Repetidos comunes Flashcards
Qué son los repetidos comunes y dónde se encuentran?
- Regiones de DNA que contienen secuencias repetidas dispersas
- Encontrados en la heterocromatina
En qué regiones del genoma podemos encontrar los repetidos comunes?
— Transposones (45%)
— Regiones intergenicas
— Pseudogenes
— Repeticiones largas
— Repeticiones cortas
— Repeticiones en Tándem (en bloques)
Qué son los transposones y qué porcentaje ocupan del genoma?
Secuencias móviles del genoma que pueden replicarse e insertarse en diferentes localizaciones
45%
Qué hacen los transposones de clase 2?
Saltan directamente (DNA se inserta en DNA)
Qué hacen los transposones de clase 1?
un RNA se vuelve DNA y se inserta en el DNA
“retrotransposones”
Qué repeticiones tenemos en los retrotransposones?
- Repeticiones terminales largas (LTRs): secuencias de 100 pb-5 kb en extremo de cromosomas
- Repeticiones terminales no largas (no LTRs): LINEs y SINEs
Qué procentaje del genoma ocupan los LINEs?
20%
dónde se encuentran los LINEs?
en regiones eucromaticas en las bandas G (Giemsa + regiones ricas en A-T)
A qué se refiere el término “autónomo” para los LINEs?
ellos mismos codifican endonucleasas y trancriptasas reversas para volverse transposones e insertarse
Permiten la retrotranscripcion de SINES
Qué hace LINE 1?
la más común (17% o 6 kb)
tiene
ORF1
ORF2
cola poliA
promotor bidireccional
Qué hace ORF1?
transcribe la enzima p40 que tiene actividad de chaperona para guiar enzimas
Qué hace ORF2?
transcribe la endonucleasa y transcriptasa
Qué porcentaje del genoma ocupan los SINEs?
Cuántas pb?
13%
100-400 pb
Cuál es la forma más común de los SINEs?
los elementos ALU
Características de los elementos Alu?
— Seuencia más abundante de 280 pb
— 2 repetidos en tandem de 120 pb c/u, seguidos de secuencias de A y T
— Tienen 2 monómeros asimétricos
— En las bandas R (regiones ricas en G y C)
