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DÉTECTION ÉPIDÉMIOLOGIQUE D'AGENTS INFECTIEUX > COURS 7: VIRUS ÉMERGENTS ET RÉEMERGENTS, INFLUENZA, MPOX, FIÈVRES HÉMORRAGIQUES VIRALES 🧬 > Flashcards

COURS 7: VIRUS ÉMERGENTS ET RÉEMERGENTS, INFLUENZA, MPOX, FIÈVRES HÉMORRAGIQUES VIRALES 🧬 Flashcards

1
Q

définir un virus émergent

A

virus qui apparaît nouvellement dans une population ou qui se propage rapidement dans une nouvelle région géographique

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Q

donner des exemples de virus émergent

A

COVID-19, Zika, Nipah, Hendra

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3
Q

exemples de virus réemergents

A

Mpox, Mycobacterium tuberculosis (bactérie), grippe

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4
Q

nommer des facteurs (6) qui font en sorte que des virus émergent dans la population

A

-augmentation des contacts avec les animaux
-variabilité génétique des virus
-changements écologiques et environnementaux
-globalisation et mobilité humaine
-pratiques agricoles et industrielles
-facteurs socio-économiques

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5
Q

quels sont les trois facteurs que l’OMS prend en compte dans la surveillance des pathogènes prioritaires?
+
nommer des exemples qui y sont associés

A

TRANSMISSION: réservoirs, mode/efficacité de transmission, phase asymptomatique, immunité collective, géographie mutations qui augmentent transmissibilité, changements climatiques

VIRULENCE: taux de mortalité si aucun traitement, sévérité symptômes, population à haut risque, mutations qui augmentent la virulence

MESURES MÉDICALES: existence d’un vaccin ou pouvoir le générer rapidement, existence d’outils diagnostiques, existence de médicaments

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6
Q

VRAI OU FAUX

les pathogènes surveillés par l’OMS comportent plus de bactéries que de virus?

A

FAUX, il y a beaucoup plus de virus

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7
Q

de quelle manière sont regroupés les virus?

A

en famille, exemple filoviridae, flaviviridae, poxviridae, etc

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8
Q

nommer des exemples de virus appartenant à la famille des Coronaviridae, Filoviridae, Orthomyxoviridae et Poxviridae.

A

Coronaviridae = COVID, SRAS
Filoviridae = EBOLA, MARBURG
Orthomyxoviridae = INFLUENZA H1, H2, …
Poxviridae = MPOX

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9
Q

définir un réservoir

A

hôte dans lequel le virus survit (se multiplie) sans causer de maladies graves à cet hôte

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10
Q

le réservoir est important pour?

A

la persistance et la propagation des virus

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11
Q

VRAI OU FAUX

un bon réservoir viral ne doit PAS mourir?

A

VRAI

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12
Q

SECTION: VIRUS DE LA GRIPPE

A
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13
Q

quel virus cause la grippe?

A

virus Influenza

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14
Q

incubation du virus de la grippe

A

1 à 3 jours

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15
Q

à quel moment a lieu le pic des symptômes de la grippe?

A

2-3 jours post infection

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16
Q

à quel moment a lieu le pic du titre viral de la grippe?

A

2-3 jours post infection, comme les symptômes

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17
Q

le virus de la grippe infecte quelles parties du corps?

A

voies respiratoires supérieurs et inférieures (complications)

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18
Q

VRAI OU FAUX

le virus de la grippe peut également infecter les alvéoles?

A

VRAI, mais il n’a pas beaucoup de récepteurs là-bas donc il préfère les voies respiratoires

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19
Q

comment se transmet le virus de la grippe (3)?

A

gouttelettes, contact direct et aérosols

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20
Q

dans quelle partie du corps se situe le virus de la grippe aviaire?

