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Biopathologie générale > Introduction à la génétique et cytogénétique médicales - Cours 4 > Flashcards

Introduction à la génétique et cytogénétique médicales - Cours 4 Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que la génétique?

A

La science de l’hérédité. Elle étudie la transmission des caractères normaux et pathologiques d’une génération à l’autre

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Q

Comment appelle-t-on l’étude de la génétique qui inclut les aspects pathologiques de l’hérédité?

A

Génétique médicale

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3
Q

Comment divise-t-on les pathologies de l’hérédité?

A

En deux grandes catégories :
1- L’anomalie est due à une mutation génique et est identifiée par la biochimie et la biologie moléculaire ; souvent suspectée à l’histologie (maladies de surcharge)
2- L’anomalie est visible morphologiquement et est identifié par la cytogénétique
On considère actuellement qu’entre le tiers et la moitié des enfants hospitalisés le sont pour des problèmes génétiques

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4
Q

Que se passe-t-il entre 2000 à 2004?

A

On annonce la fin du séquençage du génome humain (HUGO). On connait désormais plus de 99% du génome humain

Première surprise :
-Le génome ne comporte pas 100 000 gènes comme on le croyait mais seulement de 20 000 à 25 000
-Les gènes humains n’occuperaient qu’environ 2% de tout notre ADN

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5
Q

Qu’est-ce qu’un gène?

A

Correspond à un segment d’ADN contenant une information particulière

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6
Q

Qu’est-ce qu’un locus ?

A

Se définit comme l’endroit occupé physiquement par une fonction génique (un gène) sur un chromosome et son homologue
Au même endroit (locus) sur les deux chromosomes d’une même paire, on peut retrouver la même forme de cette fonction génique ou une forme différente (allèle)

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7
Q

Qu’est-ce qu’une allèle?

A

L’une ou l’autre forme d’un gène occupant un locus défini sur une paire chromosomique déterminée
Un individu normal peut posséder plus de deux allèles à la fois pour un locus donné, à savoir, l’un de ces allèle est d’origine paternelle et l’autre, d’origine maternelle

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8
Q

Qu’est-ce que la polyallélie?

A

Pour une fonction génique, lorsqu’il y a plusieurs allèles dans une population

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9
Q

Qu’est-ce que le génotype?

A

Correspond à la constitution génétique d’un individu

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10
Q

Qu’est-ce que le phénotype?

A

Représente l’ensemble des caractères apparents d’un individu, caractères constatés à l’examen de cet individu sans l’aide de son histoire familiale

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11
Q

Qu’est-ce que le syndrome?

A

Une condition clinique dans laquelle on peut reconnaître un nombre important de modifications phénotypiques constantes chez plusieurs individus

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12
Q

Donnez un exemple de maladie où la personne est porteuse d’un gène anormal et est phénotypqieuement normale pendant une bonne partie de sa vie

A

La Chorée de Huntington : autosomique dominant - locus 4p16.3 - mortalité des neurones, mouvements saccadés et démence

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13
Q

Définissez : Plusieurs gènes peuvent avoir le même effet

A

Hétérogénéité génique

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13
Q

Définissez : Un même gène peut avoir plusieurs effets

A

Pléiotropisme

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14
Q

Définissez : Des agents du milieu peuvent stimuler les effets d’un gène

A

Phénocopie

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15
Q

Une maladie est dite congénitale lorsqu’elle…

A

Est présente à la naissance

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16
Q

Est-ce qu’une maladie congénitale doit absolument être héréditaire?

A

Elle peut être héréditaire ou non (par exemple la plupart des malformations cardiaques)
Par contre, une maladie héréditaire peut ne pas être congénitale si elle n’apparaît que plus tard dans la vie (par exemple, la Chorée de Huntington)

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17
Q

Est-ce que le syndrome d’alcoolisation foetale est une maladie congénitale et/ou héréditaire?

