🔴Genome et son expression

Question 1

Def nucléotide

Answer 1

Base azote + ose + phosphate

Question 2

Quelles sont les 2 liaisons des nucleotides

Answer 2

Base azote / oses : N glycosilation sur le c1 de l’ose

Oses / phosphate : Liaison phosphoester

Question 3

Def nucléoside

Answer 3

Base azotée + oses

Thymine : ADN
Uridine : ARN

Question 4

Oses de l’ADN (les deux formes d’écritures)

Answer 4

2’ desoxyribose
B-D 2’ desoxyribose

Question 5

Oses de L’ARN

Answer 5

Ribose
B-D ribofuranose

Question 6

Liaison oses phosphate consiste en quoi ? et rappelle moi le type de liaison ?

Answer 6

liaison phosphoester
Estérification de la fonction alcool en 5’ de l’ose par un acide phosphorique

Question 7

2 types de nucleotide phosphate

Answer 7

Nucleotide Triphosphate :GTP ( guanosine 5 triphosphate )
Nucleotide monophosphate : GMP ( guanosine 5 monophosphate )

Question 8

2 types de base azotée et quelles nucleosides leurs appartiennent ?

Answer 8

Base purique : adénine guanine
ps: base purique c’est des molécules avec deux cycles à côté l’un de l’autre

Base pyrimidique : thymine uracile cytosine

Question 9

Structure de l’ADN caractéristique ?

Answer 9

Structure bicatenaire :
Orientation inverse —> antiparallèle (5’ 3’ ) (3’ 5’)
Extrémité 5´ P libre
Extrémité 3’ OH libre

Question 10

au sein de la structure de l’ADN il y’a une partie hydrophobe et une partie hydrophile. De quoi est constitué la partie hydrophile ?

Answer 10

Phosphate et sucre à l’extérieur

Question 11

combien y’a t’il de molécule d’ADN dans un chromosomes ?

Answer 11

1 seul molécule d’ADN dans un chromosome !!

Question 12

Combien de liaison hydrogène entre A/T et G/C

Answer 12

A/T = 2 liaisons ( axelle teubé 2 neurones )

G/C 3 liaisons (grand prix exploreur il y’a eu que 3 grand prix )

Question 13

Différence de structure entre ARN et ADN ?

Answer 13

ADN = bicatenaire
ARN = monocatenaire ( 1 seul brin )

Question 14

5 types d’ARN

Answer 14

ARN r
ARN t
ARN m
ARN sn (small nucléaire)
ARN mi

Question 15

ARN r

Answer 15

participe à la formation du ribosome !
un ribosome = Protéine + ARN
-dans le REG
-synthèse des protéines via ARN messager

Question 16

ARNt

Answer 16

realise le transport des AA vers les ribosomes

Question 17

ARN m

Answer 17

réalise le transfert de la partie informative de l’information génétique de l’ADN dans le noyau jusqu’au ribosome dans la cytoplasme cytoplasme
⚠️⚠️nécessite une maturation en ajoutant une queue poly A sauf pour les ARNm codant pour les histones

Question 18

ARN sn

Answer 18

Intervient dans la maturation des ARNm

Question 19

Génome humaine ( chiffres )

Answer 19

26000 gènes nucléaire
37 mitochondriaux

10-14 bactéries
10-13 cellules
3x10-9 paires de base soit (9 milliard )

Question 20

Génome mitochondrial à quel type d’ADN ? et transmissible par qui ?

Answer 20

-37 gènes mitochondriaux
-ADN circulaire
-transmission uniquement par la mère +++

rappel:
ADN: bicatenaire
ARN : monocatéaire
gène mitochondriaux :ADN CIRCULAIRE

Question 21

Gènes codée d’un génome mitochondrial (37 gènes)

Answer 21

13 gènes
22 ARN t
2 ARN r
Pas d’intron

Question 22

Taille génome nucléaire

Answer 22

3.10(9) paire de base
2 mètre d’ADN par cellule

Question 23

3 étapes de la compaction de la chromatine ?

Answer 23

-2 mètres de chromatine pour un noyau de 5 à 8 micron

1)filaments 30nm : formation boucle

2)enroulement en hélice des boucle = formation des deux chromatides du chromosomes +++

3)augmentation de la compaction d’un facteur 10 000

Question 24

Def Nucleosome

Answer 24

-8 histones qui donnent 1 octamère
- ADN enroulé autour de l’octamère facteur 6
-10 nm de diamètre 6 nm d’épaisseur

150 à 200 pb d’ADN enrouler
20 à 60 pb entre les nucleosomes

Question 25

Histones protéines riche en quoi?

Answer 25

Protéine riche en AA BASIQUE

Question 26

Quelle particularité a la partie N-terminal de l’histone ?et quelle sont les conséquences ?

Answer 26

Accessible à des modifications post-traductionelle : Acethylation Methylation Phosphorylation conséquence : ça agit sur la compaction de l’ADN donc sur l’accessibilité des facteurs de transcriptions

Question 27

À quoi sert l’histoire H1 ?

Answer 27

Une compaction supplémentaire de 40 fois

Question 28

Histone se trouvant dans les nucleosomes ?

Answer 28

2x( H2A +H2B + H3 + H4)

Question 29

Caractéristique de la chromatine fermée ?

Answer 29

Transcriptionellement inactive : Partie N terminal des histones —> Méthylée Diacethylée Déphosphorylée

Question 30

Caractéristique chromatine ouverte ?

Answer 30

Transcriptionellement active : Partie N terminal des histones : -démethylee -acétylée -phosphorylée

Question 31

Taille chromatine ouverte / fermé ( soit compacté)

Answer 31

Ouverte 10 nm en chapelet Fermé 30 nm

Question 32

À quoi sert les enzymes dans la régulation de la chromatine

Answer 32

Ils sont responsables des modifications post traductionelle soit des modification sur la partie N-terminal des histones plus précisément le phénomène d’acethylation

Question 33

Qu’engendre l’acethylation des histones ?

Answer 33

On neutralise les charges positives des histones ce qui diminue les interactions avec l’ADN donc decompaction et ouverture de la chromatine

Question 34

Pourcentage génome nucléaire en heterochromatine et euchromatine

Answer 34

7% heterochromatine 93% euro chromatine 30% ADN génique moins de 1 tiers du génome 70 % ADN intergenique

Question 35

Quelles sont les ADN répété non codant ?

Answer 35

ADN: satellite /microsattelite /mini satellite /rétrotransposons /transposons

Question 36

quelles sont les ADN non codant répété en tandem ou dispersé ?

Answer 36

Tandem : ADN satellite microsattelite minisatelitte Disperse : retrotransposons / transposons

Question 37

Étape RÉPLICATION de l’ADN ( 3) ? quelles est l’objectifs de cette réplication/ caractéristiques ?

Answer 37

Initiation , élongation , terminaison objectifs : dupliquer l’information génétiques en vue d’une division cellulaire . obtention de DEUX ADN double brin avec pour chacun un brin parentale et un brin neo-synthetisé. C’est pour ça qu’on appelle ça une synthèse semi- conservative car elle garde toujours un brin parentale .

Question 38

REPLIACTION PROCARYOTE Étapes initiation ?

Answer 38

Ouverture de la double via la fixation d’une protéine(hélicases) : -helicases: ADN rendu monocatenaire - protéine SSB ( single strand binding ) : stabilise l’ADN monocatenaire Formation fourche réplication réplication des deux côtés

Question 39

REPLIACTION PROCARYOTE étape d’élongation ?

Answer 39

par l’ADN polymérase à partir : -brin matrice -dNTP -une amorce d’ARN (primase= ARN polymerase) qui va se détacher lorsque l’ADN polymerase va se fixer

Question 40

REPLIACTION PROCARYOTE Réaction élémentaire de l’élongation ?

Answer 40

Attaque Nucleoside : -de l’oxygène du C3 du dernier nucleotide fixé -sur le phosphore du phosphate alpha du nouveau Nucleotide

Question 41

REPLICATION PROCARYOTE Étape terminaison ?

Answer 41

-signal de terminaison -digestion amorce ARN -complément lacune ADN -ligation des fragments par une lignée =>Obtention de 2 brins circulaires

Question 42

Étapes pour passer de l’ADN à la protéine ?

Answer 42

Transcription (transcrit primaire ) Maturation (transcrit mature ) =>épissage Transport ( noyau vers cytoplasme ) Traduction = à partir du transcrit mature dans le cytoplasmes Modification ciblage = production d’une protéine fonctionnelle

Question 43

TRANSCRIPTION CHEZ LES EUCARYOTES quelle est le rôle de la transcription soit de l’ARN polymerase?

Answer 43

recopier une partie de l’ADN du génome en ARNm

Question 44

TRANSCRIPTION CHEZ LES EUCARYOTES Réaction élémentaire de la transcription ( ARN POLYMERASE )

Answer 44

Attaque Nucleophile de l’OH en 3’ sur le phosphate alpha +++ réaction irréversible

Question 45

TRANSCRIPTION CHEZ LES PROCARYOTES fonctionnement ?

Answer 45

5 sous unité: - deux alpha - deux bêta (bêta et bêta’ prime ) - une sigma c’est la sigma qui reconnaît la séquence promoteur proximal

Question 46

quelle type de liaison entre les nucleotides

Answer 46

liaison phosphodiester

Question 47

entre les ARNr les ARNt et les ARNm quelle est le lien qu’ils ont tous les trois avec le ribosomes

Answer 47

ARNr : participe à la formation du ribosome ARNt: transport les acide aminée jusqu’au ribosome ARNm : réalise le transfert de l’information génétique du noyau au ribosome dans le cytoplasme

Question 48

tous les ARNm necessite l’ajout d’une queu poly À?vrai ou faux

Answer 48

faux pour tous sauf pour les ARNm codant pour les histones

Question 49

qu’est ce qui permet la régulation de l’assemblage de la chromatine ?

Answer 49

la régulation de l’assemblage de la chromatine se fait par des enzymes !! en réalisant une acethylation des histones - neutralisations des charges positives des histones - alors diminution des interactions avec l’ADN - decompaction et ouverture de la chromatine

Question 50

quelle est la différence entre la synthèse du brin direct et la synthèse du brin complémentaire ?

Answer 50

la synthèse du brin direct et complémentaire se fait de 5-3 mais celle du brin direct dans le sens de propagation de la fourche et celle du brin indirect dans le sens inverse de la propagation de la fourche

Question 51

quelles sont les nombre de base synthétise lors de l’élongation sur les procaryotes ou eucaryote ?

Answer 51

procaryote 500 base par seconde eucaryote 50 base par seconde

Question 52

qu’est ce qu’on obtient à la fin de réplication des procaryotes?

Answer 52

séparation des deux copies d’ADN et obtention de 2 brins circulaire

Question 53

différence entre l’ADN polymérase et l’ARN polymerase ?

Answer 53

ADN polymerase = pour la réplication des procaryotes au niveau de l’élongation et à besoins d’une amorce d’ARN ARN polymerase = pour la TRANSCRIPTION +++ pas besoin d’amorce d’ARN

Question 54

TRANSCRIPTION CHEZ LES EUCARYOTES quelle est le sens de déplacement et de synthèse de l’ARN polymerase ?

Answer 54

déplacement de 5 à 3 sur le brin codant et une synthèse sur le brin matrice de 3 à 5

Question 55

TRANSCRIPTION CHEZ LES EUCARYOTES combien de types d’ARN polymerase et lesquelles ? et à quoi il correspondent ?

Answer 55

ARN I —> ARNr ARN II —> ARNm ARNsn ARNmi ARN III —> ARNt ARN5s

Question 56

INITIATION CHEZ LES EUCARYOTES fonctionnement ?

Answer 56

tu vas avoir un promoteurs avec des GTF (facteurs généraux de transcription) et ton ARN polymerase va se fixer sur ces GTF fixation sur le promoteur de TFIIA TFIIB TFIID(TBD TATA) TFIIE TFIIF TFIIH et un complexe protéique le médiateur

Question 57

ELONGATION CHEZ LES EUCARYOTES

Answer 57

ma machine transcriptionelle se déplace de 5 à 3 et attention rehybridation des deux brins après son passage !

Question 58

def tropoisomérase

Answer 58

enzyme qui évite les torsions trop importante de l’ADN

Question 59

ELONGATION CHEZ LES EUCARYOTES comment fonction la correction d’erreur de la machine transcriptionelle ?

Answer 59

elle clive (séparé le dernière nucleotide ) si celui ci est mauvais alors elle clive la liaison phosphodiester !

Question 60

TERMINAISON CHEZ LES EUCARYOTES c’est quoi le signal de terminaison ?

Answer 60

GC puis une région riche en U

Question 61

ÉTAPE MATURATION (ARN pré messager ) quelles sont les 3 étapes ?

Answer 61

l’étape de maturation est présente uniquement chez les eucaryotes !!! 1) formation de la coiffe 2) addition de la queu poly À 3 ) epissage

Question 62

ÉTAPE MATURATION (ARN pré messager ) rôle la coiffe et fonctionnement ?

Answer 62

rôle : protéger l’ARN contre l’action des ribonucléases reconnaissance de l’ARNm par les ribosomes transport de l’ARNm par les pores nucléaires structure de la coiffe : ajout en 5’ d’une guanine methylee par une liaison 5’-5’

Question 63

ÉTAPE MATURATION (ARN pré messager ) rôle et fonctionnement de l’ajout de la queu poly A ?

Answer 63

rôle : stabilisation de l’ARNm fonctionnement : clivage de l’ARNm par une endonucléase 20 nucleotide après la séquence signal puis ajout de la queu poly A sur l’extrémité 3’

Question 64

ÉTAPE MATURATION (ARN pré messager ) epissage ou excision des introns fonctionnement ?

Answer 64

réalisé par le spliceosome composé par de l’ARNsn et des protéines. Il réalise l’émissaire dans le noyau fonctionnement : deux transesterifications : -attaque du groupement 2 OH libre du A = formation d’un lasso -attaque de l’OH de l’extrémité 3’ de l’éxon 1

Question 65

mécanismes qui permettent la diversité des protéines et qui ne permettent pas la diversité des protéines ?

Answer 65

permette la diversité : ajout queu poly A + traduction + epissage ne permet pas la diversité : initiation à la transcription

Question 66

combien y’a t’ils en pourventage de gêne exprimée par cellule ?

Answer 66

20%

Question 67

l’expression des gènes dépend du type cellulaire ?

Answer 67

oui l’expression dépend aussi des signaux du métabolismes du cycle et des états

Question 68

la phosphorylation et la dephosphorylation se fait en post transcriptionelle ?

Answer 68

faux en post traductionnel!! il a aussi la methylation ou l’acetylation ect …

Question 69

dans la régulation transcriptionelle à quoi sert le facteur cis et le facteur trans ?

Answer 69

facteur cis (au niveau du promoteur disal): site de fixation facteur trans : combinaison de protéine qui se fixe sur le facteur cis

Question 70

def séquence enhancer ?

Answer 70

augmentation de l’activité transcriptionelle ps silencer : diminution de l’activité transcriptionelle

Question 71

quelles sont les liaisons et leur interactions entre facteurs trans et ADN ?

Answer 71

liaison h liaison hydrophobe lisaion ionique via une interaction faible liaison forte et spécifique via une interaction faible mais multiples entre AND acide aminée et protéine

Question 72

quelles est l’expression du gène si il est hyper méthyle et hypo méthylé

Answer 72

hyper methylé: faible expression hypo methylé : forte expression