CM 1 microbio Flashcards
Décrire la structure d’une bactérie et quelle partie la distingue de nos cellules
• Paroi cellulaire • Membrane cytoplasmique • Chromosome (ADN) • Ribosomes (synthèse de protéines à partir de l’ ARN);
Bactéries ont paroi cellulaire mais pas nous
Quelle est la différence entre la paroi cellulaire des Gram + et des Gram -
Gram positif:
• Couche épaisse de peptidoglycans
• Acide lipoteichoïque (polysaccharides)
Gram négatif • Couche mince de peptidoglycans • Porines • Lipopolysaccharides (LPS) • Protéines
Quelles sont les couleurs associées aux gram + et aux gram -?
Gram + : bleu/violet
Gram -: rouge/rose
Quelle est l’utilité de la coloration de Gram?
Identifier des bactéries dans:
•Échantillon clinique (expectoration, ponction articulaire)
•Bouillon d’enrichissement ou bouteille d’hémoculture.
• Une colonie (croissance) sur une gélose au sang de
mouton
Quelle est la méthode de coloration de Gram sur échantillon ou bouillon?
- Coloration au violet de cristal. Rincer.
- Fixation au lugol (iode). Formation d’un complexe violet de cristal-iode. Rincer.
- Décolorayion à l’acétone-alcool. Rincer.
- À cette étape, l’alcool-acétone retire le violet de crystal de la paroi
bactérienne des Gram - alors que les
Gram + retiennent le violet de crystal. - Contre-coloration par safranine rouge
- Examen microscopique à immersion i.e. 1000X.
V ou F? L’absence de bactérie à la coloration de Gram d’un échantillon clinique signifie que l’échantillon ne contient aucunebactérie.
Faux!
En faible quantité, la coloration de Gram pourrait être
négative (absence de bactéries vues à l’examen
microscopique) et la culture bactérienne pourrait montrer la
présence de bactéries.
Quelles bactéries ne sont pas visibles à la coloration de Gram (bactéries fantômes)?
Mycoplasma pneumoniae
Chlamydia trachomatis
Treponema palidum
Pas de paroi cellulaire
Quels sont les genres de bactéries cocci Gram +?
- Staphylococcus
- Streptococcus
- Enterococcus
Quels sont les cocci Gram + :
- En amas?
- En paires?
- En chainettes?
- Amas: Staphylococcus
- Paires: Streptococcus pneumonia
- En chainettes: Streptococcus (autres que pneumoniae) et enterococcus
Comment peut-on distinguer les espèces de Staphylococcus par une coloration de Gram?
Impossible, Gram permet juste de distinguer le genre et non l’espèce
Quels sont les cocci Gram - en paires?
Neisseria (meningitidis, gonorrhoeae et autres espèces)
Moraxella catarrhalis
V ou F? Toutes les Neisseria sont pathogènes
Faux!
Il existe plusieurs espèces de Neisseria non pathogènes.
On les retrouve le plus souvent sur les muqueuses.
Quelles sont les bactéries bâtonnets Gram + sporulés?
Bacillus spp.
Clostridium spp.
Quelles sont les bactéries bâtonnets Gram + sporulés?
Corynebacterium
spp.
Quelles sont les bactéries bâtonnets Gram + longs et minces?
Listeria monocytogenes
Lactobacillus spp.
Erysipelothrix spp.
Quelles sont les bactéries bâtonnets Gram + embranchés?
Nocardia spp.
Actinomyces spp
Quelle est la fonction d’un spore et comment peut-on les détruire?
La spore permet une survie prolongée dans l’environnement.
Les spores sont détruites par la stérilisation, l’eau de javel et le peroxyde
d’hydrogène.
Quelle est la maladie/manifestation clinique associée au Clostridium difficile?
Colite (diarrhée)
Quelle est la maladie/manifestation clinique associée au Clostridium perfringens?
Gangrène gazeuse
Quelle est la maladie/manifestation clinique associée au Clostridium botulinum?
Botulisme
Quelle est la maladie/manifestation clinique associée au Clostridium tetani?
Tetanos
Où retrouve-t-on les Clostridium spp.?
Flore normale du côlon
À quoi est associé le Bacillus anthracis?
