Chap 1 Flashcards
Quel est le pka de chacun des acides aminés polaires/chargés ?
STALCTHAA =13,13,12.5,10.5,10.1,8.3,6,4.3,3.9
Ordre des lettres grecque pour chaîne lateral AA
Alpha beta gama sigma epsilon zeta
C’est quoi un AA beta branché ? Et on les retrouve ou et pk ?
1 atome de C en beta et seulement 1H branché. Retrouve dans feuillet bêta car difficile de former une helice alpha
Acide polyprotique ??
Faible : (A-)x(h3o+)/AH
Equation d’Henderson-Hasselbalch ?
Pka=-logka
pH= pka + log(A-/AH)
Valeurs des pka de cooh et nh3+
2 et 9 environ
Les aa sont des molecules chirales ? Achirales ? D ou L dans la nature ?
Chirale et L
Liaison peptide longueur et conformation ?
0.133 nm et trans
Sont ils coplainaires ? Elle est elle partiellement double ? (Liaison C-N)
Oui
Comment appelle t on un seul type de chaine ? Plusieurs type de chaine ? 1 seule chaine ?
Homo-oligomerique
Hetero-oligomerique
Monomerique
Un exemple d’hetero-oligomere
Hemoglobine avec 2 chaines alpha et beta
Quelles sont les 3 formes des protéines et leurs caractéristiques ?
Fibreuse : simple linéaire
Globulaire : sphérique compact hydrophobe intérieur et hydrophile extérieur donc soluble
Membranaire : assez hydrophobe
Architecture des protéines niveau moléculaire ? 4 stades ?
1: sequences aa
2: repliement local
3: repliement global (structure 2nd)
4: sous unités peptidiques
Quels sont les déterminants de la conformation d’une prot globulaire ? Y’en a 5
Sequence aa
Ponts s-s
Interaction hydrophobe
Tt types de liason
Rotation angle phi et psy
Force (liaison qui influence la structure ?)
Ionique (electrostat)
Van der walls
Hydrogène
Hydrophobe
Non covalente
