UE1B-18 Les Analyses Biomédicales Flashcards
Quelles sont les 3 phases d’une analyse de Biologie Médicale ?
1) Phase Pré-analytique
2) Phase Analytique
3) Phase Post-analytique
Par quoi est dirigé l’analyse de Biologie Médicale ?
Par des contraintes normatives et règlementaires strictes, afin d’en garantir la qualité.
Par quoi sont réglementées les analyses sur les prélèvements d’origine humaine en France ?
Par :
- la norme ISO-15189 du COFRAC (Comité Français d’Accréditation).
- les articles L6211-1 à L6242-5 du Code de Santé publique.
Qui est responsable de ces 3 phases d’Analyse de Biologie Médicale ?
→ Le Biologiste Médical : Médecin ou Pharmacien
Concernant les Tests à visée de Dépistage (TD) ou d’Orientation Diagnostique (TROD)…
- PAS des Analyses Biomédicale.
- PAS régies par les même règles.
- Dépistage et NON PAS Diagnostic.
- Exemple : les tests urinaire de grossesse / test antigénique du COVID-19 → permettent le Diagnostic présomptif.
La Phase Pré-analytique
- Prescription de l’examen
- Prise de contact par le patient et/ou le prélever extérieur au laboratoire (infirmier libéral, médecin…)
- Acte de prélèvement
- Identification des échantillons prélevés
- Transport / Acheminement des prélèvements au laboratoire
- Différentes phases de pré-traitement et d’enregistrement des échantillons au laboratoire
Quelles conditions doit respecter cette phase ? (5)
RESPECT :
- des bonnes conditions de prélèvements
- des conditions d’acheminements au laboratoires
- de la cohérence de l’identité du patient entre la prescription et l’échantillon
- de la cohérence de la description en vue du diagnostic recherché
- de la présence des renseignements cliniques indispensables à la bonne prise en charge du prélèvement
Quelles sont les nombreux prélèvements qui existent ?
- Ponction de sang périphérique (veine)
- Ponction lombaire
- Ponction pleurale
- Ponction d’ascite
Quelle est la condition stricte pour que le prélèvement puisse être réalisé ?
- Les prélèvements doivent être réalisés dans des conditions d’ASEPSIE (= désinfection cutanée au niveau du point de ponction), afin de limiter tout risque de propagation de germes.
Définition : Tube VERT
=> Héparinate de Lithium
- faussera l’analyse de dosage du Lithium : qui sera anormalement élevé.
Définition : Tube VIOLET
=> complexe EDTA + Potassium
- faussera l’analyse du dosage du Potassium : qui sera anormalement élevé.
Définition : Tube BLEU
=> Contenant du Citrate de Sodium
- destinés aux analyses de coagulation du sang et sont toujours prélevés en premier (excepté quand il y a des hémocultures) pour éviter interaction avec les additifs des autres tubes pouvant fausser ces analyses de coagulation.
Pourquoi sont adaptés les tubes VERT et VIOLET ?
- Pour les analyses de type ionogramme et NFS (Numération Formule sanguine)
Définition : Phase Analytique
= Processus technique permettant l’obtention d’un résultat FIABLE et PRÉCIS pour l’analyse biologique.
Que se passe-t-il lors de la Phase Analytique ?
Un ou plusieurs éléments de l’échantillon vont être dosé(s), analysé(s) ou caractérisé(s) afin de répondre aux objectifs de l’analyse biomédicale.
Que doit-on faire à ce processus technique ?
- Il doit être STANDARDISÉ : afin de limiter le risque d’erreur (notamment lié à l’incertitude de mesure) et de permettre une reproductibilité des résultats.
Que met en place le laboratoire pour garantir la qualitéde ces résultats ?
- Des procédures de « Validation des méthodes»
- Des procédures de «Contrôles de qualité»
Comment peuvent être les «Contrôles de Qualités» ? (2)
- INTERNES (CQI) : «intra-laboratoire» : vérifier que le résultat obtenu dans MON LABORATOIRE est cohérents à l’échantillon de référence.
- EXTERNES (EEQ) : «inter-laboratoire» : vérifier que les AUTRES LABORATOIRES trouvent la même chose que mes résultats.
Quelles sont les 2 techniques permettant le dosage ou la caractérisation d’un élément contenu dans un liquide biologique ?
- Néphélométrie
- Turbidimétrie
Sur quel principe reposent ces 2 méthodes ?
Sur le principe selon lequel la LUMIÈRE, traversant un milieu contenant des particules dont l’indice est différent de celui du milieu, diminue en intensité du fait d’un phénomène de dispersion.
