Maladies infectieuses Flashcards
Quels sont les 4 principaux sites du corps humain colonisés par une flore microbienne?
- Les muqueuses du tube digestif (intestin ++)
- La muqueuse urogénitale (vagin ++)
- La muqueuse respiratoire supérieure (bouche ++)
- La peau (zones humides ++)
Quels sont les 3 sites anatomiques entièrement stériles ?
- Cardiovasculaire (sang et tissus)
- Musculo-squelettique (muscles/os/articulations)
- Neurologique (liquide céphalo-rachidien)
Les sites profonds
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- ORL : sinus, oreille moyenne et profonde
- Respiratoire : bronches distales et alvéoles, plèvre
- Génito-urinaire : urètre proximal, vessie, utérus, prostate, uretère, reins
- Digestif : foie, rate, pancréas, cavité péritonéale
Connaître la distribution des principaux microorganismes de la flore selon le site anatomique
Quelles sont les 4 analyses microbiologiques à effetuer en présence d’une maladie infectieuse?
- Le sommaire microscopique et la culture d’urine (SMU et DCA)
- La culture des expectorations
- Les hémocultures
- La ponction lombaire
Chez quels patients effectue-t-on un SMU / DCA?
Chez tous les patients qui se présentent avec symptômes urinaires compatibles, sauf chez les jeunes femmes non enceintes avec symptômes typiques, sans fièvre et sans facteur de risque d’infection résistante
* On ne precrit pas une culture d’urine chez un patient asymptomatique, sauf exceptions *
Comment s’effectuent la SMU et DCA?
- À effectuer avant la prise d’antibiotiques
- Habituellement sur une urine mi-jet, après désinfection (on veut éviter la contamination par la flore de la peau)
Comment se fait la prescription de la SMU/CDA?
Par la formulation «SMU/DCA»
* heure importante à indiquer *
Quelles sont les 3 grandes considérations à prendre en compte lors de l’interprétation du SMU/DCA?
1) L’urine est stérile
2) Mais, pour la plupart des prélèvements, dont le mi-jet qui est le plus répandu, elle peut se contaminer au passage par les flores digestive, génito-urinaire et cutanée
3) L’interprétation du résultat dépend du sommaire d’urine, de la bactérie identifiée et de la quantité retrouvée
Quelles sont les principales bactéries causant l’infection urinaire?
- Entérobactéries
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E. Coli
Klebsiella sp
Proteus mirabilis
Citrobacter
- Enterococcus faecalis
- Staphylococcus saprophyticus
- Streptocoque B-hémolytique du groupe B
- Pseudomonas aeruginosa
Quelle est la quantité habituellement retrouvée de bactérie en infection urinaire?
Supérieure à 107-8 UFC/L
La bactérie sera identifiée par le laboratoire seulement si elle est un pathogène reconnus en quantité suffisante
Quelles sont les principales bactéries représentant de la contamination dans l’urine?
- Streptocoque viridans
- Corynébactérie
- Staphylocoques à coagulase ngative (sauf S. saprophyticus)
- Micrococcus sp
Interpréter un SMU
- Certaines bactéries sont productrices de nitrite. Toutefois, une infection urinaire de nitrite de comprend pas nécessairement la présence de nitrite
- La présence de protéine dans l’urine est un signe d’inflammation
Interpréter un DCA
S = sensible à l’antibiotique
R = résistant à l’antibiotique
Quand est-il pertinent de demander une culture des expectoration?
Pneumonie nosocomiale
Habituellement pas recommandée lors d’une pneumonie acquise en communauté traitée en externe, sauf si :
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- Pneumonie nécessitant hospitalisation ou sévère
- HIstoire de colonisation par des germes plus résistants
- Déterioration sous antibiotique
- Hospitalisation récente et utilisation d’antibio dans les 3 mois
Comment se fait la culture des expectorations?
- Se fait avant la prise d’antibiotiques (si possible)
- Un seul spécimen (de qualité) suffit
Comment prescrire une culture des expectorations?
Quelles sont les 3 grandes considérations à prendre en compte lors de l’interprétation d’une culture des expectorations?
- Ce n’est pas un spécimen stérile (flore normale - colonisants)
- La/les bactéries qu’on retrouve ne sont pas nécessairement l’agent étiologique de la pneumonie
- L’interprétation du résultat dépend, entre autres, de la qualité du spécimen
Quels sont les principaux pathogènes potentiels d’une culture d’expectoration?
Streptococcus pneumoniae
- Moraxella catarrhalis
- Haemophilus influenzae
- Streptococcus viridans
- Eikenella spp.
- Anaérobes
Quelles sont les utilités d’une culture d’expectoration?
