Phosphorylation oxydative Flashcards

1
Q

Qu,est-ce que la phosphorylation oxydative?

A

L’utilisation d’un gradient de protons pour la synthèse d’ATP à partir d’ADP et de Pi

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Q

Quelles sont les caractéristiques de la membrane mitochondriale externe?

A

Lisse et perméable à la plupart des ions et petites molécules

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3
Q

Quelles sont les caractéristiques de la membrane mitochondriale interne?

A

Circonvoluée et imperméable aux ions et petites molécules, en particulier aux protons H+.

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4
Q

De quoi est composé le gradient électrochimique?

A

1- Gradient électrique: Potentiel de la membrane est 0.14mV (matrice plus négative que espece intermembranaire)
2- Gradient chimique: Espace intermembranaire est plus acide que matrice (plus de H+).

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5
Q

Qu’est-ce que la chimiosmose?

A

Le mouvement des ions en fonction de leur gradient électrochimique à travers une membrane sélectivement perméable.

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6
Q

La membrane mitochondriale interne contient des systèmes de transport pour…

A
  • NADH (entre)
  • Métabolites du cycle de Krebs (entrent)
  • ATP (sort) et ADP + Pi (entrent)
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7
Q

Quelles molécules voyagent en symport pour entrer dans la matrice mitochondriale?

A
  • Pi et H+

- Pyruvate et H+

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8
Q

Quelles molécules voyagent en antiport au travers de la membrane interne?

A

ATP sort alors que ADP entre

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9
Q

Comment s’appelle le système antiport impliqué dans le transport de l’ATP et ADP? Quelle est sa structure?

A

Translocase des nucléotides adényliques. C’est un dimère de sous-unités identiques

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10
Q

Quel est le transporteur de Pi qui utilise un gradient de pH?

A

Le transporteur de phosphate

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11
Q

D’où vient chaque H+ qui entre dans la matrice avec un Pi ou une pyruvate?

A

Il a été exclu de la matrice par les pompes de la chaîne de transport d’électrons couplées aux réactions redox.

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12
Q

Pourquoi l’utilisation d’un gradient de pH pour le transport de Pi et pyruvate représente-t-elle un coût énergétique pour la cellule?

A

Parce que les H+ utilisés pour le transport de Pi et pyruvate auraient pu revenir par l’ATP synthase et générer de l’énergie

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13
Q

Comment s’appelle la navette de transport du NADH présente dans le coeur, foie et reins?

A

Navette malate-aspartate

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14
Q

Que représente la phase A du transport du NADH?

A

Transport d’électrons dans la matrice

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15
Q

Quelle est la première étape du transport d’électrons dans la matrice?

A

Le NADH dans le cytosol réduit l’oxaloacétate pour donner NAD+ et malate

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16
Q

Quelle enzyme catalyse oxaloacétate + NADH -> malate + NAD+?

A

Malate déshydrogénase cytosolique

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17
Q

Où va le NAD+ résultant?

A

Il reste dans le cytosol

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18
Q

Qu’advient-il du malate dans le cytosol?

A

Il est transporté dans la matrice en échange d’alpha-cétoglutarate

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19
Q

Quel transporteur transporte le malate dans la matrice?

A

Le transporteur malate-alpha-cétoglutarate

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20
Q

Qu’advient-il du malate après son arrivée dans la matrice?

A

Il est réoxydé par le NAD+ pour donner du NADH et de l’oxaloacétate

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21
Q

Quelle enzyme de la matrice catalyse malate + NAD+ -> NADH + oxaloacétate?

A

Malate déshydrogénase mitochondriale

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22
Q

Quelle est la phase B du transport du NADH?

A

La régénération de l’oxaloacétate cytosolique

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23
Q

Par quoi commence la phase B?

A

Une transaminase de la matrice transforme oxaloacétate en aspartate et glutamate en alpha-cétoglutarate.

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24
Q

Qu’advient-il de l’aspartate formé dans la matrice?

A

Transporté dans le cytosol en échange du glutamate cytosolique par le transporteur glutamate-aspartate

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25
Q

Que devient l’aspartate une fois dans le cytosol?

A

Transformé en oxaloacétate par une transaminase en même temps que l’alpha-cétoglutarate est transformé en glutamate

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26
Q

Quel est le nom de la navette du NADH qui se retrouve dans le cerveau et les muscles squelettiques?

A

Navette du glycérophosphate

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27
Q

Quelle enzyme catalyse l’oxydation de NADH en NAD+ et, par le fait même, la réduction de DHAP en GAP?

A

GAPDH

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28
Q

Quel est le rôle de GAP dans la navette du glycérophosphate?

A

Oxyder FAD membranaire en FADH2

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29
Q

Quelle enzyme catalyse le transfert d’électrons de FADH2 en FAD?

