Peptides as drugs Flashcards

1
Q

Artemisinin:
IgG:

A

Artemisinin: 230 Dalton
IgG: 150 000 Dalton

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Peptider

A

Peptider
* Har aminosyror.
* Aminosyra är där sidokedjan förändras.
* När de är sammankopplade av peptidbindningar, hålls kedjorna ihop av vätebindningar: primär-, sekundär- (alfa och beta), tertiär- och kvartärstruktur.
* Vissa är hydrofila, vissa är hydrofoba, vilket kan påverka effekten.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Pipeline:

A

Pipeline: Läkemedel under utveckling.
* Peptidhormoner: Insulin (1920-talet), ACTH

  • Cirka 80 peptidbaserade läkemedel (FDA), ~150 peptidläkemedelskandidater i kliniska prövningar (ungefär 1/3 av dessa kandidater i pipeline är antikroppar); ytterligare 500–600 peptider genomgår prekliniska studier.

Fördelar med peptider som läkemedel:
* Enorm strukturell mångfald (!) och potential
* Specificitet
* Effektivitet: Eftersom de är specifika krävs små doser för att få effekt.
* Låg toxicitet: Eftersom de har ett naturligt ursprung.

Begränsningar med peptider som läkemedel:
* Låg oral biotillgänglighet, nedbrytning i mag-tarmkanalen
* Låg plasmasstabilitet och kort cirkulationstid: Elimineras lätt av njurarna
* Kort halveringstid
* Snabb clearance via njurar och lever
* Hydrofila egenskaper förhindrar passage över fysiologiska barriärer (undantag: cellpenetrerande peptider)
* Flexibilitet i strukturer = selektivitet (?), kan leda till icke-selektivitet

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Dessa är småmolekylära läkemedel

A

Dessa är småmolekylära läkemedel som har hög toxicitet och interaktioner, är icke-selektiva med toxicitet.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Mål för peptidläkemedel

A

Mål för peptidläkemedel
* Peptidhormonreceptorer (GPCR)
* Icke-GPCR-cellmembranreceptorer
* Cytokinreceptorer
* Jonkanaler
* Intracellulära mål inklusive RNA, signalmolekyler (via cellpenetrerande peptider)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Sidogrupper

A

Sidogrupper
Hur produceras peptidläkemedel? Är vi begränsade till de 20 naturligt förekommande aminosyrorna?
Beroende på vilken sidokedja som finns får man olika egenskaper. Modifierade aminosyror är vanliga.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

De olika delarna av en aminosyra:

A

De olika delarna av en aminosyra:
1. Alfa-proton: Detta är väteatomen (H) som är bunden till det alfa-kol som finns vid aminosyrans centrum.
2. Alfa-kol: Detta är det kolatom som är bunden till alla de viktigaste grupperna i en aminosyra: en aminogrupp (-NH₂), en karboxylgrupp (-COOH) och en sidokedja (R-grupp). Alfa-kol är centrum för aminosyrans struktur.
3. Aminogrupp: Aminogruppen (-NH₂) är en funktionell grupp som består av en kväveatom bunden till två väteatomer. Den är en av de två huvudgrupperna som definierar en aminosyra.
4. Karboxylgrupp: Karboxylgruppen (-COOH) är den andra huvudgruppen i en aminosyra. Den består av en karbonylgrupp (C=O) och en hydroxylgrupp (-OH). Karboxylgruppen gör att aminosyran är sur.
5. R-grupp (sidokedja): Sidokedjan, eller R-gruppen, är den del av aminosyran som varierar mellan olika aminosyror. Den kan vara enkel som i glycin (H), eller mer komplex och innehålla olika funktionella grupper som påverkar aminosyrans egenskaper (t.ex. hydrofob, hydrofil, sur, basisk). Det är R-gruppen som ger varje aminosyra sina unika egenskaper.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Ovanliga och icke-naturliga aminosyror:

A

Ovanliga och icke-naturliga aminosyror:
L-type och D-type aminosyror: De naturligt förekommande aminosyrorna i proteiner är i L-form enligt stereokemi, men D-formen kan vara användbara i läkemedelsutveckling för att hindra enzymer från att bryta ner dem, eftersom enzymer ofta är specifika för L-formen. Genom att använda D-aminosyror kan man skapa peptider eller läkemedel som är mer stabila och inte lika benägna att brytas ner snabbt i kroppen.

Homo-aminosyror: Har en extra kolgrupp i sidokedjan jämfört med de vanliga aminosyrorna. Detta kan påverka peptidens egenskaper, såsom dess bindning och stabilitet

Genom att inkludera beta-aminosyror kan man designa peptider som har bättre stabilitet, bioaktivitet eller förmåga att interagera med specifika mål i kroppen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Förbättrad farmakokinetik för peptider

A

Förbättrad farmakokinetik för peptider
* Förbättrad stabilitet och specificitet genom modifieringar av aminosyror eller ryggkedja, införande av icke-naturliga aminosyror, kemiska modifieringar som D-aminosyror, N-terminals (aminoterminal) kapning, amidation, acetylering, förlängning av N-terminaler eller C-terminaler. Peptiden är linjär med N- och C-del, och om de acetyleras kan de bli stabilare.