- Surtout utile pour les pneumonies bactériennes à germe « typique »
- SI culture positive, peut identifier le germe responsable
- L’antibiogramme fait sur la culture permet de donner un traitement ciblé
- Permet de connaître l’épidémiologie
Quelles sont les limites de la culture des expectorations?
- Il faut pouvoir expectorer
- Il faut interpréter en fonction du fait que la flore peut être retrouvée sans être en cause (jugement clinique)
- Il faut idéalement obtenir le spécimen avant les antibio
- Le résultat de la culture prend quelques jours à sortir
INterpréter une culture des expectorations
* Si contraire (>25 épithéliales et <10 polynucléaire), test contaminé *
Quand est il intéressant de demander les hémocultures?
Si probabilité élevée de bactériémie
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- Sepsis/choc septique
- Ostéomyélite / discite vetrtébrale / abcès épidural
- Méningite
- Arthrite septique (non traumatique)
- Suspicion d’endocardite et autre infection intravasculaire
- Infection de cathéter
Si probabilité modérée de bactériémie
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- Pyélonéphrite
- CHolangite
- Abcès du foie
- Pneumonie acquise en communauté (PAC) sévère
- Pneumonie acquise sous ventilateur (PAV)
- Celluite chez immunosupprimé
Comment se fait la prise d’hémocultures?
- Avant la prise d’antibiotiques
- Prise de 2 hémocultures au minimum
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2 ponctions veineuses différentes (en périphérie le + souvent)
2 bouteilles par ponction (aérobie et anaérobie)
TOTAL DE 4 BOUTEILLES
Comment se fait la prescritpion d’hémocultures?
Quelles sont les 3 grandes considération à prendre en compte lors de l’interprétation des hémocultures?
- Le sang est normalement stérile
- Pour prélever les hémocultures, il faut passer à travers la peau qui n’est pas stérile
- L’interprétation du résultat dépend de la bactérie identifiée, du tableau clinique et d’autres informations en lien avec le prélèvement
Quels sont les microorganismes retrouvés dans le sang qui sont toujours considérés comme significatifs?
- Staphylococcus aureus
- Streptocoque B-hémolytique du groupe A
- Streptococcus pneumoniae
- Entérobactéries (ex: E. coli)
- Haemophilus influenzae
- Bactéroïdes (bacille Gram négatif anaérobie)
- Pseudomonas aeruginosa
- Candida
* Ne doivent pas être considérées comme des contaminants *
Quelles sont les bactéries contaminant les hémocultures?
Le plus souvent significatives, mais parfois contaminants
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- Entérocoque
- Streptocoque viridans
Souvent (mais pas exclusivement) contaminants
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- Staphylocoque à coagulase négative
- Corynébactérie
- Cutibacterium acnes
- Bacillus sp.
- Micrococcus sp.
* Bactéries de la peau *
Interpréter l’examen direct d’une hémoculture
Interptéter le résultat de la culture d’un bilan septique
Quand est-il pertinent de demander une ponction lombaire?
En cas de suspicion d’infection du système nerveux central, comme une méningite ou une encéphalite.
La ponction lombaire est nécessaire et urgente
Comment se fait la prise d’une ponction lombaire?
Avant les antibiotiques, si cela ne retarde pas le traitement
Différentes analyses du liquide céphalo-rachidien
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- Biochimie sur le LCR (glucose et protéines)
- Gram et culture bactérienne
- Décompte cellulaire
- Autres analyses, telles que le PCR méningite « multiplex » et le PCR spécifique Herpès types I et II.
Comment se fait la prescription du ponction lombaire?
Prescrire chaque analyse du LCR voulue
Quelles sont les 3 grandes considération à prendre en compte lors de l’interprétation d’une ponction lombaire?
- Le LCR est stérile
- Lors de laponction lombaire, il faut passer à travers la peau qui n’est pas stérile
- L’interprétation du résultat dépend de la biochimie, du décompte cellulaire, de la bactérie identifiée et du tableau clinique
Quels sont les pathogènes ne devant jamais être considérés comme des contaminants lorsqu’ils sont présents dans le LCR?
Bactéries (selon l’âge, le statut immunitaire,..)
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- Streptococcus pneumoniae
- Neisseria meningitidis
- Haemophilus influenzae
- Streptocoque B-hémolytique de groupe B
- Escherichia coli
- Listeria monocytogenes
Virus
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- Herpès type I et II
- Varicella zoster
- Entérovirus
Interpréter les résultats de biochimie d’un ponction lombaire
- Plusieurs bactéries se nourrissent de glucose
- La présence de protéines dans le LCR est signe d,inflammation
Interpréter le décompte cellulaire et l’examen direct sur le LCR
Interpréter les résultats du PCR méningite multiplex lors d’un ponction lombaire
Interpréter un culture du LCR
