GÉNÉTIQUE MÉDICALE (2H) Flashcards
Quelles sont les 2 grandes catégories de pathologies de l’hérédité? Comment sont-elles identifiées?
- Anomalie due à une mutation génique: Identifiée par la biochimie et la biologie moléculaire, souvent suspectée à l’histologie (ex: maladies de surcharge)
- Anomalie morphologiquement visible : identifiée par la cytogénétique (anomalie sur tout le chromosome)
Que veut dire SNPs?
single nucleotide polymorphism
V ou F? Un gène égal nécessairement un caractère phénotypique.
Faux, il y a des interactions des gènes-gènes et gènes-milieu qui peuvent modifier le phénotype qui aurait dû être exprimé à partir d’un tel gène
V ou F? On a toujours un seul allèle pour un gène donné.
Faux, une paire d’allèles
locus
endroit occupé physiquement par un gène
Qu’est-ce qu’un allèle?
L’une ou l’autre forme d’un gène occupant un locus défini sur une paire chromosomique déterminée
Qu’est-ce que la polyallélie?
Pour une fonction génique, il peut y avoir plusieurs allèles dans une population
Qu’est-ce qu’un syndrome?
Condition clinique dans laquelle on peut reconnaître un nombre important de modifications phénotypiques constantes chez plusieurs individus
V ou F? Une personne porteuse d’un gène anormal peut être phénotypiquement normale pendant une bonne partie de sa vie
vrai
V ou F? Le phénotype est une indication fidèle du génotype.
faux
Qu’est-ce que le pléiotropisme?
Un même gène qui a plusieurs effets
Qu’est-ce que l’hétérogénéité génique?
Plusieurs gènes ont le même effet
Qu’est-ce qu’une maladie congénitale?
Maladie présente à la naissance
V ou F? Une maladie congénitale est toujours héréditaire.
faux
V ou F? Une maladie héréditaire peut ne pas être congénitale.
vrai
Le syndrome d’alcoolisation foetale est-il congénitale ou non? Héréditaire ou non?
Congénitale non héréditaire
Comment fait-on pour distinguer les effets du milieu des effets de l’hérédité?
Comparaison de jumeaux identiques
L’euchromatine est _________ (+ ou -) condensée et contient les gènes __________ (transcrits ou non transcrits)
-
Transcrits
_______________ (hétérochromatine ou euchromatine) contient peu de gènes (télomères et centromères)
Hétérochromatine, car très condensée
Quels sont les deux mécanismes de modifications des nucléosomes, et leurs conséquence?
1) Complexe de remodelage : change conformation nucléosome, ce qui condense ou décondense ADN, la rendant plus ou moins accessible
2) Modifications chimiques ou épigénétiques des histones :
- Acétylation : ajout acyle, augmente accessibilité des gènes
- Méthylation : ajout méthyle, diminue accessibilité des gènes
La réplication de l’ADN se fait de _______ vers _________
5’ vers 3’
Quel phénomène se produit-il entre l’ARN prémessager et messager?
épissage (maturation)
Nommer les 4 mutations géniques vues en classe
insertion ou délétion d’un multiple de 3 nucléotides
insertion ou délétion d’un non multiple de 3 nucléotides
mutation stop
substitution
conséquence de l’insertion ou délétion d’un multiple de 3 nucléotides
mutation ponctuelle, respect cadre de lecture, protéine non tronquée, perte/gain de fonction
conséquence de l’insertion ou délétion d’un non multiple de 3 nucléotides
mutation frameshift, décalage du cadre de lecture, protéine tronquée, perte/gain de fonction
conséquence mutation stop
insertion d’un codon stop, protéine tronquée, perte de fonction
conséquence substitution
mutation faux-sens, remplacement nucléotide par un autre, respect cadre lecture, perte/gain de fonction. modification du repliement de la protection
V ou F? Dans une mutation faux-sens, il n’y a pas respect du cadre de lecture.
Faux, respect du cadre de lecture
Qu’est-ce qu’une mutation faux-sens?
On change un nucléotide et ça change 1 a.a.
Quelles sont les 5 choses qui peuvent être touchées par une mutation génique?
- Régulation du gène
- Séquence
- Arrêt de la traduction
- Maturation de l’ARNm
- Changement d’un a.a.
Quelles sont les conséquences d’une mutation génique dans la régulation du gène?
La protéine est soit surexprimée, soit sous-exprimée
Quelles sont les conséquences d’une mutation sur la séquence d’un gène?
La protéine est soit surexprimée, soit sous-exprimée
Peut affecter sa fonction (gain ou perte de fonction)
Quelles sont les conséquences d’un arrêt de la traduction?
Protéine tronquée dont la fonction va être affectée (gain ou perte)
Quelles sont les conséquences d’une mutation génique qui va affecter la maturation de l’ARNm?
Protéine tronquée dont la fonction va être affectée (gain ou perte)
Quelles sont les conséquences d’une mutation génique qui va induire le changement d’un a.a.?
gain ou perte de fonction
Quelles sont les conséquences d’une mutation qui va activer un gène?
