Kortfrågor HT16 Flashcards
Vad har en telomer för funktion och vad gör telomeras?
- skydda DNA:t genom att finnas längst ut på kromatider.
- telomeras bygger på telomererna.
Vad har en TATA-box för funktion och var finns den lokaliserad?
Den finns ca 25-30 baspar innan replikationsstart i promotorn. Den fungerar som initiator av replikation genom att allmänna transkriptionsfaktorer binder in.
Du och din kollega har sekvenserna DNA från en patient, och ni finner ett par skillnader gentemot referenssekvensen i det första exogent av en “gen X”. Förklara för din kollega hur man snabbt kan bilda sig en första uppfattning om vad dessa skillnader (mutationer) i DNA kan få för funktionella konsekvenser.
Du kan se om det är en deletion (förskjuter läsramen) eller en förändring i basen vilket kan ge en missense mutation, nonsensemutation eller silens mutation.
Hur är en tyrosinkinasreceptor uppbygd, dvs vilka är de huvudsakliga domänerna?
En extracellulär del till vilken en ligand binder.
En transmembranal del.
En intrazellulär del med bindningsdomäner för olika signalmolekyler varav en del är activation lip där tyrosin fosforyleras vid aktivering av receptorn. Olika bindande domäner kan vara SH2, SH3, PH.
Mutationer i Ras är vanliga i cancerceller. Ge en kort förklaring till detta.
Ras har en central roll i cellproliferationen vilket gör att ett muterat ras ofta ger en okontrollerad tillväxt.
GTP-bindande protein är mycket viktiga för signalering i cellen. Hur inaktivares GTP-bindande protein
Genom att själva hydrolysera sin GTP till en GDP. Denna reaktion sker alltid så småningom men kan ske snabbare med hjälp av en GAP.
Vad är skillnaden mellan autokrin och parakrin signalering?
Autokrin: en celltyp producerar ligand och dess receptor.
Parakrin: en celltyp producerar ligand och en annan celltyp producerar receptorn.
Varför är en 5’-cap på ett mRNA viktig? Nämn två funktioner.
- skydda RNAt från nedbrytning.
- hjälpa translationen genom att möjliggöra ringslutning.
Är följande påstående sant eller falskt: “skillnader i proteinuttryck mellan olika specialiserade celler återspeglas alltid av cellernas olika mRNA-nivåer”?
Falskt. Det kan ske modifieringar och förhindrande av translation med mRNAt (av exempelvis miRNA) vilket gör att nivån mRNA kan ge ett falskt intryck av hur mycket av dess protein som bildas.
Hur kommer det sig att olika mikroRNA kan reglera uttrycket av en och samma gen? Vad är den strukturella grunden för detta?
MikroRNA binder komplementärt till mRNAt som genen bildar och förhindrar translation. Olika mikroRNA kan därmed reglera uttrycket av samma gen genom att binda till olika delar av dess mRNA. En gen kan ge upphov till många olika mRNA-kombinationer.
Ge en definition av angiogenes.
Nybildning av kärl från redan existerande blodkärl. (sker på kapillärnivå)
Beskriv kortfattat den generella strukturen hos en “adherens junction”.
- En transmembranal adhesionsprotein (ex. cadherin)
- Ett anchoring protein intracellular (ec. beta-catenin)
- Cytoskeletal del (ex aktin eller intermediära filament)
Förklara påståendet “affinitets reagens såsom antikroppar för detektion av protein fungerar inte perfekt”. Vidare, vad rekommenderar du för kontroll när man använder sig av affinitetsreagens för detektion av sjukdomsmarkörer?
Svara på sen
Vad är ett ribozym och varför klassas ribosomen som ett ribozym?
Svara på sen
Heparansulfatproteoglykaner reglerar bland annat signalering genom att binda tillväxtfaktorer, men vad styr interaktionen mellan HSPG och protein (vad binder till vad)?
Svara på sen
