VIRUS : BIOLOGIE ET CLASSIFICATION Flashcards
Nommez les caractéristiques des virus
-ils ne sont pas considérés vivants
-ils sont des parasites intracellulaires obligatoires
-ils sont incapable de synthétiser des protéines ou produire de l’énergie par eux-mêmes (en dehors d’une cellule)
-les virus ont une taille beaucoup plus petites que les bactéries : 18 à 300 nm (non visibles au microscope optique)
-ils peuvent infecter les insectes, les poissons, les plantes, les reptiles, les mammifères et les bactéries (bactériophages)
Qu’est-ce qu’un virus?
La particule virale est nommée un virion
Un virion est composé d’un génome viral entouré d’une capside +/- une enveloppe
Le génome viral est composé soit d’ADN ou d’ARN mais pas les deux
Certains virus sont entourés d’une enveloppe
-composante interne (protéines virales)
-composantes externe (composante lipidique)
-+ ou - des spikes (glycoprotéines)
Réplication virale
- Attachement
-protéine d’attachement sur le virus
-récepteur sur la cellule - Pénétration du virus dans la cellule
- Décapsidation
- Transcription et réplication
- Assemblage
- Libération
Classification et forme
-Génome des virus ARN ou ADN
-Formes : linéaire, circulaire, segmenté
-Brins : simple brin, double brin
-Formes : icosaèdre, sphérique, filamenteuse, balle de fusil
Réplication virale
Les virus ARN se répliquent dans..
Les virus ADN se répliquent dans..
Certains virus doivent fournir une ou des..
Les virus ARN se répliquent dans le cytoplasme
Les virus ADN se répliquent dans le noyau
Certains virus doivent fournir une ou des enzymes pour forcer la réplication
Réplication virale (rétrovirus -VIH, HTLV-I, HTLV-II)
-ce sont des virus ARN
-ils possèdent une transcriptase inverse qui permet de produire un brin d’ADN à partir de l’ARN viral
-cet ADN viral peut être intégré à l’ADN de la cellule ce qui met le virus à l’abri du système immunitaire (pas prêt de trouver un tx contre VIH)
Classification des virus (hôtes et basée sur la structure)
Hôtes
-animal (humain, souris, oiseaux)
-plantes
-bactéries
Basée sur la structure
-taille
-morphologie
-acide nucléique (ADN ou ARN)
-nu ou enveloppé
Nommez les virus ADN enveloppés
-herpesviridae
-hépatite B
Nommez les virus ADN nu
-virus papillome humain
-adénovirus
-parvovirus B19
Nommez les virus ARN enveloppés
-virus de l’influenza
-coronavirus
-virus respiratoire syncytial
-virus de la rougeole
-virus de la rubéole
-virus des oreillons
-VIH
-virus hépatite C
Nommez les virus ARN nu
-virus de l’hépatite A
-entérovirus
-rhinovirus
-rotavirus
-calicivirus
-astrovirus
Nommez les caractéristiques des virus nus
- Résistants
-température
-à des détergents
-à la sécheresse
-à l’acide (acidité gastrique, pas tous résistants) - Sont libérés dans la cellule lors de la lyse cellulaire
- Transmission par contact direct et indirect, gouttelettes
- Bonne survie dans l’environnement et dans le tractus digestif
Nommez les caractéristiques des virus enveloppés
Composantes de l’enveloppe : membrane, lipides, protéines, glycoprotéines
- Fragiles aux conditions adverses de l’environnement
- Facilement détruits par l’acidité gastrique
- Transmission surtout par contact direct ou par gouttelettes
- Libérés de la cellule hôte soit par bourgeonnement ou lors de la lyse cellulaire
*Exception : le virus COVID-19 est enveloppé, mais il y a des évidences qu’il se transmet par aérosol
Classification des virus
Adénovirus =
Entérovirus =
Virus des hépatites =
Adénovirus = adénoïdes (récepteurs permettent de rentrer dans les adénoïdes (dans ganglion))
Entérovirus (tractus digestif)
Virus des hépatites A, B, C, D et E (foie)
La classification des virus se fait aussi selon leur capacité ou non de pouvoir..
