Chap 4 Flashcards
Par quoi sont denaturés facilement les proteines
Alterations interactions non-covalentes de faible energie
Qu’a prouvé l’expérience d’Anfisen avec la Rnase A ? Comment ?
Que la structure 3D et la fonction d’une prot dépendait de la sequence d’AA
Dénaturation des ponts S-S avec Urée (agent denaturant) puis il l’a enlevé et la protéine s’est refaite
C’est quoi la formule du calcul de levinthal et c’est quoi ?
Repliement des prot
T= 10^n/10^13 en sec
Y’a il souvent des intermediaires dans la voie du repliement d’une protéine ?
Oui
Qu’est ce qui détermine le repliement d’une prot ? 3pts
Residus interne
Force hydrophobe (tres fort)
Helice et feuillet (moins present mais plus specifique)
Ordre de repliement d’une protéine ? 6points
Court segments secondaire
Sous domaines
Domaines
Globule fondu
Conformation native
Multimerisation
Quels sont les particularités de l’etat globule fondue ? 2
Meme structure secondaire que conformation naive
Si c’est une enzyme elle est INACTIVE
Qu’est ce que le guanidinium ?
Agent denaturant
Sur une chromatographie sur gel qui sort en premier entre la forme native et dénature ?
Forme dénaturée qui est moins compacte
Donne 3 moyens de dénaturer une proteine
Temperature change spectre
pH change ionisation et ponts H
Agents chaotropiques enleve les liaisons hydrophobes (urée)
Donne moi 2 techniques de determination de repliement in vitro avec leur fonctionnement
Spectroscopie de DC
Changement dans le spectre qui indique un changement de la structure secondaire apres dénaturation (%)
RMN
Changement de déplacement chimique
Fonctionnement de la spectroscopie de DC ? Que mesure t il ?Équation ?
Utilise la lumière circulaire polarisée comme source de radiation sur les mol chirales
Mesure la diff d’absorption apres exposition a la LCP coeff comme loi de beer lambert
Ce mesure en ellipticite molaire deg cm dmol
Quels sont les avantages de la spectroscopie DC ?
Determiner la compo en structure 2nd facon quali ou semi quali
Observer les changements de structure 2nd
Échantillon petit et intact
Quels sont les limites de la spectroscopie DC
Info global pas precis sur un site
On peut pas savoir si y’a plus de 1 conformation
Pas de modele théorique precis (base sur experience)
Repliement in vivo : Quand se replie les prot ?
Apres sortie complète ribosome
Longeur largeur canal ribosome ?
100 et 15 A soit 30 aa et que des helices
Est ce que la conformation native depend de la structure primaire ? Et le repliement in vivo est il spontané ?
Oui et non
Qu’est qui in vivo pousse les new polypeptide a s’agréger ?
Congestion moleculaire
Quel est le facteur associé au ribosome chez procaryote/eucaryote ? Association direct au ribosome ? Atp ?interaction ? Quel poids de prot ? Native ou intermidiaire ?
TF et NAC
Oui
Non
Hydrophobe
Moins que 25 kDa
Native
Quel est la chaperonines associes chez procaryote/eucaryote ? Association direct au ribosome ? Atp ?interaction ? Quel poids de prot ? Native ou intermidiaire ?
GroEL et TRic
Non
Oui
Hydrophobe
Entre 25 et 60 kDa
Native et intermédiaire
Quels sont les facteurs associés chez procaryote/eucaryote ? Association direct au ribosome ? Atp ?interaction ? Quel poids de prot ? Native ou intermidiaire ?
Hsp70 dnak hsp70
Co-chaperon dnaj
Hsp40
Echange nucleotides Grpe Bag1
Non
Oui
Hydrophobe
Plus de 60 kDa
Native
Chaperonine : Combien d’anneau dans un GroEL/ES
2 anneaux 7 sous unités chacun dos a dos
Pour HSP70 ou dnak est ce que le temps de repliement est proportionnel a la taille moléculaire ?
Oui
A quoi sert la proteine disulfure isomerase ? Pdi
Facilite le repliement de protéines qui se dénaturent si elles ont plus leur s-s
Quels sont les AA présents sur la pdi ?
CGHC (2 cysteines importantes)
Que fait la forme reduite de la pdi ?
Catalyse reaction échange entre liaison s-s
Que fait la forme oxydee de la pdi ?
Catalyse synthese de s-s
Les régions désordonnées dans les protéines sont elles fréquentes chez les eucaryotes ?
1/2 des protéines en ont
Par quoi est cause le desordre dans une proteine ?
Acide amine polaire
Chez quel type de prot sont frequent les régions désordonnées
Facteur de transcription / voix de signalisation / virus
Que se passe il si tu relies deux proteines au niveau des régions désordonnées ?
Elles se replient
Dans quelles maladies sont impliquées les régions désordonnées ?
Amyloïdoses ( neurologique )
C’est quoi la famille des amyloïdoses ?
Maladie ou les proteines solubles sont devenues fibrilles donc insolubles
Parkison
Ou maladie a prion bse
