virus Flashcards
description virus ?
agent intracellulaire obligatoirement parasite
- dépend de la machienir de l’hote car ne peut pas faire d’É ou de prot par lui meme
- adn ou arn
- enveloppé ou non
- agents infectieux donc les composantes sont assemblés et donc virus ne se reproduit pas par division cellulaire
historiquement, on les décrivaient comme des organisme pouvant être filtré (filtres concu pour retenir les bactéries)
que faut il pour que le virus se propage /s ereplique?
puis qu’il nest PAS VIVANT : il doit être capable d’infecter la cellule hote et capable d’utiliser la machinerie de l’hote pour produire ses propres composantes, savoir encoder tous les processus requis qui ne sont pas fournit par la cellule hote.
puis les composante virales formée dans la cellule hote doivent etre capables de s’assemblée entres elles.
donc : puisque ce nest pas tous les virus qui peuvent infecté toutes les cellules :
- virus doit pouvoir pénétrer dans cellule
- la cellule doit avoir la machinerie necessaire approprier pour que le virus puisse se répliquer
- une fois répliqué, le virus doit pouvoir être libéré de la cellule et transmettre l’infection. (assure sa survie)
taille des virus?
nanomètre
plus petit = parvovirus (18 nm)
plus gros = poxvirus (300 nm) = sont presque visible en microscopie optique (taille similaire a la chalmydia. souvent + gros = codent pour + de prot et sont + complexes.
composition de la particule virale ?
- acide nucléique entouré d’une capsule protectrice protéique (couche de protéine) = nucléocapside = présentes chez tous les virus!!!
génome d’acide nucléique+ capside protéique + enzyme qui lient la capside a l’acide nucléique = nucléocapside
facultatif = enveloppe (nus ou enveloppé)
nucléocapside + membrane de glycoprotéines = virus enveloppé
3 forme sde nuclécpaside?
- icosahédrique
- hellicoïdale
- complexe
le génome d’acide nucléique des virions (particule virale)?
- adn : simple ou double brin circulaire ou linéaire OU - arn (segmenté ou non) simple brin (polarité + comme arnm ou - : tous les simple arn négatif sont enveloppés) double brin
la couche la plus externe du virus (capsule ou enveloppe? fct ?
- permet la structure, protection et véhicule de transmission du virus
- les structure a la surface du virus permettent l’interaction du virus avec la cellule hote via des protéines d’attachement virale (PAV)
donc : si on détruit la couche externe du virus, on l’INACTIVE. Les anticorps dirigé contre la surface du virus préviennent les infections.
caractéristique de la capside ?
- structure rigide fait de protéines capable de résister a des conditions environnementales difficiles.
Les virus NUS sont RÉSISTANTS : à la sécheresse, acidité, les détergents (ceci inclut l’acide gastrique et la bile)
–> leur résistance au acide et détergent détermine leur mode de transmission.
la capside peut être SYMÉTIQUE (helicoïdale ou icsahédrique) ou ASYMÉTIQUE (complexe)
la capside icosahédrique ?
les protéines virales (sous unité protéiques) s’unissent en ‘‘protomère’’
5 protomère s’unissent pour formé des capsomère (‘’ pentamère’’). cest capsomère (pentam;re ou penton) s’uniront en capside.
une capside est fait de 12 capsomère (qui interagissent toute avec 5 autres capsomère)
l’icosahédrique ressemble a une sphère résultant de l’assemblage de plusieurs sous unité protéiques dont toutes les faces sont identiques.
L’acide nucléique est au centre de la capside qui le protège
** les icosahédriqu eplus gros sont formé en insérant des capsomère (hexon) entre les pentons.
capside hélicoïdale ?
les sous unité protéiques interagissent ensemble et avec l’acide nucléique pour former une sorte de batonnet cylindrique protéique qui peut être
- rigide
- creux
- flexible
l’enveloppe caractéristique?
- membrane de lipoprot, prot et glycoprot (similaire aux membrane plasmatique)
- les glycoprot sont ancrées dans la membrane et se projette hors du virus (comme des ‘’ spikes ‘’ ou ‘’ spicules ‘’)
fct penveloppe ?
- des glycoprot peuvent agir comme protéines d’attachement virale capable de lier certaines cellules cibles.