Définition : Turbidimétrie
(Technique de Routine)
- on mesure la lumière TRANSMISE
→ facile, rapide, peu coûteux
Processus de Turbidimétrie
On envoie un faisceau de lumière à travers la solution.
La lumière traverse la solution et certaines particules vont absorber une partie de cette lumière.
- Plus il y a de particules, Plus il y a une absorption importante.
La lumière restante qui traverse la solution est détectée par un capteur placé de l’autre côté du verre.
→ grâce à ce capteur on peut mesurer indirectement la concentration des particules.
Définition : Néphélométrie
(Technique de Référence)
- on mesure la lumière DIFFUSÉE : dans un angle donné α par rapport à la direction de la lumière incidente
→ long, coûteux
Processus de Néphélométrie
On place le capteur sur le côté de la solution.
Lorsque la lumière traverse la solution, les particules vont diffuser la lumière selon un angle.
- Plus il y a de Solution, Plus la quantité de lumière est importante.
→ On compare l’angle de diffusion à une valeur de référence.
Que permettent de réaliser ces 2 méthodes ?
Des dosages immunologiques de protéines spécifiques dans différents liquides biologiques : quantifier les particules contenu dans ma solution.
Exemple de ce qu’on peut quantifier
- les complexes immuns (Anticorps/Antigènes) :
présence d’une infection ? - l’albumine, pré-albumine, CRP :
présence d’une dénutrition ? ou d’une inflammation ?
Exemple : Dosage de l’Albumine
=> Permet de nous orienter sur : soit un état nutritionnel, soit une inflammation.
- La Turbidimétrie permet de mesurer la concentration d’Albumine de manière rapide et précise = technique de routine, couramment utilisée dans les laboratoires cliniques.
En cas d’Hypoalbuminémie ?
< 35 g/L dans le sang.
→ État de dénutrition.
En cas d’Hypoalbuminémie chez la personne âgée ?
< 30 g/L dans le sang.
→ État de dénutrition sévère chez la personne âgée.
Si l’ «Albumine» est BASSE et la «Protéine C Réactive» HAUTE ?
= Inflammation
Si l’ «Albumine» est BASSE et la «Protéine C Réactive» NORMALE ?
= Dénutrition
La Phase Post-analytique comporte 3 éléments :
1) Validation
2) Interprétation contextuelle du résultat
3) Communication appropriée du résultat au prescripteur
Quelles conditions, la Phase Post-analytique doit-elle respectée ?
Les conditions fixées à l’Article L. 1111-2, du Code de la Santé Publique.
Quelle est l’utilité de la Phase Post-analytique ?
- Transforme les résultats vérifiés par Analyse → Validés et Interprétés par les Biologistes médicaux.
Que retrouve-t-on dans cette Phase Post-analytique ?
- Les règles de traitement des échantillons parés analyse
- La conservation des échantillons
- L’élimination des échantillons
- L’archivage des enregistrements
En quoi la Phase Post-analytique est-elle cruciale ?
Permet de répondre à une question : comme un diagnostic d’une infection grave ou le dosage d’un médicament et permet au médecin d’adapter en fonction sa prise en charge.
Comment doit-être la communication, pour qu’elle soit efficace ?
Doit être précise, aisément compréhensible par le prescripteur, et réalisée dans un délai adapté à la prise en charge du patient.
Définition : Dialogue Clinico-Biologiste
= la communication entre le Biologiste Médical et le Prescripteur.
→ une activité essentielle et quotidienne du Biologiste.
- c’est à ce moment que s’installe la relation de CONFRATERNALITÉ avec les autres médecins/biologistes.
Que permet le Dialogue Clinico-Biologique ?
Permet de conseiller le médecin clinicien sur le meilleur examen à prescrire (en fonction de l’objectif recherché), et/ou réaliser un diagnostic « para-clinique » modifiant la prise en charge du patient.
Définition : Biochimie Clinique
= La biochimie appliquée à un processus physiopathologique humain.
Quel est le but de la Biochimie Clinique ?
De déterminer un mode efficient dépistage, un diagnostic, un pronostic, de suivre l’évolution d’une maladie de même que l’efficacité d’un traitement.
Quelles sont les 3 sous-unités de la Biochimie Clinique ?
- Biochimie Générale
- Biochimie Spécialisée
- Biologie Délocalisée
Définition : Biochimie Générale
= le plus gros volume des analyses de biologie médicale.
