GA UA2 : Le microbe et l'homme Flashcards
Que veut dire le terme «Flore normale»?
La flore normale sont les micro-organismes (surtout bactéries et parfois les levures) qui peuvent être présents normalement au niveau d’un site anatomique sans causer de maladie chez l’humain en bonne santé.
Caractérisez la relation biologique entre la flore normale et l’hôte?
Nommer aussi les deux types de relations possibles entre l’hôte et le mo.
Flore normale ne cause pas de détriment à l’hôte.
Il peut y avoir une relation «neutre» où le microorganisme profite de l’environnement sans toutefois bénéficier l’hôte. Ce sont des microorganismes commensaux.
Il peut y avoir une relation en symbiose où le micro-organisme profite à l’hôte
Est-ce que les souches bactériennes de la flore normale d’une personne peuvent changer dans un court laps de temps (< 1 an)?
Oui. Les micro-organismes peuvent être en transition ou des résidents permanents.
Est-ce que la flore normale change de nature au cours d’une vie d’une personne?
Oui elle change. L’environnement d’une personne change au fil des années. Certains micro-organismes sont mieux adaptés à l’environnement de l’enfance que chez les adultes
Associez les bactéries et levures suivantes avec le site anatomique et indiquez la relation (pathogène ou flore normale à faible virulence).
Staphylococcus aureus Candida spp. Peptostreptoccus spp. Streptococcus spp. Pseudomonas spp. Enterococcus spp.
Quelles sont reliées aux : voies respiratoires supérieures
Peptostreptococcus spp. (flore normale à faible virulence)
Staphylococcus aureus (flore normale potentiellement pathogène)
Streptococcus spp.(flore normale ou pathogène si S. pneumoniae ou streptocoques du groupe A)
Candida spp. (pathogène)
Pseudomonas spp. (pathogène rarement faisant partie de la flore normale)
Associez les bactéries et levures suivantes avec le site anatomique et indiquez la relation (pathogène ou flore normale à faible virulence).
Staphylococcus aureus Candida spp. Peptostreptoccus spp. Streptococcus spp. Pseudomonas spp. Enterococcus spp.
Quelles sont reliées au : TGI
Enterococcus spp.(flore normale)
Peptostreptococcus spp. (flore normale)
Streptococcus spp.(flore normale)
Pseudomonas spp. (pathogène)
E. coli (pathogène)
Clostridium sp.(pathogène)
La nombre et la diversité des micro-organismes dans le tractus gastro-intestinale augmente à mesure que l’on s’approche du colon.
Associez les bactéries et levures suivantes avec le site anatomique et indiquez la relation (pathogène ou flore normale à faible virulence).
Staphylococcus aureus Candida spp. Peptostreptoccus spp. Streptococcus spp. Pseudomonas spp. Enterococcus spp.
Quelles sont reliées au : Sang
Toutes les bactéries sont immédiatement soupçonnées comme pathogéniques si retrouvées dans le sang.
On retrouve plus fréquemment les suivants:
Staphylococcus aureus
Candida spp.
Pseudomonas spp.
Enterococcus spp
Associez les bactéries et levures suivantes avec le site anatomique et indiquez la relation (pathogène ou flore normale à faible virulence).
Staphylococcus aureus Candida spp. Peptostreptoccus spp. Streptococcus spp. Pseudomonas spp. Enterococcus spp.
Quelles sont reliées au : Tractus génito-urinaire
Site généralement stérile.La présence de croissance n’indique pas nécessairement une infection.
Candida spp. (pathogène ou colonisateur),
Enterococcus spp. (considéré généralement comme contamination)
Staphylococcus aureus (pathogène)
Associez les bactéries et levures suivantes avec le site anatomique et indiquez la relation (pathogène ou flore normale à faible virulence).
Staphylococcus aureus Candida spp. Peptostreptoccus spp. Streptococcus spp. Pseudomonas spp. Enterococcus spp.
