A

VanA-operonet (samma som för VRE). Dessa stammar kallas VRSA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Vilka antibiotikagrupper har ribosomens 50s subenhet som sitt target?

A

Makrolider, oxazolidinoner

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Vilka antibiotikagrupper har ribosomens 30s subenhet som sitt target?

A

Aminoglykosider och tetracykliner och glycylcykliner (tigecyklin)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Vilken är den vanligaste resistensmekanismen för tetracyklinresistens?

A

Effluxpumpar (TetA, tex). de byter en proton mot en tetracyklin mot koncentrationsgradienten, vilket gör att tetracyklinet pumpas ut.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Vilka är de främsta mekanismerna för aminoglykosidresistens?

A
  1. Syntes av enzymer som modifierar aminoglykosidmolekylen så att den inte kan binda in
  2. Brist på enzymerna som aktivt transporterar in amingolykosiderna (tex anaerober, eller small colony variance som har annorlunda egenskaper)

Vanligast är 1.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Vilken gen orsakar aminoglykosidresistens?

A

aacA-aphD-genen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Var brukar aminoglykosid-resistensgenen (aacA-aphD) vanligtvis sitta?

A

Integrerade plasmider på SCCmecII-kasetten

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Vilka antibiotika ingår i förkortningen MLS?

A

Makrolider, linkosamider och streptogramin B

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Ge exempel på några specifika antibiotika som en bakterie blir resistent mot om den har MLS-resistens

A

Azitromycin, claritromycin, erytromycin och clindamycin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Vilken är den vanligaste mekanismen för MLS-resistens?

A

Modifierade målstrukturer, tex genom metylering

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Vilka antibiotika ger Erm-genen resistens mot?

A

Alla MLS

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Vilka två sätt kan Erm-genen uttryckas, och vad innebär det?

A
  1. Konsekutivt: hela tiden
  2. inducerbart: uttrycks endast vid stimulering, tex behandling med makrolid-ab.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Är linezolidresistens vanligt?

A

Nej

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

Vilka är de två vanligaste resistensmekanismerna för oxazolidinoner?

A
  1. (vanligast): ändrade målstrukturer via syntes av dimetylerande enzymer (dimetylerar adenin A2503)
  2. Mutationer i gener som kodar för ribosomala proteiner
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

Hur sprids oxazolidinonresistens?

A

Plasmider

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

Vilken är de 2 vanligaste mekanismerna för fusidinsyraresistens? Vilka gener?

A

1: (vanligast) Mutationer. Främst i genen fusA som kodar för elongeringsfaktor
2. Aktivt skydd av elongeringsfaktorn (FusB, FusC)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

Hur sprids fusidinsyraresistens?

A

Främst via plasmider som uttrycker FusB eller FusC. Dessa ger aktivt skydd av elongeringsfaktorn.

FusA är spontana kromosomala mutationer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

Vilken är den främsta mekanismen för kinolonresistens?

A

Kromosomala mutationer i gyrA/gyrB-generna som kodar för DNA-gyraset, vilket ger minskad affinitet för kinolonerna.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

Vad är mekanismen för rifampicinresistens och vilken gen är orsaken?

A

Mutation i rpoB-genen ger förändringar i RNA-polymeraset (byte av aminosyror) vilket ger en ändrad målstruktur.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

Vad är mekanismen för Sulfa-resistens?

A

Förändrad målstruktur som hindrar inbindning. Ofta kromosomalt kopplat

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

Vilka är resistensmekanismerna för trimetoprimresistens?

A
  1. Kromosomala mutationer ger förändrad målstruktur
  2. Horizontell genöverföring av enzymer som inte är känsliga för trimetoprim (plasmider, transposoner). drfA/drfK-generna
37
Q

blaZ är en resistensgen. Vilket antibiotika/vilken antibiotikagrupp påverkas, vilken är genprodukten och vilken är resistensmekanismen?

A

Antibiotika: Penicillin
Genprodukt: Betalaktamas
Resistensmekanism: Hydrolys av betalaktamringen

38
Q

MecA är en resistensgen. Vilket antibiotika/vilken antibiotikagrupp påverkas, vilken är genprodukten och vilken är resistensmekanismen?

A

Antibiotika: Alla betalaktamer
Genprodukt: PBP2a
Mekanism: Förändrad målstruktur

39
Q

aacA-aphD är en resistensgen. Vilket antibiotika/vilken antibiotikagrupp påverkas, vilken är genprodukten och vilken är resistensmekanismen?