Surexpression
Gain de fonction
Quelles sont les conséquences possibles d’une mutation qui va inactiver un gène?
Perte d’expression
Baisse d’expression
Perte de fonction
Décrire brièvement les deux exemples de maladies enzymatiques découlant de mutations
1) Maladies de surcharge : lorsque gène pour enzyme muté, substrat de cette enzyme s’accumule et surcharge cytoplasme (gonfle cellules)
2) Maladies d’anti-enzymes : lorsque gène contrant une enzyme est muté, produit de l’enzyme antagoniste s’accumule, comme maladie surcharge
Quels sont les problèmes liés à un déficit en alpha1-antitrypsine?
Accumulation d’alpha1-antitrypsine dans le RE des hépatocytes et églament problèmes pulmonaire dus à la dégradation des alvéoles par une protéase. Normalement l’alpha1-antitrypsine va inhiber cette protéase, mais là elle est prise dans le RE des hépatocytes
Qu’est-ce qu’une amylose?
Accumulation de protéines insolubles dans un tissu
Quelles sont les conséquences de mutations dans les protéines de signalisation?
Cancer
Malformations
Donner un exemple de canalopathie. À quoi est-elle due?
Fibrose kystique du pancréas
Due au mauvais repliement d’une protéine
Quand est-ce normal pour un humain d’être hémizygote?
Chez tous les hommes pour la majorité des gènes présents sur les chromosomes X et Y.
Qu’est-ce que la codominance?
Chacun des deux allèles d’une paire s’exprime comme un dominant lorsque présent, on a donc une sorte de coexpression.
Comment différencier rapidement les maladies autosomales dominante et récessive sur un pedigree?
Dominante saute pas de génération, au moins une personne par génération l’a, tandis que récessive contraire.
Vrai/Faux : une maladie récessive liée au chromosome X sera transmise par une mère porteuse (Aa) à tous ses enfants, qui seront tous atteints.
Faux, seuls les garçons seront atteints, vu que filles sont slm porteuses (Aa) de la maladie récessive
Dans quel contexte une maladie autosomique récessive se développe-t-elle souvent?
Consanguinité
Les hommes et les femmes ont autant de chance d’être atteints d’une maladie lorsque celle-ci est située sur ________
Un autosome
Qu’est-ce qu’une mutation sporadique?
Mutation pas héréditaire, nouvelle mutation
Qu’est-ce que le nanisme achondroplasique? Quel type de maladie héréditaire?
Forme héréditaire de nanisme due à une mutation génique qui engendre une croissance et un développement anormal des os longs.
Maladie autosomique dominante
Qu’est-ce que l’albinisme oculo-cutané de type 1?
Maladie autosomique récessive rare caractérisée par un défaut de synthèse de la mélanine, le pigment de la peau, des poils et de la rétine
Dans quel type d’hérédité est-ce que le caractère est transmis par une personne atteinte (homme ou femme) à la moitié de ses enfants?
Dominante autosomique
Qu’est-ce que la maladie de Marfan? Quel type d’hérédité?
Personnes très grandes
Dominante autosomique
Dans quel type d’hérédité est-ce que seuls les hommes sont atteints (sauf quelques exceptions)?
Récessive liée à l’X
Dans quel type d’hérédité est-ce que seuls les femmes transmettent l’affection sans être atteintes?
Récessive liée à l’X
À quel type d’hérédité répond la dystrophie musculaire de Duchenne?
Récessive liée à l’X
Dans quel type d’hérédité est-ce que les femmes transmettent la maladie à leurs fils et à la moitié de leurs filles?
Dominante liée à l’X
Dans quel type d’hérédité est-ce que seuls les hommes sont atteints, de père en fils?
Hérédité liée à l’Y
Dans quel type d’hérédité est-ce qu’il n’y a aucune récessivité ni dominance?
Hérédité liée à l’Y
Dans quel type d’hérédité est-ce que les hommes transmettent la maladie à toutes leurs filles , mais à aucun de leur garçon?
Dominante liée à l’X
Qu’est-ce que l’empreinte parentale?
Activation sélective à la naissance d’un seul allèle du gène de l’enfant et inactivation de l’autre (expression monoallélique)
L’empreinte parentale est un phénomène ________________
épigénétique
Combien de gènes sont soumis à l’empreinte?
50
En fonction de son origine paternelle ou maternelle, le gène s’exprime agit comme si haploïde ou diploïde ?
haploïde
Qu’est-ce qui est impliqué dans une anomalie chromosomique? Quelles sont les conséquences générales?
Implique un grand nombre de gènes
Produit plusieurs malformations ou malfonctionnements
Vrai/Faux : la cytogénétique ne s’intéresse qu’aux chromosomes
Faux, aux cellules aussi
Définir caryotype
Arrangement des chromosomes homologue d’un individu selon leur taille et leur forme
Quelle est la cause de 50% des échecs de reproduction?
