Enzymologie pt. II

Question 1

Les deux méthodes de linéarisation de la formule de Michaelis-Mentel?

Answer 1

→ de Lineweaver-Burk (ou méthode des doubles inverses)
1/Vi = (Km + [S])/(Vmax . [S]) → 1/Vi= (Km)/( Vmax [S]) + 1/Vmax
→ de Eadie-Hofstee: Vi= -Km x (Vi/[S]) + Vmax.

Question 2

Le Km: Unité? Définition? Formule? Que permet-il?

Answer 2

→ Unité: concentration (mole/L)
→ [S] pour laquelle la moitié des sites actifs sont occupés et pour laquelle Vi=Vmax/2
→ (k2+k3)/k1 Si k3<

Question 3

La Vmax: unité? à quoi correspond-elle?

Answer 3

Unité: Mole par unité de temps

Vitesse quand E est Saturée en S, quand [S] est 20 fois supérieure au Km

Question 4

La kcat: unité et à quoi correspond-elle?

Answer 4

Unité: sec-1
Nombre maximal de molécules de S transformées en P par 1 molécule d’E car seconde, quand E est saturée en S
«Turn Over» de l’E, mesure l’activité catalytique de l’E

Question 5

Combien environ vaut la kcat?

Answer 5

Kcat env = 10² à 10⁶ sec⁻¹

Question 6

Que mesurent la kcat et le Km IN VIVO?

Answer 6

Kcat/Km mesure l’efficacité catalytique, caractéristique de E in vivo.

Question 7

In vivo, quelle est la proportion de S par rapport à E?

Answer 7

Dans les milieux biologiques in vivo, on n’est jamais dans des concentrations saturantes en substrat: [S]«< Km et [Et]=[E] (avec E l’enzyme libre et Et l’enzyme totale)

Question 8

Rapport kcat/Km?

Answer 8

Vi= kcat [Et]. ([S]/Km+[S])

Question 9

En quelles unité le résultat du dosage d’une enzyme peuvent-ils être exprimés?

Answer 9

→ En Katal (Système Inter): quantité d’E qui transforme une mole de S par seconde → Katal/L
→ En Unités Internationales (fait pas partie du système inter!) Qtté d’E qui transforme une MICROmole par minute → UI/L

Question 10

pH des enzymes normal?

Answer 10

7

Question 11

Quelques exceptions de pH chez les enzymes?

Answer 11

• Enzymes lysosomales pH = 4,5
  
  • Pepsine pH = 2-3
  • Amylase pancréatique pH= 7
  • Trypsine pH= 9

Question 12

Définition d’effecteurs chimiques?

Answer 12

Molécule qui, par sa liaison à l’enzyme, modifie la vitesse de réaction de l’enzyme.

Question 13

Les catégories d’effecteurs chimiques?

Answer 13

• Activateurs

* Inhibiteurs (réversibles irréversibles)

Question 14

Les types d’activateurs?

Answer 14

• Ions métalliques

- Co-enzymes

Question 15

Caractéristiques des ions métalliques?

Answer 15

– Éléments du site actif, nécessaire à la catalyse

– Facilement séparables

Question 16

Un exemple d’ions métalliques?

Answer 16

kinases activées par le Mg²⁺

Question 17

Caractéristiques des co-enzymes?

Answer 17

– Soit fixé de façon étroite à l’E = groupe prosthétique

– Soit labile = co-substrat

Question 18

Quelques exemples de co-enzymes?

Answer 18

– coE nicotiniques: NAD⁺/NADH: Nicotinamide Adénine Dinucléotide (dérivé de Vitamine B3)
– coE flaviniques: FAD/FADH2 Flavine Adénine Dinucléotide (dérivé de Vitamine B2)
– Phosphate de pyridoxal (PLP) (Vit. B6)
– Folates (DHF, THF…) (Vit B9)

Question 19

De quoi dérivent de nombreuses co-enzymes?

Answer 19

de vitamines

Question 20

Caractéristiques des inhibiteurs?

Answer 20

→ Petites molécules spécifiques.

→ Entité I qui diminue la vitesse de réaction enzymatique V0 i

Question 21

Rôles des inhibiteurs dans les milieux biologiques (in vivo)?

Answer 21

• Contrôle de l’activité enzymatique (régulation)
• Médicaments
• Substances toxiques

Question 22

Roles des inhibiteurs en recherche (in vitro)?

Answer 22

→ Outils d’étude

- Rôles de l’E, du S et du P

Question 23

Formule de la constante d’inhibitipn?

Answer 23

Ki constante d’inhibition = K+i/K-i

Question 24

Caractéristiques des inhibiteurs irréversibles?

Answer 24

– Liaison covalente (ou non) STABLE de I à E

– Inactivation définitive de l’enzyme

Question 25

Deux exemples d’inhibiteurs irréversibles?

Answer 25

→ activation de l’aspirine (acide acétique salicylique): Ser 530 et Arg 120 se chargent de l’inhibition
→ Les bêta-lactanin

Question 26

Caractéristiuqes des bêta-lactinine?

Answer 26

– classe d’antibiotiques,
– inhibent la formation du peptidoglycane (assemblage des peptides)
– Structure commune: il y a un COOH, unefonction cétone et un amide N - C = O

Question 27

Dans la méthode de linéarisation de lineweaver-burk, où la courbe coupe-t-elle l’axe des abcisses? Et des ordonnées?

Answer 27

Axe des abcisses en -1/Km

Axe de sordonnées en 1/Vmax

Question 28

Que vaut la pente dans la linéarisation de Lineweaver-Burk?

Answer 28

Km/Vmax