A

maladie congénitale non héréditaire caractérisée par un retard mental, une microcéphalie, des anomalies cardiaques, une insuffisance rénale et un retard de croissance

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18
Q

De quoi dépend les différences entre les individus?

A

Certaines différences entre les individus dépendent uniquement de la constitution génétique (par exemple, les groupes sanguins)
D’autres différences dépendent à la fois de la constitution génétique et de l’environnement (certains cancers, certaines infections, etc.)
Enfin, il existe des différences qui ne dépendent que de l’environnement et dans lesquelles la constitution génétique ne joue aucun rôle (les brûlures, Tchernobyl)

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19
Q

Comment est-il possible de distinguer les effets du milieu de ceux de l’hérédité?

A

Par la comparaison de jumeaux monozygotes, qui possèdent le même patrimoine génétique : leurs dissemblances doivent être attribuées à l’action de l’environnement

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20
Q

De quoi est composé le nucléotide?

A

Base azotée, sucre, phosphate

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21
Q

Quels sont les bases azotées de l’ADN?

A

Guanine-Cytosine
Thymine-Adénine

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21
Q

Qu’est-ce que le nucléosome?

A

Unité de base d’organisation de la chromatine
Segment d’ADN + complexe d’histones en octamère (coeur protéique)
Permet la condensation de l’ADN en chromatine, elle même repliée (compactage de nos 2 mètres d’ADN dans chaque cellule)
Plus l’ADN est condensé, moins les gènes pourront être transcrits

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22
Q

Définissez : Compactage de l’ADN moins condensé; contient les gènes transcrits

A

Euchromatine

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23
Q

Définissez : Compactage de l’ADN hyper compact; toujours condensé, contient les gènes non transcrits, contient peu de gènes : télomères et centromères

A

Hétérochromatine

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24
Q

De quoi est composé le corps protéique?

A

2 copies de H2A, H2B, H3, H4

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25
Q

Comment peut-on modifier la conformation de l’ADN?

A

Par le complexe de remodelage
Par modification chimique des histones ou épigénétique

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26
Q

Qu’est-ce que le complexe de remodelage?

A

Protéines, utilisant de l’ATP qui induit des changements de conformation du nucléosome
Permet de condenser ou décompenser la structure et exerce donc un certain contrôle sur l’accessibilité des gènes au mécanisme de transcription

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27
Q

Explique la modification chimique des histones ou épigénétique

A

Acétylation et méthylation-phosphorylation-ubiquitinylation

-Acétylation : Mise en place par les histones-acétyltransférases. Ajout d’un groupe acétyl qui modifie l’empaquetage des gènes par les histones; augmente l’accessibilité à ces gènes. Réversible
-Méthylation : ajout de groupement méthylès sur les histones, modifie la condensation –>Gènes plus ou moins accessibles

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28
Q

Dans quel sens se fait la réplication de l’ADN?

A

Dans le sens 5’-3’

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29
Q

Quels sont les étapes de l’ADN jusqu’au la protéine?

A

ADN (nucléotides TACG)
Transcription
ARNm (nucléotides UACG)
Traduction
Protéine (20 acides aminés possibles)

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30
Q

Qui s’occupe de la traduction des ARNm en protéine?

A

Les ribosomes

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31
Q

Nommez les sortes de mutations

A

Mutation génique ponctuelle
Mutation frameshift
Mutation stop
Mutation ponctuelle

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32
Q

Qu’est-ce qu’une mutation génique ponctuelle?

A

Délétion ou insertion de multiples de 3 nucléotides
Respect du cadre de lecture (absence de décalage du cadre de lecture)

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33
Q

Qu’est-ce qu’est une mutation stop?

A

Codon se fait remplacer par codon stop
Arrêt de lecture -> Troncation

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33
Q

Qu’est-ce qu’une mutation frameshift?