Anomalies chromosomiques
Quels sont les 3 types de chromosomes selon la position de leur centromère?
Métacentrique
Submétacentrique
Acrocentrique
formule chromosomique
nb de chromosome (46)
gonosome (XX ou XY)
anomalie de chromosome s’il y a lieu (+21)
Quelles sont les règles de la nomenclature des chromosomes?
Bande “Numéro du chromosome”“p ou q”“localisation internationale”
Qu’est-ce que l’aneuploïdie?
+/- 1 chromosome
Quelle est la seule situation où la monosomie d’un chromosome complet est viable?
Lorsqu’on enlève un X
Quelles sont les différentes anomalies structurales des chromosomes? (5) Décrire.
Translocation : Les chromosomes s’échangent des bouts
Isochromosomes: Séparation des bouts d’en haut des bouts d’en bas au niveau du centromère
Délétions : Perte de bouts de chromosomes
Inversions: On switch l’ordre des petits bouts de chromosomes
Formation de chromosomes circulaires: On perd des bouts de chromosomes au bout des chromosomes et les bouts restant s’accrochent ensemble pour faire un cercle
Dans un caryotype, les chromosomes sont placés selon ________________, selon _____________ et selon _______________
Leur grandeur
La position de leur centromère
Leur forme
Vrai/Faux : pour faire une analyse caryotypique, il faut absolument une cellule en division, expliquer
Vrai, pcq sinon on observe pas les chromosomes en paires
Quelles sont les 3 désavantages/limites des caryotypes?
- Résolution: pas vrm bonne
- Pas facile de caractériser les anomalies
- Nécessité d’obtenir des mitoses
Quand la cytogénétique moléculaire est-elle particulièrement pratique?
Permet de détecter les anomalies chromosomiques de nombre et de structure
Expliquer le principe de la technique FISH, ses utilisations (4) et ses limites (1)
Sonde moléculaire fluorescente s’hybride spécifiquement sur séquence complémentaire d’ADN génomique. Elle peut ensuite être observée au microscope.
Peuvent être :
- Spécifique de loci : identifier une région précise génome (utile trouver remaniements d’une région précise: translocations, microdélétions, inversions…)
- Peinture : ensemble de petites sondes qui couvrent tout génome (utile pour les translocations)
- Break-apart ou sonde de dysjonction (utile pour les translocations)
- Centromérique : s’hybride aux centromères (utile pour dénombrer chromosomes)
Limites :
- Peut pas déterminer région impliquée si insertion
En quoi consiste l’hybridation génomique comparative sur métaphase?
comparaison du nombre de molécules
d’ADN d’un patient par rapport à un
témoin avec établissement d’un ratio ou
rapport entre les deux.
En quoi consiste l’hybridation génomique
comparative sur réseau d’ADN-CGH array? Quelles sont les limites de cette technique?
Technique de CGH sur des lames où sont fixés des fragments d’ADN/séquences génomiques ou sondes.
Limites:
- voit pas Mutations géniques
- Ne détecte pas les translocations ou inversions équilibrées.
- Ne détecte pas les anomalies déséquilibrées présentes dans moins de 10-20% des cellules
Quand doit-on faire de la cytogénétique (4)?
Conseil génétique et diagnostic pré-natal
- Retards mentaux famillaux
- Problèmes d’avortement répétés
- Problèmes d’infertilité
Donner des applications cliniques des du FISH et CGH-array
FISH :
- Anomalies constitutionnelles
- Translocations pathologiques (en oncologie, télomériques cryptiques, etc.)
- Diagnostic trisomies
CGH-array :
- Pathologies acquises (oncologie)
- Référence pour déséquilibres génomiques
Décrire la trisomie 21 (formule chromosomique et symptômes)
47, XX, +21 ou 47, XY, +21
Symptômes :
- Grosse langue
- Fente palpébrale (espace entre paupière supérieure et œil) élargie
- Hypotonie musculaire générale
- Retards de développement mentaux et physiques
- Malformations cardiaques
Décrire la trisomie 18, ou syndrome d’Edwards (formule chromosomique et symptômes)
47, XX, +18 ou 47, XY, +18
Symptômes :
- Petit poids de naissance
- Retard mental.
- Hypertonicité
- Microrétrognathisme (dysmorphie crânio-faciale)
- Mains botes
- Omphalocèle (défaut de fermeture de cavité abdominale)
- Mort précoce majorité des cas
Décrire le syndrome de Turner (formule chromosomique et symptômes)
45, X
Symptômes : - Phénotype féminin - Taille plus petite que la moyenne. - Faible développement des caractères sexuels secondaires - Infertilité.
Décrire le syndrome de Klinefelter (formule chromosomique et symptômes)
47, XXY
Symptômes :
- Phénotype masculin
- Grande taille
- Sous-développement caractères sexuels secondaires
- Gynécomastie (seins chez les hommes) .
- Hypogonadisme (testicules toujours petits et absence de lignée germinale)
- Infertilité.
