Molekulare Zytogenetik

Question 1

Nenne Techniken der Zytogenetik

Answer 1

Stufendiagnostik:
- Karyogramm
- Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung
- Microarray-Techniken
- Analyse des Gesamtgenoms (NGS, …)

Question 2

Anwendung von FisH

Answer 2

Nachweis von fluoreszenz-markierten DNA-Sequenzen im Zellkern/ auf Mitose-Chromosomen

Question 3

Eigenschaften von FisH

Answer 3

• Fluorochrom-markierte Sonden
• Analyse spezifischer Teile des Genoms
• Lokalisation der Sonden muss bekannt sein
• Aufläsung einige hundert kb

Question 4

Nenne Sondentypen von FisH

Answer 4

Gen-spezifisch, im Zentromer, im Telomer, gesamtes Chromosom

• auf Chromosmen
• in Interphasekernen

Question 5

Was ist das Mikrodeletions-Syndrom und womit kann man es diagnostizieren?

Answer 5

• Deletion < 5 Mb
• FisH mit Lokus-spezifischen Sonden LSI

Question 6

Nenne MIkrodeletions-Syndrome

Answer 6

• WIlliams-Beuren
• DiGeorge
• Prader-Willi/Angelmann
  …

Question 7

Was ist das DigGeorge-Syndrom?

Answer 7

• Mikrodeletion 22q11.2
• häufigstes Mikrodeletionssyndrom
• Deletion von ca 3 Mb
• häufig Neumutationen

Question 8

Klinische Befunde eines DiGeorge-Syndroms

Answer 8

• Herzfehler (cardiac anomalies)
• abnormal face: Mikrogenie, kurzes Philtrum, auffällige Nase
• Thymushypoplasie/ - aplasie
• Gaumendefekte (cleft palate)
• Hypokalzämie

CATCH

Question 9

Was ist das Williams-Beuren-Syndrom?

Answer 9

• Mikrodeletionssyndrom
• ca 1,6 MB
• idR Neumutation

Question 10

Klinische Befunde bei Williams-Beuren-Syndrom

Answer 10

• Herzfehler
• typische Fazies
• Nieren-/Augenprobleme
• Hyperkalzämie
• psychomotorische Retardierung
• relativ gute sprachliche Fähigkeiten
• sehr sozial, musikalisch

Question 11

Was ist ein Microarray?

Answer 11

• molekularbiolog. Untersuchungssystem
• erlaubt parallele Analyse des Gesamtgenoms
• Genom in mehrere 100 000 Fragmente zerlegt

Question 12

Was ist ein Array-CGH?

Answer 12

• Microarray
• Patienten-DNA wird mit DNA einer gesunden Kontrollperson verglichen

Question 13

Was ist ein SNP-Array?

Answer 13

Patienten-DNA wird in silico mit 270 Kontrollpersonen verglichen

Question 14

Was sind SNPs?

Answer 14

• single nucleotide polymorphism
• 2/mehr Versionen eines Nukleotids an bestimmter Position mit jeweils >= 1 % in der Population
• über das gesamte Genom verteilt ca 50 mio SNPs
• Lokalisation innerhalb und außerhalb von Genen

Question 15

Vorteile / Nachteile von Karyogramm

Answer 15

• geringerer Aufwand
• Aufarbeitung 2-3 Tage
• Aussage übers Gesamtgenom
• Auflösung nur 5.10 Mb
• balancierte und unbalancierte Translokationen können gefunden werden

Question 16

Vorteile/Nachteile von FISH

Answer 16

• spezielle Fragestellung
• Aufbereitung 2 Tage
• nur spezifischer Locus/Chromosomenregion
• Auflösung mit 100-200 Kb besser als Karyogramm
• balanciert und unbalancierte Translokationen

Question 17

Vorteile/Nachteile von SNP-Array

Answer 17

• Aufbereitung 3 Tage
• Gesamtgenom wird betrachtet
• hohe Auflösung mit < 100 Kb
• nur unbalancierte Aberrationen