A

Délétion ou insertion de non multiples de 3 nucléotides
Pas de respect du cadre de lecture :
-Protéine tronquée -> Instable et dégradée (perte de fonction)
-Protéine tronquée ->Effet gain de fonction

Insertion :
Pas de respect du cadre de lecture car insertion ou perte de nucléotides qui ne représente pas un multiple de 3 –>Troncation

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34
Q

Quelles sont les conséquences d’une mutation génique?

A

Une mutation génique de type “single gene effect) peut être responsable :
-Anomalie du développement
-Anomalie biochimique : maladie métabolique/mitochondrie
-Accumulation excessive de protéines anormales : maladies de surcharge/maladies métaboliques

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35
Q

Quelles types de maladies sont-elles causées par un changement du type de protéine?

A

-Maladies enzymatiques : Maladies métaboliques et maladies des anti-enzymes (Déficit en A1AT)
-Malformations
-Maladies immunologiques
-Protéinopathies (Amylose)
-Maladies neurodégénératives
-Prédisposition au cancer (protéines impliquées dans la voie de signalisation)
-Canalopathie (ex. mucoviscidose)

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36
Q

Qu’est-ce qu’une mutation ponctuelle? Donnez un exemple

A

Substitution d’un nucléotide par un autre
Ex : Drépanocytose
Déformation du globule rouge –>Faucille
Du fait de la modification de la Bêta hémoglobine

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37
Q

Quel est la maladie en lien avec une perte de fonction enzymatique?

A

Maladies de surcharge ou maladie enzymatique
Peut être du à un problème d’excrétion, de taux, ou de surcharge
La mutation atteint un gène qui malforme une enzyme qui n’est alors plus capable de catalyser un composé A en B. Il y a alors accumulation de A dans la cellule qui repousse le noyau et fait une surcharge

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37
Q

Donnez un exemple de maladie enzymatique ou de surcharge

A

Maladie de Gaucher : Déficit en glucocérébrosidase

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38
Q

Donnez un exemple de déficit de fonction d’une protéine

A

Déficit en alpha1-antitrypsine
L’alpha1-antitrypsine agit entre les protases. Sans elle, inflammation brise membrane et fait un gros trou
Accumulation dans le réticulum endoplasmique

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39
Q

Qu’arrive-t-il lors d’une accumulation de la protéine amylose?

A

Bloque les vaisseaux sanguins

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40
Q

Quand est-ce qu’un individu est dit homozygote?

A

Il est dit homozygote pour un gène donné s’il est porteur du même allèle à l’état double (AA ou aa), c’est-à-dire s’il possède une paire d’allèle identiques situés à un locus donné sur une paire de chromosomes homologues

41
Q

Quand est-ce qu’un individu est dit hétérozygote?

A

S’il est porteur de deux allèles différents (Aa), il est hétérozygote pour ce gène

42
Q

Quand est-ce qu’un individu est dit hémizygote pour un gène donné? Donnez un exemple

A

S’il est porteur d’un seul exemplaire de la paire d’allèles
Par exemple, ceci se retrouve chez tous les hommes pour la majorité des gènes présents sur les chromosomes X et Y. Pour les autres paires chromosomiques, ceci ne survient que dans certaines pathologies chromosomiques

43
Q

Définissez codominance

A

Parfois, chacun des deux allèles différents d’une même paire s’exprime de façon complète chez l’hétérozygote

44
Q

Donnez un exemple de codominance

A

Les personnes du groupe sanguin AB, sur les globules rouges desquelles on peut détecter les antigènes A et B, parce que les allèles A et B sont codominants

45
Q

Quelle est le nom des maladies concernant la grande majorité des maladies génétiques?

A

Maladies génétiques résultant d’une mutation génique

46
Q

Qu’est-ce que l’hérédité mendélienne?

A

Les trois lois fondamentales de la génétique de Mendel sont applicables à tout être vivant

47
Q

L’analyse génétique ne se limite pas à la transmission de maladies rares. À quoi s’expend-elle?

