Microbiologie - Génétique bactérienne Flashcards
Les infections représentent quelle proportion (%) des décès mondiaux?
16%
Nommer 3 mécanismes de résistance aux antibiotiques.
- Altération de la perméabilité/séquestration
- Modification ou destruction de l’antibiotique
- Modification ou remplacement de la cible
Nommer quelques exemples de cibles des antibiotiques.
- Membrane
- Synthèse d’ATP
- Biosynthèse de l’acide folique
- Paroi
- Synthèse des protéines
- Polymérase à ARN
- Gyrases à ADN
Pourquoi les antibiotiques qui ciblent la paroi sont-ils souvent peu toxiques?
Car la paroi est unique aux bactéries (les cellules humaines n’en ont pas)
Vrai ou faux. Les plasmides codent pour des fonctions essentielles à la cellule.
Faux.
Quelle structure bactérienne permet l’empaquetage compact du matériel génétique?
Le nucléoïde
Nommer 3 facteurs qui donnent un avantage à la bactérie conférés par le pasmide.
- Résistance aux antibiotiques
- Capacité métabolique supplémentaire
- Facteur favorisant l’infection
Chez les bactéries, un gène de longueur moyenne occupe combien de paires de bases?
1000 environ
Quels sont les 3 types de gènes pouvant être retrouvés dans le chromosome bactérien?
- Résistance
- Virulence
- Essentiel
Vrai ou faux. En général, les bactéries ont un seul chromosome qui est circulaire.
Vrai
Qu’est-ce que le pangénome?
Ensemble des gènes qui peuvent se retrouver dans au moins une souche d’une espèce bactérienne
Qu’est-ce que le génome de base?
Gènes communs à toutes les souches d’une même espèce
Qu’est-ce que le génome accessoire?
Gènes retrouvés dans certaines souches mais absents chez d’autres souches
Compléter la phrase.
Génome de base + génome accessoire = …
Pangénome
Quel est le mode de division des bactéries?
La fission binaire
Vrai ou faux. Dans la fission binaire, il y a répartition égale des copies du chromosome entre les cellules filles.
Vrai
Vrai ou faux. Dans la fission binaire, il y a répartition égale des copies du plasmide entre les cellules filles.
Faux, pas toujours
Combien de temps prend en moyenne la production d’une génération bactérienne par fission binaire?
20 minutes
Quels sont les 3 types de régulation de l’expression des gènes?
- Changement dans la séquence d’ADN
- Changement dans le nombre de transcrits
- Changement dans la quantité de produit de gène actif
En gras = plus important chez les bactéries
Qu’est-ce qu’un répresseur?
Protéine inhibant la transcription d’un gène en se liant à une séquence spécifique de nucléotides
Qu’est-ce qu’un activateur?
Protéine qui stimule la transcription d’un gène
Compléter la phrase.
Le contrôle négatif s’effectue par un …
Répresseur
Compléter la phrase.
Le contrôle positif s’effectue par …
Un activateur
Compléter la phrase.
La régulation de l’expression des gènes est un processus actif qui exige que la cellule soit …
Dans un état métabolique actif
Qu’est-ce que la régulation simple?
Un promoteur pour contrôler un gène
Qu’est-ce que la régulation dans un opéron?
Un seul promoteur pour contrôler plusieurs gènes adjacents
Qu’est-ce que la régulation par un régulon?
Une seule protéine régulatrice pour contrôler plusieurs gènes situés à différents endroits dans le génome
Qu’est-ce que la régulation par un stimulon?
Le contrôle de plusieurs gènes non contigus par un même stimulus
Qu’est-ce qu’une mutation?
Modification de la séquence des nucléotides de l’ADN
Qu’est-ce qu’un mutation mauvais sens?
Qui créé une protéine défectueuse
Qu’est-ce qu’une mutation non sens?
Qui créé une protéine incomplète (codon stop prématuré)
Qu’est-ce qu’une mutation silencieuse?
