Perintöaines Flashcards

1
Q

nukleiinihapot

A

DNA ja RNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

DNA

A
  • kaksijuosteinen
  • yhdessä DNA molekyylissä voi olla miljoonia nukleotidejä (sokeriosa, fosfaattiosa, emäsosa)
  • juosteet kiinni vetysidoksilla
  • tumallisilla ja arkeoneilla DNA-rihma kierynyt histoniproteiinien ympärille kromatiiniksi (suojaa DNA:Ta solun entsyymien toimesta tapahtuvalta pilkkoutumiselta ja säätelee DNA:n aktiivisuutta)
  • tumallisissa soluissa koko perintöaineksen kattava DNA-rihma jakautunut eri pituisiin pätkiin = kromosomeihin, esim. ihmisellä 46 kromosomia, joista 23 keskenään erilaisia -> perimä koostuu siis 23 kromosomiparista
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

onko bakteereilla histoneita

A

ei, niillä on muita proteiineja joiden avulla DNA pakataan tiiviimmäksi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

RNA

A
  • yksijuosteinen

- useita rakenteeltaan ja toiminnaltaan erilaisia tyyppejä: lähettiRNA, siirtäjäRNA, ribosomiRNA, mikroRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

miten nukeotidit liityvät viereisiin nukeotideihin

A

kovalenttisin fosfodiesterisidoksin, joissa kaksi sokeriosaa on liittyneinä toisiinsa fosfaattiryhmän välityksellä
-nukleotidi liittyy viimeisen nukleotidin 3. hiileen fosfaatin välityksellä

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

montako sidosta A-T ja A-U välillä?

entä C-G?

A

A-T ja A-U: 2 vetysidosta

C-G: 3 vetysidosta, eli vahvempi rakenne

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

puriinit ja pyrimidiinit

A

puriinit: A & G
pyrimidiinit: T, S & U

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

mitä rakenteellista eroa puriinit ja pyrimidiinit

A

puriinit: kaksoisrengasrakenne
pyrimidiinit: 1 kuusiatominen rengas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

DNA:n replikaatio

A

DNA:n kahdentuminen

  • helikaasientsyymi avaa replikaatiokuplan -> DNA-polymeraasi kiinnittyy RNA-alukkeiden avulla, liittäen DNA-nukleotidejä yksitellen alukkeen perään (ainoastaan edellisen nukleotidin kolmanteen hiileen eli 3’-päähän)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

DNA kaksoisjuosteen avaava entsyymi

A

helikaasientsyymi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

uuden DNA juosteen katalysoiva entsyymi (yhdistää juosteet)

A

DNA-polymeraasi

-tarvitsee RNA-alukkeet!

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

RNA-aluke

A

lyhyt, yksijuosteinen RNA-pätkä, joka pariutuu emäspariperiaatteen mukaisesti yksijuosteiseen, avattuun DNA:han.

  • pariutuu kumpaankiin vastinjuosteeseen, jotta DNA-polymeraasi voi kiinnittyä kaksoisjuosteeseen
  • (pelkästä alukkeesta puhuen voi olla DNA tai RNA jakso, jota tarvitaan DNA-synteesin aloittamiseksi)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

replikaatiokupla

A

avautunut DNA:n kaksoiskierre, jossa tapahtuu kahdentumista

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

replikaatiohaarukka

A

replikaatiokuplan kohta, jossa DNA-kaksoisjuoste on avautumassa vetoketjun tavoin
-tumallisia replikaatiota voi tapahtua monessa kohtaa DNA:ta, joten voi olla samanaikaisesti monta replikaatiokuplaa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

mistä suunnasta DNA juoste rakentuu

A

5’-3’ suunnassa
-uudet nukleotidit liittyvät liitetään vaan edellisen sokeriosan kolmanteen hiileen eli 3’ päähän eli juoste pitenee 3’-päästä

eli siis: 5’ päässä on fosfaatti osa jo kiinni, joten 3’ päähän (jossa OH-ryhmä), liitetään uusin nukleotidi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

johtava juoste

A

yhtäjaksoisesti replikaation etenemissuuntaan muodostava juoste; rakentuu alukkeiden perään samaan suuntaan, mihin DNA-kaksoisjuoste aukeaa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

laahaava juoste

A

rakennetaan avautumissuuntaan nähden vastakkaiseen suuntaan paloina, Okazakin fragmentteina, joista jokainen vaatii oman alukkeen
-lopuksi fragmentit liitetään yhteen ligaasientsyymin toimesta