A

La transmission de la plupart des traits physiques et mentaux (taille, poids, intelligence, etc.) ne peut pas être expliquée seulement par l’hérédité mendélienne
Les variations rencontrées sont explicables seulement par l’action combinée de plusieurs gènes et du milieu (hérédité multifactorielle) et aussi par l’existence de la polyallélie (plusieurs allèles dans une population)

48
Q

Qu’est-ce que la transmission autosomale récessive ?

A

Malade doit avoir les 2 allèles
Pas de maladie à chaque génération
Le caractère peut apparaitre uniquement dans la fratrie (i.e. les frères et les soeurs d’une personne atteinte); les ascendants et les descendants d’une personne atteinte sont généralement normaux (car ils sont hétérozygotes)
Les parents d’un enfant atteint sont souvent consanguins
Homme et femmes ont autant de chances d’être atteints parce que l’allèle anormal est situé sur un autosome

49
Q

Donnez un exemple de maladie autosomale récessive

A

L’albinisme oculo-cutané type 1
-Définition :
Maladie autosomique récessive rare caractérisée par un défaut de synthèse de la mélanine, le pigment de la peau, des poils et de la rétine
11q14-21
Fréquence : 1/40 000

50
Q

Qu’est-ce qu’une transmission autosomale dominante?

A

Malade dès qu’on a un allèle
Maladie à chaque génération, sauf si sporadique
Le caractère est présent à toutes les générations, sans en sauter une
Chaque individu atteint possède un parent atteint
Les individus normaux ne transmettent pas le caractère à leurs enfants
Le caractère est transmis par une personne atteinte (homme ou femme) à la moitié de ses enfants
Hommes et femmes ont autant de chances d’être atteints parce que l’allèle anormal est situé sur un autosome

51
Q

Donnez 2 exemples de maladies autosomales dominantes

A

1- Le nanisme achondroplasique
Forme héréditaire de nanisme due à une mutation génique qui engendre une croissance et un développement anormal des os longs
La grandeur moyenne à l’âge adulte est de 132 cm pour un homme et 123 cm pour une femme
Hérédité mendélienne dominante autosomique
Locus : 4p16.3
Mutation du gène FGFR3 récepteur du facteur de croissance fibroblastique 3
Sporadique (nouvelle mutation) pour la majorité des cas (78%)

2- Maladie de Marfan : Grands membres

52
Q

Qu’est-ce qu’une mutation liée à l’X?

A

Sauf de très rares exceptions, seuls les hommes sont atteints. Le gène muté s’exprime toujours puisqu’il n’y a pas de locus correspondant sur le chromosome Y (hémizygote)
Les femmes transmettent l’affection sans être atteintes (porteuses car hétérozygotes)
De rares femmes hétérozygotes sont atteintes - rôle de l’inactivation du X
La moitié des garçons sont atteints et la moitié des filles sont porteuses
La majorité des gènes situés sur le chromosome X sont récessifs

53
Q

Donnez un exemple d’une mutation liée à l’X

A

La dystrophie musculaire de Duchenne
Tombe souvent et démarche chancelante
Maladie causée par une mutation du gène de la dystrophine (Xp21.1)
Un tiers des enfants atteints est porteur d’une nouvelle mutation
C’est la plus répandue des myopathies de l’enfant
Pseudo-hypertrophie des mollets et lordose
Difficulté du passage de la position assise à la position debout (signe de Gower)

53
Q

Qu’est-ce que l’hérédité dominante liée au X?