A

Une déshydrogénase flavoprotéique sur le côté externe de la membrane mitochondriale interne

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30
Q

Quelle est le rôle de la déshydrogénase flavoprotéique vis à vis la chaîne de transport des électrons?

A

Pour chaque FAD réduit en FADH2, elle envoie 2 électrons à la chaîne de transport.

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31
Q

Combien de complexes protéiques composent la chaîne de transport?

A

4

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32
Q

À quel complexe les électrons du NADH sont-ils transférés?

A

Complexe I

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33
Q

À quel complexe les électrons du FADH2 sont-ils transférés?

A

Complexe II

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34
Q

Quelle molécule transfère les électrons des complexes I et II au complexe III?

A

Coenzyme Q (CoQ)

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35
Q

Quelle molécule transfère les électrons du complexe III au complexe IV?

A

Le cytochrome C

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36
Q

Un potentiel redox positif signifie…

A

Un deltaG négatif (spontané)

37
Q

À quoi sert le transport des électrons dans la chaîne de transport?

A

À fournir l’énergie nécessaire au pompage des protons H+ hors de la matrice pour conserver le gradient électrochimique

38
Q

Quels complexes participent activement à la mise en place du gradient électrochimique?

A

I, III et IV

39
Q

Quelle molécule peut inhiber le complexe I?

A

Roténone et Amytal

40
Q

Quelle molécule peut inhiber le complexe III?

A

Antimycine A

41
Q

Quelle molécule peut inhiber le complexe IV?

A

CO et Cyanure (CN-)

42
Q

Quel type de déplacement les complexes peuvent-ils effectuer dans la membrane?

A

Latéral

43
Q

Que contient le complexe I?

A
  • Une FMN

- 6 à 7 centres F-S

44
Q

Quel chemin les électrons empruntent-ils au complexe I?

A
  • NADH donne ses deux électrons à FMN
  • FMN devient FMNH2
  • FMNH2 donne ses 2 électrons aux centre Fe-S où le Fe peut alterner entre 2+ et 3+
  • Fe-S transfère les électrons au CoQ qui devient CoQH2-
  • CoQH2 donne les 2é au complexe III
45
Q

Quel chemin les protons empruntent-ils au complexe I?

A
  • Les 4 protons sont pompés hors de la matrice mitochondriale
46
Q

Quel est le nom du complexe I?

A

NADH déshydrogénase

47
Q

Quel est le nom du complexe II?

A

Succinate déshydrogénase

48
Q

De quel autre chemin métabolique le complexe II fait-il partie?

A

Le cycle de Krebs. C’est la seule enzyme du cycle enfouie dans la membrane interne.

49
Q

Que contient le complexe II?

A
  • FAD

- 3 centres Fe-S

50
Q

Quel chemin les électrons empruntent-ils au complexe II? D’où proviennent-ils?

A
  • Le succinate transfère 2 électrons au FAD lié au complexe II et devient fumarate + 2H+
  • Le FAD devenu FADH2 transfère les électrons au centre Fe-S
  • Centre Fe-S donne les électrons à CoQ -> CoQH2
  • Les électrons passent de CoQH2 au complexe III
51
Q

Quel est le nom du complexe III?

A

Q-cytochrome c oxydoréductase

52
Q

Que contient le complexe III?

A
  • 2 cytochromes b
  • 1 centre fe-S
  • 1 cytochrome c
53
Q

Quel est le sort des électrons dans le complexe III?

A
  • CoQH2 transfère électrons à Fe-S

- Fe-S transfère un électron à la fois à Cyt c

54
Q

Quelle est la différence en matière de transport d’électrons entre CoQ et Cyt c?

A

CoQ peut transporter les deux électrons en même temps au complexe III, tandis que Cyt c ne peut qu’en transporter un à la fois au complexe IV.

55
Q

Combien de protons seront pompés hors de la matrice par le complexe III?

A

4

56
Q

Qu’est-ce que le cytochrome C?

A

Une protéine à hème (hémoprotéine) associée à la membrane mitochondriale interne.

57
Q

Pourquoi le Cyt c ne peut-il transporter qu’un électron à la fois?

A

Car le fer de son noyau hème n’accepte qu’un seul électron à la fois (Fe3+ à Fe2+)

58
Q

Quel est le nom du complexe 4?

A

Cyt c oxydase

59
Q

Que contient le complexe IV?

A
  • 2 cytochromes a

- 2 centres cuivres (a et b)

60
Q

Combien d’électrons le complexe IV transfère-t-il et à quelle molécule?

A

Le complexe IV transfère 4 électrons, un à la fois, à une molécule d’O2 (O2 + 4H+ -> 2H2O)

61
Q

Combien de protons le complexe IV pompe-t-il?