Agent de l’anthrax
Quelle est la maladie/manifestation clinique associée au Bacillus cereus?
Intoxication alimentaire
Où retrouve-t-on les Bacillus spp.?
Flore normale de la peau
Quels sont les bâtonnets Gram - faisant partie des entérobactéries?
Escherichia coli Klebsiella pneumoniae Proteus mirabilis Salmonella spp. Shigella spp. Yersinia enterocolitica Enterobacter spp.
Quels sont les bâtonnets Gram - ne faisant pas partie des entérobactéries?
Haemophilus influenzae Pseudomonas aeruginosa Campylobacter spp. Vibrio cholerae Pasteurella multocida Bordetella pertusis Bacteroides fragilis
Quelle est la différence entre les bactéries anaérobies strictes
et les bactéries anaérobies facultatives?
Les bactéries anaérobies strictes sont tuées par l’oxygène. Il faut remplacer l’oxygène par de
l’azote pour leur croissance.
Les bactéries anaérobies facultatives peuvent croître en
présence ou en l’absence d’oxygène.
Nommer des bactéries anaérobies strictes
Clostridium spp.
Bacteroides fragilis
Streptococcus anaerobius
Nommer des bactéries anaérobies facultatives
Entérobactéries Streptocoques β-hémolytiques (groupe A, B, C, G) Streptococcus viridans Bacillus anthracis Enterococcus spp. Staphylococcus spp
Quand faut-il pratiquer l’hygiène des mains?
- Avant une intervention aseptique
- Après un risque de contact avec un liquide biologique
- Après tout contact avec un patient ou son environnement
Quelles sont les précautions de contact?
Port de gants et jaquettes
Quelles maladies requièrent l’utilisation de précautions de contact?
- SARM
- ERV
- Clostridium difficile
- Gastro-entérites
Quelles sont les précautions respiratoires (gouttelettes)?
Précaution contre gouttelettes >5 microns (1 mètre)
•Masque de procédure + protection oculaire
• Chambre individuelle
Quelles maladies requièrent l’utilisation de précautions respiratoires (gouttelettes)?
- Covid-19
- Infections invasives à Streptococcus pyogenes
- Influenza/autres virus respiratoires
- Méningite
Quelles sont les précautions aériennes (aérosols)?
Précautions contre particules < 5 microns
• Chambre à pression négative
• Chambre individuelle avec salle de bain
• Masque N-95
Quelles maladies requièrent l’utilisation de précautions aériennes (aérosols)?
- COVID-19? (rarement)
- TB
- VZV
- Rougeole
- MRSI (maladie respiratoire sévère infectieuse)
Quand faut-il prescrire des hémocultures?
Pt avec fièvre ET signes systémique sévères: • Atteinte de l’état général • Frissons solennels •Basse PA
Diagnostics graves évoqués (même sans fièvre): • Méningite • Endocardite • Infection rénale • Pneumonie avec dyspnée
Fièvre chez: femme enceinte, immuno-supprimé (cancer, VIH +,
greffé), personne âgée
Hypothermie chez la personne âgée
Combien d’hémocultures et de bouteilles sont nécessaires?
2 hémocultures pris à 15-20 min d'intervalle à deux sites différents 4 bouteilles (2 aérobies et 2 anaérobies) donc 40 ml en tout
Quelle est la séquence d’actions à faire pour faire un prélèvement?
- Se laver les mains.
- Nettoie la peau du patient avec de l’alcool.
- Nettoie les bouchons des deux bouteilles d’hémoculture (aérobie
et anaérobie). - Mettre le garrot.
- Mettre des gants.
- Désinfecter la peau du patient avec de la chlorhexidine.
- Ponctionner la veine.
- Déposer 10 ml de sang dans la bouteille aérobie et 10 ml
de sang dans la bouteille anaérobie. - Retirer le garrot puis l’aiguille.
- Enlever ses gants
- Se laver les mains.
Pourquoi est-ce important de prélever 2
hémocultures i.e. 40 ml de sang?