A

Antibiotika: Aminoglykosider
genprodukt: inaktiverande enzymer
Mekanism: Modifikation av aminoglykosiderna via acetylering och fosforylering

40
Q

drfB är en resistensgen. Vilket antibiotika/vilken antibiotikagrupp påverkas, vilken är genprodukten och vilken är resistensmekanismen?

A

Antibiotika: trimsulfa
Produkt: DHFR (enzym)
Mekanism: reducerad affinitet för DHFR

41
Q

gyrA/gyrB är en resistensgen. Vilket antibiotika/vilken antibiotikagrupp påverkas, vilken är genprodukten och vilken är resistensmekanismen?

A

Antibiotika: kinoloner
Genprodukt: GyrA och GyrB-subenheterna av gyras-enzymet
Mekanism: reducerad affinitet för kinoloner

42
Q

ermA/ermB/ermC är en resistensgen. Vilket antibiotika/vilken antibiotikagrupp påverkas, vilken är genprodukten och vilken är resistensmekanismen?

A

Antibiotika: MLS (makrolider, linkosamider, streptogramin)
Genprodukt: enzym
Mekanism: Metylering av 23s rRNA vilket ger reducerad bindningsaffinitet

43
Q

Vilken gen är det som definierar en MRSA? Vilka antibiotikagrupper är den resistent mot?

A

MecA-genen. Alla betalaktamer (inklusive karbapenemer). Sjukhusstammar är ofta multiresistenta.

44
Q

Beskriv SCC-mec. Vad står det för, vad är det och vilka gener ingår?

A

Staphylococcal cassette chromosome mec

Genomö av okänt ursprung

Innehåller mecA (resistens), mecI och mecR (regulatoriska) samt ccrA och ccrB (rekombinaser)

45
Q

hur många typer av SCCmec finns det och vilka källor är vanligast för de olika typerna ?

A

14 typer

1-3: hospital acquired
4-5: samhällsförvärvade
5-14: andra stafylokocker (ej s.aureus)

46
Q

Kan mecA-genen fungera i plasmider eller kromosomer eller båda? Hur påverkar det resistensspridningen?

A

Endast kromosomen, måste integreras för att fungera. Den blir svårare att byta/flytta mellan bakterierna och resistensen sprids inte lika lätt

47
Q

Vilka typer av methicillinresistens finns som inte är MecA-medierad?

A
  1. BORSA (borderline oxacillin resistent SA)
  2. MODSA: modifieringar i sin naturliga PBP
  3. MecC/MecB

Alla är ovanliga.

48
Q

beskriv mecB och mecC (jämför med mecA, vilka gener, vilken typ av genfragment?)

A

MecA-homologer

Kopplade till blaZ

mecB är kopplade till transposon, mecC kopplad till ccr (skapar SCCmec typ 11)

49
Q

Definiera LA-MRSA

A

Livestock-associated MRSA

50
Q

Vilka MRSA är vanligast: CA, HA eller LA?

A

HA-MRSA

51
Q

Hur uppstod CA-MRSA? Vilka smittas? Hur ser resistensen ut?

A

Har förmodligen uppstått från MSSA som tagit upp SCCmec-kassetter

Smittar yngre friska personer

Oftast endast resistent mot betalaktamantibiotika (till skillnad från HA-MRSA)

52
Q

Nämn några kategorier av virulensfaktorer som CA-MRSA kan ha

A

Cytolytiska toxin, superantigen och tillväxtfrämjande faktorer

53
Q

Vad är ACME?

A

Arginine Catabolic Mobile Element

En virulensfaktor som är vanlig hos CA-MRSA. Ett stort block av virulensfaktorer som underlättar stabil kolonisering av hud.

54
Q

Vad är Panton-Valentin Leukocidin (PVL)?

A

Ett toxin som är cytotoxiskt för vita blodkroppar och hudceller. Såväl MSSA som MRSA kan ha det. Förknippas fr.a. med djupa hudinfektioner.

55
Q

I norden, är det vanligast med importerade MRSA-fall eller inhemska?

A

Inhemska! Främst samhällsförvärvade fall

56
Q

Nämn några riskfaktorer för MRSA

A

Trångboddhet, låg socioekonomisk standard, bärare i familjen, ab-beh, sjukhusvistelse

I USA: IV-missbruk, homosexuella män, HIV

57
Q

Är det olika riskfaktorer för MRSA och MSSA?

