Microbio: Module 1 - Capsule 3 (par: Elizabeth Romero)

Question 1

C’est quoi le postulat de Koch? Est-il encore admis de nos jours?

Answer 1

il stipule que, normalement, un organisme est responsable d’une maladie. Au départ c’était un grand progrès, mais aujourd’hui c’est un postulat qui a ses limites puisqu’on se rend compte que c’est pas forcément un microorganisme qui cause une maladie mais parfois c’est le dérrèglement de notre microbiote, de notre microflore (qui nous protège) qui va causer une maladie

Ces maladies sont pas forcément des infections, donc ces dérrégulations de notre microbiote vont avoir des impacts au niveau immunologique, métabolique, du système nerveux

Question 2

C’est quoi le Human microbiome project, mis sur place en 2007?

Answer 2

étude multinationale de 5 ans pour analyser la composition génétique du microbiome vivant chez un adulte sain

Il consistait à faire une collection dans le nez, bouche, peau , intestin, vagin de volontaires
sains adultes

Question 3

Lors du Human microbiome project (2007), qu’est-ce qui a été séquencé?

Answer 3

Séquençage de :

• la région du gène codant pour l’ARN ribosomal 16S
• du génome complet pour une partie des échantillons

Question 4

On s’est aperçus de quoi en faisant le Human microbiome project (2007)?

Answer 4

Beaucoup de variations dans la composition des espèces et des gènes des individus et en fonction des sites corporels

Question 5

La plupart des bactéries avec lesquelles nous vivons nous viennent de où, et on les retrouve donc où dans le corps humain?

Answer 5

La plupart des bactéries nous viennent de l’extérieur, donc elle sont retrouvées dans des lieux en contact avec le milieu exterieur (comme la peau et les muqueuses)

Question 6

Un humain adulte comporte combien de cellules humaines VS combien de bactéries?

Answer 6

• environ 30 trillions cellules humaines (3x10¹³)
• environ 38 trillions de bactéries

On est plus fait de bactéries que de cellules humaines (+ grande part de cellules procaryotes que de cellules eucaryotes dans notre corps)

Question 7

En plus des bactéries et des cellules humaines, que retrouve-t-on dans le corps humain, et qu’on est juste en train de découvrir. Pourquoi ces microorganismes sont importants?

Answer 7

Il y a également les bactériophages, qui ont un role important parce que ils régulent le microbiote

Question 8

La population bactérienne est
dépendante de quoi?

Answer 8

l’environnement

Question 9

L’humain a quel type de relation avec les bactéries?

Answer 9

relation symbiotique

Question 10

À part l’environnement, qu’est-ce qui va influencer le microbiote

Answer 10

Il y a une évolution avec l’âge, avc leshormones, qui est normale et aussi laprise d’antibiotiques, ainsi quecertaines conditions comme la malnutrition ou l’obésité changent drastiquement la composition de notre microbiote central

Question 11

Décrivez l’évolution de la population bactérienne de l’humain en fonction de l’âge (quelle bactérie domine à quel moment)

Answer 11

On voit qu’au départ on a beaucoup de protéobactérie et en vieillissant on en a très peu et on est principalement envahis de firmicutes

Question 12

V ou F: le stade foetal est le moment où l’humain a la plus grande densité de bactéries.

Answer 12

FAUX: dans le ventre de notre mère on est dans un monde essentiellement stérile

l’exposition au microorganismes va se produire lors de l’accouchement (1ere colonisation). En qq années on va être completement envahis d’un microbiote ou d’une flore normale sur la peau, les narines, les cavités orales, les intestins et le tractus urogénital

Question 13

V ou F: les individus n’ont rien en commun quant aux microbiote qui les compose.

Answer 13

FAUX: 95% des individus ont en commun un microbiome central pour chaque site spécifique, en particulier au niveau de la bouche et dans le nez, les intestins et sur la peau

Question 14

C’est quoi un microbiome central?

Answer 14

c’est la notion que les bactéries sont représentées par peu d’espèces, qui sont les + nombreuses

Question 15

C’est quoi un microbiome secondaire?

Answer 15

Un microbiome secondaire va etre constitué de beaucoup d’espèces qui vont être peu nombreuses et peu partagées entre les individus

Question 16

La microflore bactérienne de la peau comporte combien de bactéries différentes?