Exemples des Analyses les plus courantes
- le ionogramme : dépister un trouble hydro-électrolytique dans l’organisme
- le dépistage : de troubles métaboliques = Diabète / Dyslipidémie / Dénutrition
- le dépistage d’une dysfonction d’organe
- le dépistage d’une infection ou d’un syndrome inflammatoire biologique
Quel est le cation le plus abondant dans l’organisme ?
Le POTASSIUM (ion K+)
→ 98% intracellulaire : présence d’une pompe Na/K ATPase sur les membranes des cellules.
Concernant l’excrétion du Potassium…
90% du Potassium ingéré est excrété par les reins, grâce à une sécrétion tubulaire distale médiée par l’adostérone.
Qu’est-ce qui peut modifier les échanges au niveau du Néphron ?
De nombreux médicaments / hormones.
Définition : AUGMENTATION du Potassium dans le sang
HYPERKALIÉMIE (K+ > 4,5 mmol/L)
Définition : DIMINUTION du Potassium dans le sang
HYPOKALIÉMIE (K+ < 3,5 mmol/L)
Que faut-il faire pour interpréter un trouble de la Kaliémie ?
Doser la kaliurèse = la concentration du potassium dans les urines.
- afin de déterminer l’origine de l’augmentation ou de la diminution de la kaliémie.
Pourquoi le Potassium est-il important dans notre corps ?
Joue un rôle important dans le bon fonctionnement de notre corps : au niveau des muscles et système cardiovasculaire.
Quelles sont les manifestations cliniques d’une Hypokaliémie ? (5)
- Asthénie
- Faiblesse musculaire, myalgie, crampes
- Constipation
- Troubles du rythme cardiaque (certains graves pouvant aller jusqu’à la fibrillation auriculaire ou ventriculaire et engendrer un arrêt cardio-respiratoire)
- Syndrome poly-uro poly-dypsique
Quelles sont les manifestations cliniques d’une Hyperkaliémie ? (2)
- Troubles neuro-musculaires : paresthésies, parésie voire tétraparésie (des 4 membres).
- Troubles cardiaques : trouble de la conduction et du rythme pouvant également aboutir à une
fibrillation ventriculaire.
Quelles sont les causes principales d’une Dyskaliémie ? (3)
- Troubles des apports de potassium
- Troubles des pertes de potassium
- Trouble de répartition du potassium entre le milieu intra- et extra-cellulaire (ou shift cellulaire)
La Biochimie Spécialisée : Amélioration du diagnostic anténatale de Trisomie 21
- Triple Test
OU - Test combiné des marqueurs sériques maternels au 1er semestre de grossesse associé à la mesure de clarté nucale
→ pas cher et non invasif
Quel est l’objectif de ces tests ?
Évaluer le risque de Trisomie 21
Définition : Trisomie 21
- Aneuploïdie (anomalie de nombre)
=> 3 chromosomes 21 - risque augmente avec l’âge
- Test non invasif
Quels sont les 3 paramètres qui ce Test prend en compte ?
- 2 paramètres biologiques : Marqueur PAPP-A et Bêta-HCG libre
- 1 marqueur échographique : Mesure de la clarté nucale
Valeur de la clarté nucale NORMALE
< 3,5 mm
Valeur de la clarté nucale FŒTUS TRISOMIQUE
> 3,5 mm
Valeur du groupe NON À RISQUE de Trisomie 21
< 1/1000
Valeur du groupe à risque INTERMÉDIAIRE
Entre 1/51 et 1/1000 = test d’ADN libre circulant fœtale peut être proposé
Valeur du groupe à risque ACCRU
> 1/50 = Amniocentèse pour établir le caryotype du fœtus
Définition : Amniocentèse
= Prélèvement de liquide amniotique (geste invasif) afin de récupérer de l’ADN fœtal dans le cadre d’analyse (caryotype) de maladie génétique en vue d’établir un diagnostic.
Le test a une sensibilité de 85-87%
- Probabilité d’être positif lorsqu’on est malade.
Le test a une spécificité de 95%
- Probabilité d’être testé négatif lorsqu’on est pas malade.
Définition : Hématologie
= Discipline de la biologie médicale qui étudie les maladies du sang = hémopathies.
Quel est le but de l’Hématologie ?
De diagnostiquer les anomalies (quantitatives ou qualitative) des 3 lignées sanguines.
Quelles sont les 3 lignées sanguines ?
- Érythroblastique (Globule rouge/Hématies)
- Granulocytaires
- Mégacarocytaire (Plaquettes)
L’Hématologie s’intéresse également à une autre spécialité, laquelle ?
