6 - pharmacogénomique Flashcards
buts de la PGx
- Diminuer la variabilité de réponse des tx
> Augmenter l’efficacité en donnant le tx aux répondants et ne pas l’administrer aux non-répondants - Diminuer les EI
- Diminuer les coûts –> ajustement de la dose en fonction du profil PGx, au lieu de changer le tx
- Diminuer l’attrition des nouveaux tx en développement
différence dans l’administration de tx sans vs avec pharmacogénomique
- sans : pas de différenciation entre répondeurs et non-répondeurs donc pas de personnalisation de tx
- avec : on fournit des prescriptions aux répondeurs (aug réponse et diminue coûts) et on trouve tx alternatifs aux non/hyper-répondeurs (moins d’échecs thrp et $)
pharmacogénomique vs pharmacogénétique
- pharmacogénomique : l’étude de l’effet des gènes sur la réponse aux med
- pharmacogénétique : étude de l’effet de la génétique sur la variabilité de la réponse à un tx
but de la PG dans le développement du med
diminuer l’échec des nv meds en R&D
PG dans le développement du med : principe
- exclusion des non-répondeurs (inefficace) ou hyper-répondeurs (risque EI)
- permet de détecter plus facilement un effet stat significatif
V ou F : la PG est de plus en plus utilisée en R&D
V
BM pharmacogénomique
caractéristique mesurable de l’ADN/ARN qui est indicatif de processus bio normaux ou pathologiques OU de la réponse à des interventions thrp
BM PG : nature possible
- relié à ADN
- relié à ARN
BM PG : exemple relié à ADN
- SNP
- haplotype (grp d’allèles sur un chromosome)
- modif épigénétiques (méthylation)
- délétions ou insertions
- variations dans le nbr de copies
BM PG : exemple relié à ARN
- séquences
- expression
- tx de l’ARN
- concentration de micro-ARN
V ou F : un BM PG se limite pas juste aux échantillons humains
V, peut être d’origine virale ou animale
dans quels contextes l’utilisation d’un BM PG est pertinent
- essais de lab existent pour tester les BM phénotypiques et les marqueurs génomiques
- résultats suggèrent des différences claires et significatives entre les sous grp
- capacité à identifier des phénotypes de réponse aux med (peu importe la présence d’un marqueur PG)
- phénotypes de rép aux meds associés à des marqueurs génomiques connus
BM : stratégies de génotypage
- approche par gène-candidat
- approche pangénomique
stratégies de génotypage : AV et DV de l’approche par gène-candidat
- AV : puissance stat supérieure
- DV : étude de mécanismes slm, nbr limité de gènes/SNP
stratégies de génotypage : AV et DV de l’approche pangénomique
- AV : pas d’hypothèse a priori, étude simultanée possible de traits polygénique et variants génétiques, pas de limitations de connaissances de mécanismes
- DV : $$$, nécessite de grandes cohortes pour avoir une bonne puissance stat
analyses prospectives-rétrospectives
études faites une fois l’essai clinique complété, mais avec un devis d’analyse prospectif
analyses prospectives-rétrospectives : critères à rencontrer
- essai clinique adéquat, bien fait et avec grp ctrl
- nbr élevé de pts
- le marqueur d’intérêt mesurable chez la majorité des pts
- validité analytique du marqueur PG
- plan d’analyse pré-établi
avantages d’utiliser des BM PG dans le développement du med
- identifier les cibles pertinentes pour augmenter le ratio bénéfice-risque
- résultats influencés par le génotype
- principe éthique (limiter les essais)
limites d’utiliser des BM PG dans le développement du med (7)
- connaissances limitées des génotypes et phénotypes pertinents pour la rép aux med et à la progression de la maladie
- dispo limitée de la technologie et de l’expertise pour concevoir et interpréter les données PG
- taille d’échantillon
- la taille de l’effet du variant génétique sur le paramètre et la taille d’échantillon contribuent à la puissance stat de détection
- réglementation et standardisation complexe des méthodologies PG
- limites légales à la collecte d’échantillons dans certains pays
- considération commerciales et financières
à quoi sert le génotypage ADME en développement du médicament
identifier la variabilité des profils PK
BM PG dans le développement du med : en quoi l’échantillonnage est un défi
- diminution de la couverture génétique (car impossible de capturer toutes les variantes donc peut avoir erreur de classement des pts)
- diminution des effets stat significatifs