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

telomeeri

A

kromosomien päissä olevat geenittömät (toistuvia emäsjärjestyksiä sisältäviä) alueet, jotka suojaavat solua tämän lyhenemisen aiheuttamilta haittavaikutuksilta (DNA:n replikaatiossa kromosomin päät (telomeerit) lyhenevät hieman, koska replikaatiossa DNA-polymeraasi voi kiinnittyä vain RNA-alukkeeseen ja replikaation päätyttyä alukkeet poistetaan mutta jäljelle jää alukkeen mittainen yksijuosteinen DNA-pätkä joka leikataan irti entsymaattisesti -> jakautumiskertojen myötä telomeerit lopulta loppuvat, mikä johtaa solun toiminnan muuttumiseen ja kuolemaan)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

geeni

A

perinnöllisyyden perusyksikkö: DNA-jakso, joka sisältää RNA-molekyylin rakennusohjeen

=koodi, joka ohjaa solun toimintaa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

geenin perusrakenne

A

säätelyalue (=säätelee geenin aktiivisuutta) ja koodaava alue (=sisältää tiedon proteiinin tai RNA-molekyylin rakentamiseksi)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

tumallisen solun säätelyalueen rakenne

A

tehostajajaksot (voivat sijaita DNA-juosteessa kaukana säätelemästään geenistä, aktivoivat geenin luennan) ja promoottori (geenin koodaavan osan välittömässä läheisyydessä, geenin luennan/proteiinisynteesin aloituskohta)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

tumallisen solun koodaavan alueen rakenne

A

eksonit (informaatiota sisältävät osat eli koodaavat osat) ja intronit (eivät sisällä informaatiota)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

mitä eroa tumallisen ja tumattoman solun koodavassa ja säätelyalueessa?

A

tumattomilla yhtenäinen säätelyalue (promoottori+operaattori), eikä koodaavassa osassa ole introneita (PAITSI arkeoneilla!!!)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

kodoni

A

emäskolmikko = geenin tietoyksikkö = kolmen emäksen muodostama ryhmä

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

montako erilaista kodonia on?

A

4^3 eli 64 erilaista kodonia, koska emäksiä on neljä erilaista ja kodoni koostuu kolmesta emäksestä

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

ylläpitogeenit

A

=geenejä, jotka ovat toiminnassa jatkuvasti (tietyissä soluissa)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

säätelygeenit

A

= geenejä, jotka säätelevät muiden geenien toimintaa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

lukkiutuneet geenit

A

= geenit, jotka ovat olleet toiminnassa jossain yksilönkehityksen vaiheessa esim. lapsuuden kasvun aikana (niitä ei lueta ilman erillistä aktivaatiota)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

sammuneet geenit

A

= geenit, jotka evoluution kuluessa ovat lakanneet toimimasta tietyillä lajeilla

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

genomi

A

yksilön koko perintöaines eli solujen koko DNA (sis. kromosomeissa olevat geenit ja geenien ulkopuolisen alueen)

(genomiin voidaan laskea myös mitokondriaalinen ja viherhiukkasten sis. perintöaines)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

montako kromosomia ihmisellä somaattisissa soluissa=

A

46 (jotka sisältävät hieman yli 20 000 geeniä)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

geenikartta

A

geenien sijainti kromosomistossa

33
Q

onko tumallisilla suurin osa genomista geenin ulkopuolista aluetta vai ei?

A

ON, ihmisellä jopa 98% genomista on geenien ulkopuolista aluetta (sisältää esim. sammuneita geenejä, toistojaksoja

34
Q

geenin toistojakso

A

lyhyt toistuva emäsjärjestys geenissä, määrä vaihtelee yksilökohtaisesti, käytetään mm. yksilöntunnistuksessa

35
Q

transposoni

A

hyppivä geeni = genomin osia, jotka kykyenevät kopioitumaan itsenäisesti ja siirtymään johonkin toiseen kohtaan genomia

todnäk virusperäinen

36
Q

ovatko sentromeerit ja telomeerit geenien ulkopuolista DNA:ta?

A

ovat

37
Q

mitä eroa genomilla ja genotyypillä?

A

genotyyppi on yksilön genomissa olevat geenien alleelit, siihen ei lasketa mukaan geenien ulkopuolista DNA:ta

38
Q

miten proteiinit rakentuvat lyhyesti?

A

geenien sisältämä informaatio käännetään ensin RNA:ksi ja RNA:n pohjalta rakennetaan aminohappoketju

39
Q

Mikä entsyymi syntetisoi RNA:ta?

A

RNA-polymeraasientsyymi

40
Q

miten geenin luentaa säädellään?