A

plutôt au niveau des poumons, pas vraiment dans les voies supérieures, d’où se transmet bien à l’humain

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21
Q

décrire le virus influenza
(env, polarité, type et classification)

A

enveloppé, ARN -
genre associés à l’humain:
-alpha, beta et gamma (influenza A et B, C)
-classifiés (le A) selon l’hémagglutine et la neuraminidase qu’ils expriment

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22
Q

différence entre influenza A, B et C

A

A, B = 8 SEGEMENTS
C = 7 SEGMENTS

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23
Q

que permet HA

A

l’entrée dans la cellule cible via son récepteur qui est l’acide salique

alpha 2.3= aviaire
alpha 2.6= mammifère

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24
Q

que permet NA?

A

la sortie du virus

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25
Q

que font PB2, PB1 et PA?

A

polymérise virales, ARN Pol et pas d’activité de proof-reading

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26
Q

que permet NS1?

A

inhibition de la réponse immunitaire

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27
Q

décrire le phénomène de dérive antigénique (drift)

A

accumulation de mutations ponctuelles associées à l’absence de l’activité de correction de l’ARN polymérase virale

mutations silencieuses ou non
principalement dans HA et NA
ÉPIDÉMIES SAISONNIÈRES

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28
Q

décrire le saut antigénique (shift)

A

échange de segments lorsque deux virus influenza A infectent une même cellule (réassortiment)

-création d’un nouveau virus avec un profil génétique différent

plusieurs combinaisons mais pas nécessairement fonctionnelles

ASSOCIÉ À LA CRÉATION DE VIRUS PANDÉMIQUE

EXMPLE H1N1

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29
Q

quel est le réservoir du virus influenza A?

A

oiseaux aquatiques (sauf pour H17 et 18)

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30
Q

les réservoirs de l’influenza A sont associés à quel type de maladie/transmission?

A

maladies gastro-intestinale et transmission à d’autres oiseaux fécale-orale

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31
Q

pourquoi le virus influenza A a un grand potentiel de propagation?

A

les oiseaux migrent

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32
Q

VRAI OU FAUX

dans le cas de l’influenza A, les porcs peuvent être associées à la génération de virus pandémiques?

A

VRAI, passe de l’oiseau au porc et après à l’humain (exemple segments PB2/PA de l’oiseau sautent au porc)

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33
Q

nommer 3 conditions gagnantes qui favorisent une pandémie

A

1- adaptation à se répliquer chez les mammifères (humain)

2-transmission efficace entre humain

3-pas d’immunité pré-existante, nouveau variant différent antigéniquement + pas de vaccin

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34
Q

nommer des pandémies causées par le virus influenza A

A

1918: Grippe espagnole H1N1 (LA PLUS DOCUMENTÉE)

1957: Grippe asiatique H2N2 (HA/NA différent sont favorise propagation)

1968: Grippe Hong Kong H3N2 (moins de mort/infection, car N2 pas nouveau)

1977: Grippe russe H1N1 (pas bcp de gens atteints)

2009: Grippe A H1N1

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35
Q

Est-ce qu’il y a des virus influenza aviaires qui circulent encore? Si oui nommer des exemples.

A

VIRUS H5N1: depuis la fin des années 90 circule, aussi H5N8, H5N2, H5N1

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36
Q

pourquoi on observe beaucoup de circulation de virus influenza aviaires en Asie?

A

présence de beaucoup d’oiseaux et porcs dans les marchés

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37
Q

concernant le virus H5N1:
-où il circule
-issus de quel réassortiment
-3 caractéristiques

A

-circule parmi les oiseaux aquatiques et la volaille
-issus de H5N8 X LPAI
-caractéristiques: se réplique mieux + meilleures propagation dans les oiseaux aquatiques + changement du profil épidémiologique chez les oiseaux

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38
Q

en plus de l’Asie, H5N1 se propage en Europe et en Amérique du Nord et infecte qui?

A

gamme d’oiseaux plus larges: oiseaux de proies (aigles, faucons, vautours), carnivores terrestres (raton-laveurs, renard, lynx), dauphins

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39
Q

quel facteur limite la propagation du virus H5N1?

