Proteiners transport, veckning och nedbrytning del 1

Question 1

Hur uppkom kärnmembranet?

Answer 1

Genom en invagination av cellmembranet i cytoplasman.

Question 2

Förklara mitokondriens ursprung.

Answer 2

Mitokondrien kom till genom fagocytos av en aerob bakterie som resultat av att cellen behövde mer energi.

Question 3

Vad betyder begreppet “topologi”?

Answer 3

Vilka utrymmen, vilka organeller som har kontakt med varandra. (cytosolen är inte topologiskt ekvivalent med extracellulära matrix)

Question 4

Vad har ER för funktion?

Answer 4

Vi har strävt ER som ansvarar för intransport av proteiner. Vi har slätt ER som är med i lipidbiosyntesen.

Question 5

Vad har golgiapparaten för funktion?

Answer 5

Golgi modifierar proteiner.

Question 6

Vad har mitokondrien för funktion?

Answer 6

Bildar ATP i elektrontransportkedjan.

Question 7

Vad har peroxisomen för funktion?

Answer 7

Den har med betaoxidationen att göra samt skapar och bryter ned väteperoxid.

Question 8

Var startar proteinsyntes?

Answer 8

Vid fria ribosomer i cytosolen.

Question 9

Hur sorteras proteinerna?

Answer 9

Med hjälp av signalsekvenser i proteinet (antingen genom N-terminal, intern,C-terminal eller en kombination).

Question 10

Hur transporteras protein från:

a) cytosol till mitokondrie/ER/peroxisom?
b) ER till Golgi
c) Golgi till lysosom/sekretorisk vesikel/cellens utsida?
d) cytosol till kärna?

Answer 10

a) transmembran transport
b) vesikulär transport
c) vesikulär transport
d) gated - kärnporskomplexet

Question 11

Hur går transporten av protein till mitokondriens matrix till?

Answer 11

1. Signalsekvens interagerar med TOM-komplex
2. Chaperoner håller proteinet uppveckat (Hsp 70), när dessa lossnar krävs energi.
3. Proteinet åker igenom TOM till TIM delvis med hjälp av protongradienten.
4. Chaperoner på insidan veckar proteinet, energikrävande process.
5. Signalsekvensen klyvs bort.

Question 12

Hur sker importen av protein till peroxisomen?

Answer 12

1. Signalsekvens PTS1 yttrar sig.
2. Proteinet interagerar med Pex5 receptor.
3. Två st Pex5 receptorer sätter sig på Pex 14
4. Proteinet tar sig in.
5. Pex5 återanvänds genom att ta sig ut genom ett komplex bestående av Pex2, Pex10 och Pex12.

Question 13

Nämn några chaperoner och beskriv var de finns.

Answer 13

Hsp 70 - cytosol, mitokondrier, ER
Hsp 60 - cytosol, mitokondrier
Hsp 90 - cytosol

Question 14

Hur kan det bildas mer Hsp70 vid värmeshock?

Answer 14

Hsp70 är vanligtvis kopplat till HSF1. När det finns många helveckade protein kommer Hsp70 lossna och HSF1 gå in i kärnan och fungera som en transkriptionsfaktor till ytterligare Hsp70.

Question 15

Vilket chaperon veckar redan under translation?

Answer 15

Hsp70

Question 16

Vilket chaperon veckar om felveckade färdiga protein?

Answer 16

Hsp60

Question 17

Vad är E1, E2 och E3?

Answer 17

E1 - ubiquitin-aktiverande enzym
E2 - ubiquitin-konjugerande enzym
E3 - ubiquitinligas

Question 18

Hur skapas signalen för polyubiquitinylering?

Answer 18

1. E1 binder en ubiquitin, detta kräver ATP
2. E1 överför ubiquitinet till E2.
3. Ett protein med “degrationssignal” sätter binder sig till E3/(E2)
4. Första ubiquitin adderas till proteinet.
5. Proteinet polyubiquitineras

Question 19

Nämn två sätt för att aktivera E3 ubiquitinligas.

Answer 19

1. fosforylering

2. ligandbindning

Question 20

Nämn tre sätt för proteinet att skapa/exponera en nedbrytningssignal.

Answer 20

1. fosforylering av proteinkinas
2. avmaskande av blockering
3. skapa en ostabil N-terminal

Question 21

Var finns proteasomen?

Answer 21

I cytosolen.

Question 22

Vad består proteasomen av?

Answer 22

En ubiquitinreceptor, “unfoldase ring” samt active sites.

Question 23

Vad är signalpepsidas?

Answer 23

Det är ett enzym som klipper bort signalsekvensen.