ADN General Flashcards
Estructura de la molécula de ADN
Nucleotidos formados por una pentosa unida a un fosfoester y este a una base nitogrenada. Se unen mediante uniones fosfodiester formando el ácido nucleico. Forman un esqueleto de fosforribosa del que proyectan bases nitrogenadas al interior. El extremo 3’ tiene un hidroxilo libre y el 5’ un fosfato libre.
Desnaturalización de la doble cadena de ADN
Métodos como el aumento de temperatura, modificación de fuerza iónica, cambio de pH o adición de urea provocan la separación de la cadena. La presencia de ADN monocatenario se evalua por espectroscopia a 260nm
Cromosomas celulares
Están constituidos por ADN cromosómico, que contiene al genoma del organismo. En eucariontes se disponen en más de un cromosoma. La molécula de ADN del cromosoma está asociada a proteínas que oliegan al ADN y constituyen la cromatina
Cromosomas homólogos
Son cromosomas que aportan información similar de la madre y el padre.
Cromatides hermanas
Son cromosomas duplicados, o sea dos moléculas del mismo ADN.
Gen, regiones y funciones
Cada gen transcribe a una proteína o ARN funcional. Tiene secuencias reguladoras de su transcripción, regiones no codificantes (sitios de corte y empalme, región promotora, secuencia de escision 3’ y secuencia de poliadenilacion) y regiones codificantes
Replicosoma
Se monta en las burbujas de replicación formadas en los orígenes de replicación, y replcisn al cromosoma en dos cromatides hermanas
Secuencias rápidas en tandem
Genes con secuencias identicas de alrededor de 100 repeticiones de genes fundamentales en el desarrollo embrionario
ADN satélite
Secuencias repetidas con distribución estructural en los centromeros o asociadas a los telomeros. Constituyen áreas de heterocromatina
Cromatina
Complejo formado por el ADN asociado a proteínas histonicas y no histonicas para la condensación y compactación
Histonas, tipos y funciones
Las histonas participan en la condensación del ADN. Las histonas H4 y H3 forman un tetramero donde se enrolla la molécula de ADN, y luego interacciona con un tetramero formado por las histonas H2B y H2A formando un octamero. Interaccionan con los enlaces fosfodiester
Nucleosoma, impacto de endonucleasas y sales
Está formado por el nucleo octamerico, la secuencia de ADN asociado al octamero y el ADN espaciador entre dos núcleos. Se estabiliza por interacciones ionicas, uniones hidrofobicas e interacciones de histonas entre sí
Las endonucleasas degradan las secuencias espaciadoras, y sales pueden separar al núcleo del ADN asociado
Empaquetamiento de la cromatina, estructuras y función
Los extremos terminales de las histonas quedan libres en el nucleosoma y se proyectan al exterior para interaccionar entre nucleosomas. El ADN espaciador se compacta por histonas como las H1. Permite que los cromosomas se alberguen en el núcleo
Complejos remodeladores de cromatina
Requieren de hidrolisis de ATP, debilitan la interacción entre el octamero y la cadena de ADN. Descondensan la cromatina si se requiere la replicación
Herencia epigenetica
Son los cambios producidos en proteínas unidas al ADN, que son modificaciones químicas reversibles. Pueden no tener efecto en células hijas o inactivar un gen.
Modificaciones enzimaticas de histonas, lisina y serina
Las modificaciones principales en colas de histonas son la fosforilacion, la metilacion, la acetilacion y la ubiquitinacion, y son reversibles postraduccionales.
La acetilacion de una lisina baja la carga de interacción con nucleosomas, mientras que la metilacion hace que participe en diferentes funciones biológicas.
La fosforilacion de la serina le añade una carga negativa
Variantes de histonas, variantes de H3
Son sintetizadas en todo el ciclo, requieren complejos remodeladores de cromatina. Las variantes de H3 son H3.3 y CENP-A. Actúan como marcas de localización para em complejo proteico lector que interpreta el código de histonas
Aumento del grado de empaquetamiento, histona H3
La metilacion de la histona H3 hace que interaccione con el cromodominio y el cromoshadow de la proteína HP1, generandl la condensación hasta la secuencia que detiene la heterocromatizacion.
Herencia de modificaciones de histonas
Afecta al genoma. Se disocian las H2A y H2B, y el tetramero formado por H3 y H4 se asocia a la molécula para conservar el patrón de modificaciones
Secuencias SARS
Son las secuencias del ADN que interaccionan con el esqueleto proteico que sostiene al bucle. Sectorizan la transcripción.
Proteínas del mantenimiento estructural del cromosoma
Son proteínas que mantienen la asociación entre la fibra plegada y el armazón proteico. Son monomericas, no histonicas, forman candados dimericos. Incluyen a las cohesinas y las condensinas
Fases de empaquetamiento
Asociación del ADN al octamero-> interacción de colas de histonas-> interacción con el esqueleto proteico formando bucles-> condensación por condensinas.
Localización de la cromatina en el núcleo
Eucromatina-> se encuentra en la región central, de activa transcripción, con un nucleolo de ARN en el centro
Heterocromatina-> asociada a la lámina nuclear
La marcación con inositol determina la regionalización