  • Införandet av konjugeringsgrupper för att förbättra halveringstiden (t.ex. PEG – pegylation, lipider, immunglobuliner - Fc-fragment)
  • Användning av fettsyror för att fördröja frisättningen vid injektionsstället
  • Öka molekylstorleken för att förhindra glomerulär filtrering och minska renal clearance
  • Nya formuleringstrategier för att förbättra stabilitet (minska injektionsfrekvens, förbättra oral absorption)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Källor till peptidbaserade läkemedelsämnen

A

Källor till peptidbaserade läkemedelsämnen
* Hormoner
* Signalsubstanser
* Epitoper/dela av proteinstrukturer
* Förkortningar av bindningsdomäner
* Rationell design
* In silico screening
* Fagdisplaybibliotek
* Försvarsmolekyler
* Peptidinnehållande toxiner

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Solid Phase Peptide Synthesis

A

Solid Phase Peptide Synthesis
Solid Phase Peptide Synthesis (SPPS) är en metod för att syntetisera peptider på ett fast substrat (ofta en olöslig polymer). Denna teknik gör det möjligt att bygga peptider, en aminosyra i taget, på ett sätt som gör det enklare att rena och isolera den slutliga produkten.

* Fästning av första aminosyran: Man börjar med att binda den första aminosyrans C-terminal (änden som har en karboxylgrupp) till ett fast, olösligt material (polymeriskt stöd). Det gör att peptiden sitter fast under hela processen, vilket förenklar arbetet.
* Koppling av nästa aminosyra: En andra aminosyra, som har skyddade reaktiva grupper för att förhindra oönskade reaktioner, kopplas till den första.
* Tvätt och avskyddning: Efter kopplingen tvättas systemet för att ta bort överskott av kemikalier. Sedan tas skyddsgruppen bort från den nykopplade aminosyran, så att den är redo att kopplas till nästa aminosyra.
* Upprepning: Denna process (koppling, tvätt, avskyddning) upprepas för varje ny aminosyra tills hela peptidkedjan är färdig.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Kemisk syntes

A

Kemisk syntes
* Solid Phase Peptidsyntes (SPPS): En metod för att bygga peptider där aminosyrorna kopplas ihop en i taget på ett fast (olösligt) stöd, vilket gör processen enklare att hantera och renare eftersom överskott av reagenser lätt kan tvättas bort.

* Manuell eller automatisk syntes.

* Fmoc (skyddsgrupp som avlägsnas med bas): En skyddsgrupp som används för att skydda aminogruppen på aminosyror under syntesen. Den avlägsnas med en bas, vilket gör det möjligt att koppla på nästa aminosyra. Fmoc-metoden är populär för sin milda avskyddningsförhållanden. Fmoc är lämplig för syntes av glykosylerade eller fosforylerade peptider. 

* Boc (skyddsgrupper som avlägsnas med syra): En annan typ av skyddsgrupp för aminogruppen. Till skillnad från Fmoc tas Boc bort med syra. Boc är lämplig för syntes av peptider med upp till 30–40 aminosyror. 

Peptidsyntesen sker i riktningen från peptidens C-terminal (karboxyländen) till N-terminalen (aminänden).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Peptider för typ 2-diabetes

A

Peptider för typ 2-diabetes
Glukagonliknande peptid-1 (GLP-1) och dess analoger:
* Ett peptidhormon som tillhör mag-tarmhormonerna kallade “inkretiner”.
* Binder till GLP-1-receptorn.
* Ökar insulinproduktionen efter måltid.
* Har en kort halveringstid (bryts ner av enzymet dipeptidylpeptidas-4 inom 1–2 minuter).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Modifierade peptider

A

Modifierade peptider
Somatostatin – hämmar sekretionen av tillväxthormon, insulin, glukagon, gastrin, sekretin och tyreoideastimulerande hormon.

Exempel: Behandla akromegali, hämma hypersekretoriska endokrina tumörer.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Hur administreras peptidläkemedel?

A

Hur administreras peptidläkemedel?
* Långsam frisättning via subkutana eller intramuskulära injektioner
* Intranasal leverans
* Hydrofoba depåer, t.ex. biologiskt nedbrytbara mikropartikeldepåformuleringar

En gång i veckan eller var sjätte månad.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Rekombinant uttryck

A

Rekombinant uttryck
Design av längre peptider är begränsad av syntesmetoder.

Insulin som härstammar från grisar och kor orsakade allergiska reaktioner.

Mänskliga peptider produceras i cellodlingar (bakterie- eller däggdjursceller).

17
Q

Vad kan vi lära oss från peptider som finns i naturen?

A

Vad kan vi lära oss från peptider som finns i naturen?
Struktur och aktivitet hos peptider som finns i naturen (nya peptider och nya strukturer)
Idéen att cyclisera: Cyclisering innebär att peptidkedjan binds ihop i en cirkulär form istället för att vara linjär. Detta kan stabilisera peptiden och göra den mer resistent mot nedbrytning i kroppen.
Utnyttja metoder i naturen för att producera peptider: användning av biokatalysatorer
Inkorporera nya bioaktiviteter

18
Q

Cyklopeptider

A

Cyklopeptider är stabila
Extrem stabilitet, kemisk, termisk och biologisk

19
Q

Varför är vi intresserade av cykliska peptider?

A

Varför är vi intresserade av cykliska peptider?
* För deras inneboende bioaktiviteter
* Idén att cyklisera (kemiska och biosyntetiska metoder)
* Att använda dem som stabiliserande stommar (graftning av epitoper): Cykliska peptider används också som “stommar” eller “ramar” för att stabilisera andra molekyler eller epitoper (de delar av ett antigen som känns igen av immunsystemet).