גנטיקה של אוכלוסיות Flashcards
כשהיינו חוזרים אחורה בזמן היינו מצפים שמספר אבות אבותינו?
היו גדלים באופן אקספוננצילי
למה יש פחות אבות בהיסטוריה ממה שאנחנו מצפים?
עקב התמזגות באילן היוחסין
מהן הסיבות לשונות במין האנושי?
מנגנונים גנטים
מנגנונים חברתיים וסביבתיים
A single nucleotide variant (SNV)
שינוי בנוקלאוטיד יחיד בגנום.
SNP-single nucleotide polymorphism
משמעות
- שינוי בנוקלאוטיד בודד
שצריך להיות בדנ”א הגרמינאלי.
וחייב להיות לפחות ב- 1 אחוז באוכלוסיה.
יכול לגרום לשינוי בח”א.
יכול לא לגרום לשינוי בח”א.
מרביתם- לא משנים.
שנים אנשים שונים אחד מהשני , בכמה נוקלאוטידים?
(SNP/SNV)
3 מליון אותיות
לכמה אחוז מה-
SNPS אין משמעות פנוטיפית?
95%
מהם הסיבות המרכזיות שגורמות לשינוי תכונות בגנום במקומות שונים בעולם?
אקלים
תזונה
עמידות למחוללים
על מה משפיעה היסטוריה דמוגרפית?
משפיעה על תדירות האללים בכל רחבי הגנום.
על מה משפיעה הסלקציה/ברירה טבעית?
משפיעה על תדירות אללים באזורים גנומים ספציפים
מתי נוצרה מרבית השונות באללים בהיסטוריה?
לפני שבני אדם נדדו על פני כדור הארץ.
הבדל בצבע אור קשר ל-
קרבה לקו המשווה וחשיפה לקני אור.
ההשפעה של ויטמין
D?
במה תלוי?
משפיע על בריאות נשים ופוריותן.
בחשיפה לשמש - נוצר בעור.
נדידה של נשים מקו המשווה וויטמין
D?
התבהרות של העור עזרה לנשים שנדדו מקו המשווה לייצר ויטמין
D.
ניתן לראות
SNPS
שנמצאים ב-
בכל היבשות
בכל מהיבשות
ביבשת ספציפית.
באוכלוסיה ספציפית בתוך יבשת
מהם הדברים שקרו שחשפו אותו לאללים שונים/ אללים גורמי מחלות?
תוחלת חיים התארכה-
הווריאנטים שמעלים את הסיכון למחלות באים לידי ביטוי כעת.
האבולוציה התעלמה מהם בעבר, כי לא השפיעו- לא הגענו לגיל מבוגר.
אוכלוסיה גדלה- יותר צאצאים- יותר אללים יחודיים
רוב ה-
SNV הם
מאוד נדירים, נמצאים בשכיחות של מתחת ל-
1%
מה שיכול ליצור
מוטציות פרטיות נדירות
אפקט צוואר בקבוק-
תופעה דמוגרפית.
לא קשורה לאבולציה אלא להיסטוריה של אנשים.
מתוך אוכלוסיה שלמה- עברו קומץ של אנשים/שרדו קומץ של אנשים- מוביל לצמצום של השונות.
נוצרת אוכלוסיה חדשה שמייצגת רק חלק מהשונות של האוכלוסיה המקורית.
יכול לגרום למוטציות נדירות להיות שכיח.
founder effect?
למה יכולה להוביל
אוכלוסיה- חלק מהאוכלוסיה יוצרת אוכלוסיה חדשה.
באוכלוסיה המקורית- מוטציה מאוד נדירה.
באוכלוסיה החדשה- מוטציה מאוד שכיחה.
מעלה את השכיחות של
אללים מעוררי מחלה.
דוגמה למוטציה מייסדת-
BRACA1\2
ביהודים אשכנזים.
מה איפשרה לנו שיטת
GWAS?
לבדוק מחלות ללא תורשה מנדלינית שחודשים כי יש לה מרכיב גנטי.
לבדוק האם יש
SNPs
שיותר שכיחים בחולים לעומת הבריאים.
מאפשר להוביל לאזור גנומי חשוד.
מהו הווריאנט שמעלה את הסיכון לחלות באלצייהמר?
APOE4/4
איפה נמצא הגן
APOE
ובאיזה אקסון
יש את הווריאנטים שיוצרים את
הגורם המגן/מסכן לחלות באלצייהמר
כרומוזום
19
אקסון 4.
שם יש שני ווריאנטים
שיוצרים 4 אפלוטיפים.
באיזה אוכלוסיה ניתן לראות שכיחות גבוהה של מחלת כליות כרונית?
פי כמה?
בתושבי אפריקה הסאב סהרית.
*ניתן לראות אצל אפרו אמריקאים.
פי 4.
מהי הסיבה לכך שהשכיחות של מחלת כליות כרונית נפוצה דווקא באוכלוסיה זאת?
עקב ווריאנט שונה.
בגן ל-
APOL1
מה הווריאנט שנמצא אצל אוכלוסית הסאב - סהרה
באפריקה מספק?
עוזרים נגד טפילים באיזור הסאב סהרה.
מה הראו הממצאים על השתלת כליות?
הישרדות שתל מתורם אפרו-אמריקאי הייתה פחותה מתורם
ממוצא אירופאי.
הוביל לכך שלא ביצעו שימוש בכליות מתורמים אפריקאים.
היום לוקחים כליות למי שאין את הווריאנט המסוכן של
APOL1.
אנמיה חרמשית- אללים
אלל הטרוזיגוטי- לא גורם לאנמיה חרמשית אבל מגן מפני ההידבקות במלריה (יתרון הישרדותי).
אלל המוזיגוטי- אנמיה חרמשית
הקשר בין תדירות אליל
לבין ההשפעה לחלות בין מחלה מסויימת-
ככל שהוורינט יותר נדיר
ההשפעה היא חזקה יותר.
וככל שההוריאנט יותר שכיח-
ההשפעה שלו היא חלשה יותר.
יש יוצאים מהכלל.
- polygenic risk score
הצטברות של מספר מוטציות שמעלות את הסיכון למחלה שכיחה
polygenic risk score
נשים לעומת גברים-
לנשים אין השפעה של polygenic risk score.
לגברים יש השפעה חזקה מאוד ל- polygenic risk score.
דרך לבדוק אב קדמון משותף שהתגלתה-
דרך כרומוזום
Y
קרבה גנטית
קרבה גנאלוגיה
לא זהה.
גנאלוגיה משותפת- אב קדמון משותף.(Y דומה)
קרבה גנטית- היא זאת שרלוונטית מבחינה רפואית.
למי יש מגוון גנטי גדול יותר?
לשימפנזים או כל בני האדם על כדור הארץ?
שימפנזים- נמצאים יותר זמן מאיתנו אבולוציונית ולכן היה להם זמן רב יותר לרחוש שונות גנטית.