A

Le caractère est présent à toutes les générations
Chaque individu atteint possède un parent atteint
Les individus normaux ne transmettent pas le caractère à leurs enfants
Les femmes transmettent l’affection à la moitié de leurs garçons et à la moitié de leurs filles
Les hommes transmettent l’affection à toutes leurs filles et à aucun de leur garçons. Ceci est la caractéristique qui distingue l’hérédité dominante liée à l’X de l’hérédité dominante autosomique
Il existe très peu d’affections chez l’humain où l’allèle anormal est transmis suivant le mode dominant lié au X

54
Q

Donnez un exemple de maladie dominante liée au X

A

Rachitisme vitamino-résistant
Locus Xp22.1-p22.2
Résistant à la vitamine D
Hypocalcémie et courte taille

55
Q

Qu’est-ce que l’hérédité lié au Y?

A

Em dehors de la détermination du sexe, on ne connait pratiquement pas de caractères anormaux qui, chez l’humain, sont liés au Y
Dans cette transmission, il y a absence de dominance ou de récessivité. Le gène muté s’exprime toujours
Seuls les hommes sont atteints, de père en fils. Aucune fille n’est atteinte

56
Q

Donnez un exemple de maladie lié au Y

A

L’hypertrichose des oreilles

57
Q

Qu’est-ce que l’empreinte parentale?

A

Lorsqu’un gène est soumis à empreinte, une seule des deux copies du gène est active (expression monoallélique). Les maladies rencontrées en pathologie humaine seront la conséquence :
-Soit de la perte d’expression de l’allèle actif
-De l’expression anormale de l’allèle normalement silencieux (“relaxation d’empreinte”). Exemple du syndrome de Beckwith-Wiedemann

Une cinquantaine de gènes soumis à empreinte (phénomène épigénétique : faisant intervenir méthylation de l’ADN et ou acétylation/désacétylation des histones à proximité des gènes)
En fonction de son origine paternelle ou maternelle, le gène s’exprime (différent de la notion autosomique dominant et récessif); agit comme si haploïde
Présence dans les régions flanquantes de ce type de gène d’une boîte d’empreinte qui régule l’expression du gène

58
Q

Qu’est-ce qu’un avantage sélectif?

A

Caractére héréditaire ou acquis secondaire à une mutation. Initialement pour “échapper” au prédateur

59
Q

Donnez un exemple d’avantage sélectif

A

Anomalie monogénique : Hémoglobine S ou Anémie falciforme

Ainsi, le changement d’une seule paire de bases dans la molécule d’ADN entraîne la production d’une hémoglobine anormale :
-Un acide aminé, l’acide glutamique, est remplacé par un autre, la valine: ce qui produit des cellules falciformes
Se rencontre uniquement chez les personnes noires
En Afrique, offre une protection contre la malaria (hétérozygote)

60
Q

Qu’est-ce qu’une anomalie chromosomique?

A

Implique un grand nombre de gènes et produit plusieurs malformations ou malfonctionnements

61
Q

Qu’est-ce que la cytogénétique?

A

La cytogénétique est cette partie de la génétique qui s’occupèrent de l’hérédité au niveau cellulaire et plus particulièrement au niveau des chromosomes
Chaque espèce possède une formule chromosomique caractéristique (le caryotype) par le nombre et la morphologie

62
Q

Que cause les anomalies chromosomiques?

A

Sont une cause majeure d’échec de la reproduction (50% des cas) et d’anomalies congénitales et elles sont extrêmement fréquentes dans les cancers

63
Q

Qu’est-ce que la chromatine?

A

ADN + histone
2 types : Euchromatine et hétérochromatine

64
Q

Qu’est-ce qu’un chromosome?

A

ADN linéaire fortement condensé

65
Q

Qu’est-ce qu’une chromatide?

A

Copie d’un chromosome répliqué, attaché à sa soeur par le centromère (un des deux nucléofilaments qui constituent le chromosome)

66
Q

Qu’est-ce qu’un caryotype?

A

Arrangement des chromosomes homologues ou apparentés, suivant sa taille et sa forme; dans un caryotype les chromosomes sont numérotés d’après une classification internationale

67
Q

Qu’est-ce que le centrosome?