Quelles sont reliées au : Peau
Staphylococcus aureus (pathogène)
Streptococcus spp. (pathogène)
Candida spp. (pathogène)
Est-ce que les micro-organismes de la flore normale peuvent causer la maladie?
Oui. La translocation du micro-organisme à partir d’un site normalement colonisé à un autre site peut mener à une infection.
La translocation à travers la barrière peut se faire de différentes façons (trauma et pénétration, atteinte de la barrière naturelle, progression de la colonisation, etc.)
Nommez les effets positifs de la flore normale.
Développement de la compétence immunologique
Protection contre l’envahissement pathogène de micro-organismes par compétition au site
Digestion et production d’éléments nutritionnels.
Chez l’homme, la production de vitamine K par les bactéries au niveau gastro-intestinale est une source significative. Ceci sera un enjeu important pour l’interaction entre les antibiotiques et la warfarine (un antagoniste de la vitamine K).
Énumérez les étapes pour qu’une infection se produise.
Énumérez les attributs de la pathogénèse microbienne.
a) Transition de l’environnement extérieur à un environnement favorable à l’infection. Passage à travers les barrières et mécanismes de protection de l’hôte.
Évasion du système immunitaire.
b) Processus d’envahissement, de destruction tissulaire, et de réplication au site d’infection.
c) Transmission du premier hôte à un autre hôte
d) Processus de résolution de l’infection pour le premier hôte
Énumérez les attributs de la pathogénèse microbienne.
Entrée (passage des barrières), adhérence (au site de survie, s’établir), survie (acquérir des nutriments, éviter le système immunitaire), multiplication, dissémination (au sein de l’hôte, et d’un hôte à un autre)
Définissez :
- Pathogène commensal
- Pathogène opportuniste
- Pathogène primaire
- Pathogène commensal
Le micro-organisme commensal pathogène cause la maladie seulement si une ou des barrières à l’invasion sont atteintes.
- Pathogène opportuniste
Lorsqu’il y a une infection, le pathogène commensal est nommé pathogène opportuniste.
- Pathogène primaire
Caractéristiques qui lui permettent de surmonter les barrières et causer la maladie chez une personne saine.(comparativement au pathogène commensal qui nécessite par exemple une plaie dans la peau pour accéder au sang et causer une infection)
Différencier le mot «pathogène» du mot «virulence».
La virulence fait plutôt référence à une mesure quantitative du dégrée de l’infection.
Comment détermine-t-on qu’un micro-organisme est pathogène.
La détermination de pathogène se fait au niveau moléculaire et génétique.
Énumérez des barrières naturelles de l’humain qui empêchent l’entré de micro-organismes.
Barrière mécanique, épithélium cilié, compétition de la flore normale, mucus, sécrétion d’IgA, follicules lymphoïde, l’évacuation de fluides, péristaltisme, etc.
Est-ce que les micro-organismes peuvent se lier aux surfaces des appareils médicaux?
Oui. Les micro-organismes peuvent adhérer aux surfaces sur les appareils médicaux. Ces propriétés leur permettent de produire des infections persistantes difficiles à traiter.
Quels micro-organismes vont se cacher dans les cellules eucaryotes?
Nommer une bactérie intracellulaire obligatoire.
Nommer des bactéries (4) qui peuvent survivre à l’intérieur ou à l’extérieur des cellules.
Quels micro-organismes vont se cacher dans les cellules eucaryotes?
Les virus et certaines bactéries vont entrer dans les cellules eucaryotes pour ‘éviter’ le système immunitaire.
Nommer une bactérie intracellulaire obligatoire.
Chlamydia
Nommer des bactéries (4) qui peuvent survivre à l’intérieur ou à l’extérieur des cellules.
Salmonella, Shigella, Legionella, Mycobacterium
Quels sont les signes et symptômes de l’inflammation?
Œdème, rougeur, chaleur, douleur.
Nommez les deux médiateurs principaux de la fièvre.
