Cours 3- Écosystème digestif Flashcards
Un microbiote est un ensemble ___ de micro-organismes organisés en ____. Ces micro-organismes interagissent ___ et avec ___ dans lequel ils vivent (corps humain, sol, eau)
microbiote = écosystème microbien
dynamique
communautés complexes
entre eux
l’environnement
Nomme 5 types de micro-organismes du microbiote.
b,l,a,p,v
microorgansime = organsimes vivants microscopiques
- Bactéries commensales et pathogènes
- champignons unicellulaires (Levures)
- Archaea
- Protozoaires (Parasites unicellulaires)
- Virus / bactériophages
Sur notre corps, il existe plusieurs microbiotes de composition différente, notament au niveau :
- ___
- ___
- ___
- ___
- ___
multitude de microbiotes aux écologies diff/ ICB RV
- intestinal
- cutané
- buccal
- respiratoire
- vaginal
Quel est le microbiote le + peuplé de l’organisme ?
microbiote intestinal
Le microbiote intestinal est principalement dans ____ et le ___ réparti entre la ___ et le ____ qui recouvre la muqueuse intestinale.
intestin grêle et côlon
lumière
biofilm protecteur de mucus
VF ? Dans le microbiote intestinal, il y a + de bactéries que de virus/phages.
FAUX, il y a plus de virus/phages que de bactéries.
Il y a un gradient ____ qui est en stricte relation avec des paramètres physicochimiques du TGI comme:
- la teneur en ____
- le ___ ou
- la ____ de transit.
oro-anal de bactéries
* O2
* pH
* vitesse
VF ? Le microbiote intestinal est le même tout le long du TGI ?
justifier
FAUX, il y a des variations qualitatives ET quantitatives de la flore intestinale tout au long du TGI
Microbiote de l’intestin grêle :
On retrouve des bactéries à
croissance ___ grâce à la présence de quelques sucres simples qu’elles consomment. Les bactéries sont des ___ car elles supportent autant l’O2 que l’anoxie (CO2, N2).
rapide
anaérobes facultatives
Microbiote du côlon :
On retrouve des bactéries à croissance ___ et exigeantes en sources de nutriments. Elles vont utiliser/consommer des résidus de nutriments ___ (ex: fibres alimentaires). On qualifie cette étape de ___.
lente
non digérables
fermentation microbienne
Il y a aussi une différenciation ___ du microbiote, de la ___ à la ___, recouverte par une couche de mucus qui ___ selon la région du TGI.
transversale
lumière intestinale
muqueuse
varie
diff bactérie dans les 2 endroits (mucus protège paroi de bactérie)
VF? L’épaisseur de la couche de mucus ET le type de mucine diffèrent en fct de la région du TD
Tube digestif
VRAI
Couche de mucus dans l’intestin grêle :
- Couche ___
- Les micro-organismes y ___ facilement.
- fine
- pénètrent
Couche de mucus dans le côlon :
- __ couche
- La couche externe est ___ et les micro-organismes y __ facilement.
- La couche interne est ____ par les micro-organismes.
- Bi
- semi liquide/solide, pénètrent
- presque impénétrable
À la naissance, le TGI est rapidement colonisé par des micro-organismes provenant en partie de qui ?
- Nomme 2 sources de colonisation à la naissance.
la mère
- mode d’accouchement & type d’allaitement
VF? Les nourissons aillaités au sein ont une microbiote différent de ceux recevant un lait maternisé.
VRAI
Après la naissance, qu’est ce qui fait en sorte que le microbiote se complexifie/diversifie progressivement ?
diversification alimentaire
La période d’acquisition du microbiote = ____ semble très importante pour la ___ .
1000 premiers jours de vie
maturation du système immunitaire
Vers quelle âge la fraction dominante du microbiote devient stable ?
3 ans
À l’âge adulte, la composition du microbiote reste relativement stable jusqu’à ___, car la diversité microbienne s’affaiblit et laisse place à d’autres espèces plus délétères, qualifiées de pathogènes opportunistes.
la vieillesse
Comment évolue le microbiote intestinal au cours de la vie ?
- Le microbiote se développe rapidement entre 0 et 3 ans.
- Il continue de maturer jusqu’à 18 ans.
- Il est stable entre 18 et 65 ans.
- Après 65 ans, il se modifie, souvent avec une perte de diversité bactérienne.
VF ? Mon microbiote est unique.
justifier
VRAI
- constitue notre propre “carte identité biologique /microbienne”
Le microbiote a la capacité de ___ qui n’est pas infaillible.
résistance aux perturbations écologiques
VF ? En cas de résilience (perturbation), le microbiote ne pourras jamais revenir à son état initial.
justifier
FAUX, le microbiote peut malgré tout revenir à son état initial sous une période +/- longue selon le statut immunitaire de l’hôte (immunocompétent / immunodéprimé).
VF ? La prise d’antibiotique a très souvent un effet négatif sur le microbiote.
VRAI
Fonctions du microbiote :
- Fonctions __
- Fonctions __
- Effets ___
- ____
- métaboliques
- barrière/défense
- trophiques
- Neuromodulation
La fermentation intestinale est un processus de ___ qui se fait par des réactions ___ se produisant à l’abris de __ et qui dégage ___.
dégradation
d’oxydo-réduction
l’air
peu d’énergie
QSJ ? Les bactéries transforment des nutriments qui ne se digèrent PAS (fibres, substrats glucidiques complexes indigestes) en –> métabolites secondaires (a.g à chaîne courte) au potentiel bioactif, des alcools, des gaz, etc.