A

Région qui unit les chromatides soeurs

68
Q

Qu’est-ce que le télomère?

A

Extrémité du chromosome

69
Q

Qu’est-ce que la mitose?

A

Phase de division cellulaire en deux cellules filles diploïdes à l’identique

70
Q

Qu’est-ce que l’interphase?

A

Phase du cycle sans division cellulaire

71
Q

Qu’est-ce que la méiose?

A

Division cellulaire en 2 temps aboutissant à 4 cellules filles haploïdes

72
Q

Quelle lettre est associée au bras long du chromosome? Au bras court?

A

Court : p
Long : q

73
Q

Quels sont les 3 conformations de chromosomes?

A

Métacentrique : bras long = bras court
Submétacentrique : bras court plus petit que bras long
Acrocentrique : bras court beaucoup plus petit que bras long

74
Q

Comment appelle-t-on la composition en chromosomes des cellules d’un individu?

A

Constitution chromosomique

75
Q

Comment s’exprime la constitution chromosomique?

A

Par la formule chromosomique qui est constitué par :
-Le nombre de chromosomes (par exemple : 46 ou 47)
-Suivi par les gonosomes (par exemple : XX ou XY)
-L’indication d’une anomalie chromosomique s’il y a lieu (par exemple : +21)

76
Q

Comment fait-on la nomenclature des chromosomes?

A

No du chromosome (17)
Petit ou grand bras (p)
Localisation internationale (13.1)

Donne : 17p13.1

77
Q

Les gamètes ou cellules germinales possède…

A

Un nombre haploïde de chromosomes (23 chromosomes dans l’espèce humaine)

78
Q

Les cellules somatiques, on un nombre…

A

Diploïde de chromosome (46) dont :
-22 paires de chromosomes sont des autosomes et
-Une paire de chromosomes sexuels sont des gonosomes

79
Q

Qu’est-ce que comporte la polyploïdie?

A

L’addition anormale d’un ou de plusieurs compléments haploïdes :
-69 chromsomes - triploïdie
-92 chromsomes - tétraploïdie, etc.

80
Q

Qu’est-ce que l’aneuploïdie?

A

L’aneuploïdie porte sur une seule paire de chromosomes homologues dont le nombre est augmenté ou diminué (anomalie de nombre). Il peut y avoir :
-Une monosomie (un seul chromosome au lieu de deux, ex : 45, X) ou
-Une trisomie (trois chromosomes au lieu d’une paire, ex : 47, XY, +21)
Sauf pour le chromosome X, les monosomies d’un chromosome complet ne sont pas compatibles avec la vie

81
Q

Nommez les types d’anomalies structurales

A

1- Translocation balancée réciproque
2- Translocation fusion centrique Robertsonian
3- Isochromosomes
4- Délétions
5- Inversion paracentrique
6- Inversion péricentrique
7- Chromosome anneau

82
Q

Qu’est-ce qu’un caryotype classique?

A

Une analyse morphologique des chromosomes qui permet leur classement selon un ordre établi par entente internationale
Les 46 chromosomes de l’espèce humaine se répartissent en 23 paires ; 22 paires d’autosomes (de 1 à 22) et 1 paire de chromosomes sexuels, les gonosomes (X et Y)
Les 46 chromosomes ont 23 formes différentes (24 chez l’homme) et chacune des formes se retrouve pour deux chromosomes sauf pour le chromosome Y. Les paires sont placées par ordre de grandeur (les plus grandes d’abord), selon la position des centromères (index centromérique) et selon leur forme
Dans le caryotype : On doit compter les chromosomes pour rechercher les anomalies de nombre et analyser la forme de chaque chromosome afin d’identifier les anomalies de structure

83
Q

Quel est le premier pré-requis à l’analyse cytogénétique carytotypique?

A

D’obtenir des cellules de division

83
Q

Quelles sont les trois grandes catégories de cellules?