Interleukine 1 (IL-1) et facteur de nécrose tumorale alpha (TNF-α)
Est-ce que le processus inflammatoire peut endommager les tissus? Si oui, par quel processus?
Oui.
Les cellules polymorphonucléaires (granulocytes) peuvent endommager les tissus par le relâchement d’enzymes (collagenase, elastase).
La résistance au système inflammatoire mène à l’accumulation des ___ et d’une progression du processus.
Ultimement, ceci mène à la formation d’un ___.
Notez que ce phénomène ne s’applique pas aux micro-organismes qui _____. Ces dernières ne stimulent pas le système inflammatoire.
La résistance au système inflammatoire mène à l’accumulation des cellules inflammatoires et d’une progression du processus.
Ultimement, ce mène à la formation d’un granulome (tumeur inflammatoire).
Notez que ce phénomène de granulome ne s’applique pas aux micro-organismes qui «évitent» les défenses inflammatoires. Ces dernières ne stimulent pas le système inflammatoire et donc la résultante de granulome n’apparait pas
Définissez le mot exotoxine
Une exotoxine est une toxine produite par un micro-organisme et secrété dans l’environnement pour causer la destruction tissulaire.
Nommez trois méthodes que les micro-organismes ont développées pour éviter le système immunitaire.
Résistance au processus du complément, activité anti-phagocytaire, altération de la fonction phagocytaire, variation antigénique.
L’absence de croissance présente plusieurs possibilités: ____
Sachez que l’absence de croissance sur des échantillons ou prélèvements de sites stériles sont ____ de l’absence de bactéries.
L’absence de croissance présente plusieurs possibilités: qu’il y ait réellement absence de bactéries, que l’échantillonnage a été mal effectué, que la croissance en laboratoire a été problématique, etc.
Dans cette situation, seulement les indicateurs du patient (la clinique) sont disponibles pour guider le traitement.
Sachez que l’absence de croissance sur des échantillons ou prélèvements de sites stériles sont confirmatoires de l’absence de bactéries.
En sommaire, il faut interpréter les résultats de cultures selon le ___ et selon le ___
En sommaire, il faut interpréter les résultats de cultures selon le site de prélèvement et selon le contexte clinique du patient.
Présence de micro-organismes au niveau d’un site corporel, mais ne causant pas d’infection
Colonisation
Échantillon prélevé d’un site corporel pour analyse ou culture
Specimen
Technique de biologie moléculaire d’amplification génique
PCR
Introduction de micro-organismes exogènes durant la collecte du spécimen ou suite à manipulations
Contamination
Test de diffusion sur agar pour déterminer la sensibilité des micro-organismes
Antibiogramme
Définissez le E-Test
Avec ce dernier (le E-Test), l’inhibition de la croissance bactérienne se traduit par une ellipse d’inhibition dont les points d’intersection avec la bandelette définissent la CMI
Technique effectuée sur le sérum pour déterminer la présence d’antigènes ou d’anticorps dirigés contre un micro-organisme
Sérologie
Effet provoquant une activité réduite au test de diffusion sur agar lorsque le nombre de bactéries est très important
Inoculum
Essentielles au diagnostic bactériologique, elles consistent à la croissance de micro-organismes sur un milieu approprié.
Culture
Placez en ordre la séquence des tests suivants lorsque l’on veut identifier un micro-organisme responsable d’une infection compliquée chez un patient.
- Coloration gram
- Antibiogramme
- Tests de suivi
- Fin de la thérapie antibiotique
- Analyse microscopique
- Obtention des spécimens
- Traitement antibiotique empirique
- Analyse macroscopique- Bandelettes urinaires (leucocytes- nitrites) pour spécimen urinaire
- Cultures
- Réajustement de la thérapie au besoin
Obtention des spécimens => Traitement antibiotique empirique => Analyse macroscopique / bandelettes urinaires => Coloration gram => Analyse microscopique => Cultures => Antibiogramme => Réajustement de la thérapie PRN => Fin de la thérapie médicamenteuse => Test de suivi
Lorsque l’on veut identifier un mo :
La coloration gram prend ___(y temps) a effectuer. Elle peut s’effectuer sur des échantillons ___(délais) suivant la prise du spécimen si les bactéries peuvent être isolées.
