Sablo: la (presque) fin Flashcards
Quels histones modifie-t-on le plus facilement?
H3 et H4
Quels AA peuvent être méthylés?
Leurs AA basiques ou hydroxylés peuvent être méthylés, comme la lysine, l’arginine ou la sérine
Quelles modifications peut-on faire subir aux histones?
On peut phosphoryler, méthyler ou acétyler les AA
Quels sont les AA modifiés principaux?
la lysine K4, et la K7 et la K27
Que font l’acétylation et la désacétylation?
L’acétylation favorise la décondensation, et la désacétylation la condensation
Que fait la méthylation?
Généralement, la méthylation réprime, mais pas toujours.
Que fait la triméthylation?
va presque toujours entraîner une condensation
Quelles enzymes s’occupent de la (dés)acétylation des histones?
Histones Acétyl Transférases HAT vont acétyler les histones, et Histones désacétylases HDAC vont faire le contraire.
Comment les hormones vont-elles agir sur les gènes?
L’AMP cyclique se lie à la PKA, qui va activer un activateur transcriptionnel qui va être phosphorylé. Celui-ci s’appelle la CREBP, qui va se fixer sur les gènes et va reconnaître des éléments de réponse (RE), ici un CRE.
Comment les hormones stéroïdes agissent-elles sur les gènes?
Récepteur intraç qui va dimériser au contact de l’hormone. Une fois dimérisés, ils vont se fixer sur leur gène cible, séquence nucléotidique d’en général 6-8 nt.
Exemples d’hormones stéroïdes?
Glucocorticoïdes, androgènes (testostérone, …), oestrogènes, progestagènes…
Comment s’appellent séquences qui fixent les protéines de modulation de l’épissage?
ESE, ISE, ESS, ISS
Expliquer le mécanisme d’editing?
Le mécanisme d’editing va faire qu’un enzyme, la cytosine désaminase, va modifier une lettre parmi 3 de l’ARNm de telle sort qu’il devienne un codon stop, et du coup la protéine arrêtera de traduire beaucoup plus tôt.
un exemple de mécanisme d’editing?
Le mécanisme d’editing va faire qu’un enzyme, la cytosine désaminase, va modifier une lettre parmi 3 de l’ARNm de telle sort qu’il devienne un codon stop, et du coup la protéine arrêtera de traduire beaucoup plus tôt.
Un exemple de mécanisme d’editing?
gène ApoB, cholestérol avec une utilisation différente entre le foie et l’intestin, sauf que les deux gènes sont les mêmes, et les ARNm sont aussi les mêmes (env. 12000 nt), sauf que dans le foie il va traduire une prot + longue: 4500 AA contre une ApoB de 2500 AA dans l’intestin
Que permet le mécanisme d’editing?
modifier le produit du gène sans toucher à l’épissage ni à la transcription
Le mécanisme d’editing est-il fréquent?
Nah, rare
Taille des ARNt?
<200 nt
Taille des miRNA?
20-22 nt
Combien de miRNA connaît-on?
2000
Histoire de la découverte des miRNAs?
Un biologiste végétal travaillait sur un enzyme des pétunias, la chacose syntase, qui fabrique le pigment coloré. Il a clôné ce gène et l’a transfecté dans des plantules en espérant que la plante devienne plus foncée. Il a eu la surprise de voir que les pétales étaient mauves avec des petits points blancs, où il en a déduit que le gène avait été inhibé→ mise au silence d’un gène.
Que font les miRNA?
exercent un rôle inhibiteur de la traduction des gènes codants sans toucher à la transcription. Ils dégomment les ARNm.
En quoi les gènes des miRNA sont-ils transcrits?
en précurseurs PRI-miRNA, d’env. 200 nt
Comment le précurseur PRI-miRNA va-t-il être transformé en miRNA?
par une RNAse, la DROCHA, on va avoir un ARN en épingle à cheveux d’env. 70 nt, puis l’enzyme DICER va libérer le miRNA
Quel complexe protéique va prendre en charge le petit miRNA fragile?
le RISC
Comment le RISC reconnaît-il le bout à traduire sur le miRNA?
par une hybridation
Quels sont les deux types d’hybridation du miRNA?
→ Hybridation parfaite (8 à 10 nt du miRNA): recrutement d’enzymes qui vont détruire l’ARNm: décapases et???)
→ Hybridation imparfaite (3-8 nt), qui va juste ralentir la traduction mas pas assez fort pour recruter les enzymes
Un même miRNA peut-il agir sur plusieurs gèes?
Oui
Que font les piRNA?
Bloquent l’action des transposons: empêcher des mécanismes de recombinaison, pour protéger le matériel génétique tout au long de la vie des ç germinales
Où trouve-t-on les piRNA?
Dans les cellules germinales
Qu’est-ce que les ARN régulateurs longs?
LNC RNA. Certains ont un rôle d’échafaudage, comme la télomérase
Que font les ARN nucléolaires snoRNA?
rôle de modificateurs chimiques: ribozymes qui vont participer à la modification chimique des ARN ribosomiques lors de leur maturation