A

1- Des cellules en division spontanée et fréquente : Ex : les cellules de la moelle osseuse, les cellules tumorales (les hémopathies, certaines tumeurs solides)
2- Des cellules en division spontanée mais moins fréquente : Ex : Les cellules fibroblastiques (peau), les cellules embryonnaires et les cellules tumorales (les tumeurs solides)
3- Des cellules qui normalement ne se divisent pas dans l’organisme : Ex : Les lymphocytes sanguins. Des substances, comme la phytohémagglutinine (PHA), en stimulent la prolifération in vitro

84
Q

Quelles sont les limites du caryotype?

A

-Résolution : 5 millions de paire de bases (Mb)
-Caractérisation des anomalies est difficile : les bandes de différents chromosomes peuvent se ressembler
-Nécessité d’obtenir des mitoses

85
Q

Nomme 3 types de cytogénétique moléculaire

A

FISH
CGH
SNParray

86
Q

Qu’est-ce que la cytogénétique moléculaire?

A

Elle est de plus en plus utilisé dans les laboratoires de cytogénétique diagnostique
Elle permet de détecter les anomalies chromosomiques de nombre ou de structure dans les cas où l’index mitotique des cellules à étudier est trop faible (par exemple dans les cellules amniotiques) ou lorsque les anomalies elles-mêmes sont infra microscopiques

87
Q

Expliquez l’hybridation in situ fluorescente ou FISH

A

Repose sur les propriétés de dénaturation et renaturation de la molécule d’ADN
Sonde moléculaire (ou petite séquence d’ADN) marquée, qui s’hybride sur la séquence du génome correspondant (séquence complémentaire) soit sur chromosomes d’une mitose (métaphase) ou sur noyaux interphasiques. Lecture et visualtion au microscope à fluorescence de la sonde

88
Q

Quelles sont les types de sondes marquées avec fluorochrome pour le FISH?

A

-Spécifiques de loci : Pour identifier une région très précise du génome, utile pour rechercher remaniements impliquant une région précise : translocation, microdélétions, inversions…
-Peinture : constituée d’un ensemble de petites sondes qui couvrent tout le génome, utile pour les translocations
-Break-apart ou sonde de dysjonction ; utile pour les translocations
-Centromérique : s’hybride au niveau des centromères; utile pour dénombrer des chromosomes

89
Q

Quelles sont les limites de FISH?

A

-Sondes spécifiques - break-apart : étude ciblée
-Peintures : Résolution de 1.5Mb pour détecter des translocations télomériques. Si insertion, ne peuvent déterminer quelle est la région chromosomique impliquée

90
Q

Qu’est-ce que l’hybridation génomique comparative sur métaphase?

A

Étude du contenu global de l’ADN
Comparaison du nombre de molécules d’ADN (nombre de copie-CNV) d’un patient par rapport à un témoin avec établissement d’un ratio ou rapport entre les deux
Le ratio d’intensité a une valeur théorique de 1 si nombre identique de molécules
Valeur de 0.5 si délétion (perte) ou de 1.5 si gain (trisomie)

91
Q

Expliquez l’hybridation génomique comparative sur réseau d’ADN-CGH array

A

Technique de CGH sur des lames où sont fixés des fragments d’ADN/fréquences génomiques ou sondes
La résolution de la puce dépend du nombre et de la localisation des sondes

92
Q

Quelles sont les limites du CGH?

A

-Mutations géniques
-Ne détecte pas les anomalies équilibrées comme les translocations ou inversions équilibrées
-Ne détecte pas les anomalies déséquilibrées présentes dans moins de 10-20% des cellules (exemple : mosaïque faible)

93
Q

Expliquez le SNP array (puces à SNPs)

A

Fixation sur la lame d’oligonucléotides (ou sonde) contenant un polymorphisme portant sur une seule paire de base
Avantage : permet de détecter des disomies uniparentales (ou perte d’hétérozygotie avec duplication de l’allèle restant)
Donne la variation du nombre de copies et le profil allélique

94
Q

Quand faire de la cytogénétique?