- ce sont des antigène majeurs pour l’organisme : peuvent eliciter une immunité protectrice.
caractéristique des virus enveloppé (vs nus)?
- contrairement au virus nus, sont facilement inactivé a la sécheresse, acide, détergent et solvant (la plupart ne peuvent survivre dans tractus digestif)
leur enveloppe doit resté mouillée: ils sont donc transmis par les fluides comme le sang, gouttelette respiratoire et les tissus.
classification des virus …?
basée sur :
- morphologie du virus (structure du virion) : symétrie de la capside (complexe, helicoïdale, icosahédrique), enveloppé ou non, nb de capsomère etc.
- acide nucléique (adn ou arn (polarité) // segmenté ou non // circulaire ou linéaire).
classification des virus à adn?
- simple ou double brin ?
- simple = non enveloppé = parvovirus
- double =
enveloppé = poxvirus (helicoïde)
ou non enveloppé (circulaire ou linéaire)
les adn sont simple ou double. les simple tjrs nus
les double peuvent etre nus ou enveloppé
sont tous icosahédrique sauf le spoxvirus (double enveloppé)
les double brins nus sont circulaire ou linéaire
classification des virus a arn ?
- simple brin
– polarité
+ : enveloppé (icosahédrique ou helicoïde) ou non (icosahédrale)
- : tjrs enveloppé hélicoïde - double brin
non enveloppé icosahédale
les virus arn : double ou simple. double sont tjrs nus icosahédrique.
les simples sont polarité - ou +.
les pol - sont tous enveloppé et helicoïdale.
les pol + sont enveloppé (helicoïdale/icosahédrique) ou nus (icosahedrique)
poxviridae? helicoïdale, double adn enveloppé
virus de la variole
herpes viridae? adn
virus de l,herpes simplex 1 et 2
and : adenaviridae?
adeno virus
adn : hepadnaviridae
virus de l’hépatite b
adn : papillomaviridae
virus du papillome humain
adn : polyomaviridae
JC virus
adn : parvoviridae
parvovirus B18
famille arn et virus imp?
paramyxoviridae : rougeole et oreillon orthomyoviridae : influenza type a et b coranoviridae : coranovirus arenaviridae: fièvre de lassa rhabdoviridae : rage flivoviridae : ebola bunyaviridae : encephalopathie de californie rétroviridae = vih reoviridae : rotavirus togaviridae : rubéole flaviviridae : fièvre jaune, du nil, hépatite C calciviridae : norwalk picornaviridae : polio
mecanisme de base de réplication ?
la cellule hote fournit l’É, les substrat et la machinerie necessaire a la replication des prot virale et replication du génome.
le reste qui nest pas fourni par la cellule doit être encodé dans le genome viral.
étape de la replication virale ?
1- reconnaissance de la cellule cible
2- attachement
3- pénétrer dans la cellule cible via la membrane plasmatique
4- décapsidation
5- multiplication virale : synthèse des constituant viraux (4 sous etape)
6- assemblage du virus
7- bourgeonnement des virus enveloppé
8- relachement du virus hors de la cellule
les 4 sous étapdes de la synthèse de constituant viraux ?
1- synthèse d’arnm précoce et de prot non structural
2- réplication du génome
3- synthèse de l’arnm tardif et des prot structurale
4- modification post trad des protéines
- des erreures peuvent être produite rsultant en des virions vident ou avec génome defectueux.
reconnaissance et attachement du virus?
les virus ont des PAV (prot d’attachement virale) ou autre pour se lier a un R sur une cellule cible. virus peuvent lier R sur certaines cell seulement, parfois chez certains hote seulement.
les cellules ciblées par le virus forme de TROPISME TISSULAIRE.
EX. LE VIRUS DE L’HÉPATITe C est hépatrope
ex. de PAV : gp120 VIH et HAgp de l’influenza A
ex. de R cellule: CD4 (lie VIH) et acide sialique des cell épithéliale qui lie l’influenza A
exemple de tropisme tissulaire et maladie ?
- pneumotrope (influenza, adenovirus, rhino virus etc)
- neurotrope (rage, encephalite,polio)
- visérotrope (VIH, mononucléose, gastro, hépatite, fièvre jaune
- dermothrope (variole, rougeole, rubéole, varicelle, zona)
entrée dans la cellulel ?
