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biochimie > Transcription > Flashcards

Transcription Flashcards

1
Q

Procaryotes
Forme,L adn
Chromo
n nucleotides
Presence de

A

ADN dans le cytoplasme

Un seul chromosome « circulaire » = continu

Plusieurs millions de nucléotides

Présence de plasmides = petits morceaux

d’ADN circulaires, indépendants de l’ADN principal

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2
Q

eucaryote
L Adn
Chromo
n nucleotides
Presence de

A

ADN dans le noyau

Plusieurs chromosomes avec ADN fortement

compacté et linéaire

Plusieurs milliards de nucléotides

ADN associé à des protéines

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3
Q

l’ADN des mitochondries :
Forme,code genetique,transmission

A

ADN circulaire

Code génétique différent de l’ADN nucléaire

Transmission maternelle uniquement

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4
Q

ADN bactérien transcription

A

pratiquement totalement
transcrit

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5
Q

Chez Eucaryotes,Transcription

A

une grande partie du génome
n’est pas transcrite,

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6
Q

Pourcentage adn transcrit
Champignons,drosophile,amphibirns,homme

A

60% chez les champignons;

70% chez la Drosophile;

20% chez les Amphibiens;

10% chez l’homme

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7
Q

gène d

A

Un segment d’ADN portant toute l’information nécessaire pour la
synthèse d’une protéine =

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8
Q

Les gènes chez les eucaryotes contiennent :

A

Une zone d’initiation de la transcription

Une zone de terminaison de la transcription

Une partie codante composée d’introns et d’exons

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9
Q

Les Exons d

A

sont des régions de l’ADN contenant l’information génétique
(régions traduites)

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10
Q

Les Introns d

A

sont des régions de l’ADN qui seront éliminées lors de la
maturation des ARNm (régions non traduites)

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11
Q

LA TRANSCRIPTION d

A

Mécanisme de synthèse des ARNs

ARNm : copie d’une portion d’ADN (gène)

Tout l’ADN n’est pas transcrit (région codante/non codante)

Synthèse : dans le sens 5’-3’

de manière antiparallèle par rapport à l’ADN copié

de façon complémentaire

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12
Q

LA TRANSCRIPTION
Les differents acteurs (4)

A

Matrice d’ADN

Nucléotides sous forme triphosphate ATP, CTP, GTP UTP

RNA polymérase

Cofacteurs (Mg++)

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13
Q

Plusieurs ARN polymérase :Cite

A

ARN polymérase I : ARNr

ARN polymérase II : ARNm, ARNsn

ARN polymérase III : ARNt

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14
Q

Structure des gènes des eucaryotes :D

A

Gènes fragmentés

Exons : ADN contenant l’information génétique (traduit en acides
aminés)

Introns : séquences intercalaires, fonctions ?

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15
Q

RNA – polymerase I synthetise

A

Synthétise les RNA cytoplasmiques: RNAr
(18S-5,8S-28S)

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16
Q

RNA – polymerase II synthetise

A

Synthétise les RNA messagers et certains
des snRNA

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17
Q

RNA – polymerase III synthetise

A

Synthétise les petits RNA ( tRNA, rRNA
5S, snRNA, 7SL-RNA)

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18
Q

La RNA polymerase II. D ,r,l

A

enzyme qui assure la transcription des gènes qui
seront traduits en protéines

présente dans tous les noyaux cellulaires

nécessite des ribonucléosides triP et des
cofacteurs protéiniques (facteurs de la
transcription)

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19
Q

Etape d’Initiation d

A

Début de la transcription se fera sur le
promoteur avec les divers TF ( II A, IIB,
IID……), plus l’enzyme

Association TBP, intervention IIB et rap
30 pour fixer l’enzyme et déterminer le
brin transcrit et le sens de la transcription

Puis rap 74, IIE et IIH (II H provoque
l’ouverture et déroulement partiel de la
double hélice)

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20
Q

Etape d’élongation

A

Enzyme est accompagnée d’une
série de facteurs d’élongation
qui modifient la chromatine
pour permettre l’avancée de
l’enzyme.Double hélice ouverte en
une boucle où se place
l’enzyme

bulle de transcription

Le transcrit primaire
reste hybridé sur
quelques nucléotides avec
le brin antisens puis s’en
détache pour permettre à
la double hélice de se
reformer

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21
Q

Arrêt de la transcription

A

La transcription s’arrête peu après le signal de
terminaison qui est une séquence située vers
la fin du gène

Séquence riche en GC (palindromique)

Repliement de l ’ARN transcrit

Suivie de queues riches en UUU

ARN va décrocher

Libération de l’ARN m synthétisé et de l’ARN
polymérase

22
Q

Maturation de
l’ARN transcrit
Extremité 5’

A

Addition d’une coiffe (capping) au bout de
l’extrémité 5’ du RNAm

coiffe = Guanosine méthylée au n° 5’ et sur les
deux premières bases

coiffe s’acquiert lorsque 30 nucléotides sont
synthétisés

23
Q

Maturation de
l’ARN transcrit role de la coiffe(2)

A

*Protection contre la dégradation

*Initiation à la synthèse protéique

24
Q

Maturation de
l’ARN transcrit
Extremite 3’

A

Acquisition d’une queue poly A

Signal de clivage 10 à 30 nucléotides avant fin de
terminaison UAAA/ endonucléase

Ajout de queue poly A/ poly A polymérase

AAAAAA (A)n

Stabilisation ARNm

Exportation ARNm à partir du noyau

signal de reconnaissance pour le ribosome

25
Q

L’excision -
épissage

A

excision-épissage : coupures suivies
de ligatures de morceaux d’ARN.