Fermentation intestinale
Les substrats secondaire formés par la fermentation intestinale sert à :
- Provision ___ pour l’organisme
- Réduit la ____
- Nourrit les ___
sub.sec=a.g courte chaine, gaz, alcool
- d’énergie
- charge osmotique colique = moins de risque de diarrhée
- colonocytes
Un microbiote intestinal déséquilibré peut entraîner des troubles au niveau gastro-intestinal, comme :
TDDM
QSJ ? Déséquilibre du microbiote.
dysbiose
Un microbiote intestinal déséquilibré peut entraîner des troubles au niveau extra-digestif, comme :
SAIA
QSJ ? Microorganismes vivants (bactéries, levures) qui, lorsqu’ils sont administrés en quantité adéquate, produisent un bénéfice pour la santé de l’hôte.
Probiotiques
QSJ ? Médicaments utilisés pour traiter et prévenir les infections bactériennes.
antibiotiques
Antiobio
La ____ aux antibiotiques constitue aujourd’hui l’une des plus graves menaces pesant sur la santé mondiale.
résistance des bactéries
QSJ ? Substrat (ingrédient non-digestible) qui est utilisé sélectivement par les microorganismes de l’hôte exerçant un effet bénéfique pour la santé.
prébiotiques
IMPORTANT
VF ? Certains probiotiques, prébiotiques et psychobiotiques se vendent Pr.
FAUX, ce ne sont PAS des médicaments, mais des suppléments/compléments.
QSJ ? Probiotiques (bactéries vivantes) et/ou prébiotiques (aliments favorisant la croissance des bactéries intestinales bénéfiques) qui procurent des bienfaits pour la santé mentale.
psychobiotiques
La fécothérapie est la transplantation de ___ qui consiste à insérer les ___ dans un receveur afin de rétablir un microbiote non sain.
microbiote fécal
selles d’un donneur sain
VF ? Fécothérapie…
- est une procédure hautement réglementée, à des fins expérimentales seulement.
- plusieurs essais cliniques randomisés ont montré que la transplantation de microbiote fécal est peu efficace pour mettre fin aux récidives d’infections à Clostridium difficile.
- VRAI
- FAUX, très efficace (90 %)
Certains micro-organismes ont l’équipement génétique et enzymatique pour participer ___.
au métabolisme des médicaments
(activation, inactivation, modulation de la toxicité).
VF ?
- Les interactions bidirectionnelles entre médicaments et microbiote intestinal sont très bénéfiques pour la santé.
- Les médicaments peuvent modifier la composition du microbiote
- Les bactéries intestinales peuevnt infleuncer l’efficacité et la dynamique d’absorption de ces medx
- FAUX, peuvent avoir de conséquences graves pour la santé.
- VRAI
- VRAI
La ___ , une discipline émergente regroupant les domaines de la génomique microbienne, de la pharmacologie et de la microbiologie cherche à comprendre comment les variations inter-individuelles dans le microbiote façonnent l’efficacité de réponses aux médicaments et leurs possibles effets secondaires.
pharmacomicrobiomique
Nommez 2 ex de medx connu pour interagir avec la microbiote ET une efficacité modulée
Antidiabétiques
Inhibiteurs de la pompe à protons (IPP)
Les ___ constituent des outils clés de recherche en santé, en innovation permanente pour être à la pointe de la technologie.
systèmes de digestion artificiel
Les ____ ET ____ se déclinent sous différents formats, niveaux de complexité et fonctions selon l’organe de la digestion reproduit, par exemple un estomac ou l’ensemble du système gastro-intestinal.
modèles de digestion ET fermentation in vitro
Les modèles in vitro
- sont une ____ intéressante…
- peuvent être utilisés en ____ …
… à l’expérimentation animale et/ou aux études
cliniques humaines, à condition que la ____ de ces outils soit du niveau de celle des expériences faites chez l’Homme ou l’animal.
- alternative
- complémentarité / pertinence
Quelle est la pertinance des modèles in vitro?
Le but?
- se rapprocher de la physiologie digestive humaine
- Validations scientifiques corrélant des
résultats obtenus in vivo chez l’Homme ou
l’animal à ceux obtenus en modèles in vitro
VF ?
- Il est interdit chez l’Homme mais permis chez les animaux de tester de nouvelles molécules pharmaceutique.
- Les modèles de digestion in vitro permettent de contourner un grand nombre de problèmes liés à l’éthique.
- FAUX, interdit chez l’Homme et à limiter un maximum chez les animaux.
- VRAI, on peut tester des bhays dangereux sans problème
photo pour 2e point
QSJ ? Reproduit les principaux paramètres physicochimiques de la partie haute du tractus digestif de l’Homme
TIM-1
imitation des ces conditions physiologique (TPPTSA)
VF? Utilisation des outils in vitro – une démarche très encouragée d’un point de vue réglementaire. (conseil canadien de protection des animaux ET l’Union Européienne)
VRAI
QSJ ? Ce système reproduit de façon successive l’estomac, l’intestin grêle en une seule partie ainsi que les trois régions du côlon. De plus, il intègre le microbiote intestinal.
SHIME
imitatation des conditions (TPATSA)
Simulator of the Human Intestinal Microbial Ecosystem
En plus d’inclure les différentes sécrétions digestives, le ____ intègre le microbiote intestinal. Les bactéries du microbiote intestinal
sont incorporées dans le système à partir de selles humaines fraichement collectées. L’objectif
étant de reproduire les différentes variables de l’écosystème colique.
On arrive aussi à distinguer les différentes ____: les bactéries qui colonisent spécifiquement la couche de mucus, à celles qui
restent dans le lumen.
SHIME
niches