Plus le volume est grand, plus la probabilité de trouver la bactérie ds le sang est haute
Mais le risque « coût-bénéfice » devient moins intéressant après 40 mL
**prélever 40 mL = Facteur le plus important pour trouver des bactéries dans le sang si
elles sont présentes.
Quand faut-il prescrire plus que 2
hémocultures (>40 mL de sang)?
Endocardite subaiguë (peu virulent, patient
stable):
• Obtenir 3 hémocultures (donc 6 bouteilles) en 30 – 60 minutes
• Prélever 2 autres hémocultures si la première série est négative après
24 heures.
Pourquoi préleve-t-on en
« 2 temps »?
- Évaluer la contamination cutanée (mauvaise désinfection de la peau = bactéries peu pathogène de la peau rentre)
- Évaluer le caractère continu de la bactériémie
Vrai ou faux? Le streptococcus pyogenes peut être un contaminant cutané
Faux,
Il ne peut jamais l’être étant donné qu’il ne fait pas partie de la flore normale de la peau! Sa présence dans les hémoculture est donc signe de bactériémie continue.
Pourquoi prélève-t-on une bouteille aérobie et une anaérobie pour chaque hémoculture?
10 mL (aé) + 10 mL (ana) = meilleur
recouvrement de bactéries
• À cause des anaérobies (augmentation légère)
• Meilleure croissance de certaines bactéries aérobies dans les
bouteilles anaérobies (principale raison)
Comment se déroule le traitement des hémocultures
au laboratoire?
- Température 37 degrés + brassage continu
- Détection des métabolites des bactéries ds bouteille
- Coloration Gram si hémoculture positive + culture sur gélose pour antibiogramme
Est-ce important de savoir
quelle(s) bouteille(s) est(sont)+?
Pas vraiment
• Un S. epidermidis dans les 2 bouteilles n’est pas
plus significatif que s’il était retrouvé dans une seule bouteille
(contaminant probable) (+ important de savoir si présent ds 1 seul prélèvement ou les 2)
• Même si on trouve un gram - seulement dans la bouteille anaérobie,
probabilité demeure élevée que ça sera une bactérie aérobie.
Nommer un cocobacille Gram -
Haemophilus influenzae
Comment peut-on savoir si la présence de bactéries dans une hémoculture est signe de bactériémie ou contaminant?
• La bactérie rapportée est-elle reconnue comme un pathogène ou un
colonisant de la peau?
• Nombre d’hémoculture positive (pas le nombre de bouteilles)? 1/2 ou 2/2
• Nb d’heures d’incubation, avant détection de
croissance bactérienne? (18-24h si bactériémie, 2-5 jrs si
contaminant pcq faible qté initiale)
• Le lien entre le site de l’infection et le germe identifié est-il plausible?
Quels pathogènes sont fréquents dans les hémocultures? (pas des contaminants)
- Staphylococcus aureus
- Pneumocoque
- Entérocoque
- Streptococcus pyogenes (groupe A)
- E. coli
- Pseudomonas aeruginosa
- Candida
Quelles bactéries sont souvent des contaminants?
- Staphylococcus à coagulase négative (tout sauf Staph aureus)
- Corynebactérium sp.
- Bacillus sp.
(flore normale de la peau)
Quels agents infectieux significatifs pourraient croitre après 24 heures?
Bactéries anaérobies, les levures, certaines bactéries aérobies fastidieuses (HACEK)
*Les bouteilles d’hémoculture sont incubées un maximum de 5 jours
avant de conclure qu’elles sont négatives.
Que signifie la présence de 2/2 hémocultures positives à un germe de la
flore normale de la peau?
Infection de cathéter vasculaire.
Quelles sont les conditions pour qualifier une bactériémie de nosocomiale?
•Elle survient plus de 48 heures après l’arrivée à l’hôpital
ET
• Elle est attribuable à une condition infectieuse qui n’était pas présente à l’arrivée à l’hôpital.
Comment fait-on un diagnostic de diarrhée à
Clostridioides difficile
- Selles non formées (liquides)
- Basée sur la recherche de toxines
Trois techniques possibles FACILEMENT disponibles
• Test rapide EIA
• Recherche de toxine sur culture cellulaire
• Recherche de toxine par TAAN
Une technique PEU utilisée au Québec
• La culture toxigénique de C. difficile (long et cher)
Quel est le test le plus sensible pour trouver des toxines de C. difficile et quel est son désavantage?