Answer 16

10¹⁰

Question 17

Les bactéries de la microflore bactérienne de la peau sont principalement aérobie ou anaérobie?

Answer 17

aérobies

Question 18

Quelle est l’espèce de bactérie la plus répandue sur la microflore bactérienne de la peau?

Answer 18

Staphylococcus epidermidis

Question 19

Quelle est la densité bactérienne sur la microflore de la peau?

Answer 19

plus de 1000 bactéries par cm² (cette densité est beaucoup plus forte aux endroits humides)

Question 20

Dans les zones humides de la peau (mentionnées précedemment) on retrouve quel type de bactérie?

Answer 20

Staphylococcus aureus

Question 21

C’est quoi Propionibacterium acnes (renommé Cutibacterium acnes)?

Answer 21

une bactérie anaérobie, pousse sous la peau au cours de la puberté, conduisant à l’acné.

Question 22

Les mauvaises odeurs associées à la transpiration sont associées à quelles bactéries?

Answer 22

des bactéries qui vont fermenter les sucres et donner une odeur spéciale

En particulier ce serait associé à une bactérie qui s’appelle staphylococcus ominis

Question 23

La microflore bactérienne du nez et de la bouche comportent combien de bactéries?

Answer 23

10¹⁰

Question 24

La microflore bactérienne du nez et de la bouche comportent quels types de bactéries principalement?

Answer 24

Principalement bactéries anaérobies ou anaérobies
facultatives, de plusieurs sortes

Question 25

que peut-on dire par rapport à la **concentration de bactéries** dans la _bouche_?

Answer 25

elle peut être **aussi importante que dans le gros intestin**

Question 26

Quelles sont les **bactéries **_an_**aérobies** les plus fréquemment trouvées dans la microflore de la _bouche_ et du _nez_?

Answer 26

sont des genres ***Peptostreptococcus***, ***Actinomyces***

Question 27

Quelles sont les **bactéries _aéro_bies** les plus fréquemment trouvées dans la microflore de la _bouche_ et du _nez_?

Answer 27

du genre ***Streptococcus***, ***Haemophilus***, ***Neisseria***

Question 28

V ou F: Ce sont principalement les espèces de bactéries **_an_****aérobies** de la microflore de la _bouche_ et du _nez_ qui sont **potentiellement pathogéniques**?

Answer 28

**FAUX**: Ce sont principalement les espèces **_aéro_bies** qui sont potentiellement pathogéniques, _dépendant de l’espèce_ précise _et_ aussi _de l’opportunité de pénétrer des régions normalement stériles_ du corps.

Question 29

_Jusqu'à l'apparition des dents_, quelle est l'espèce de bactéries **la plus courante** dans la bouche?

Answer 29

*Streptococcus salivarius*

Question 30

_Après l’apparition des dents_, quelle est l’espèce de bactérie la **plus courante** dans la bouche?

Answer 30

***Streptococcus mutans*** (sur les _dents_ seulement) et d’**autres streptocoques** (sur les _gencives_). (dans la bouche, en particulier au niveau des dents, on a plusieurs espèces de streptococcus qui vont s'occuper de former la plaque dentaire)

Question 31

Quelles sont les 3 types de bactéries qui composent la **microflore du vagin** _avant la puberté_?

Answer 31

- staphylocoques - streptocoques - entérobactéries

Question 32

_Après la puberté_, quelle est l'espèce que l'on retrouve principalement dans la **microflore bactérienne du vagin**?

Answer 32

* **Lactobacillus acidophilus vaginalis*** et autres * *lactobacilles** (collectivement: bacilles de Doderlein) Le milieu vaginal est colonisé par des lactobacilles à la puberté elles _se fixent aux cellules de l’épithélium vaginal_

Question 33

À quoi sert ***Lactobacillus acidophilus vaginalis***?

Answer 33

le _métabolisme du glycogène en acide lactique_ par cette bactérie est responsable du **_pH acide dans le vagin_**, ce qui en retour **empêche la prolifération d’autres micro-organismes**

Question 34

Qu'est-ce qu'il se passe s'il y a un **dérrèglement** de l'espèce *_Lactobacillus acidophilus vaginalis_*?