A

säätelyproteiinien avulla: voivat aktivoida tai estää geenin luentaa

  • säätelyproteiinien valmistusta säädellään muilla elimistön viestiaineilla, kuten hormoneilla
  • säätelyproteiinit sitoutuvat säätelyalueen tehostajajaksoihin
41
Q

esiaste-RNA

A

kun RNA-polymeraasi lähtee etenemään geeniä pitkin, syntetisoidaan DNA juosteen viereen esiaste-RNA:ta

42
Q

operaattori

A

tumattomassa solussa promoottorin ja koodaavan alueen välissä oleva jakso, johon voi olla kiinnittyneenä estäjäproteiini

43
Q

operoni

A

tumattomilla: yhden säätelyalueen (promoottori+operaattori) perässä voi olla useampien geenien koodaavat alueet

44
Q

koodaava juoste

A

Koska DNA koostuu kahdesta toisilleen vastakkaisen emäsjärjestyksen omaavasta juosteesta, vain toinen juoste sisältää tiedon proteiinien rakentamiselle = koodaava juoste

45
Q

mallijuoste

A

juoste, jolla on koodaavalle juosteelle vastakkainen emäsjärjestys; l-RNA rakennetaan mallijuosteen rinnalle emäspariperiaatteen mukaisesti, jolloin syntyvään lähettiin tulee sama emäsjärjestys kuin koodaavassa juosteessa

46
Q

proteiinisynteesiin vaiheet (2)

A

transkriptio ja translaatio

47
Q

transkriptio

A

tumallisten eliöiden tumassa tai tumattomien solulimassa tapahtuva tapahtuma:
tehostajajaksoihin sitoutuneet säätelyproteiinit avustavat RNA-polymeraasin sitoutumista promoottoriin -> kaksoiskierre avautuu -> esiaste-RNA syntetisoidaan DNA:n mallijuosteen rinnalle (sis. eksonit ja intronit) -> joten intronit täytyy sitten poistaa silmukoinnin avulla -> sitten on syntynyt lähetti-RNA

48
Q

lähetti-RNA

A

esiaste-RNAsta silmikoinnin jälkeen muodostunut juoste, joka sisältää tiedon proteiinin aminohappojärjestyksestä emäskolmikkojen muodossa.

49
Q

translaatio

A

ribosomeilla tapahtuva tapahtuma, jossa lähetti-RNA:n emäsjärjestys käännetään proteiinin aminohappojärjestykseksi (l-RNA kiinnittyy ribosomiin, synteesi alkaa, kun ribosomi osuu aloituskolmikon kohdalle, s-RNA tuo aminohapot, loppuu lopetuskolmikon kohdalle)

50
Q

mikä emäskolmikko toimii translaation aloituskolmikkona?

A

AUG (metioniini)

51
Q

mitkä kolme kodonia toimii lopetuskolmikkoina (RNA:ssa)

A

UAA
UAG
UGA

niitä ei vastaa mikään aminohappo

52
Q

siirtäjä-RNA

A

jokainen s-RNA sisältää kolmen emäksen mittaisen vastinkolmikon, antikodonin
-> sRNA tuovat paikalle aminohappoja (ribosomille)

53
Q

montako s-RNA molekyylia ribosomilla voi olla kerrallaan?

A

2: toisessa on muodostuva aminohappoketju, ja toinen tuo paikalle uuden aminohapon -> ribosomi liittää siirtäjien tuomat aminohapot toisiinsa peptidisidoksella

54
Q

mitä eroa tumallisten ja tumattomien proteiinisynteesissä?

A
  • muutoin sama, mutta tuman puuttumisen vuoksi sekä transkriptio että translaatio tapahtuvat solulimassa
  • myös koska bakteereilla ei introneita -> transkriptiotuote on valmis lähetti-RNA, jota ribosomi voi ryhtyä lukemaan jo lähetti-RNA synteesin eli transkription aikana
  • myös yhdestä transkriptiotuotteesta (l-RNAsta) voidaan rakentaa useampi aminohappoketju, koska operonirakenne (eli voi sis. monta geeniä)
55
Q

mikro-RNA

A

lyhyt RNA pätkä, jota käytetään proteiinisynteesin hiljentämiseen

56
Q

RNA-interferenssi

A

jos solulimaan saapuvassa lähetti-RNAssa on vapaan mikro-RNA:n kanssa vastakkainen emäsjärjestys, mikro-RNA voi pariutua l-RNAhan -> jolloin tämä syntynyt KAKSIjuosteinen RNA-molekyyli pilkotaan entsyymien toimesta -> solu voi hiljentää näin proteiininsynteesin vielä geenin aktivoitumisen ja transkription jälkeenkin (translaatiota siis ei pääse tapahtumaan)