Sinon, il faudrait attendre la croissance sur culture qui prend généralement au moins ___(z temps).
La coloration gram prend 10 minutes a effectuer. Elle peut s’effectuer sur des échantillons immédiatement suivant la prise du spécimen si les bactéries peuvent être isolées.
Sinon, il faudrait attendre la croissance sur culture qui prend généralement au moins 24 heures.
Quand peut-on réajuster la thérapie par rapport aux tests?
Ainsi, le réajustement de la thérapie peut se produire après les résultats de la coloration gram, l’analyse macroscopique ou l’analyse d’urine si le traitement empirique est inadéquat. De même l’arrêt de la thérapie peut se produire après les résultats de culture si ces derniers sont négatifs.
Associe les acronymes suivants avec les énoncés ci-dessous:
CMI- CMB- ELISA- PCR
Outil de recherche clinique pour déterminer l’activité in vitro des nouveaux antimicrobiens
CMI
Associe les acronymes suivants avec les énoncés ci-dessous:
CMI- CMB- ELISA- PCR
Test diagnostic consistant à rendre décelable, et de ce fait analysable, l’ADN présent à l’état de trace
PCR
Associe les acronymes suivants avec les énoncés ci-dessous:
CMI- CMB- ELISA- PCR
Test sérologique utilisant une technique immuno-enzymatique
ELISA
Associe les acronymes suivants avec les énoncés ci-dessous:
CMI- CMB- ELISA- PCR
Concentration minimale de l’antibiotique pouvant produire une destruction complète du MO testé
CMB
Décrivez le processus pour obtenir (isoler) une bactérie à partir d’un échantillon clinique?
Nommez le nom du milieu de culture
décrivez le processus pour isoler une bactérie sur le milieu de culture
décrivez le principe fondamental qui est appliqué dans ce processus.
- Nommez le nom du milieu de culture :
Le milieu de culture se nomme ‘agar’.
- Décrivez le processus pour isoler une bactérie sur le milieu de culture :
Le milieu de culture offre un support solide, sur lequel repose l’échantillon pour croissance. À partir d’un échantillon clinique, utilisant une technique précise, il est possible de répandre l’échantillon suffisamment pour obtenir des colonies indépendantes en croissance (donc sans se toucher). Ces colonies indépendantes peuvent ensuite être testés pour identification de la bactérie, et pour déterminer la susceptibilité aux antibiotiques.
- Décrivez le principe fondamental qui est appliqué dans ce processus :
Le processus d’isoler une bactérie repose sur le principe qu’une colonie indépendante est issue d’une seule bactérie.
Pour déterminer si la culture est cliniquement significative et si les micro-organismes isolés sont responsables de l’infection, le clinicien doit interpréter les résultats en fonction de 4 différents paramètres.
Nommez ces paramètres
Condition clinique du patient
Site de culture
Méthode de prélèvement
Type et quantité de micro-organismes isolés
Quelle est la pertinence des tests suivants chez la personne âgée: Culture et analyse d’urine
À effectuer seulement chez les patients ___. Investigation urinaire n’est pas indiquée si ___
- Résultats positifs: Pas très utile pour di___. Si porteur de sonde: positif chez ___% des patients
- Résultats négatifs: Utile pour ___
À effectuer seulement chez les patients AVEC symptômes urinaires ou état fébrile. Investigation urinaire n’est pas indiquée si symptômes non spécifiques
- Résultats positifs: Pas très utile pour différencier une vraie infection d’une bactériurie asymptomatique. Si porteur de sonde: positif chez 100% des patients
- Résultats négatifs: Utile pour éliminer cette source d’infection
Quelle est la pertinence des tests suivants chez la personne âgée: Culture d’expectorations (tousser et cracher dans le pot)?