La classification des virus se fait aussi selon leur capacité ou non de pouvoir être cultivés en laboratoire
-virus cultivables
-virus non cultivables
Qu’est-ce qu’un arbovirus?
Certains virus sont transmis par arthropod
Classification des virus basée sur une manifestation clinique
Jaunisse (ictère)
-virus des hépatites A, B, C, D, E
-virus de la fièvre jaune
Encéphalite (inflammation du cerveau)
Diarrhée
Virus exanthémateux (éruption cutanée)
-vésicules (cloches d’eau)
-érythème ou macule (rougeurs sur la peau)
-érythémato-papulaire ou maculo-papulaire (rougeurs et surélévation des lésions)
Nommez les virus qui donnent une manifestation clinique éruption de type “rougeur”
-virus de la rougeole
-virus de la rubéole
-virus de l’herpès humain-6 (HHV-6)
-parvovirus B19 (5ième maladie)
-virus esptein-barr (mononucléose)
-entérovirus
-VIH
Nommez les virus qui donnent une manifestation clinique éruption de type “vésicule”
-virus varicella-zoster
-virus herpès simplex
-entérovirus
Outils diagnostiques disponibles pour les infections virales
- La culture virale (n’est plus utilisée depuis la pandémie de COVID-19 dans les laboratoires hospitaliers)
- La détection d’antigènes viraux
- Les tests d’amplification d’acides nucléiques (TAAN)
- La sérologie virale
Les prélèvements pour la culture virale peuvent se faire où?
-d’une lésion cutanée
-d’une muqueuse (ex: gorge, vulve, col)
-d’un liquide normalement stérile (ex: urine, liquide céphalo-rachidien)
-d’un tissu (poumon, foie, rein, etc)
*La culture virale ne s’applique pas à du sang
La recherche d’antigène viraux
Recherche d’influenza
-on recherche une bande rose
-gauche : A
-droite : B
On fait plus de test de biologie moléculaire
Recherche d’Ag pour le diagnostic d’infections virales
Sérum - AgHBs (virus de l’hépatite B)
Sérum - Ag p24 du VIH
Nez/nasopharynx/gorge - SRAS-CoV-2
Recherche d’antigènes viraux dans les sécrétions du nasopharynx
-moins sensibles que les TAAN
-applicable à peu de virus
pour la recherche de SARS-CoV-2 (ex. Panbio)
-méthode autorisée au Qc uniquement pour les personnes symptomatiques
-moins sensible que les TAAN (faux négatif)
-moins spécifique que les TAAN (faux positif)
Caractérisiques des tests d’amplification d’acides nucléiques (TAAN)
-technique de + en + utilisée
-applicable à beaucoup de virus (mais pas tous)
-$$$$$$$$
-rapide (<24 heures)
-personnel spécialisé (technicien, biologiste moléculaire)
-ne sont pas disponibles dans tous les laboratoires hospitaliers
ANTICORPS
_____ apparaissent les premiers mais sont présents de façon transitoire
_____ apparaissent un peu plus tardivement, mais persistent après la guérison
IgM apparaissent les premiers mais sont présents de façon transitoire
IgG apparaissent un peu plus tardivement, mais persistent après la guérison
Rappel : IgG au bébé, mais pas IgM
Virus pour lesquels une sérologie IgM est disponible dans les laboratoires hospitaliers
-cytomégalovirus
-virus epstein-barr
-virus des oreillons
-virus de la rougeole
-virus de la rubéole
-parvovirus B19
-virus de l’hépatite A
-virus de l’hépatite B (anti-HBc IgM)
Quel virus à une forme segmenté?
Influenza
Nommez les 2 virus provenant d’animaux qui nous préoccupent
-rage
-SRAS 1 : grippe aviaire