A

4

62
Q

Quel rôle joue le MPTP dans la maladie de Parkinson?

A

cette molécule est transformée en MPP+, un puissant inhibiteur du complexe I des cellules de la substance noire du cerveau. Cela tue les neurones responsables de synthèse de dopamine, et des symtpômes de la maladie de Parkinson en résultent.

63
Q

Quel est le nom du complexe qui participe activement à la synthèse d’ATP en utilisant le gradient électrochimique des protons?

A

ATP synthase

64
Q

Combien de protons sont nécessaires à la synthèse d’un ATP?

A

3

65
Q

Comment s’appelle la région transmembranaire de ATP synthase?

A

F0

66
Q

Comment s’appelle la région matricielle de ATP synthase?

A

F1

67
Q

La réaction de l’ATP synthase est-elle réversible

A

Oui, en conditions standards seulement (pas in vivo)

68
Q

De quoi est responsable F0?

A

Pomper les protons dans F1

69
Q

De quoi est constitué F0?

A
  • 3 sous-unités hydrophobes (a, b et c)

- a possède 2 demi-canaux à protons (entrée et sortie)

70
Q

De quoi est constitué F1?

A
  • 5 types de polypeptides (alpha, beta, gamma, delta, epsilon)
  • gamma et epsilon forment la tige centrale
  • 6 sous-unités alpha et beta forment un hexagone
71
Q

Comment fonctionnent alpha et beta de la ATP synthase?

A
  • ils fixent les nucléotides

- beta possèdent l’activité catalytique permettant de synthétiser ATP ou de l’hydrolyser (in vitro)

72
Q

Combien de sites de liaison pour ADP et Pi F1 contient-elle?

A

3 (un sur chaque beta)

73
Q

Par quoi F0 et F1 sont-elles reliées?

A
  • tige gamma-epsilon reliée à l’anneau de sous-unités c

- Une colonne externe constituée de a, des 2 sous-unités b et de la sous-unité delta.

74
Q

V ou F: In vitro, l’ATP synthase n’a pas besoin d’un gradient de protons pour fonctionner.

A

V

75
Q

Qu’a révélé l’expérience de Boyer sur l’ATP synthase?

A

La synthèse d’ATP ne requiert pas d’énergie

76
Q

Quelle étape du fonctionnement de l’ATP synthase requiert de l’énergie?

A

Le détachement de la molécule d’ATP après sa synthèse

77
Q

Quelles sont les 3 conformations possibles des sites catalytiques de ATP synthase?

A
  • Ouverte (O)
  • Lâche (L)
  • Serrée (T)
78
Q

Quelles parties de ATPsynth composent le rotor?

A
  • Le dodécamère c

- La tige gamma-epsilon

79
Q

Quelles partie de ATPsynth composent le stator?

A
  • Hexamère alpha-beta

- Sous-unités a, b et delta

80
Q

Expliquez les étapes conformationnelles des sites catalytiques de ATP synthase

A

1- ADP et Pi ont une faible affinité avec conformation L
2- Le passage des protons induit les changements conformationnels simultanés des 3 sites
- L avec ADP et Pi devient T, où se produit l’ATP
- T devient O et relâche ATP
- O passe en L et accueille ADP et Pi

81
Q

Quelle molécule inhibe l’ATP synthase? Quelle sous-unité en particulier bloque-t-elle?

A

Oligomycine bloque le canal à protons (F0)

82
Q

Quelles molécules sont responsables du découplage du transfert d’électrons de la production d’ATP?

A

DNP et FCCP

83
Q

Qu’est-ce que le découplage?

A

L’action d’une molécule qui dissipe le gradient en entraînant avec elle au travers de la membrane un ou plusieurs protons.

84
Q

Qu’est-ce que le découplage produit?

A

Chaleur

85
Q

Quels organismes génèrent de la chaleur par découplage des phosphorylations oxydatives?

A
  • Animaux en hibernation

- Bébés naissants

86
Q

Qu’est-ce qui confère la couleur brune au tissu adipeux brun?

A

Une haute concentration de mitochondries

87
Q

Qu’est-ce que la thermogénine?

A

Un canal à protons passif responsable du découplage dans la membrane interne mitochondriale du tissu adipeux brun

88
Q

V ou F: Le découplage arrête la respiration cellulaire et donc la synthèse d’ATP

A

Faux. Elle arrête seulement la synthèse d’ATP.

89
Q

Qu’est-ce que l’effet Warburg?

A

L’observation que la plupart des cellules cancéreuses tirent leur énergie par un taux élevé de glycolyse suivie de fermentation dans le cytosol produisant des niveaux élevés d’acide lactique.