=> l’Hémostase : intérêt pour les anomalies de la «coagulation du sang»
À quoi sont liés le plus souvent les Hémopathies ?
À une anomalie de l’Hématopoïèse.
Définition : Hématopoïèse
- Synthèse des cellules sanguines dans les organes lymphoïdes primaires : moelle osseuse et thymus
- Différenciation au niveau des organes lymphoïdes secondaires (rate, ganglions lymphatiques)
Quelle est l’une des anomalies les plus fréquentes en l’hématologie ?
L’ANÉMIE
→ taux d’hémoglobine inférieur aux valeurs normales.
En fonction de quoi évolue le taux d’hémoglobine normal ?
- du sexe
- de l’âge
Quelle est la méthode de référence utilisée pour doser l’hémoglobine pour pouvoir diagnostiquer une Anémie ?
La Méthode de Drabkin.
Quelles sont les différentes étapes de ce dosage par la Méthode de Drabkin ?
1) Ajout du réactif de Drabkin et Hémolyse : les globules rouges libérant l’hémoglobine.
2) Oxydation de l’hémoglobine : en Méthémoglobine (Fe3+), par les ions ferricyanures.
3) Formation d’un complexe : la cyanméthémoglobine, grâce aux ions cyanures.
Processus de détermination de la quantité d’Hémoglobine
=> Après la formation du complexe : Cyanméthémoglobine.
- On va déterminer la Densité Optique ou Absorbance de cette solution.
→ on utilise un Phonomètre à la longueur d’onde d’absorption maximal de la cyanméthémoglobine (540 nm).
Que nous dis la Loi de Beer Lambert sur le lien Absorbance / Densité Optique et la Quantité d’hémoglobine ?
Il y a proportionnalité entre l’Absorbance / Densité Optique et la Quantité d’hémoglobine.
Que va-t-on réaliser afin de déterminer la quantité d’hémoglobine ?
Une courbe de calibration.
→ La quantité d’hémoglobine est déterminée par comparaison avec les Densités Optiques mesurées pour des concentrations connues d’hémoglobine.
À quoi fait référence l’Anémie ?
- À une diminution de la quantité d’hémoglobine.
OU - À une diminution du nombre de Globules Rouges dans le sang (hypoxémie).
Qu’entraîne l’Anémie ?
→ une diminution de l’apport en oxygène dans les tissus = HYPOXIE.
Quels sont les signes cliniques de l’Anémie ?
- Signes Physiques : (médecin)
- pâleur cutanéo-muqueuse
- souffle cardiaque systolique - Signes Fonctionnels : (patient)
- asthénie
- dyspnée d’effort puis de repos
- tachycardie
- vertiges
- céphalées
Définition : Anémies Centrales
→ atteinte au niveau de la moelle osseuse.
→ taux de Réticulocytes constamment bas : < 150 x 10^9/L.
= Anémies Arégénératives
Quelles sont les causes de ces Anémies Arégénératives (centrales) ? (6)
- Disparition des cellules souches de la moelle osseuse : responsable de la production de Globules Rouges.
- Dysfonctionnement médullaire (de la moelle osseuse).
- Envahissement de la moelle osseuse : cancer.
- Diminution de la stimulation hormonale.
- Manque de matière première : carences nutritionnelles.
- Production d’inhibiteurs de l’érythropoïèse.
Définition : Anémies Périphériques
→ la moelle fonctionne de manière NORMALE
→ le taux de Réticulocytes élevé : > 150 x 10^9/L.
= Anémies Régénératives
Quelles sont les causes de ces Anémies Régénératives (périphériques) ? (6)
- Perte excessive du sang.
- Hémolyse des Globules Rouges avant leur durée de vie normale (environ 120 jours).
Quelles sont les 4 sous-disciplines de la Microbiologie Clinique ?
- la Bactériologie
- la Virologie
- la Mycologie-parasitologie
- l’Hygiène hospitalière
Quel est l’objectif de la Microbiologie Clinique ?
=> de Détecter un agent infectieux, Évaluer les alternatives thérapeutiques : pour traiter l’infection et limiter sa propagation.
Quelles sont les 2 méthodes de détection d’un micro-organisme ?
- Méthodes DIRECTES
- Méthodes INDIRECTES
Définition : Méthodes Directes
=> On met directement en évidence le microorganisme
(examen direct au microscope, culture, mise en évidence d’un antigène, mise en évidence du génome par amplification génique…)
Définition : Méthodes Indirectes
=> mise en évidence d’une conséquence de la présence du microorganisme dans l’organisme hôte :
- la sérologie = la mise en évidence des anticorps dirigés contre les antigènes du microorganisme infectant.
