Le peptides Flashcards
Qu’est ce qu’un peptide ?
C’est le composé constitué de plusieurs acides aminés
Comment s’appelle un peptide en dessous de 50 acides aminés ?
C’est un polypeptide
Comment s’appelle un peptide au dessus de 49 acides aminés ?
C’est une protéine
Qu’est-ce qu’une liaison peptidique ?
C’est une liaison covalente formée par condensation du groupe α-carboxyle d’un acide aminé avec le groupe α-aminé d’un autre acide aminé et élimination d’eau
Qu’est ce que l’effet mésomère ?
C’est l’effet par lequel des électrons/des liaisons délocalisés se déplacent dans la molécule
Quelles sont les 3 formes de la liaison peptidique ?
La première forme extrême, la seconde forme extrême et la forme hybride
Quelles sont les trois propriétés fondamentales de la liaison peptidique ?
Elle est plane, rigide et polaire
Quels sont les trois angles variables d’une liaison peptidique ?
Les angles Ω, Ψ et Φ
Quelles sont les deux valeurs possibles de l’angle Ω ?
0 et 180°
Que se passe-t-il quand Ω = 0° ?
Il y a encombrement spatial, c’est la configuration cis de la liaison peptidique
Que se passe-t-il quand Ω = 180° ?
La liaison peptidique est sous la configuration trans, où la structure rappelle une symétrie centrale
Quelle configuration la liaison peptidique prend presque toujours ?
Elle prend presque toujours une configuration Trans, plus stable
Quels sont les deux types de liberté de rotation ?
La liberté de rotation de l’angle Φ et la liberté de rotation de l’angle Ψ
Qu’est-ce que l’angle Ω ?
C’est l’angle de torsion autour de la liaison C-N
Qu’est-ce que l’angle Ψ ?
C’est l’angle de rotation autour de la liaison Cα et le groupe carbonyle
Qu’est ce que l’angle Φ ?
C’est l’angle de rotation entre le Cα et l’azote amidique
Qu’induit l’existence de deux types de liberté de rotation pour le carbone asymétrique ?
Déjà qu’il y a deux plans et que le carbone se trouve au centre de la succession de ceux-ci
Comment lit-on une chaîne polypeptidique ?
On commence par l’acide aminé qui a sa fonction amine libre (N-ter) et on finit par l’acide aminé qui a sa fonction carboxylique libre (C-ter)
Quelles sont les propriétés des peptides découlant des acides aminés ?
Ils sont chargées avec caractère amphotère, ils possèdent un pI, et absorbent la lumière dans l’UV à 280 si ils possèdent un ou plusieurs acides aminés aromatiques, ils donnent un complexe violet avec du sulfate de cuivre en milieu alcalin (Réaction du Biuret)
Qu’est-ce qu’un résidu ?
C’est le composé artificiel obtenu après clivage des liaisons peptidiques
Quel acide aminé est considéré comme libre dans une protéine ou peptide ?
C’est le dernier acide aminé
Lorsqu’un peptide se trouve neutre dans un encadrement de pK comment calculer le pI ?
pI = la moitié de la somme de l’encadrement pK, en gros la moyenne
Que faut-il enlever au rapport m/z de l’acide aminé libre d’un peptide ?
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Dans un peptide quels sont les composés ionisables ?
N, COOH, les acides aminés ionisables
Qu’est-ce qui bloquerait l’ionisation des différents composés d’un peptide ?
Les modifications post-traductionnelles
