Chap 1 Flashcards
Quel est le pka de chacun des acides aminés polaires/chargés ?
STALCTHAA =13,13,12.5,10.5,10.1,8.3,6,4.3,3.9
Ordre des lettres grecque pour chaîne lateral AA
Alpha beta gama sigma epsilon zeta
C’est quoi un AA beta branché ? Et on les retrouve ou et pk ?
1 atome de C en beta et seulement 1H branché. Retrouve dans feuillet bêta car difficile de former une helice alpha
Acide polyprotique ??
Faible : (A-)x(h3o+)/AH
Equation d’Henderson-Hasselbalch ?
Pka=-logka
pH= pka + log(A-/AH)
Valeurs des pka de cooh et nh3+
2 et 9 environ
Les aa sont des molecules chirales ? Achirales ? D ou L dans la nature ?
Chirale et L
Liaison peptide longueur et conformation ?
0.133 nm et trans
Sont ils coplainaires ? Elle est elle partiellement double ? (Liaison C-N)
Oui
Comment appelle t on un seul type de chaine ? Plusieurs type de chaine ? 1 seule chaine ?
Homo-oligomerique
Hetero-oligomerique
Monomerique
Un exemple d’hetero-oligomere
Hemoglobine avec 2 chaines alpha et beta
Quelles sont les 3 formes des protéines et leurs caractéristiques ?
Fibreuse : simple linéaire
Globulaire : sphérique compact hydrophobe intérieur et hydrophile extérieur donc soluble
Membranaire : assez hydrophobe
Architecture des protéines niveau moléculaire ? 4 stades ?
1: sequences aa
2: repliement local
3: repliement global (structure 2nd)
4: sous unités peptidiques
Quels sont les déterminants de la conformation d’une prot globulaire ? Y’en a 5
Sequence aa
Ponts s-s
Interaction hydrophobe
Tt types de liason
Rotation angle phi et psy
Force (liaison qui influence la structure ?)
Ionique (electrostat)
Van der walls
Hydrogène
Hydrophobe
Non covalente
Effet du sel sur liaison ionique ?
Affaibli la liaison
