Genome et son expression Flashcards

1
Q

Def nucléotide

A

Base azote + ose + phosphate

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Q

Quelles sont les 2 liaisons des nucleotides

A

Base azote / oses : N glycosilation sur le c1 de l’ose

Oses / phosphate : Liaison phosphoester

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3
Q

Def nucléoside

A

Base azotée + oses

Thymine : ADN
Uridine : ARN

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4
Q

Oses de l’ADN

A

2’ desoxyribose = B-D 2’ desoxyribose

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5
Q

Oses de L’ARN

A

Ribose =B D ribofuranose

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6
Q

Liaison oses phosphate consiste en quoi

A

Estérification de la fonction alcool en 5’ de l’ose par un acide phosphorique

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7
Q

2 types de phosphates

A

Nucleotide Triphosphate :GTP
Nucleotide monophosphate : GMP

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8
Q

2 types de base azotée et quelles nucleosides leurs appartiennent

A

Base purique : adénine guanine
Base pyrimidique : thymine uracile cytosine

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9
Q

Structure de l’ADN caractéristique

A

Structure bicatenaire :
Orientation inverse —> antiparallèle (5’ 3’ ) (3’ 5’)
Extrémité 5´ P libre
Extrémité 3’ OH libre

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10
Q

À quoi correspond la partie hydrophile de l’ADN

A

Phosphate et sucre à l’extérieur

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11
Q

1 chromosome = combien de molécule d’ADN

A

1 seul molécule d’ADN dans un chromosome !!

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12
Q

Combien de liaison hydrogène entre A/T et G/C

A

A/T 2 liaisons
G/C 3 liaisons

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13
Q

Différence de structure entre ARN et ADN

A

ADN = bicatenaire
ARN = monocatenaire ( 1 seul brin )

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14
Q

5 types d’ARN

A

ARN r
ARN t
ARN m
ARN sn (small nucléaire)
ARN mi

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15
Q

ARN r

A

-Protéine + ARN
-dans le REG
-synthèse des protéines via ARN messager

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16
Q

ARNt

A

Transport des AA vers les ribosomes

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17
Q

ARN m

A

-transfert de la partie informative de l’info génétique
-de l’ADN au ribosome au cytoplasme
⚠️⚠️nécessite une maturation en ajoutant une queue poly A sauf pour les ARNm codant pour les histones

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18
Q

ARN sn

A

Intervient dans la maturation des ARN m

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19
Q

Génome humaine ( chiffres )

A

26000 gènes nucléaire
37 mitochondriaux

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20
Q

Génome mitochondrial

A

-ADN circulaire
-transmission uniquement par la mère

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21
Q

Gènes codée d’un génome mitochondrial

A

13 gènes
22 ARN t
2 ARN r
Pas d’intron

22
Q

Taille génome nucléaire

A

3.10(9) base
2 mètre d’ADN par cellule

23
Q

4 caractéristiques de la structure de la chromatine

A

-2 mètres de chromatine pour un noyau de 5 à 8 micron
-filament 30nm : formation boucle
-enroulement hélice en boucle = formation des deux chromatides du chromosomes
- augmentation de la compaction d’un facteur 10 000

24
Q

Def Nucleosome

A

-8 histones qui donnent 1 octamère
- ADN enroulé autour de l’octamère
-10 nm de diamètre 6 nm d’épaisseur

25
Q

Histones protéines riche en quoi?

A

Protéine riche en AA BASIQUE

26
Q

Quelle particularité a la partie N-terminal de l’histone

A

Accessible à des modifications post-traductionelle :
Acethylation
Methylation
Phosphorylation

27
Q

À quoi sert l’histoire H1

A

Une compaction supplémentaire de 40 fois

28
Q

Histone se trouvant dans les nucleosomes

A

2x( H2A +H2B + H3 + H4)

29
Q

Caractéristique de la chromatine fermée

A

Transcriptionellement inactive :
Partie N terminal des histones —>
Méthylée
Diacethylée
Déphosphorylée

30
Q

Caractéristique chromatine ouverte

A

Transcriptionellement active :
Partie N terminal des histones :
-démethylee
-acétylée
-phosphorylée

31
Q

Caractéristique chromatine ouverte

A

Transcriptionellement active :
Partie N terminal des histones :
-démethylee
-acétylée
-phosphorylée

32
Q

Taille chromatine ouverte / fermé

A

Ouverte 10 nm
Fermé 30 nm

33
Q

À quoi sert les enzymes

A

Ils sont responsables des modifications post traductionelle soit des modification sur la partie N-terminal des histones

34
Q

Qu’engendre l’acethylation des histones

A

On neutralise les charges positives des histones ce qui diminue les interactions avec l’ADN donc decompaction et ouverture de la chromatine

35
Q

Pourcentage génome nucléaire

A

7% heterochromatine
93% euro chromatine
30% ADN génique
70 % ADN intergenique

36
Q

Quelles sont les ADN répète non codant

A

ADN: satellite /microsattelite /mini satellite /rétrotransposons /transposons

37
Q

ADN non codant répété en tandem ou dispersé

A

Tandem : ADN satellite microsattelite minisatelitte
Disperse : retrotransposons / transposons

38
Q

Étape RÉPLICATION de l’ADN

A

Initiation , élongation , terminaison

39
Q

Étapes initiation

A

Fixation protéine :
-helicases: ADN rendu monocatenaire
- protéine SSB ( single strand binding ) : stabilise l’ADN monocatenaire
Formation fourche réplication réplication des deux côtés

40
Q

élongation par :

A

ADN polymérase à partir :
-brin matrice
-dNTP
-une amorce d’ARN (primase= ARN polymerase) qui va se détacher lorsque l’ADN polymerase va se fixer

41
Q

Réaction élémentaire de l’élongation

A

Attaque Nucleotide :
-de l’oxygène du C3 du dernier nucleotide fixé
-sur le phosphore du phosphate alpha du nouveau Nucleotide

42
Q

Étape terminaison

A

-signal de terminaison
-digestion amorce ARN
-complément lacune ADN
-location des fragments
Obtention de 2 brins circulaires

43
Q

Étapes pour passer de l’ADN à la protéine

A

Transcription (transcrit primaire )
Maturation (transcrit mature )
Transport ( noyau vers cytoplasme )
Traduction = à partir du transcrit mature dans le cytoplasmes
Modification ciblage = protéine fonctionnelle

44
Q

Propriété de l’ARN polymerase

A

Nécessite une matrice ADN
pas d’amorce nécessaire

45
Q

Réaction élémentaire de la transcription ( ARN POLYMERASE )

A

Attaque Nucleophile de l’OH en 3’ sur le phosphate alpha
+++ réaction irréversible

46
Q

But transcription

A

Recopier une partie de l’ADN en ARN messager =formation d’ARN pré messager

47
Q

Pendant la transcription que fait le brin codant

A

Remplace la thymine par uracile dans l’ARN

48
Q

Fonctionement transcription

A

Demarrage
Déplacement sur le brin ADN 3’ 5’
Synthèse ARN 5’ 3’

49
Q

Caractéristique ARN POL I

A

ARN r

50
Q

Caractéristique ARN POL II

A

ARN m
ARN sn
ARN mi
+ inhibition par champignon : alpha amanitite

51
Q

ARN POL III caractéristique

A

ARN t
ARN 5s