- nus : endocytose médiée par R
- enveloppé = fusion des membranes et la nucléocapside est relaché dans le cytoplasme
lieux de décapsidation ?
une fois dans la cellule, la nucléocapside doit se rendre a son site de réplication et se rompre.
adn : génome transporter au noyau : se réplique a/n du noyau en utilisant les polymérase de la cellule hote.
arn : génome reste dans le cytoplasme pour se répliquer (exception des rétrovirus et orthomyxovirus). ces virus doivent odnc eux meme encoder les enzymes necessaire a la transcription et réplication (la cellule hote ne peut pas transcrire a partir de l’arn)
assemblage et bourgeonnement du virus?
dépend du lieu de réplication et du fait que le virus est nus ou enveloppé.
- virus adn assemblé dans le noyau (sauf pour les poxvirus)
- virus arn et les poxvirus assemblé dans cytoplasme
les capsides virales sont soit : assemblé puis remplis de génome ou assemblée autours du génome.
–l’enveloppe est acquise….
soit lors du bourgeonnement du virus hors de la cellule ou soit du RE et appareil de golgi.
la plupart des virus a arn bourgeonne sans tuer la cellule.
le relachement hors de la cellule?
les virions sont relaché hors cellules par :
- lyse cellulaire
- exocytose
- bourgennement a travers la membrane plasmatique
souvent :
nus = lyse cellulaire
enveloppés = bourgennement sans mort de la cellule hote.
* les virus qui bourgeonne dans le cytoplasme (ex. du RE) sont relacher par exocytose ou lyse cellulaire.
mécanisme de transmission virale ?
- fécale orale (aliment et eau contaminé)
- aérosol
- relaxation sexuelle
- mere-enfant (transmission verticale)
- sang contaminé ou transplant d’organe
- zoonose
- fomite (vecteurs passifs)
- contact direct avec des sécrétions (salive, plaie, goutelette)
le principal déterminant de la transmission virale ?
L’ENVELOPPEMENT OU NON DU VIRUS.
la transmission depend de la source du virus, de sa capacité à endurer les conditions de l’environnement et du corps jusqu’a sa cellule cible.
– les virus enveloppé sont résistance au température et ph extrème, secheresse, detergent etc. contrairement au virus enveloppé.
transmission virus nus ?
puisqu’il survivent a lacidité de l’estomac et au sels biliaires, ils se transmettent souvent par voie fécale orale et sont une sources fréquente d’objets contaminé (fomite)
leur capside est protéique, ils sont + stable dans les condition environnante et peuvent être transmis plus facilement, rester infectieux malgré une sécheresse et résister à l’acide gastrique.
transmission du virus enveloppé?
il doit avoir une enveloppe intact pour rester infectieux et doit resté mouillé. Il est doit + souvent transmis par les fluides : gouttelette respiratoire, mucus, sang, salive, sperme, organe transplanté (ex. vih, influenza, hepatite B)
la membrane est faite de lipide, prot et glycoprot. ils sont labiles face aux conditions environnante et doivent resté mouillé. Ile ne survivent donc pas au GI et doivent être transmis par grosse goutelette (sang, organe transplanté, sécrétions, tissus)
le rôle des animaux?
- ils peuvent etre vecteurs, porter et transmettre l’infection a dautres animaux ou homme (zoonose = mx virale pouvant atteinte homme et animaux)
- ils peuvent être réservoir : maintiennent et amplifient l’infection.
def arbovirose ?
lorsqu’un arthropode est le vecteur d’une infection virale.
quelques conditions pouvant faliciter la transmission?
garderie hote asx qui peuvent propager l'infection promiscuité style de vie voyage/loisir
comment faire la dx d’infection virale?
1- détection d’anticorps spécifique chez l’hote infecté : sérologie : très utilisé
2- PCR : détecter le matériel génétique viral (++ utilisé)
3- observation en microscopie electronique (en recherche)
4- culture virale : sur cell de tissus humain monocouche (on voit apparaitre des effet cytopatogénique) : parfois utilisé
comment on controle les infection virale?
