Réplication: suite (Sablo) Flashcards
Qu’est-ce que le brin matrice?
Le brin qui va être recopié
Qu’est-ce que le brin Codant?
Le brin d’ADN qui ne sera pas recopié
Qu’est-ce que la séquence frein?
AAUAAA (signal de terminaison ou de poly-adénylation)
L’ARN polymérase s’arrête-t-elle juste après la séquence frein?
Quelques nucléotides plus loin
Une substance bloquant l’action polymérase de type 2?
L’alpha-amanitine, présente dans des champignons→ mortelle
Comment s’appelle le premier nucléotide à transcrire?
Le promoteur
Qu’est-ce que la polymérase utilise pour repérer le promoteur?
Des balises
Quelles balises la poly 2 va-t-elle utiliser?
des TFII = facteurs de transcription. Ils se fixent en premier sur l’ADN, qui reconnaissent des séquences = boîtes
Deux exemples de facteurs de transcription?
- la boîte TATA, qui peut fixer un facteur général de transcription par la TVP, qui va fixer le facteur TF2d
- Le facteur TF2B peut être fixé par BRE (=éléments de réponse)
Combien d’activateurs/d’inhibiteurs/de protéines pouvant moduler l’activité de la poly existe-t-il?
> 200
Nom des séquences fixant les activateurs de la poly et que fixent-elles?
Enhancers, qui fixent des facteurs activateurs TAF
Nom des séquences fixant les inhibiteurs de la poly et que fixent-elles?
Répresseurs, qui fixent des facteurs inhibiteurs TIF
Comment protège-t-on l’ARNm des nucléases du côté 3’?
recrutement d’une enzyme, la PAP (polyapolymérase), qui ajoute une tonne d’adénines côté 3’ pour éviter que les nucléases aillent manger le côté 3’, parce qu’elles veulent pas manger tout le temps la même chose. En plus, ça fait un tag d’adénine qui protège l’extrémité.
Comment protège-t-on l’ARNm des nucléases du côté 5’?
La premier nucléotide incorporé est un triphosphate puisqu’il n’est attaché à rien du tout. Cette extrémité va être modifiée pour la rendre incompréhensible pour les nucléases. Tout ça forme une coiffe qui va protéger l’extrémité 5’
Comment le nucléotide du bout 5’ de l’ARNm va-t-il être modifié?
3 enzymes:
- 1 ARN phosphatase qui va retirer un phosphate
- 1 guanylyltransférase: elle va apporter du GTP, qui va former une liaison anormale 5’-5’ avec le nucléotide.
- 1 méthyl-transférase va méthyler, sur le GTP.
Que vont faire les coiffes de chaque côté de l’ARNm?
coiffe fixe des facteurs stabilisant l’ARNm des deux côtés
Interaction des coiffes de l’ARNm?
Font que l’ARNm a une forme de boucle
Qu’est-ce que l’épissage?
le raboutage des exons (=elimination des introns, ça revient au même)
Quel pourcentage du génome passe à la trappe pour la traduction?
80%
Taille moyenne d’un exon?
100-150 paires de bases
Qu’est-ce qu’un ribozyme?
assemblages d’une centaine de protéines et de quelques petits ARNs participant à l’épissage: les ARNsn
Comment appelle-t-on un assemblage de ribozymes?
les complexes du spliceosome
Comment se fait l’épissage côté 5’?
on va former une boucle rapprochant les deux exons, et couper la boucle: le clivage met en jeu un échange de liaisons phosphodiester. A 50nt de la fin de l’intron, on trouve toujours une adénine particulière qui va servir de point de branchement. Cette adénine va servir à former la boucle de l’intron, le point d’ancrage de la boucle if that makes sense