57
Q

ribosomin rakenne

A

koostuu proteiinista ja ribosomaalisesta RNA:sta

  • kaksi toisiinsa liittyvää alayksikköä
  • ribosomeja koodaavat geenit sijaitsevat tumajyväsen alueella, jossa valmiit ribosomit myös kootaan
58
Q

vaihtoehtoinen silmukointi

A

yhdestä geenistä voidaan tuottaa useita erilaisia lähetii-RNA:ita -> yhdestä geenistä voidaan tuottaa useampia lopputuotteita

59
Q

mitä eroa proteiinin prim., sek., tert., ja kvart.rakenteilla?

A

prim: aminohappojen järjestys
sekund: kierteinen/laskostunut rakenne (alfa-heliksi tai beeta-laskos)
tert: proteiinin kolmiulotteinen rakenne (sis. useita sekund.rakenteita ja vahvempia molekyylien välisiä sidoksia)
kvart: useamman tert.rakenteisen proteiinin yhdistelmä

60
Q

mutageeni

A

mutaatiota aiheuttava asia, esim. säteily, virukset ja myrkylliset aineet

61
Q

miten mutaatiot voidaan jakaa?

A

vaikeusasteeltaan kolmeen ryhmään:

  • geenimutaatiot
  • kromosomimutaatiot
  • kromosomistomutaatiot
62
Q

geenimutaatiot

A
  • pistemutaatiot
  • nukleotidien määrän muutokset (muu kuin kolmella jaollinen luku) eli frame shift mutaatiot

näiden seurauksena yksi tai muutama nukleotidi muuttuu, jolloin vaikutus korkeintaan yhteen geeniin

63
Q

pistemutaatio (geenimutaatio)

A

yksittäinen emäspari vaihtuu toiseksi: voi muuttaa aminohappojärjestystä; geenistä syntyy uusi alleeli

  • lopputuloksena uusi toimiva kokonaisuus tai esim. toimimaton proteiini, mikä voi johtaa esim. sairauden puhkeamiseen tai syöpään
  • koska monilla aminohapoilla useampi koodaava emäskolmikko -> ei välttämättä muutoksia aminohapossa
64
Q

hiljainen mutaatio

A

jos pistemutaatio ei muuta syntyvän proteiinin aminohappojärjestystä

65
Q

frame shift mutaatio (geenimutaatio)

A

nukleotidien määrän muutos (yksi tai useampi häviää tai tulee lisää muu kuin kolmella jaollinen määrä, koko geenin lukukehys muuttuu) -> yleensä isommat seuraukset kuin pistemutaatio

66
Q

kromosomimutaatio

A

jopa tuhansia nukleotidejä saattaa muuttua

  • edellyttää DNA-rihman katkeamista ja uudelleenliittymistä
  • yleensä geenimutaatiota suurempi vaikutus

tavallisimmat tyypit:

  1. häviämä (=deleetio)
  2. kääntymä (=inversio)
  3. kahdentuma (=duplikaatio)
  4. siirtymä (=translokaatio)
  5. liittymä (=insertio)
67
Q

kromosomistomutaatio

A

kromosomien määrän muuttuminen: aneuploidia ja polyploidia

68
Q

aneuploidia

A

yksittäisen kromosomin määrä poikkeaa: tavallisesti eläimillä jokaista kromosomia kaksi; yleisimmät muutokset ovat trisomia (3 vastinkromosomia) tai monosomia (vain 1 kromosomi)

69
Q

polyploidia

A

kokonainen peruskromosomisto on moninkertaistunut esim. 2n ->4n

  • kasveilla tärkeä lajiutumista aiheuttava tekijä, mutta ihmisillä lähes poikkeuksetta sikiökehityksen pysähtyminen
  • allopolyploidia: ylimääräiset kromosomistot erilaisia eli esim. peräisin toiselta lajilta
  • autopolyploidia: sama kromosomisto on monistunut
70
Q

mihin kohtaan mutaatio täytyisi osua ilmetäkseen?

A

kyseisessä solussa aktiiviseen geeniin; suurin osa kromosomeista on geenien ulkopuolista aluetta, joten hyvin harva mutaatio osuu geenin alueelle

71
Q

korjausentsyymit

A

korjaavat jatkuvasti mutaatioiden aiheuttamia virheitä DNA-sekvenssissä

72
Q

miten mutaatiot voivat periytyä?