- vaccin (atténué, inactivé) : en prévention
- tx antiviral seulement pour certaines infection
les 6 cibles thérapeutique pourle tx antiviral (cible différentes étapes du cycle de réplication cellulaire)
- inhibition de l’attachement (antagoniste du R qui bloquent l’interaction virus cellule ou des agent neutrlisant)
- inhibition de l’entrée dans la cellule et de la décapsidaiton : si on bloque ceci, le génome ne peut être libéré. pour virus qui entre par vésicule endocytique : des antiviraux vont modifier le ph de ces vésicules pour empêcher la fusion/le bris de la membrane et empêcher la décapsidation.
- inhibition de la réplication du génome : LA PLUPART DES ANTIVIRAUX SONT DES ANALOGUE DE NUCLÉOSIDES : ex. analogue de adn polymérase viral ou arn transcriptase inverse = cible parfait car essentielles au virus mais absente chez l,H”
- inhibiteur de l’assemblage et relachement du virus.
inhibiteur de la décapsidation/entré ds cellule?
amantadine et rimamtadine (action + spcifique contre influenca A)
enfuvirtine : bloque entré et décapsidation du VIH.
mauvaise cible d’antiviraux?
- inhibition de synthèse d’arnm (car l’hote possède aussi des anrm)
les inhibiteur de la replication du génome?
analogue de nucléosides : ils se lient aux enzyme virale (polymérase virale qui est peut précise) et bloque la transcription souvent par arrête de l’élongation de l’arn ou d’adn
inhibteur de l’assemblage et relachement du virus.
inhiber les enzyme responsables de ces étapes.
ex.
inhibiteur de la protéase du VIH (enz essentielle pour l’assemblage du virus et production virions infectieux)
inhibiteur de la neuraminidase de influenza A et B (enz qui controle le relargage des virions
le coronavirus : 2019n-CoV
famille = coronaviridae sous famille = orthocoronaviridae genre = betacoronavirus espece : 2019n-CoV (se compare a SARS-CoV et MERS-CoV). mais ces deux la ont eu 8000 et 2000 cas et coronavirus 24000 * homologie de 80% avec SARS-CoV
aspect en couronne
ARN brin simple, polarité +, enveloppé
éclosion coronavirus?
janvier 2020 en chine
origine probable = chauve souris
en date du 31 decembre 2019: 27 cas de pneumonie (1er = 8 déc)
dans la province de Hubei (ville : Wuhan)
point commun des cas = sont aller au marché huanan fruits de mer et animaux a Wuhan –> ce sont tous des travailleurs ou des clients.
le marché a fermé le 1e janver
USA = 11 cas dans 5 état touché
canada : 4 cas : 2 toront, 1 vancouvert, 1 london
28 pays ont eu des cas
coronavirus : en date du 5 février?
24 000 cas (presque tous en chine)
grave = 15%
décès = 492 (2%)
nb pays touché = 28
surtout H 55.5 ans avec fièvre et toux seche et pneumonie bilatérale
+ rarement : dyspnée
transmission coronavirus ?
- transmission interhumaine : OUI (1 cas en génère 2.7 cas (2-3 autres) via contact, goutelette, aérosol
- il y a aussi 5% qui sont ‘’ super spreaders’’
À l’hopital : prévention?
chambre apression négative, protection occulaire, masque N-95, blouse imperméable, gants
tableau clinique coronavirus?
incubation 10-14j
- syndrome d’allure grippal avec diarrhée 20% des cas et infiltrat pulmonaire
contagiosité coronavirus?
sécrétion maximal du virus : 12-14 j après début des sx
contagiosité max : 4 semaine
considéré USPPI : urgence en santé publique portée internationale
def USPPI?
évènement extraordinaire constituant un risque pour la santé publique dans les autres états en raison du risque de propagation international de maladies pouvant requérir une action coordonnée internationale
traitement possible coronavirus?
- lopinavir/ritonavir +/- INF alfa : actif in vitro.
- remdesivir : efficace contre MERS-CoV mais aucun donnée contre coronavirus.
pour la chine on s’attent ?
bilan + 100 000 cas
+ 2000 mort
fin épidémie été/automne 2020
au canada : 4 cas, peut être un peut plus (aucun au qc) mais le risque de cas diminue e jour en jour
