Proteiners transport, veckning och nedbrytning del 2

Question 1

Vad betyder SRP?

Answer 1

Signal recognition particle - består av 6 protein och en RNA-molekyl.

Question 2

Vart sorteras produkten om den har en N-terminal, amfipatisk sekvens?

Answer 2

Till mitokondrien.

Question 3

Vad har proteinet för signal för att komma till ER?

Answer 3

Hydrofob sekvens ofta N-terminalt placerad.

Question 4

Hur tar sig proteiner in till ER?

Answer 4

1. SRP binder signalsekvensen på växande proteinet så att translationen avstannar.
2. SRP binder till specifik SRP-receptor på ER.
3. Proteinet translokeras genom en proteintranslokator och translationen fortsätter.

Question 5

Hur sker translokation av ett membranprotein?

Answer 5

Med hjälp av start- och stoptransfersekvenser som är hydrofoba och därmed fastnar i membranet.

Question 6

Vad avgör om C- eller N-terminalen hamnar inne i ER?

Answer 6

Det beror på om aminosyrorna är positivt eller negativt laddade runt stoptransfersekvensen. Positivt laddade är. uppåt mot cytosolen.

Question 7

På vilka tre sätt kan transport av transmembranprotein ske till kärnmembranet?

Answer 7

1. Vesikeltransport
2. Fri diffusion via poren
3. Licensing - binder till importin som kan guida genom poren

Question 8

Vilka interaktioner bidrar till att proteinet veckas?

Answer 8

Elektrostatiska interaktioner, vätebindningar, van der Waals interationer.

Question 9

Vad är PDI?

Answer 9

Proteindisulfidisomeras. Detta är ett enzym som hjälper till med veckningen i ER genom att skapa disulfidbryggor.

Question 10

Till vilken aminosyra binder N-länkad glykosylering?

Answer 10

Asparagin.

Question 11

Till vilken aminosyra binder O-länkad glykosylering?

Answer 11

Threonin.

Question 12

Var och när sker N-glykosylering?

Answer 12

Mycket snabbt efter translokation till ER.

Question 13

Vad gör oligosackaridtransferas?

Answer 13

Överför en oligosackarid till proteinet.

Question 14

Vad har N-glykosylering för funktioner?

Answer 14

• veckningskontroll av protein
• lokalisering/transport av protein
• proteinaktivitet
• stabilitet
• löslighet

Question 15

Hur fungerar veckningskontroll i ER med hjälp av N-glykosylering?

Answer 15

Glukosträdet klyvs tills det att det endast är en glukosmolekyl kvar. Denna binder till calnexin. Om proteinet är färdigveckat lämnar det ER, om det är felveckat kommer glukosyl transferas att fästa en glukos igen så att proteinet kan fästa till calnexin igen.

Question 16

Vilka tre sensorer finns det för felveckade protein?

Answer 16

• IRE 1
• PERK
• ATF6

Question 17

Vad menas med retrotranslokation?

Answer 17

Export och nerbrytning av felveckade proteiner i ER.

Question 18

Vad menas med ER-stress?

Answer 18

Det ansamlas många oveckade proteiner och alla hinner inte veckas.

Question 19

Vad är BIP?

Answer 19

Ett chaperon som rekryteras vid ER-stress.

Question 20

Hur bildas mer chaperoner vid ER-stress?

Answer 20

BIP släpper IRE1 som då dimerisaras och fosforyleras. Detta kommer göra att xPP1 mRNA kommer att spliceas till ett funktionellt mRNA som bildar ett xPP1-protein som går in i kärnan och fungerar som transkriptionsfaktor till att bilda mer BIP.

Question 21

Vad är signalpepsidas?

Answer 21

Det sitter i ER-membranet och klyver bort startransfer-sekvensen när proteinet fastnat.

Question 22

Vad är acceptorsekvensen för olgiosackariden?

Answer 22

Asn-X-Ser/Thr