A

mutaation on tapahduttava sukusoluja tuottavan ituradan soluissa

73
Q

proteiinisynteesi

A

Proteiinisynteesissä on kaksi vaihetta: transkriptio ja translaatio. Transkriptio tapahtuu tumallisten eliöiden tumassa tai tumattomien solulimassa. Translaatio tapahtuu solulimassa. Translaatiossa muodostuva aminohappoketju on proteiinin primaarirakenne.
Tumallisella eliöllä transkriptio alkaa, kun geenin tehostajajaksoihin sitoutuneet säätelyproteiinit avustavat RNA-polymeraasin sitoutumista geenin promoottoriin (eli geenin koodaavan osan välittömässä läheisyydessä, geenin luennan/proteiinisynteesin aloituskohtaan). Kaksoiskierre avautuu ja RNA-polymeraasi syntetisoi esiaste-RNA:n DNA:n mallijuosteen rinnalle 5’-3’ suunnassa. Toisin sanoen uudet nukleotidit liitetään edellisen sokeriosan kolmanteen hiileen eli 3’ päähän, jossa OH-ryhmä, eli juoste pitenee 3’-päästä aina. Esiaste-RNA kuitenkin sisältää niin koodaavat eksonit kuin ei-koodavat intronit, joten intronit täytyy poistaa silmukoinnin avulla ennen tumasta poistumista. Valmista RNA-molekyyliä, josta intronit on poistettu kutsutaan lähetti-RNA:ksi. Lähetti-RNA poistuu tumasta solulimaan translaatiota varten.
Translaatiossa eli proteiinisynteesin toisessa vaiheessa lähetti-RNA:n emäsjärjestys käännetään proteiinin aminohappojärjestykseksi ribosomien pinnalla. Ribosomit sijaitsevat joko vapaana solulimassa tai karkean solulimakalvoston pinnalla. Synteesi siis alkaa, kun ribosomi osuu aloituskodonin (AUG) kohdalle. Siirtäjä-RNA, joka sisältää antikodonin ja aminohapon, tuo lähetti-RNA:n emäsjärjestystä vastaavan aminohapon paikalle, kun kodoni ja antikodoni pariutuvat hetkellisesti. Ribosomi liittää siirtäjien tuomat aminohapot toisiinsa peptidisidoksella. Synteesi päättyy, kun lopetuskolmikko tulee kohdalle.

74
Q

telomeraasientsyymi

A

kantasoluissa ja syöpäsoluissa on telomeraasientsyymiä, joka syntetisoi uutta telomeeriä kromosomien päihin

75
Q

epigeneettinen säätely

A

ei vaikuta geenin emäsjärjestykseen, mutta muuttaa geenien luenta aktiivisuutta esim. DNA-metylaatilla (metyyliryhmän liittäminen sytosiiniin) tai histonien metylaatiolla tai geenien pakkaaminen tiukasti histonien ympärille estää myös niiden luentaa

76
Q

epigeneettisten muutosten periytyminen

A

voi periytyä tytärsoluille solun jakautuessa ja sukusoluissa tapahtuva epigeneettinen säätely voi näin ollen myös periytyä jälkeläisille

77
Q

geneettinen leimautuminen

A

jos sukusolulinjan soluissa tapahtuu epigeneettistä geenin inaktivaatiota -> geenit lukkiutuneita myös valmiissa sukusoluissa -> voi johtaa geneettiseen leimautumiseen, jossa toiselta vanhemmalta perityt tiettyjen geenien alleelit eivät ilmene jälkeläisissä

78
Q

minkä tyyppistä muuntelua epigeneettinen säätely/periytyminen on?

A

muovautumismuuntelua, koska epigeneettiset muutokset ovat ympäristön aikaansaamia (jos epigeneettiset muutokset sukusolulinjan soluissa -> voivat periytyä)

79
Q

minkälaisia muutoksia kromosomimutaatiot voivat aiheuttaa?

  1. häviämä (=deleetio)
  2. kääntymä (=inversio)
  3. kahdentuma (=duplikaatio)
  4. siirtymä (=translokaatio)
  5. liittymä (=insertio)
A
  1. kromosomista irtoaa pala, jonka mukana myös geenejä häviää (pala ei siis liity mihinkään enää)
  2. kääntymällä harvoin merkitystä, ellei se tapahdu geenin keskeltä
  3. kahdentuma voi olla. haitallinen koska esim. säätelygeenin kahdentuminen voi johtaa geenin luennan kiihtymiseen. kahdentumat myös johtavat välillä uusien geeniperheiden syntymiseen
  4. ja 5. siirtymä ja liittymä: ei välttämättä haitallisia, ellei siirtyvä kromosomin pala liity keskelle jotain geeniä ja tee sitä toimimattomaksi