TAAN (+ sensible que culture cellulaire et test rapide EIA)
Trop sensible –> risque de traiter porteurs sains de souches toxinogènes
Quels sont les avantages et désavantages de la recherche de pseudomembranes de C. difficile?
Avantages:
•Rapide: utilisation d’un colonoscope
• Très spécifique: ddx très limité
Désavantage:
• Peu sensible: plupart des patients n’auront PAS de pseudomembranes pcq leur présence est associée à formes plus sévères
Quelles bactéries entéropathogènes peuvent causer la diarrhée?
- Salmonella
- Shigella
- Yersinia enterocolitica
- E. coli
- Campylobacter
(voyage, viande/poulet cru, animaux sang froid)
Quels virus peuvent causer la diarrhée?
- Norovirus (diarrhée épidémique)
* Rotavirus (enfants surtout)
Quels parasites peuvent causer la diarrhée?
Au Québec, giardiase surtout
Quelle est la différence entre les prélèvements pour les TAAN N. gonorrhoeae/Chlamydia trachomatis et pour la culture d’urine?
Pour TAAN gono/chlamydia = début de jet (urétrite: ramasse 1ères sécrétions de l’urètre non stérile)
• Pour culture d’urine = mi-jet (pour recueillir seulement l’urine stérile)
Quelle est la séquence d’analyse par culture d’urine?
- Prélèvement du mi-jet d’urine
- Ensemencement du prélèvement dans gélose au sang et gélose MacConkey (0.001 mL de bactéries)
- Incubations des géloses à 37 degrés pendant la nuit
- Si plus de 100 colonies le lendemain matin: positif
- Antibiogramme
- durée totale pour avoir la réponse: 24-72h
Comment peut-on expliquer la présence d’inflammation
avec culture d’urine négative?
• Culture faite après le début des antibiotiques
• L’inflammation vient d’ailleurs que l’urine (urètre?, la prostate?)
• L’inflammation est causée par un microorganisme non
cultivable
Quels sont les principaux agents responsables
des infections urinaires
• E. coli • Proteus mirabilis • Klebsiella pneumoniae • Enterocococcus spp. • Staphylococcus saprophyticus • Pseudomonas aeruginosa
Quels sont les symptômes d’infection urinaire basse?
- Brûlements mictionnels
- Hématurie macroscopique
- Urgence mictionnelle
Quels sont les symptômes d’infection urinaire heate?
- Brûlements mictionnels
- Hématurie macroscopique
- Urgence mictionnelle
- Douleur loge lombaire
- Fièvre
- Leucocytose
Comment les Gram + assemblent-ils leur paroi cellulaire?
Synthèse des peptidoglycans: dimères de sucre assemblés en chaine par les PBP
(donc requière la liaison des peptidoglycans aux PBP)
*PBP: penicillin binding protein
Quel est le mécanisme d’action des bêta-lactamines?
Visent la paroi cellulaire:
se lient aux PBP pour les empêcher de se lier aux peptidoglycans –> mort de la bactérie
Concernant la pénicilline:
- Quelle est sa classe?
- Quelles sont ses voies d’administration?
- Classe: β-lactamines
- Voies d’administration :
• Orale (V)
• Intraveineuse (G)
• Intramusculaire (benzathine)
Quel est le spectre d’action de la pénicilline?
Streptocoques β hémolytiques (Tous : A, B, C et G)
Streptococcus pneumoniae (La majorité)
Streptococcus groupe viridans (La majorité)
Streptococcus anaérobies (La majorité)
Treponema pallidum (Tous)
Bactéries anaérobies de la flore ORL (plusieurs)
Quel est le spectre d’action de l’ampicilline?
Comme la pénicilline Ajouts: Enterococcus faecalis Listeria monocytogenes Certaines entérobactéries (E. coli, Salmonella spp., Shigella spp. Proteus mirabilis) Haemophilus influenzae non producteur de B-lactamase
Retraits:
Treponema pallidum
Quelles bactéries produisent des ß-lactamases (pacmans mangeurs de ß-lactamines)?