Séquences non codantes éliminées par excision
(endoribonucléase) sur séquence signal : GU et AG aux
deux extrémités de l’intron,

Exons sont liés (ARN ligase) entre eux bout à bout
(épissage) pour établir la séquence primaire de l’ARNm.

26
Q

La copie exacte de l’ADN est

A

l’ARN “transcrit
nucléaire ou primaire” ou HnRNA (ARN nucléaire
hétérogène) : longue molécule supérieur à 30 S.

27
Q

REGULATION

I- Au Niveau chromatinien

A

Environnement chromatinien

Sites sensibles et hypersensibles à la DNase I

Superenroulement de la structure

Modification de la structure primaire de l’ADN

Méthylation de îlots CG

Phénomène d’édition

28
Q

Sites sensibles à la DNase I d

A

correspondent aux gènes actifs

ou qui l’ont été (euchromatine)

29
Q

Sites hypersensibles à
la Dnase I. d et r

A

correspondent aux
gènes très activement
transcrits

l’hypersensibilité à la
DNase permet de
définir des domaines
(locus control region) :
régions des promoteurs
des gènes actifs

30
Q

Superenroulement de la structure r et d

A

Compaction de la structure: 3.109 pb soit environ 1
m dans un noyau de quelques microns

Régulation de l’accessibilité des bases

Rôle des histones qui sont riches en AA basiques
peuvent modifier la structure de la chromatine en
modifiant leur charge

31
Q

L’acétylation de l’AA terminal des H3 et H4 par l’ histone acétyl
transférase (HAT) crée

A

une configuration de la chromatine accessible et
facilite l’activité transcriptionnelle

32
Q

L’action des histones déacétylases (HDAC) r

A

facilite la compaction de la
chromatine et donc réprime la transcription

33
Q

Méthylation des îlots CG

A

Modification épigénétique : modification transmise au cours
des multiplications cellulaires

4 à 6 % des cytosines sont méthylées dans le génome humain

Addition covalente d’un groupement méthyl (CH3) en
position 5 d’une cytosine dans un dinucléotide CpG

34
Q

La méthylation des cytosines des régions 5’ non transcrites des gènes
(présence +++ dans les régions régulatrices) entraîne

A

une baisse de l’activité
de la transcription

35
Q

Méthylation:

A

signal de fermeture du gène

36
Q

Hypométhylation d

A

=> réactivations des transposons: instabilité des chromosomes

=> Activation de l’expression d’un proto-oncogène

37
Q

Hyperméthylation d

A

=> régions promotrices des gènes suppresseurs de tumeurs

inhibition de la transcription des gènes

LA TRANSCRIPTION

Conséquence de la méthylation

La méthylation est exceptionnelle dans le cancer HNPCC (Hereditary
Non Polyposique Colo-rectal Cancer

38
Q

Probleme architecture a cause de quel gene

A

Thrombospondin 1

39
Q

Invasion tumeur a cause de quel gene

A

E-cadhérine, APC

40
Q

Conséquence de la méthylation
Phénomème d’empreinte parentale

A

Processus responsable de l’expression monoallélique

( soit maternelle soit paternelle) d’un gène

Phénomène réversible, héréditaire et affecte l’expression des gènes

Empreinte est tissu spécifique

Empreinte paternelle→ chromosome paternel n’est pas exprimé

41
Q

le génome maternel contribue à

A

l’extinction de gènes indispensables
au développement d’annexes embryonnaires indispensables à la
survie).

42
Q

Modification de la structure primaire de l’ADN

Phénomène d’édition (MAISON d ’EDITION )
2types d’edition
Entraine

A
  • par insertion ou délétion altère le nombre de résidus contenus dans
    la molécule d’ARN
  • par conversion ou remplacement de nucléotides altère l’identité des
    nucléotides contenus dans la molécule d’ARN
    La désamination de la C en U
43
Q

La désamination de la C en U au niveau d’une séquence (CAA) résulte

A

d’un remplacement d’un codon glutamine par un codon stop (UAA)

44
Q

L’édition du gène Apo B code deux formes alternatives : + l de secretion

A

Apo B100
sécrétée dans le foie alors que Apo B48 l’est dans l’intestin

45
Q

APOBEC Cytidines deaminases apparentées à APOBEC 1 ( APOBEC 3)
2 R

A

participent à la lutte contre l’infection virale chez l’homme
Conversion de C en U

46
Q

Elément Cis –régulateur :

A

séquence contigue à un gène et ayant un
effet régulateur sur le taux de transcription de ce gène

47
Q

séquences stimulatrices ou enhancers. R ,effet max + effet diminue

A
  • augmentent le taux de transcription
  • effet diminué si inversion
  • effet maximun en un point donné mais persiste
    même s’ils sont déplacés
48
Q

Les Facteurs trans
D+diff structures

A

Protéines se fixant sur le DNA par des motifs
typiques au niveau de leur zone d’interaction

Différentes structures:

doigt de gant Zn

hélice bloucle hélice

protéine à leucine

49
Q

Choix promoteur résulte de et r

A

Choix promoteur résulte de l’action des facteurs
trans-régulateurs spécifiques de tissus

Taux de transcription et RNAm dépendent du
promoteur choisi

50
Q

Epissage alternatif d

A

Au Niveau post-transcriptionnel
Modification de la protéine
par modification
structure I du RNAm
Différents RNA m pour
des protéines à
fonction analogue. Peut donner Calcitonine et
CGRP

51
Q

Modulation de la durée de vie des mRNA

A

Plus queue poly A+++plus la
demi-vie ARNm est +++

> 10 H stable

30mns instable

biochimie (14 decks)

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