Genome et son expression Flashcards
Def nucléotide
Base azote + ose + phosphate
Quelles sont les 2 liaisons des nucleotides
Base azote / oses : N glycosilation sur le c1 de l’ose
Oses / phosphate : Liaison phosphoester
Def nucléoside
Base azotée + oses
Thymine : ADN
Uridine : ARN
Oses de l’ADN
2’ desoxyribose = B-D 2’ desoxyribose
Oses de L’ARN
Ribose =B D ribofuranose
Liaison oses phosphate consiste en quoi
Estérification de la fonction alcool en 5’ de l’ose par un acide phosphorique
2 types de phosphates
Nucleotide Triphosphate :GTP
Nucleotide monophosphate : GMP
2 types de base azotée et quelles nucleosides leurs appartiennent
Base purique : adénine guanine
Base pyrimidique : thymine uracile cytosine
Structure de l’ADN caractéristique
Structure bicatenaire :
Orientation inverse —> antiparallèle (5’ 3’ ) (3’ 5’)
Extrémité 5´ P libre
Extrémité 3’ OH libre
À quoi correspond la partie hydrophile de l’ADN
Phosphate et sucre à l’extérieur
1 chromosome = combien de molécule d’ADN
1 seul molécule d’ADN dans un chromosome !!
Combien de liaison hydrogène entre A/T et G/C
A/T 2 liaisons
G/C 3 liaisons
Différence de structure entre ARN et ADN
ADN = bicatenaire
ARN = monocatenaire ( 1 seul brin )
5 types d’ARN
ARN r
ARN t
ARN m
ARN sn (small nucléaire)
ARN mi
ARN r
-Protéine + ARN
-dans le REG
-synthèse des protéines via ARN messager
ARNt
Transport des AA vers les ribosomes
ARN m
-transfert de la partie informative de l’info génétique
-de l’ADN au ribosome au cytoplasme
⚠️⚠️nécessite une maturation en ajoutant une queue poly A sauf pour les ARNm codant pour les histones
ARN sn
Intervient dans la maturation des ARN m
Génome humaine ( chiffres )
26000 gènes nucléaire
37 mitochondriaux
Génome mitochondrial à quel type d’ADN ? et transmissible par qui ?
-ADN circulaire
-transmission uniquement par la mère
Gènes codée d’un génome mitochondrial
13 gènes
22 ARN t
2 ARN r
Pas d’intron
Taille génome nucléaire
3.10(9) base
2 mètre d’ADN par cellule
4 caractéristiques de la structure de la chromatine
-2 mètres de chromatine pour un noyau de 5 à 8 micron
-filament 30nm : formation boucle
-enroulement hélice en boucle = formation des deux chromatides du chromosomes
- augmentation de la compaction d’un facteur 10 000
Def Nucleosome
-8 histones qui donnent 1 octamère
- ADN enroulé autour de l’octamère
-10 nm de diamètre 6 nm d’épaisseur
Histones protéines riche en quoi?
Protéine riche en AA BASIQUE
Quelle particularité a la partie N-terminal de l’histone
Accessible à des modifications post-traductionelle :
Acethylation
Methylation
Phosphorylation
À quoi sert l’histoire H1
Une compaction supplémentaire de 40 fois
Histone se trouvant dans les nucleosomes
2x( H2A +H2B + H3 + H4)
Caractéristique de la chromatine fermée
Transcriptionellement inactive :
Partie N terminal des histones —>
Méthylée
Diacethylée
Déphosphorylée
Caractéristique chromatine ouverte
Transcriptionellement active :
Partie N terminal des histones :
-démethylee
-acétylée
-phosphorylée
Caractéristique chromatine ouverte
Transcriptionellement active :
Partie N terminal des histones :
-démethylee
-acétylée
-phosphorylée
Taille chromatine ouverte / fermé
Ouverte 10 nm
Fermé 30 nm
À quoi sert les enzymes
Ils sont responsables des modifications post traductionelle soit des modification sur la partie N-terminal des histones
Qu’engendre l’acethylation des histones
On neutralise les charges positives des histones ce qui diminue les interactions avec l’ADN donc decompaction et ouverture de la chromatine
Pourcentage génome nucléaire
7% heterochromatine
93% euro chromatine
30% ADN génique
70 % ADN intergenique
Quelles sont les ADN répète non codant
ADN: satellite /microsattelite /mini satellite /rétrotransposons /transposons
ADN non codant répété en tandem ou dispersé
Tandem : ADN satellite microsattelite minisatelitte
Disperse : retrotransposons / transposons
Étape RÉPLICATION de l’ADN
Initiation , élongation , terminaison
Étapes initiation
Fixation protéine :
-helicases: ADN rendu monocatenaire
- protéine SSB ( single strand binding ) : stabilise l’ADN monocatenaire
Formation fourche réplication réplication des deux côtés
élongation par :
ADN polymérase à partir :
-brin matrice
-dNTP
-une amorce d’ARN (primase= ARN polymerase) qui va se détacher lorsque l’ADN polymerase va se fixer
Réaction élémentaire de l’élongation
Attaque Nucleotide :
-de l’oxygène du C3 du dernier nucleotide fixé
-sur le phosphore du phosphate alpha du nouveau Nucleotide
Étape terminaison
-signal de terminaison
-digestion amorce ARN
-complément lacune ADN
-location des fragments
Obtention de 2 brins circulaires
Étapes pour passer de l’ADN à la protéine
Transcription (transcrit primaire )
Maturation (transcrit mature )
Transport ( noyau vers cytoplasme )
Traduction = à partir du transcrit mature dans le cytoplasmes
Modification ciblage = protéine fonctionnelle
Particularite de l’ARN polymerase
Nécessite une matrice ADN
pas d’amorce nécessaire
Réaction élémentaire de la transcription ( ARN POLYMERASE )
Attaque Nucleophile de l’OH en 3’ sur le phosphate alpha
+++ réaction irréversible
But transcription
Recopier une partie de l’ADN en ARN messager =formation d’ARN pré messager
Pendant la transcription que fait le brin codant
Remplace la thymine par uracile dans l’ARN
Fonctionement transcription
Demarrage
Déplacement sur le brin ADN 3’ 5’
Synthèse ARN 5’ 3’
Caractéristique ARN POL I
ARN r
Caractéristique ARN POL II
ARN m
ARN sn
ARN mi
+ inhibition par champignon : alpha amanitite
ARN POL III caractéristique
ARN t
ARN 5s