Quelles sont les 3 étapes de la Bactériologie Médicale ?
- J0 = Examen Direct : le jour de réception de prélèvement au laboratoire.
- J1 = Identification d’une culture bactérienne (pour les bactéries cultivables) : un jour après la réception du prélèvement.
- J2 = Évaluation de la sensibilité aux antibiotiques de la Bactérie mis en évidence : un jour après la réception du prélèvement.
Étape du J0
=> observer directement le prélèvement sous le Microscope + Examen Direct Simple : État Frais ou Coloration.
Que permet l’État Frais ?
=> permet de mettre en évidence de gros microorganismes : les levures.
=> permet d’évaluer la mobilité des bactéries.
Quelle est la coloration principale utilisée en Bactériologie ?
La coloration de GRAM : permet de différentier les microorganismes en fonction de leur FORME (bacille qui signifie bâtonnet ou cocci qui signifie boule) et de leur COULEUR.
Comment apparaissent les Bactéries «à GRAM positif» ?
En violet.
Comment apparaissent les Bactéries «à GRAM négatif» ?
En rose clair.
Définition : Staphylocoques
= des cocci à Gram positif : « en amas » ou « en grappe de raisin » ou « en tétrade ».
Définition : Streptocoques
= des cocci à Gram positif : « en chainettes ».
Étape du J1
→ Spectométrie de masse type MALDI-TOF
= identifier/analyser les macromolécules organiques/protéines du micro-organisme à partir de ma culture
- FACILE
- RAPIDE
- FIABLE
Processus de la technique de MALDI-TOF : Source MALDI
- préparation de l’échantillon : dépôt d’une quantité de macromolécules sur la MATRICE.
- le laser envoie un faisceau très puissant vers la matrice contenant les macromolécules.
=> l’interaction LASER/MATRICE = vaporisation, ionisation et stabilisation de ces macromolécules.
Processus de la technique de MALDI-TOF : TOF
→ les Biomolécules chargées (ions) crées sont propulsées dans un tube TOF (Time Of Flight).
- cheminent dans ce tube : atteignent un DÉTECTEUR à l’extrémité.
Processus de la technique de MALDI-TOF : ANALYSE
- le détecteur mesure le temps qu’il faut aux ions des bactéries pour parcourir le tube en vol : en fonction de leur poids et de leur charge.
→ retranscription sous forme de courbe = SPECTRE.
Comment on identifie la bactérie à partir de son spectre ?
Chaque bactérie a un profil propre, donc chaque bactérie mettra un certain temps pour atteindre le détecteur.
Ce temps de vol est ensuite comparé à une base de données contenant les temps de vol de nombreuses bactéries connues
= indice de FIABILITÉ.
Étape du J2
=> Évaluation de la sensibilité du mircoorganisme aux antibiotiques.
- Réalise un ANTIBIOGRAMME :
→ suspension de la bactérie sur une gélose
→ disposition de disques d’antibiotiques
→ observation des diamètre d’inhibition
Plus le diamètre d’inhibition est GRAND…
Plus la bactérie est SENSIBLE à l’antibiotique testé.
Quels sont les 3 seuils de sensibilité du diamètre ?
- Sensible
- Sensible à forte exposition
- Résistante à l’antibiotique
Par rapport à la CMI = Concentration Minimale Inhibitrice
=> Plus la CMI est FAIBLE, Plus la bactérie est SENSIBLE.
- Si on a un GRAND diamètre d’inhibition = petite CMI.
Définition : CMI
→ Concentration Minimale Inhibitrice
= Faible concentration en antibiotique capable d’inhiber toute une culture visible après 18h d’incubation.
Quelles sont les disciplines spécialisées de la Biologie Médicale ?
- la Génétique
- la Biologie de la reproduction
- le Laboratoire HLA
- l’Immunologie clinique dont l’Immuno-hématologie
Pourquoi les 3 phases de l’Analyse Biomédicale sont-elles essentielles ?
Pour que celle-ci soit FIABLE et REPRODUCTIBLE !
- Pré-analytique
- Analytique
- Post-analytique
Qu’a permis l’évolution importante des techniques depuis les années 2000 ?
Une optimisation et une diversification des Analyses Biomédicales.
- la Biologie Médicale est aujourd’hui ESSENTIELLE dans la prise en charge des patients.
Quelle est l’étape ESSENTIELLE pour définir une analyse la plus adaptée et un communication des résultats optimale ?
Le Dialogue Clinico-Biologique !