polimorfismos por estructura Flashcards
cuáles son los polimorfismos por estructura?
SNPs
InDels
Microsatélites (STRs)
Minisatélites (VNTRs)
satélites
cuáles polimorfismos son de cambio en un sólo nucleótido
SNPs
polimorfismos con cambio en el tamaño de la secuencia
InDels
polimorfismos con cambio por el número de repeticiones
microsatélites (STRs)
minisatélites (VNTRs)
Satélites
Qué son y por qué se dan los SNPs?
Variaciones de un solo nt en una secuencia dada
* Por deleción, inserción o sustitución de un solo nt
cuántos SNPs en secuencias codificantes
1 SNP en DNA humano cada 1,000-3,000 pb
cada cuántos pares de bases hay un SNP en secuencias no codificantes?
cada 500-100 pb
ventajas de los SNPs
frecuencia
estabilidad
biomarcadores (en todo el genoma)
qué son los InDels?
Inserciones y deleciones de múltiples bases nitrogenadas
generalidades de los polimorfismos de cambio por el numero de repeticiones (microsatélite, minisatélite y satélite)
- Secuencias repetitivas de tamaño variable
- Permiten identificar entre individuos por sus genotipos
- Identificación mediante PCR con iniciadores específicos
Que son los microsatélites o STR?
- Secuencias de 2-9 nt (unidades de repetición)
los STRs se diferencian en motivos repetidos
Repeticiones perfectas
Repeticiones interrumpidas
Repeticiones combinadas
desventajas de STRs
no están distribuidos en todo el genoma, limitando su uso para determinadas enfermedades
ventajas de los STRs
pruebas de paternidad, genética forense
minisatélites o VNTRs
- Loci de secuencias cortas repetidas en tandem un número especifico de veces
- Secuencias de 10-50 nt (unidades de repetición)
dónde están comúnmente presentes los VNTRs?
telómeros
Ventajas de los VNTRs
marcadores genéticos
cuáles son las dos maneras en las que se forma un minisatélite o VNTR?
mediante tartamudeo de la polimerasa
mediante recombinacion meiotica con entrecruzamiento disparejo
En la formación mediante recombinacion meiotica con
entrecruzamiento disparejo
qué hacen los Cromosomas homólogos?
genera UEC (unequal crossover)
En a formación mediante recombinación meiótica con entrecruzamiento disparejo que hacen las cromátidas hermanas?
genera UESCE (unequal sister
chromatid exchange)
Cómo es la formación mediante tartamudeo de la polimerasa?
- Provoca la adición de unidades repitas en tandem
- Deslizamiento en la polimerasa puede causar inserciones y deleciones
- La polimerasa se despega y crea un loop, y cuando regresa ya no reconoce en donde había estado pegada, y se pega en otra parte porque “es lo mismo”
- El loop se hace en la hebra replicada en lugar de la hebra molde, provocando deleciones
qué son los satélites?
- Secuencias de 100-200 nt (unidades de repetición) en bloque cientos o miles de veces a lo largo del genoma
Dónde están localizados los satélites
en centromeros o en regiones cercanas a los telómeros
o a veces en regiones intracromosómicas