A

transmission entre les mammifères faible ou inexistante (quelques cas exemples fermes visons)

40
Q

nommer un exemple de cas de contamination par H5N1 qui a eu lieu en 2024

A

fermiers Texans ont observés une baisse de la production du lait

virus s’est propagé par le matériel de traie

fermiers contaminés, pas grave que conjonctivite

PRÉOCCUPATION: RÉASSORTIEMENT POSSIBLE

41
Q

SECTION VIRUS MPOX

A
42
Q

différencier mpox, variole humaine, varicelle et rougeole

A

VOIR TABLEAUX DIAPO 27-28

43
Q

décrire mpox:

env, mat.gen, famille, sous-famille, genre, espèce

A

env, ADN double brin de 200 kb (gros), code pour 200 protéines

famille: poxviridae

sous-famille: chordopoxvirinae (mammifères) + entomopoxvirinae (insectes)

genre (mammifères): 4 dont les orthopoxvirus = mammifères

espèce: variole du singe

44
Q

années d’introduction des clades du virus mpox

A

2015-2016

45
Q

différence entre le clade I et II de mpox

A

clade II: Afrique de l’Ouest, moins virulent, moins sévère, mortalité faible

clade I: Afrique centrale, plus virulent, transmissible, mortalité élevé

46
Q

où a été détecté le virus mpox pour la première fois vs chez l’humain?

A

première fois: 1958 chez une colonie de singes au Danemark

première cas humain: enfant de 9 mois en RDC

47
Q

à quoi ont été associés les cas sporadiques entre 1970-2021

A

arrêt de la vaccination contre la variole, proximité des zones forestières, zones géo restreintes dans les régions endémiques

48
Q

quel pays présente à ce jour des cas de mpox constants?

A

RDC, infections associées à une contamination liée au animaux et transmission à la famille rapprochée

49
Q

le virus mpox est-t-il considéré comme une zoonose?

A

contact rongeurs ou singes

oui, noter qu’il y a possibilité de transmission dans la famille rapprochée

50
Q

comment s’effectue la transmission entre humain par le virus mpox

A

contacts rapprochés ET transmission verticale (enceinte) (clade I)

transmission sexuelle (clade II)

51
Q

le virus mpox est-il stable dans l’environnement?

A

oui, peut rester exemple 19 jours (ex: Nigéria)

mat génomique sur surfaces poreuses/non-poreuses ET virus infectieux sur surfaces poreuses

52
Q

quels sont les 3 facteurs associés à la sévérité de la maladie causée par mpox?

A

clade, statut de l’hôte et voie d’entrée

53
Q

quels sont les 2 voies d’entrée possibles de mpox?

A

dermique et tractus respiratoire

54
Q

quel est le symptôme caractéristique de mpox? les complications possibles?

A

lésions au niveau de la peau

complications: bronchopneumonie, choc septique, infection oculaire, manifestations neurologiques

55
Q

dans quel pays a eu lieu le premier cas HUMAIN de mpox?

A

CONGO, 1970
(première observation du virus en 1958 chez le singe en Danemark)

56
Q

dans quel pays a eu lieu la plus importante éclosion de mpox en 2017?

A

NIGÉRIA

57
Q

mpox en 2022 vs 2023

A

2022: clade IIb se propage en dehors de l’Afrique

2023: clade Ib à l’extérieur de l’Afrique centrale et du continent africain (vraiment virulent donc on s’en soucis beaucoup)

58
Q

les éclosions/transmission rapide de mpox sont associés à quelle communauté de personnes?

A

hommes ayant des relations sexuelles avec des hommes, événement dans la communauté homosexuelle

59
Q

le mpox peut maintenant se transmettre par quel type de contact?

A

sexuel

60
Q

VRAI OU FAUX

en 2022-2023, il y a eu des cas de mpox au Canada, si oui où?