A

Nej, inga som säkert kan urskiljas mellan grupperna. Förmodligen beror det främst på olika värdfaktorer. Vissa personer verkar SA inte alls trivas hos.

58
Q

Hos vilka andra djur kan MRSA finnas? Är det samma stammar som hos människor?

A

Hund och katt: identiska/närbesläktade med humana stammar

Häst: unika stammar

Gris: En speciell klon (ST398) smittar till människor

59
Q

Jämför HA-MRSA och CA-MRSA med avseende på:
1. resistens
2. åldersgrupp
3. riskfaktorer och underliggande sjd
4. vilka infektioner de orsakar

A

HA: ofta multiresistenta, drabbar äldre med underliggande sjukdomar eller personer med riskfaktorer. Leder till olika typer av inf, ofta vårdrelaterade

CA: ej multiresistenta, yngre patienter med få underliggande sjd, ger främst hud och mjukdelsinf

60
Q

Är MRSA värre än MSSA?

A

Beror på vilken sorts MRSA.

HA-MRSA: sannolikt ja pga behandlingsproblematik

CA-MRSA: oklart men sannolik nej förutom vid initial felaktig behandling.

61
Q

Beskriv enterokocker - vanliga arter, nisch, ge exempel på infektioner och virulensfaktorer de kan ha

A

De är vanligt förekommande i både natur och i vår tarmflora - fakultativa anaerober som tål tuffa miljöer. E. faecalis och E. faecium vanligast.

Orsakar tex UVI, sårinf, endokardit, sepsis

Virulensfaktorer: cytolysin, adhesionsfaktorer, aggregation substance (AS), sex pheromones (attraherar andra enterokocker och förenklar därmed plasmidöverföring)

62
Q

Vilken är mer resistent - faecium eller faecalis?

A

Faecium

63
Q

Varför har enterokocker naturlig låggradig resistens mot betalaktamer och aminoglykosider?

A

Betalaktamer: På grund av att de har ett PBP som har lägre affinitet för betalaktamantibiotika

Aminoglykosider: pga att de har långsamt upptag

64
Q

Beskriv resistensmekanismer hos enterokocker - vilka plasmider/transposoner är vanligast, har de ofta många?

A

Ofta många, ja.

Plasmiderna är indelade i 2 huvudklasser: a) pheromone responsive och b) broad range host

Exempel: pCF10, pAD1: pheromone plasmider med både resistens+virulensfaktorer

Tn3 family transposon: konjugativ transposon med flera res.mek.

65
Q

Är resistensen hos enterokocker övervägande lik eller olik resistensen hos MRSA?

A

väldigt lik MRSA

66
Q

Hur ser resistensen ut för enterokocker och ampicillin/penicillin?

A

Ofta naturligt resistenta/toleranta. Har andra PBP och betalaktamaser (via blaZ tex).

PBP5 ger lägre affinitet till ampicillin (kräver högdos) och påverkar även cephalosporiner. (PonA och PbpZ-generna)

67
Q

Hur fungerar enterokockernas resistens mot glykopeptider?

A

Den terminala D-alaninen i peptidoglykanet byts ut mot ett D-laktat vilket ger en 1000x minskning i affinitet. Detta görs genom:
1) enzymer som förstör den terminala aminosyran
2) enzymer som modulerar en ny peptidoglykan-prekursor
3) enzym för tvåkomponent-regulatoriska system

68
Q

Hur ser resistensen ut hos enterokocker och aminoglykosider?

A

Naturlig resistens via dåligt upptag och modifiering av aminoglykosidmolekylen

Kan ha naturligt förekommande enzymer som modifierar strukturer

Kan ha ErmM-gen som kodar för ribosomalt RNA metyltransferas (ändrad målstruktur)

69
Q

Vilka resistensmekanismer har enterokocker mot oxazolidinoner?

A

Mutationer i 23s rRNA ger resistens mot linezolid (uracil mot guanosin). Alternativt metylering av adenin 2503

70
Q

Vilken är resistensmekanismen för enterokocker och tetracykliner?

A

Effluxpumpar (tetM, tetO, tetS-generna)

71
Q

Vilka resistensmekanismer finns för enterokocker och kinoloner, och vilken mekanism är specifik för E.faecium resp. faecalis?

