Proteínas y subproteomas Flashcards
cuál es el principal objetivo de la proteómica?
identificación de las proteínas y caracterizar su función
qué es la proteómica subcelular?
estudio de las proteínas a nivel de los organelos
la expresión diferencial nos permite comparar la expresión de una proteína con un __ vs __
tx vs otro tx
cuáles son las técnicas para la subproteómica?
inmunofluorescencia
etiquetado por proximidad
fraccionamiento bioquímico
cómo funciona la inmunofluorescencia?
ac c/fluoróforo específico + organelo —> microscopia de fluorescencia
cómo funciona el fraccionamiento bioquímico?
separación de organelos por medio de detergentes
para qué sirve el análisis comparativo?
Ej:
mitocondria vs mix de los demás organelos —> comparas tipos de proteínas de los organelos —> saber cuáles son las específicas de la mitocondria o del organelo seleccionado
para qué es la visualización analítica in silico ?
ver abundancia de una proteína, ausencia o presencia de esta en el organelos
qué es un biomarcador?
marcadores que se pueden utilizar en medicina para detección precoz, el dx, la estadificación o el pronóstico de enfermedades
tipos de biomarcadores
metabolitos
pépticos, proteínas
medidas de propiedades físisicas
de dónde pueden proceder los biomarcadores?
proceso patológico
reflejar la reacción del cuerpo frente a la enfermedad
en dónde se pueden encontrar los biomarcadores?
líquidos biológicos y tejidos
qué es MALDI-TOF?
Desorción/ionización laser asistido por matriz acoplado a tiempo con vuelo
MALDI-TOF es una tecnología asistida por __
matriz
MALDI-TOF debe ser co-critalizada en la __
matriz
cuáles son las tres fases de MALDI-TOF?
desorción
ionización
desolvatación
en qué consiste la desorción de MALDI-TOF?
placa c/matriz + analito —> irradiación de láser (337nm) —> analisto se expulsa c/parte de la matriz de forma gaseosa
en qué consiste la desolvatación de MALDI-TOF?
residuos de la matriz se eliminan
en qué consiste la ionización de MALDI-TOF?
moléculas de la matriz transfieren protones, ionizando a la muestra
qué es el tiempo de vuelo en MALDI-TOF?
tiempo que tarda en llegar de la matriz al detector
con qué son aceleradas las moléculas en MALDI-TOF?
campo eléctrico
capacidad de procesamiento de MALDI-TOF
alta
(96 muestras a la vez)
cuál es el uso de MALDI-TOF?
identificación de cepas bacterianas y fúngicas mediante las variantes de masa y carga
dx