A

VRAI

Ontario (surtout) et Québec (30-39 n’as, majorité = hommes, majorité à Montréal, quelques cas de réinfection: bon vaccin mais pas de protection à 100%)

61
Q

actuellement que se passe-t-il en Afrique concernant mpox?

A

automne 2023: ⬆️ cas en RDC

QUE LE CLADE Ib PAS LE IIb

grosse recrudescence des cas de mpox clade II

62
Q

actuellement que se passe-t-il au Québec concernant mpox?

A

⬆️ cas par rapport au début de l’année

aucune clade I détecté au QC ET CANADA

que chez les hommes jusqu’à maintenant surtout chez les 26-35 ans

Montréal = la plus touchée

63
Q

décrire vite fait comment on détecte mpox, méthode utilisée

A

PCR (qPCR)

en gros prélèvement avec écouvillons sur les lésions, première qPCR= pour discriminer des orthopox et deuxième qPCR pour distinguer de la variole

64
Q

SECTION FIÈVRES HÉMORRAGIQUES VIRALES

nommer des virus causant des fièvres hémorragiques

A

VH de Crimée-Congo. Ebola et Marburg, virus de Lassa, virus du Rift, fièvre jaune/dengue, Hantavirus

65
Q

où a été découvert le virus Ebola pour la première fois? à quoi il est associé?

A

Soudan et RDC

associé la consommation de viande d’antilope, propagation/seringues contaminées

66
Q

en quelle année/pays a eu lieu la plus grande flambée du virus Ebola? cause? importation?

A

2014-2016/Guinée. chauve-souris, europe/usa

***construction du camp de diagnostic:(

67
Q

lors de la flambée du virus Ebola, quelle mesure a été prise, expliquer rapidement

A

construction des centres de traitement en utilisant des centres déjà existants, déploiement de tentes/structures temporaires ou construction de centres

centre divisés selon zone plus à risques et moins de risques

68
Q

VRAI OU FAUX
il a fallu collaborer avec les communautés locales lors de l’éclosion d’Ebola?

A

VRAI, éviter de trop isoler les patients, mais:

zone d’observation

zones où les malades interagissaient avec les proches

zones où la famille pouvait voir le défunt sans contact :(

69
Q

Il existe 6 espèces du virus Ebola, laquelle est la plus mortelle?

A

Zaïre

70
Q

Les Ebolavirus sont proches des…?

A

Marburgvirus

71
Q

Nommer deux espèces d’Ebolavirus qui n’infectent pas nécessairement l’humain, possibilité d’infecter les animaux?

A

Bombali et Reston

72
Q

décrire le virus Ebola (structure etc)

particularité?

A

env, ARN-, filovirus

particularité: large tropisme cellulaire (cellules du SI, macrophages, endotheliales, etc)

73
Q

quel est le réservoir du virus Ebola?

A

chauve-souris frugivores, contaminent directement l’humain ou par un hôte intermédiaire (exemple: gorille, chimpanzés, antilopes)

74
Q

comment a lieu la transmission du virus Ebola entre humains?

A

sang, sécrétions, peau/muqueuses contaminées, relation sexuelle

75
Q

décrire la maladie du virus Ebola, les 2 phases

A

incubation 4-8 jours

PHASE INITIALE: 0-7 jours et symptômes grippaux

PHASE TERMINALE: 7-12 jours et diarrhée, vomissements, éruptions cutanées, pertes vasculaires, réponse inflammatoire dérégulée, défaillance multiviscérale

76
Q

quelle est la principale méthode de détection du virus Ebola?

A

RT-PCR
plusieurs matrices utilisées, très sensible, marqueurs précoces de l’infection

77
Q

nommer d’autres méthodes (3) de détection du virus Ebola

A

sérologie (anticorps dans tissus, sérum, sang)

immunohistochimie/pathologie: détecter antigène viral dans tissus

isolation du virus par culture: niveau 4, plusieurs jours

78
Q

que faire quand résultat RT-PCR est négatif?