Answer 34

ça va causer une **vaginite** ou une **vaginose** (une sensation d'inconfort) et le débalancement du pH va permettre la colonisation par d'autres pathogènes comme: - Infection par *_Gardenerella vaginalis_* (une bactérie) - • Infection par *_Candida albicans_* (un mycète). _{Noter la présence sur la photo d’hyphes et de levures}

Question 35

Dans le système digestif, on a un très grand nombre de bactéries. Plus on va du **haut vers le bas**, plus on ________ la _densité bactérienne_

Answer 35

Dans le système digestif, on a un très grand nombre de bactéries. Plus on va du **_haut vers le bas_**, plus on **augmente** la _densité bactérienne_

Question 36

Au niveau de l'_estomac_, qu'est-ce qui **prévient la croissance des bactéries**

Answer 36

la barriere due au **pH**

Question 37

C'est à quel niveau du corps que l'on a la plus grande densité et diversité de bactéries? C'est où qu'on en a le moins?

Answer 37

- _**+** grande diversité et quantité_: **gros intestin** 10¹² bactéries par gramme et + de 1000 espèces - _**-** grande diversité et quantité_: **vagin**

Question 38

Quel genre de bactéries on retrouve dans le **gros intestin**?

Answer 38

**_an_**aerobie Gram- et Gram+

Question 39

On **élimine** combien de bactéries _par jour_?

Answer 39

**10³** / jour

Question 40

Quels sont les **3 effets bénéfiques** de la _microflore bactérienne_?

Answer 40

- **Empêche la colonisation par des agents pathogènes** - Aide à la **digestion** de la nourriture - Produit certaines **vitamines**

Question 41

Comment les bactéries de la **peau** remplissent le rôle de la microflore d'_e__mpêcher la colonisation par des agents pathogènes_?

Answer 41

Certaines bactéries de la peau (*_Corynebacterium_*) peuvent **produire des composés** (**acides gras**) qui empêchent la colonisation par d’autres bactéries (empêche l'adhérence)

Question 42

Comment les bactéries de l'**intestin** remplissent le rôle de la microflore d'_empêcher la colonisation par des agents pathogènes_?

Answer 42

- des bactéries de l’intestin _produisent_ des **agents anti-bactériens**, et des **déchets métabolites** qui empêchent la colonisation par d’autres bactéries - dans l’intestin, le _nombre_ de bactéries est _si élevé que les niches_ écologiques sont déjà _occupées_ = **compétition**

Question 43

Donnez un exemple de comment les bactéries remplissent le rôle de la microflore d'**aider à la digestion de la nourriture**

Answer 43

les bactéries du _système digestif_ **brisent les fibres alimentaires** en des composés plus petits

Question 44

Donnez 4 exemples de **vitamines** produites par les bactéries.

Answer 44

- vitamine K - B12 - riboflavine - thiamine

Question 45

En plus des 3 rôles mentionnés précédemment (empêche la colonisation par des agents pathogènes, aide à la digestion de la nourriture, produit certaines vitamines), on sait maintenant que la microflore bactérienne fait quoi en plus?

Answer 45

_communique avec_ notre **système immunitaire** et notre **système nerveux**

Question 46

Donnez un exemple illustrant le concept **d’association transitoire** _de certaines bactéries avec le système digestif humain_.

Answer 46

_*Clostridium tetani* est isolé dans environ 25% des déchets fécaux humains_. Les endospores sont probablement absorbées avec l’eau et la nourriture, mais les **bactéries** en résultant **ne colonisent _pas_ le système digestif de façon efficace** grâce à notre microflore

Question 47

Certains _changements dans la flore intestinale_ ont été associés à des **maladies** comme quoi?

Answer 47

**diabète de type 2** ou l’**obésité**

Question 48

Comment a-t-on découvert que certains changements dans la flore intestinale sont associés à des maladies comme le diabète de type 2 ou l’obésité?

Answer 48

On a fait une expérience de le **transfert de flore intestinale de souris obèses**: ça a suffit pour _induire l'obésité sans changer le mode de nutrition_

Question 49

le transfert de flore intestinale de souris obèses a mené à quel progrès?