A

1- Conseil génétique et le diagnostic prénatal : pour les parents porteurs d’une translocation équilibrée, pour des parents ayant déjà eu un enfant anormal ou ayant un enfant anormal dans la famille, mère âgée, etc.
2- Retards mentaux familiaux : recherche d’anomalies fines chez les parents et les enfants
3- Problèmes d’avortements répétés : recherche d’anomalies chromosomiques dans les produits d’avortement (50% de ceux-ci sont dus à une anomalie chromosomique)
4- Problèmes d’infertilité : recherche d’anomalies impliquant les chromosomes sexuels. Par exemple : une formule chromosomique à 47, XXY ou une formule à 45, X, etc.

95
Q

Par quoi les cancers sont-ils caractérisés au niveau chromosomique?

A

Par l’apparition d’anomalies chromosomiques spécifiques

96
Q

L’analyse chromosomique dans les cancers aide à quoi?

A

-La confirmation du diagnostic
-La classification du type de la tumeur
-Le pronostic
-L’orientation de la thérapie

97
Q

Quelles sont les applications cliniques des différentes techniques de cytogénétique?

A

Caryotype : très utilisé mais…
FISH : complément du caryotype pour détecter des microdélétions avec pertes de fragments entre 500 000 et 4 Mb
-Anomalies constituonnelles : Exemple syndrome de DiGeroge, délétion de 3 Mb en 22q11.2
-Translocations en oncologie -> Gènes de fusion
-Caractérisation d’une anomalie détectée sur le caryotype classique
-Détection de translocations téléfériques critiques où les chromosomes dérivés ressemblent aux chromosomes normaux en bande sur le caryotype

98
Q

Quelles sont les particularités du FISH interphasique?

A

-Pas besoin de culture cellulaire, signaux mis en évidence sur les noyaux
-Diagnostic des trisomies 13, 18 et 21 sur amniocytes des ponctions de liquide amniotiques
-Translocations en oncologie sur empreintes et/ou sur coupes tissulaires

99
Q

Pourquoi utiliser CGH array en cytogénétique?

A

Pour les pathologies acquises, en onco par exemple : souvent pas de première intention
Technique de référence pour les anomalies constitutionnelles de type déséquilibres génomiques

100
Q

Donnez 3 exemples de maladies aneuploïdes

A

La trisomie 21
Le syndrome de Turner
Le syndrome de Klinefelter

101
Q

Expliquez la trisomie 21

A

47, XX, +21 ou 47, XY, +21
1/350 grossesse, 1/800 naissances aux US
Incidence augmente avec l’âge maternelle
Fentes palpébrales obliques en haut et en dehors (mongoloïdes)
Grosse langue
Pli palmaire médian unique
Hypotonie générale (diminution de tonus musculaire)
Retard de développement physique et mental
Malformation cardiaques fréquentes

102
Q

Expliquez le syndrome de Turner

A

45, X
1/2500 naissances
Phénotype féminin
Quotient intellectuel normal ou légèrement abaissé
Taille plus petite que la moyenne
Faible développement des caractères sexuels secondaires
Infertilité
Autres signes : cou palmé, raccourcissement du 4e métacarpien, etc.
Coarctation de l’aorte

103
Q

Expliquez le syndrome de Klinefleter

A

47, XXY
1/500 garçons
Phénotype masculin
Grande taille
Développement au dessous de la moyenne des caractères sexuels secondaires (barbe, musculature, etc.)
Gynécomastie (variable)
Hypogonadisme plus ou moins marqué, testicules toujours petits en absence de lignée germinale ->Infertilité
Chez les personnes présentant une formule en mosaïque incluant la formule normale, il peut y avoir prolifération germinale discrète

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