Chap 5

Question 1

Qui a decouvert la RNase P ? Les ribozymes des introns 1 ?

Answer 1

Sydney Altman
Thomas R Cech

Question 2

Les LncRNA ont combien de bases ?

Answer 2

Plus de 200

Question 3

ARN ou proteine avant ?

Answer 3

ARN precurseur de la vie

Question 4

De quoi est composé un nucléosides ?

Answer 4

Une base azotee liee a un pentose

Question 5

4 caractéristiques sur les nucleosides ?

Answer 5

Base liee par une liaison glycosidique
Carbone de la liaison anomerique
Conformation anti ou syn
Pentose permet une plus grande solubilité dans l’eau

Question 6

Comment c’est la nomenclature du nucleoside ?

Answer 6

Purine : osine
Pyrimidine : idine

Question 7

Diff nucléoside et nucléotide ?

Answer 7

Nucleotide = phosphorylé

Question 8

Connaitre les structures d’ACTGU

Answer 8

Notes

Question 9

Les pka des bases N ?

Answer 9

5AMP 3,8 N1

5GMP 9,4 N1
2,4 N7

5CMP 4,5 N3

5UMP 9,5 N3

Question 10

Qui a une plus grande diversité de conformation ? ARN ou ADN ?

Answer 10

ARN par son 2OH

Question 11

Par quoi est determiné la capacité d’un ARN a exercer sa fonction ?

Answer 11

Structure 3D / conformation

Question 12

Donnez les 3 types d’angles de torsions des acides nucléiques ?

Answer 12

Ceux qui définissent le trajet de la chaine (6) : alpha beta….
La conformation du ribose torsion endocyclique (5) : v0….
L’angle de glycosidique (X) donne l’orientation de la base par rapport au ribose

Question 13

Quelles sont les conformations privilégiées ?

Answer 13

Décalées

Question 14

Quelles sont les deux conformations possibles du ribose ?

Answer 14

Enveloppe E
Tordue T

Question 15

Quelle est la conformation ideale de ARN de type A ?

Answer 15

C3’-endo (Nord)

Question 16

Quelle est la conformation ideale de ADN de type B ?

Answer 16

C2’-endo (Sud)

Question 17

Par quoi son stabilisee la formation de paires de bases ?

Answer 17

Ponts H (empilement de base dans les structures hélicoidales)

Question 18

Que sont les paires non canoniques ?

Answer 18

Paires non watson crick ou GU wobble

Question 19

C’est quoi la compilation geometrique de leontis et westhof ?

Answer 19

Classification des paires de bases selon la geometrie d’interaction des bases tel qu’observe dans les structures d’ARN (emphase isosterifite)

Question 20

A quoi est utile la geometrie de leontis et westhof ? 2

Answer 20

Decrire precisement et sans ambiguïté les structures d’ARN
Pour l’identification des motifs basee sur les sequences d’ARN

Question 21

Quels sont les paramètres essentiels pour specifier la geometrie dans leontis westhof ??

Answer 21

seulement 2 NECESSAIRES
les faces d’interactions des deux bases
L’orientation relative des liaisons glycosidique entre elles (cis trans)

Question 22

Y’a ils d’autres paramètres accesoires ?? Pour Leontis West

Answer 22

Syn anti des liaisons glycosidiques
Orientation locale relative

Question 23

Un exemple de paire canonique

Answer 23

Paire cis watson crick/watson crick

Question 24

Dans l’ADN et l’ARN ou se trouvent les paires de bases ? Et les ribo-phosphates ?

Answer 24

Au centre
A l’extérieur

Question 25

Qui a un sillon majeur plus large ? ADN B ou ARN A

Answer 25

ADN B

Question 26

Qui a un sillon majeur plus profond ? ADN B ou ARN A

Answer 26

ARN A

Question 27

Propriété phare des sillons majeur ?

Answer 27

Possède un grand potentiel pour la reconnaissance specifique de la sequence de l’acide nucléique (face hoogsten)

Question 28

Quelle est la conséquence due au fait que le sillon majeur de l’ARN soit moins large que celui de l’Adn

Answer 28

Il peut pas permettre la penetration de l’helice alpha et feuillet beta pour reconnaissance ADN

Question 29

Comment peut on remedier a l’etroitesse du sillon majeur de l’ARN A

Answer 29

paire de bases non canoniques
Bulge
= elargissement du sillon

Question 30

3 facons de representer la structure 2nd de l’ARN

Answer 30

Graphe planaire
Diagramme en forme d’arc
Chaines de caractères

Question 31

Qu’est ce qui definit la structure 3d face a la 2nd ?

Answer 31

Arrangement 3D avec double helice et motifs
Interactions tertiaires qui se forment si deux lignes se croisent sur le diagramme en forme d’arc

Question 32

A quoi servent les regions non appariées dans 2nd ?

Answer 32

Contiennent des motifs structuraux qui servent a la formation de la 3D