A

Gemensam: mutationer i gyrA eller parC ger minskad affinitet

E. faecium: effluxpumpar (NorA)

E Faecalis: aktivt skydd av DNA-gyraset via qnr-genen som ger minskad inbindnin

72
Q

Vilken är mekanismen för rifampicinresistens hos enterokocker?

A

Mutation i rpoB-genen (kodar för betasubenheten på RNA-polymeraset)

Man har även upptäckt effluxpumpar och enzyminaktivering

73
Q

Vilken är resistensmekanismen för enterokocker och trimetoprim?

A

Den använder exogen folsyra och undviker därmed både trimetoprim och sulfonamidernas verkan

74
Q

Vilken gen ger vankomycinresistens hos enterokocker? Vilken art är vanligast bärare av genen?

A

VanA / Van B främst. Finns även andra Van-gener. E. faecium är vanligast bärare (=VRE).

75
Q

Var i genomet sitter Van-generna?

A

Det är ett operon (Van-operonet) som sitter antingen kromosomalt eller på en plasmid.

76
Q

Vilken är den viktigaste genen för att avgöra graden av vankomycinresistens i Van-operonet?

A

den variabla ligas-genen. Den finns i 9 varianter men vanligast är vanA / vanB / vanC

77
Q

Vilken van-gen ger högst grad av resistens - vanA eller vanB?

A

VanA. Ger mic vankomycin över 64, samt teikoplaninresistens.

Van B ger låggradig resistens (mic vanko 4) och är känslig för teiko.

78
Q

Var har Clade A gruppen av VRE sitt ursprung generellt sett? Ge även specifika ursprung för A1 och A2.

A

Kliniskt ursprung. Ofta multiresistenta

A1: sjukhusassocierad, har fler virulensfaktorer
A2: djurassocierad

79
Q

Beskriv VREs bärarskap och överlevnad - var i kroppen, hur länge, smittkällor och hur väl de klarar sig i miljön.

A

Främst i tarmfloran, kan bäras i flera år

En vanlig smittkälla är på händerna hos sjukvårdspersonal, där kan VRE klara sig i upp till 60 min.

På ytor kan de klara sig i upp till 4 månader.

80
Q

Vilka riskfaktorer finns för VRE med avseende på spridning och infektion?

A

Spridning: immunosupprimerade, cancerpatienter, transplantationsavd, hematologiavd, IVA mm

Infektion: urinkateter, dialys, buk- och thoraxkirurgi.

81
Q

Beskriv pneumokocker: morfologi, hemolys, infektioner, mm.

A

Grampositiv diplokock med kapsel (90 olika serotyper. Alfahemolytisk.

Kompetent bakterie (kan motstå oxidativ stress och transformation)

Ger bronkit, otitis media, meningit, sepsis mfl.

82
Q

Förklara hur pneumokocker kan liknas med kamikazepiloter med avseende på deras virulensfaktorer

A

De använder lysiner och exploderar sig själva för att förvirra immunförsvaret

83
Q

Vad är resistensmekanismen för pneumokocker och MLS? Vilken gen?

A

Samma som för SA och Ent - ett enzym som metyliserar 23s rRNA och gör att MLS inte kan binda in. Kodas för av ermB-genen

Kan även ha effluxpumpar som ger låggradig resistens.

84
Q

Vad är mekanismen för kinolonresistens hos pneumokocker?

A
  1. Utbyte av aminosyror i DNA-gyras och topoisomeras IV, ofta via spontana mutationer i gyrA eller parC (samma som staf och ent) i regionen som kallas QRDR (quinolone resistance determining region)
85
Q

Vilken är mekanismen för tetracykliner+doxycyklin hos pneumokocker

A

Ribosomal protektion - hindrar inbindning. tetM-genen

86
Q

Vad är mekanismen för vankomycintoleransen hos pneumokocker?

A

Oklart. Ingen ren resistens rapporterad, men de överlever i närvaro av vanko.

87
Q

Definiera MDR hos pneumokocker. hur vanligt är det globalt?

A

3 eller fler resistensgener (multidrug resistant). 15-36% globalt

88
Q

Beskriv hur pneumokocker utvecklar nedsatt känslighet mot penicillin

A

De utvecklar ett förändrat PBP, förmodligen via mosaikgener (de har tagit upp delar av gener från andra arter, tex alfastreptokocker, via transformation).

Ju fler fragment som tas upp, desto högre
mic-värde för penicilliner och betalaktamer får pneumokocken.

BMA135 Antibiotika Och Resistens (16 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions