Organelas

Question 1

Tipos de transportes de proteínas

Answer 1

Regulado: del núcleo al citosol y viceversa
Vesicular: de un compartimiento a otro topologicamente equivalente
Transmembrana: del citosol a peroxidomas, plastos, mitocondria y RE

Question 2

Complejo del poro nuclear

Answer 2

Está formado por más de 30 nucleoporinas. Tiene fibrillas citosolicas y fibrillas nucleares que forman la canastilla nuclear

Question 3

Señal de localización al núcleo

Answer 3

Es lyslyslysarglys en cualquier parte de la secuencia, y no requiere peptidasa señal

Question 4

Importinas e importación

Answer 4

Son proteínas citosolicas solubels que reconocen la señal de localización, forman un complejo con la proteína e ingresan interaccionando con las fibrillas
Al hidrolizarse ran GTP en ran GDP en el núcleo, la gradiente de GDP hace que el complejo ingrese al núcleo arrastrado, y luego la importina sale unida a ran GTP mediante el gradiente cuando se intercambia GDP por GTP

Question 5

Exportinas y exportación

Answer 5

Los receptores que reconocen señales de exportación de proteínas son las exportinas. En el núcleo se une a la proteína a transportar, y la exportina se une por un sitio de unión a la proteina ran GTP. El gradiente de GTP hace que salga el complejo, y en el citosol se disocia y la exportins vuelve al núcleo por el gradiente de GDP

Question 6

Exportación de ARNm

Answer 6

Es independiente de Ran, actúan las proteinas F1XN y T1XN facilitando la exportación del ARNm maduro.

Question 7

Activación de células T y calcio

Answer 7

Aumento de calcio: desfosforila al factor de transcripción NF-AT, se une a calcineurina, se deja libre una señal de importación nuclear para unirse a sitios de transcripción.
Disminución de calcio: calcineurina se desprende del factor, se fosforila al factor, se expone una señal de exportación, sale del núcleo.

Question 8

Señal de clasificación de mitocondrias

Answer 8

Las proteínas ingresan de forms postraduccional y tienen una señal de clasificación en el amino terminal, que debe ser cortada por una peptidasa señal. La señal depende del compartimiento de la mitocondria donde se dirija.

Question 9

Receptores de mitocondrias (5) y sus funciones

Answer 9

TOM: en memb ext, acoplado a canal de translocación
TIM23: memb int, ingreso desde TOM a la matriz
TIM22: memb int, inserción de proteínas de dominios transmembrana
SAM: memb ext, proteínas que serán ancladas a la memb ext
OXA: memb int, proteínas codificadas por genoma mitocondrial y traducidos en la matriz

Question 10

Importación de proteínas mitocondriales, chaperonas, ingreso a matriz

Answer 10

Las proteínas ingresan a la mitocondria de forma desplegada con ayuda de chaperoninas citosicas, que luego se desprenden con hidrolisis de ATP. Luego chaperonas mitocondriales hacen lo mismo para el ingreso a la matriz, que se da por bombeo de protones

Question 11

Secuencia de paro en proteínas mitocondriales

Answer 11

Son secuencias que frenan la translocación para que la proteína quede enganchada por su sitio hidrofóbico a la membrana.

Question 12

Origen del peroxisoma

Answer 12

Surge de la formación de una vesícula en el RE que incorpors proteínas del peroxisoma

Question 13

Señal de clasificación a peroxisomas, cómo ingresan

Answer 13

Es una señal parte de la proteína denominada secuencia SKL en el carboxilo terminal, y no requiere de peptidasa señal. Ingresan plegadas de forma postraduccional

Question 14

Ingreso de la proteína al peroxisoma

Answer 14

El receptor soluble pex5 se une a la proteína e ingresa por el translocador pex14. El complejo luego se disocia por otro complejo de proteínas pex

Question 15

Señal de clasificación al RE y cómo ingresa

Answer 15

Tiene una señal de clasificación en el amino terminal con una secuencia hidrofobica. Ingresa en un proceso cotraduccional. Requiere peptidasa señal

Question 16

Pausa de la traducción antes de unirse al RE

Answer 16

La SRP tiene un bolsillo de union a la secuencia señal que se unirá a la proteína, un dominio bizagra que rodea al ribosoma y un dominio de pausa de la traducción que se une a los factores de elongacion. Todo esto pausa la traducción

Question 17

Reanudación de la traducción

Answer 17

La SRP direcciona al complejo al receptor del RER y transloca por el translocador SEC61. La SRP se disocia y se reanuda la traducción de manera simultánea a la translocación.

Question 18

SEC61

Answer 18

Es un poro acuoso cerrado que se abre de manera transitoria para no dejar salir calcio al citosol.

Question 19

SEC61

Answer 19

Es un poro acuoso cerrado que se abre de manera transitoria para no dejar salir calcio al citosol. Tiene un tapón que se abre lateralmente cuando interacciona con la señal

Question 20

Proteínas solubles del RE

Answer 20

Una peptidasa señal corta a la proteina en la señal de clasificación, que quedará insertada en la membrana hasta su degradación. La proteína se pliega en la luz del RE

Question 21

Proteínas integrales de membrana en el RE

Answer 21

Requieren de una o más secuencias de paro, donde se detiene la translocación. En proteínas de dible paso o múltiples pasos, la señal o señales de clasificación no se encuentran en el amino terminal, por lo que se ancla esa sección a la membrana también

Question 22

Aproximación por transfeccion para estudiar tráfico de proteínas

Answer 22

Se genera una proteína de fusión, se inserta en un plasmido y se transfecta. La proteína tiene una secuencia señal para evaluar por centrifugación diferencial y western blot o colocalizacion donde fue.

Question 23

Aproximación genética psra estudiar tráfico

Answer 23

Se modifican genéticamente a enzimas agregandoles una secuencia de direccionamiento a otra organela para evaluar su funcionalidad.

Question 24

Aproximación bioquímica para estudiar tráfico (2)

Answer 24

• se aisla la organela de interés y se determina por marcas radioactivas o western blotting la presencia de la proteína.
• se incuba por un lado a una proteína con señal de direccionamiento a mitocondrias con mitocondrias y tripsina, y por otro lado dolo con tripsina, para determinar si la señal era hacia la mitocondria.

Question 25

N-glicosidacion en el RER, mecanismo, importancia, ciclo

Answer 25

Es una modificación postraduccional importante del RE. Se insertan 14 azúcares a un grupo amino de una asparagina de la proteína mediante la enzima oligosacariltransferasa. Los ult 3 azúcares son glucosa, dos de ellos se pierden y la glucosa terminal es reconocifa por chaperonas para el plegamiento. Luego una glucosidasa corta esa glucosa para liberarla de la chaperona y que salga del RE. Si está mal plegada entra en un ciclo donde se agregan de nuevo las glucosas, hasta que el temporizador de manosas sea hidrolizado y la proteína mal plegada es marcada para su degradación.