Pertinence controversée, test pas très fiable car difficulté d’obtenir ___.
Haut taux de__ et ___ de l’échantillon (par ___) dans 50% des cas
Peut être utile lorsqu’ ____ est diagnostiquée
Pertinence controversée, test pas très fiable car difficulté d’obtenir échantillon de qualité; haut taux de colonisation et contamination de l’échantillon (par la salive ou autre) dans 50% des cas
Peut être utile lorsqu’une pneumonie est diagnostiquée
Quelle est la pertinence des tests suivants chez la personne âgée: Hémocultures
Utile pour _____ est soupçonnée (ex: présence d’un cathéter veineux, plaie infectée, pneumonie)
Utile pour confirmer le diagnostic bactériologique lorsqu’une bactériémie (bactérie dans le sang) est soupçonnée (ex: présence d’un cathéter veineux, plaie infectée, pneumonie)
Quelle est la pertinence des tests suivants chez la personne âgée: Recherche to toxines de Clostridium difficile
Confirme le diagnostic. À effectuer si ____
Une culture de selles pour recherche d’entéropathogènes serait utile seulement si ______ en l’absence de prise d’antibiotiques
Confirme le diagnostic. À effectuer si diarrhée et prise récente d’antibiotiques
Une culture de selles pour recherche d’entéropathogènes serait utile seulement si fièvre élevée, crampes ou diarrhée sanglante en l’absence de prise d’antibiotiques
Enzyme produite par les bactéries et transmise par des chromosomes ou des plasmides
Blactamase
État d’un micro-organisme dont la CMI est supérieure à la concentration sérique obtenue pour un antibiotique donné
Résistant
Bactérie à gram positif résistante
SARM
Mécanisme de transfert de gènes dont le vecteur est un virus bactérien appelé bactériophage
Transduction
Mécanisme de résistance aux antibiotiques chez environ 10-20% des bactéries
Mutation
Leur mutation jouerait un rôle important dans l’émergence d’une résistance par réduction de perméabilité cellulaire
Porine
Bacille à gram négatif sécrétant parfois des β–lactamases à spectre étendu (ESBL)
E. coli
Il est, en effet, actuellement reconnu que l’utilisation d’un antibiotique ou d’une classe d’antibiotiques au cours des ___ derniers mois, est la cause de la progression de la résistance bactérienne à cet antibiotique.
. Il est, en effet, actuellement reconnu que l’utilisation d’un antibiotique ou d’une classe d’antibiotiques au cours des 3 derniers mois, est la cause de la progression de la résistance bactérienne à cet antibiotique.
Quels sont les cinq (5) étapes principales de la sélection de l’antibiothérapie?
a. Évaluation du patient
b. Identification des issues cliniques désirées
c. Choix de l’agent: identification de la classe d’antibiothérapie, identification de l’agent au sein d’une classe thérapeutique
d. Suivi du traitement
e. Prévention
Quels sont les éléments à considérer lors de la sélection d’une classe thérapeutique? Lequel est prioritaire?
Quels sont les éléments à considérer lors de la sélection d’un agent au sein d’une classe thérapeutique? Quel élément est prioritaire?
- Quels sont les éléments à considérer lors de la sélection d’une classe thérapeutique? Lequel est prioritaire?
Lignes directrices, expérience clinique, valeurs du patient. L’importance de chacun des ces éléments va varier au cours de votre pratique.
- Quels sont les éléments à considérer lors de la sélection d’un agent au sein d’une classe thérapeutique? Priorité?
Efficacité du produit, innocuité du produit (interactions médicamenteuses, effets secondaires, réactions adverses), résistance bactérienne, adhérence au traitement, coût.
Tous les paramètres doivent être considérés. La mise en priorité des paramètres s’effectue selon la situation clinique.
