Genes codificantes de proteínas Flashcards
el DNA tiene dos hebras de __ formando una __
polinucleótidos
doble hélice
de qué está hecho el esqueleto de DNA?
fosfato y pentosa (interior)
hacia dónde se proyectan las bases nitrogenadas?
interior de la molécula
las cadenas de DNA son __
antiparalelas
cómo es la estructura B?
10 bases nitrogenadas
gira a la derecha
cómo es la estructura A?
11 nucleótidos
gira a la izquierda
cómo es la estructura Z?
gira a la izquierda
cada vuelta tiene 12 nucleótidos
cuándo se encuentra la estructura Z?
cuando inicia la transcripción
qué hebra de DNA se utiliza para la transcripción?
antisentido/cebador
3’-5’
en la transcripción todos los nucleótidos se encuentran trifosfatados, a excepción de __
el primer (monofosfatado)
casa vez que se agrega un nucleótidos, se libera un __
pirofosfato
qué región del DNA no se transcribe?
región promotora
cuáles son las secuencias de ácidos nucleicos necesarios para la síntesis de un producto génica funcional?
secuencias codificantes
secuencias no codificantes
en qué dirección es la polimerización de bases?
5’-3’
cuál es el río abajo?
dirección en la cual es transcrito el DNA (intrón/exón)
cuál es el río abajo?
promotor
cuáles son las secuencias reguladoras?
caja TATA
caja GC
Islas CpG
caja CAAT
de qué está hecha la caja TATA?
secuencia de T y A repetidas 25-35pb río arriba
qué puede bajar la tasa de transcripción de la POL II?
cambio de una base en caja TATA
qué es la caja CG?
elemento regulador con secuencia GGGCGG
en dónde se encuentra la caja CG?
genes sin caja TATA (genes constitutivos)
qué es un gen constitutivo?
realizan las mismas funciones en todas las células
en qué dirección está la caja CG?
5’-3’ y viceversa
a qué se une la caja GC?
FT SP1, 3 y 4
de qué están hechas las islas CpG?
secuencias ricas en CG 100pb río arriba
qué indican las islas CpG?
inicio de la transcripción
dónde se localiza la caja CAAT?
posición -80
en qué dirección se presenta la caja CAAT?
bidireccional
qué son los potenciadores distantes?
sitios de control que se encuentran lejos del sitio de transcripción
en dónde se localizan los ENHANCERS (potenciadores)?
reguladores tipo CIS
50kb río arriba del promotor
río abajo en algún intrón o último exón
cuál fue el primer enhacer descubierto?
SV40 en el genoma del virus
qué reguladores están continuos al gen?
reguladores tipo cis
de qué manera trabajan los sitios de regulación?
en conjunto
cómo funciona la transcripción de DNA a RNA?
RNA polymerase encuentra secuencia promotora
termina con señal de “terminación”
trabajan simultáneamente
cuáles son las modificaciones postranscripcionales del RNAm?
- adición de 5’ cap
- adición de cola de poli A 3’
- Splicing
cuál es la función de cap (7-metilguanosina)?
- proteger de degradación enzimática
- transporte en citoplasma
- sitio de unión de factor proteico para traducción
función de cola de poli A?
- proteger de degradación
- eficiente traducción en ribosomas
qué hace el splicing?
elimina intrones
une exones
cómo se le conoce al primer RNA sintetizado?
- transcrito primario
- RNA heterogéneo
- RNA precursor
por qué está conformado el RNA inmaduro?
UTR
Cap
intrones
exones
cola poli A
con qué empieza/termina un intron?
empieza —> gt
termina —> ag
cuáles son las secuencias consenso unión intrones exones?
sitio donador
sitio aceptor
sitio ramificado
cuál es el proceso de splicing?
- ataque nucleofílico de la G (GU5’)
- ataque nucleofílico de la adenina presente en sitio ramificado contra la G del extremo 5’ (lazo)
- provoca rompimiento de unión intrón exón
qué es el splicing alternativo?
mecanismo de producción de diferentes isofromas de proteínas transcritas por un solo gen
dónde es muy común el splicing alternativo?
en las proteínas requeridas para el SN
a qué se mantiene asociado el RNAm en el núcleo?
proteínas heterogéneas nucleares (complejo proteico mensajero nuclear mRNP)
por dónde se transporta el RNAm?
poros nucleares
por qué están formados los poros nucleares?
complejo de poro nuclear (NCP)
nucleoporinas
cuál es el RNA más abundante?
ribosomal 80%
dónde se lleva a cabo la transcripción y procesamiento del RNA ribosomal?
nucleolo
cuáles son los diferentes tipos de rRNA?
18s
28s
5.8s
5s
qué regiones se requieren para la unión de POL1 en la transcripción del RNA?
un elemento río arriba que -155 a -60
sitio de inicio de transcripción (-40 a +5)
cómo es la iniciación de la polimerasa I?
- UAF (compuesto por histonas) + elemento río abajo
- factor trimérico + TBP al elemento central + UAF
- se asocia complejo de POL I con Rrn3p
de qué se forma el rRNA naciente?
unión de proteínas formando el pre-rRNP
de qué está hecho el 80s (pre-rRNP)
45s pre-rRNA –> se corta para formar rRNA maduro
quién reconoce las posiciones de corte de 80s?
snoRNA (small nuclear RNA)
el ensamblaje de las unidades de los ribosomas se completa en el __ y posteriormente es movilizado a través de los __
nucleolo
NPC
qué forma la subunidad mayor del ribosoma?
28S
5.8S
ASOCIADOS
y 5S
quién forma la subunidad menor ribosomal?
18S
cómo son las modificaciones postraduccionales de RNA ribosomal?
transcripción 45S
corte para formar 18S
corte para formar 28S y 5.8S
unión de 28S con 5.8S
asociación de proteínas
quién transcribe tRNA?
POL III
la región __ de los genes que codifican para tRNA y rRNA 5s se encuentran localizados en la __ _ __
promotora
región de transcrito
cuáles son los promotores de tRNA?
Caja A y B
cuál es el promotor de 5s-rRNA?
caja c
FT de 5S-rRNA
TFIIA
FT de tRNA y 5s-rRNA
TFIIB/C
CAJA + FT –>
transcripción
cuántos nucleótidos tiene un pre-tRNA?
75-80
