peptide et proteine Flashcards
def globale et précise de peptide (+donner les deux types ) et protéine
def globale : enchaînement d’AA relie par des liaisons peptidiques
peptide :nombre restreint d’AA
-oligopeptide( quelques AA)
-polypeptide ( nombre important de AA)
protéine : nombre important de AA
exemple d’oligopeptide
gluthation
tripeptide
def liaison peptidique
c’est une liaison AMIDE !! liaison covalente qui s’établie entre la fonction carboxyle et amine porté par les carbones alpha
elle est issue de la déshydratation intermoléculaire entre deux AA
formation du peptide ?
entre les deux premier AA
extrémité gauche NH2 (amine )
extrémité droite COOH ( carboxyl )
le dernier AA a donc une fonctionnCOOH libre
au niveau des liaisons peptidiques quelle forme est majoritaire
la liaison est de la forme cis/trans
mais la forme trans est majoritaire
dans l’organisation des peptides quelles sont les structure (5)
s primaire
s secondaire
s super secondaire
s tertiaire
s quaternaire
la structure primaire et le premier niveau de structuration dans l’espace d’une chaîne peptidique ?
faux
c’est la structure secondaire la première avec la « dispositions spatiales des liaisons peptidiques entre elles »
la structure primaires c’est l’ordre des AA
quelle sont les deux angles diedres
phi (ϕ) entre N et C alpha
psi (ψ) entre C et C alpha
en pratique toutes les combinaison d’angle sont possibles ?
faux en théorie !!!!
types de structures secondaire +++
la proline correspond à quelle strucuture ?
feuillet plissé
feuillet bêta
coude
hélice alpha
la proline c’est coude ????
à quoi sert la liaison hydrogène au niveau du peptide
elles stabilisent le peptide !!!!!
def structure super secondaire
mélange de plusieurs structure secondaire dans la même séquence !
récepteur à 7 domaines gras membranaires et ubiquité correspond à quelle structure ?
structure tertiaire
deux types de liaisons pour la structure tertiaire et quaternaire et develope les deux types .
covalente :
pont disulfure entre SH et Cys( liaison solide et primordiale )
non covalente :
liaison ionique
liaison h
liaison hydrophobe
schéma page 6
décrit moi la structure tertiaire et quaternaire
tertiaire : arrangement des chaînes polypeptidiques
quaternaire : association de plusieurs chaîne polypeptidique
⚠️piège , la solubilité des peptides et protéines elles dépend de quoi et elle est influencé par quoi ?
elle dépend de la proportion d’AA polaire/apolaire et de la structure spatial
elle est influencé par le PH la température ou la présence d’un détergent
donne moi de peptide protéine hydrosoluble et un insoluble dans l’eau
hydrosoluble : albumine , globine
insoluble dans l’eau : troponine
donne moi les 2 peptides donné dans le cours et donne moi leurs caractéristiques
GLUCAGON
hormone hyperglycémiante synthétisé par le pancréas
29AA
INSULINE
-2 peptides
-3 ponts disulfures
2 pont inter chaînes
1 pont intra chaîne
hormone hypoglycémiante
synthétisé par le pancréas
3 types de protéine et décrit les moi
holoproteines : que des AA
hétéroprotéine :
1 partie protéique + 1 groupement prosthétique soit :
-phosphoproteine
-glycoprotéine
-chromo protéine
lipoprotéine
définition groupement prosthétique
partie non protéique lié à un peptide par une liaison covalente
caractéristique du sérum d’Albumine (7)
-composant du plasma sanguin
-représente 50-60% des protéines plasmatiques
-maintient la pression oncotiqye sanguine grâce à la pression osmotique dû aux protéines
-membrane semi perméable
-pour maintenir la concentration en sel égale c’est l’eau qui traverse
- transport non spécifique ++++
pour les membrane vazyculaire le sel traverse mais pas l’albumine ++++
myoglobine et hémoglobine sont des protéine ……? et quelle est leurs rôle
protéines heliniques
elles ont pour rôle le transport d’O2
caractéristique myoglobine et hémoglobine et différence entre les deux
la différence c’est que la myoglobine n’a PAS de structure quaternaire alors que l’hémoglobine si !!!
myoglobine
protéine globulaire
hétéroprotéine et chromo protéine à l’hème
rôle : stockage et libération de l’O2 en cas d’effort physique intense
hémoglobine :
hétéroprotéine et chromo protéine avec 4 chaînes 2 chaînes alpha 2 chaînes bêta
partie protéique la globine et groupement prosthétique l’hème
elle est hydrosoluble
deux courbes différentes entre hémoglobine et myoglobine lesquelles
myoglobine (hyperbole) courbe michaelienne
hémoglobine courbe sigmoïde (allostérie )
explication de l’effet allostérique de l’hémoglobine ?
donne les valeurs en théorie et réalité de l’oxygène dans le sang s
L’oxygène se fixe sur un site, et cela facilite la fixation d’autres molécules d’oxygène sur les sites restants (coopérativité positive)
en théorie 20ml d’O2 pour 100 ml de sans
en réalité 4-5ml d’O2 pour 100 ml de sang
comment se déplace la courbe en fonction d’une allostérie positive ou négative ?
allostérie positive : la courbe se déplace à gauche
allostérie négative : la courbe se déplace à droite
effecteur négatif et positive
si on augmente la pression moins d’affinité donc effecteur négatif
quand on monte en montagne genre everest trop de pression donc moins d’oxygène
baisse pression allostérie positive
baisse température
baisse pCo2
baisse production 2,3 BPG
présence hmF qui améliore l’affinité
MAIS augmentation du PH
c’est quoi l’effet BORH
influence de la PC02 sur la fixation de l’O2
3 pharmacie de la fixation de l’hémoglobine
anémie
méthémoglobinémie
hémoglobines S= drepanocytose
monoxyde de carbone
def carboxyhemoglobine
hbCo qui a une fixation du Co sur le fer à la place de l’O2
affinité 200 fois supérieur
la proline à quelle structure secondaire ?
la structure coude ni hélice alpha ni hélice bêta
c’est quoi une liaison hydrogène
c’est le H du groupement NH
—légèrement chargé positivement
c’est le O du groupement CO d’une autre liaison peptidique
—légèrement chargé négativement
quelle est la particularité des membranes vasculaires ?
les membranes vasculaire laisse passer le sel mais pas le sérum d’albumine
composition de l’hémoglobine ?
hémoglobine c’est une hétéroprotéine donc avec une protéine et un groupement prosthétiques
protéines : globine
grp prosthétiques : chromo protéine avec l’hème
pour l’humain l’hème correspond à quoi ?
protoporphyrine IX a 3 substituant ++++++