Qui créé la même protéine que prévu (mais peut quand même avoir un impact sur le fonctionnement optimal de la cellule mutée)
Quels sont les 5 groupes distincts de systèmes de réparation de l’ADN bactérien?
- Réparation directe de l’ADN
- Réparation par excision
- Réparation par recombinaison
- Réponse SOS
- Réponse sujette à erreur
Que peut entraîner une concentration suboptimale des antibiotiques?
La sélection de mutants résistants
Vrai ou faux. L’action de certains antibiotiques peut activer les systèmes de réparation de l’ADN chez les bactéries.
Vrai
Ex: aminoglycosides, B-lactamines et quinolones à faible concentration
Quelles sont les 3 méthodes d’échange de gènes chez les bactéries?
- Transformation
- Conjugaison
- Transduction
Qu’est-ce que le mécanisme de transformation?
Capacité de la cellule d’être transformée (modifiée génétiquement) par de l’ADN externe libre.
Appelé compétence
Chez quelle bactérie particulière la compétence est naturelle?
Streptococcus pneumoniae (et autres espèces apparentées de streptocoques)
Comment fonctionne le mécanisme de compétence/transformation?
La bactérie entre en contact avec des fragments d’ADN provenant d’autres bactéries (mortes) et l’intègre à son génome
Comment les antibiotiques peuvent-ils favoriser la transformation?
- En imposant une pression sélective aux bactéries transformées par des gènes de résistance
- En agissant comme stimulus externe induisant ou augmentant la compétence
- En favorisant la lyse des cellules, libérant l’ADN servant à la transformation
Quel est le principal mécanisme d’échange horizontal de gènes entre les bactéries?
La conjugaison
Comment le plasmide conjugatif peut-il être transmis à une autre cellule?
Avec un pili conjugatif (sexuel)
Qu’est-ce que la mobilisation?
Transfert de plasmides non-conjugatifs via la machinerie de plasmides conjugatifs
Qu’est-ce qu’un bactériophage?
Virus qui parasitent uniquement les bactéries
Qu’est-ce que la transduction?
Transfert de gènes médié par les bactériophages
Qu’est-ce que la capside?
Enveloppe protéique des bactériophages qui renferme leur matériel génétique (ADN ou ARN de phage)
Quelles sont les formes que les bactériophages peuvent prendre selon les cycles de vie?
- Lytiques
- Lysogéniques
- Chroniques
Vrai ou faux. Le cycle lysogénique précède le cycle lytique.
Vrai
Qu’est-ce que la transduction spécialisée?
Lorsqu’il y a empaquetage accidentel, et qu’il y a création d’un génome hybride phage-bactérie
Qu’est-ce que la transduction généralisée?
Empaquetage accidentel uniquement de fragments de l’ADN de l’hôte
Quel phénomène est le plus fréquent: transduction spécialisée ou généralisée?
Généralisée
Qu’est-ce que la transposition?
Mouvement de segments d’ADN à l’intérieur d’une même cellule (donc nécessite une proximité physique)
Quelles sont les 3 classes de transposons?
- Séquences d’insertion
- Transposons complexes
- Phages transposables
Pourquoi les transposons complexes ont une importance médicale considérable?
Car ils peuvent encoder à l’intérieur de leur région centrale, des gènes de toxines ou de résistance aux antibiotiques
Que sont les intégrons?
Des éléments génétiques qui recrutent des gènes de résistance et les intègrent les uns à la suite des autres devant des promoteurs forts assurant l’expression de multiples gènes simultanément
Qu’est-ce que la pharmacoécologie?
Effet des interventions sur la composition et les fonctions du microbiome
Qu’est-ce que la pharmacomicrobiomique?
Effet des microbiomes sur la pharmacocinétique, pharmacodynamie, efficacité et toxicité des médicaments
Vrai ou faux. Les humains peuvent devenir résistants aux antibiotiques.
Faux, c’est la bactérie qui devient résistante et non l’humain