Answer 49

**Les transplantations microbiotiques fécales** (**transferts de flore intestinale**) sont maintenant approuvés dans plusieurs pays **pour traiter certaines infections** comme la *_C. Difficile_*, une infection nosocomiale provoquant des diarrhées et colites sévères pouvant être fatales; ces infections sont souvent **contractées suite à des traitements antibiotiques qui détruisent la flore normale**.

Question 50

V ou F: Le traitement à la **vancomycine** est le **traitement le + efficace** pour traiter le ***C. difficile***

Answer 50

**FAUX**: Les **transplantations microbiotiques fécales** ont été démontrées comme étant **plus efficace** que le traitement antibiotique habituel à la vancomycine.

Question 51

Comment se font les transplantations microbiotiques fécales

Answer 51

peuvent se faire par **infusion d’une préparation microbiotique**, administrée par**lavement**(*enema*), en utilisant un**colonoscope**, ou une**sonde gastrique** (*nasogastric tube*)

Question 52

V ou F: il y a des **restrictions génétiques génétiques très strictes** quant aux _donneurs_ pour des **transplantations microbiotiques fécales**.

Answer 52

**FAUX** : **N’importe quelle personne saine peut être un donneur** adéquat (pas de restriction génétique)

Question 53

Donnez 2 exemples de **maladies** qui peuvent également être **traitées** par les _transplantations microbiotiques fécales_.

Answer 53

- syndrome du **colon irritable** (maladie de Crohn) - **colite ulcéreuse**

Question 54

Quelle est la différence de traitement par transplantation microbiotique fécale entre le *C. difficile* et maladie de Crohn ou la colite ulcéreuse?

Answer 54

Il semble qu’**une seule infusion** soit nécessaire pour traiter *_C Difficile_*, mais de **multiples infusions** sont requises pour la _maladie de Crohn_ ou la _colite ulcéreuse_.

Question 55

Quels sont les **e****ffets de la prise d’antibiotiques** sur la _microflore_?

Answer 55

- les membranes intestinales perdent leur colonisation bactérie positive donc ça **libère de l'espace pour les bactéries potentiellement pathogènes** - **impact sur la communication avec le système immunitaire** (_lorsqu'on arrête de prendre des AB_, on va avoir une _flore normale_ qui _va revenir toute seule_ sans avoir besoin de prendre de probiotiques)

Question 56

Les _capsules probiotiques BioK+_ sont **composées de quoi**?

Answer 56

d’une _quantité importante_ de ***Lactobacillus acidophilus*** et ***Lactobacillus casei***

Question 57

Qu'est ce qui est **surprenant** concernant la prise de _capsules probiotiques_ après administration d'antibiotiques?

Answer 57

_Normalement_, toutes les _bactéries_ quon va _ingérer_ par notre bouche devraient _passer par notre estomac et être détruites_ **Mais** les études semblent démontrer que les **probiotiques ça fonctionne** quand on les mprends en même temps que les antibios: comme on voit sur la photo, ça va _diminuer les symptômes de diarrhée_ et donc c'est maintenant recommandé à l'hôpital avec la prise d'antibiotiques et c'est surtout très efficace pour prévenir les diarrhées associées à *C difficile*

Question 58

Quelle est la **conclusion** des études quant à la _prise de probiotiques pour traiter les diarrhées après_ administration d’_antibiotiques_?

Answer 58

- il y a une **grande variabilité entre les études**. Cause: _composition du probiotique?_ - Également **à l’intérieur de chaque étude**. Cause: _différences individuelles dans la flore bactérienne_? Faudrait-il adapter le traitement à chaque patient? (mais les études semblent qd même démontrer que les probiotiques ont un effet)

Question 59

Quelle est la **nouvelle théorie quant à la variabilité** des _études sur la prise de probiotiques_ pour traiter les diarrhées après administration d’antibiotiques?

Answer 59

Ce serait causé par les **bactériophages**. Ce serait pas tellement les bactéries qu'on nous donne, mais les bactériophages qui _survivaient au pH de l'intestin_ et qui viendraient cibler spécifiquement certaines bactéries de notre intestin en les tuant et favoriserait ainsi la poppulation de nouveau par des bactéries positives