A

Si symptômes ont débuté trois jours APRÈS les résultats négatifs il faut faire d’autres diagnostiques, BYE MESURES PRÉVENTIVES EBOLA, SAUF SUSPICION CLINIQUE PERSISTE

Si les symptômes commencent trois jours AVANT les résultats négatifs répéter le test 72h après le début des symptômes, ISOLEMENT EN ATTENDANT

79
Q

où a été découvert le virus MARBURG pour la première fois (1967)?

A

MARBURG et Francfort en Allemagne
Belgrade en Serbie

80
Q

VRAI OU FAUX
Le taux de létalité est plus élevé pour MARBURG que pour EBOLA?

A

Vrai! 81.4%

81
Q

actuellement, dans quels pays le virus MARBURG semblent causer une augmentation de cas?

A

Guinée et Tanzanie

82
Q

Le virus de MARBURG est similaire au virus EBOLA sur 4 points qui sont?

A

même structure, même tropisme cellulaire large, même mode de transmission, diagnostic préférentiel = RT-PCR

83
Q

SECTION HANTAVIRUS, fièvre hémorragique
observé pour la première fois en?

A

Corée, durant la guerre de Corée en 1951-1954
Épidémie de fièvre hémorragique

84
Q

comment sont séparés les hantavirus? décrire

A

en virus du Vieux monde et Nouveau monde

Vieux= fièvre hémorragique avec syndrome rénal, vaccin disponible, mortalité inférieur à 1%

Nouveau: fièvre hémorragique avec syndrome respiratoire, mortalité 30-60%

85
Q

décrire les hantavirus

A

env, ARN-, SEGMENTÉ, sphériques/pléiomorohiques

86
Q

décrire les 3 segments des hantavirus et les cellules que ce virus infecte

A

SEGMENTS:
S: Small, protéine de la nucléocapside
M: Medium, glycoprotéine
L: Large: polymérase

Cellules endothéliales

87
Q

quel est le réservoir des Hantavirus?

A

les rongeurs, chaque espèce Hantavirus est associée à une espèce

88
Q

nommer un Hantavirus vu en classe

A

Sin nombre

89
Q

où retrouve-t-on le virus Sin nombre? comment on s’infecte?

A

ce virus est présent dans la salive, l’urine, et les fèces de souris

inhalation des particules virales par l’humain

90
Q

VRAI OU FAUX

le virus Sin nombre se transmet à l’humain à l’humain

A

Faux, pas documenté

91
Q

où a été détecté le virus Sin nombre pour la première fois

A

Aux États-Unis, en 1993

92
Q

dans quel pays a lieu la majorité des cas transmis par Sin nombre? saison?

A

Aux États-Unis, il y a seulement quelques cas au Canada

SURTOUT AU PRINTEMPS

93
Q

décrire la maladie associée au virus Sin nombre, deux phases

A

Début des symptômes 1-8 semaines après le contact

PHASE PRODORMALE: symptômes grippaux, respiration plus rapide

PHASE SÉVÈRE: oedème pulmonaire, hypoxie, tachycardie, hypotension, œdème interstitiel

94
Q

VRAI OU FAUX:
Sin nombre: il existe des cas asymptomatiques?

A

Vrai quelques cas ont été rapportés

95
Q

quels sont les deux tests combinés pour diagnostiquer le virus Sin nombre?

A

sérologiques (ELISA) et détection antigène viral ou ARN viral (PCR ou immunohistochimie)

96
Q

un cas diagnostiqué de Sin nombre est confirmé que quand?

A

Maladie clinique et confirmation en laboratoire (anticorps IgM ou anticorps spécifiques contre hantavirus, détection antigène viral/ARN viral)

DÉTECTION ÉPIDÉMIOLOGIQUE D'AGENTS INFECTIEUX (13 decks)

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