- Staphylococcus aureus (non SARM)
- Environ 35% des Haemophilus influenzae
- La plupart des Moraxella catarrhalis
- Tous les Klebsiella pneumoniae
- Environ 30% des E. coli
Comment traite-t-on les bactéries productrices de ß-lactamases?
Des antibiotiques qui résistent aux ß-lactamases
•Cloxacilline/oxacilline/méthicilline
• Céfazoline
Les inhibiteurs de ß-lactamases
• Acide clavulanique
• Tazobactam
Quel est le spectre d’action de la cloxacilline?
- Staphylococcus aureus et autres Staphylococcus spp. sensibles à la méthicilline
- Streptococcus sensible à la pénicilline
- Cocci Gram positif anaérobies
Quel est le spectre d’action de la céfazoline?
- Streptococcus ß hémolytiques (tous)
- Streptococcus viridans (majorité)
- Staphylococcus aureus (excluant SARM)
- Quelques entérobactéries (ex. : E. coli, Proteus, Klebsiella)
Quel est le spectre d’action de la pipéracilline/tazobactam?
Comme l’amoxicilline
Ajouts: Staphylococcus aureus (Non SARM) E. coli, K. pneumoniae, P. mirabilis Plusieurs autres entérobactéries Haemophilus influenzae Moraxella catarrhalis Pseudomonas aeruginosa Anaérobies (B. fragilis, Clostridium sp. autres que Cd.)
*Perte du Listeria monocytogenes
Quelles bactéries ciblées par la pipéracilline/tazobactam produisent des
- pénicillinase
- ß-lactamases
- Staphylococcus aureus (Non SARM)
- E. coli, K. pneumoniae, P. mirabilis
Haemophilus influenzae
Moraxella catarrhalis
Anaérobies (B. fragilis, Clostridium sp.
autres que Cd.)
Quels sont les effets secondaires des ß-lactamines?
- Allergie (fièvre et/ou éruption)
- Néphrite interstitielle
- Gastro-intestinal (diarrhée, nausée, colite à Cd)
- Surinfection à Candida
Quel est le mécanisme d’action du SARM?
Modification de la cible
PDP différents donc les noyaux ß-lactamines ne peuvent pas s’y lier –> bactérie peut faire sa paroi de peptidoglycans et survit
Comment traite-t-on un SARM?
Vancomycine!!
*Pas donner de bêta-lactamine
**Mécanisme de résistance =/= ß-lactamase donc:
• La résistance aux ß-lactamase (cloxacilline/céfazoline) n’aide pas
• Les inhibiteurs de ß-lactamase (clavulanate/tazobactam) n’aident pas
Concernant la vancomycine:
- Quelle est sa classe?
- Quelles sont ses voies d’administration?
- Classe : Glycopeptide
- Voies d’administration :
• Intraveineuse (pour les infections autres que Cd)
• Orale (pour le traitement de la diarrhée à Cd)
Quel est le spectre d’action de la vancomycine?
ANTI GRAM + PUR
Staphylococcus aureus (Incluant le SARM) Staphylocoques à coagulase négative (Incluant les souches résistantes à la méthicilline) Streptocoques Entérocoques (Sauf ERV) Bâtonnets Gram positif (incluant le Cd)
*Pas d’activité contre les Gram négatif
Contre quelles bactéries la vancomycine n’a pas d’effet?
ERV
Gram -
Quels sont les effets secondaires de la vancomycine IV?
- Réaction liée à la perfusion
- Néphrotoxicité
- Leucopénie
Quel ATB dose-t-on et pourquoi?
Vancomycine
Il faut ajuster la dose qd le pt est en insuffisance rénale
*donc on dose avant la 4e dose pour savoir la concentration du mx ds le sang
Donner des exemples de virus pour lesquels les manifestations de la réactivation peuvent être différents de celles de
la primo-infection.
Nom virus: primo-infection –> réactivation
HSV-1: Stomato-gingivite –> Feux sauvage
VZV: Varicelle –> Zona
EBV: Mononucléose –> Syndromes
lymphoprolifératifs
CMV: Mononucléose –> Rétinite, colite,
pneumonie, etc.
