Microbio: Module 1 - Capsule 3 (par: Elizabeth Romero)

Question 1

C’est quoi le postulat de Koch? Est-il encore admis de nos jours?

Answer 1

il stipule que, normalement, un organisme est responsable d’une maladie. Au départ c’était un grand progrès, mais aujourd’hui c’est un postulat qui a ses limites puisqu’on se rend compte que c’est pas forcément un microorganisme qui cause une maladie mais parfois c’est le dérrèglement de notre microbiote, de notre microflore (qui nous protège) qui va causer une maladie

Ces maladies sont pas forcément des infections, donc ces dérrégulations de notre microbiote vont avoir des impacts au niveau immunologique, métabolique, du système nerveux

Question 2

C’est quoi le Human microbiome project, mis sur place en 2007?

Answer 2

étude multinationale de 5 ans pour analyser la composition génétique du microbiome vivant chez un adulte sain

Il consistait à faire une collection dans le nez, bouche, peau , intestin, vagin de volontaires
sains adultes

Question 3

Lors du Human microbiome project (2007), qu’est-ce qui a été séquencé?

Answer 3

Séquençage de :

• la région du gène codant pour l’ARN ribosomal 16S
• du génome complet pour une partie des échantillons

Question 4

On s’est aperçus de quoi en faisant le Human microbiome project (2007)?

Answer 4

Beaucoup de variations dans la composition des espèces et des gènes des individus et en fonction des sites corporels

Question 5

La plupart des bactéries avec lesquelles nous vivons nous viennent de où, et on les retrouve donc où dans le corps humain?

Answer 5

La plupart des bactéries nous viennent de l’extérieur, donc elle sont retrouvées dans des lieux en contact avec le milieu exterieur (comme la peau et les muqueuses)

Question 6

Un humain adulte comporte combien de cellules humaines VS combien de bactéries?

Answer 6

• environ 30 trillions cellules humaines (3x10¹³)
• environ 38 trillions de bactéries

On est plus fait de bactéries que de cellules humaines (+ grande part de cellules procaryotes que de cellules eucaryotes dans notre corps)

Question 7

En plus des bactéries et des cellules humaines, que retrouve-t-on dans le corps humain, et qu’on est juste en train de découvrir. Pourquoi ces microorganismes sont importants?

Answer 7

Il y a également les bactériophages, qui ont un role important parce que ils régulent le microbiote

Question 8

La population bactérienne est
dépendante de quoi?

Answer 8

l’environnement

Question 9

L’humain a quel type de relation avec les bactéries?

Answer 9

relation symbiotique

Question 10

À part l’environnement, qu’est-ce qui va influencer le microbiote

Answer 10

Il y a une évolution avec l’âge, avc leshormones, qui est normale et aussi laprise d’antibiotiques, ainsi quecertaines conditions comme la malnutrition ou l’obésité changent drastiquement la composition de notre microbiote central

Question 11

Décrivez l’évolution de la population bactérienne de l’humain en fonction de l’âge (quelle bactérie domine à quel moment)

Answer 11

On voit qu’au départ on a beaucoup de protéobactérie et en vieillissant on en a très peu et on est principalement envahis de firmicutes

Question 12

V ou F: le stade foetal est le moment où l’humain a la plus grande densité de bactéries.

Answer 12

FAUX: dans le ventre de notre mère on est dans un monde essentiellement stérile

l’exposition au microorganismes va se produire lors de l’accouchement (1ere colonisation). En qq années on va être completement envahis d’un microbiote ou d’une flore normale sur la peau, les narines, les cavités orales, les intestins et le tractus urogénital

Question 13

V ou F: les individus n’ont rien en commun quant aux microbiote qui les compose.

Answer 13

FAUX: 95% des individus ont en commun un microbiome central pour chaque site spécifique, en particulier au niveau de la bouche et dans le nez, les intestins et sur la peau

Question 14

C’est quoi un microbiome central?

Answer 14

c’est la notion que les bactéries sont représentées par peu d’espèces, qui sont les + nombreuses

Question 15

C’est quoi un microbiome secondaire?

Answer 15

Un microbiome secondaire va etre constitué de beaucoup d’espèces qui vont être peu nombreuses et peu partagées entre les individus

Question 16

La microflore bactérienne de la peau comporte combien de bactéries différentes?

Answer 16

10¹⁰

Question 17

Les bactéries de la microflore bactérienne de la peau sont principalement aérobie ou anaérobie?

Answer 17

aérobies

Question 18

Quelle est l’espèce de bactérie la plus répandue sur la microflore bactérienne de la peau?

Answer 18

Staphylococcus epidermidis

Question 19

Quelle est la densité bactérienne sur la microflore de la peau?

Answer 19

plus de 1000 bactéries par cm² (cette densité est beaucoup plus forte aux endroits humides)

Question 20

Dans les zones humides de la peau (mentionnées précedemment) on retrouve quel type de bactérie?

Answer 20

Staphylococcus aureus

Question 21

C’est quoi Propionibacterium acnes (renommé Cutibacterium acnes)?

Answer 21

une bactérie anaérobie, pousse sous la peau au cours de la puberté, conduisant à l’acné.

Question 22

Les mauvaises odeurs associées à la transpiration sont associées à quelles bactéries?

Answer 22

des bactéries qui vont fermenter les sucres et donner une odeur spéciale

En particulier ce serait associé à une bactérie qui s’appelle staphylococcus ominis

Question 23

La microflore bactérienne du nez et de la bouche comportent combien de bactéries?

Answer 23

10¹⁰

Question 24

La microflore bactérienne du nez et de la bouche comportent quels types de bactéries principalement?

Answer 24

Principalement bactéries anaérobies ou anaérobies
facultatives, de plusieurs sortes

Question 25

que peut-on dire par rapport à la concentration de
bactéries dans la bouche?

Answer 25

elle peut être aussi importante que
dans le gros intestin

Question 26

Quelles sont les bactéries anaérobies les plus fréquemment trouvées dans la microflore de la bouche et du nez?

Answer 26

sont des genres Peptostreptococcus, Actinomyces

Question 27

Quelles sont les bactéries _aéro_bies les plus fréquemment trouvées dans la microflore de la bouche et du nez?

Answer 27

du genre Streptococcus, Haemophilus, Neisseria

Question 28

V ou F: Ce sont principalement les espèces de bactéries anaérobies de la microflore de la bouche et du nez qui sont potentiellement pathogéniques?

Answer 28

FAUX: Ce sont principalement les espèces _aéro_bies qui sont potentiellement pathogéniques, dépendant de l’espèce précise et aussi de l’opportunité de pénétrer des régions normalement stériles du corps.

Question 29

Jusqu’à l’apparition des dents, quelle est l’espèce de bactéries la plus courante dans la bouche?

Answer 29

Streptococcus salivarius

Question 30

Après l’apparition des dents, quelle est l’espèce de bactérie la plus courante dans la bouche?

Answer 30

Streptococcus mutans (sur les dents seulement) et d’autres streptocoques (sur les gencives).

(dans la bouche, en particulier au niveau des dents, on a plusieurs espèces de streptococcus qui vont s’occuper de former la plaque dentaire)

Question 31

Quelles sont les 3 types de bactéries qui composent la microflore du vagin avant la puberté?

Answer 31

• staphylocoques
• streptocoques
• entérobactéries

Question 32

Après la puberté, quelle est l’espèce que l’on retrouve principalement dans la microflore bactérienne du vagin?

Answer 32

• Lactobacillus acidophilus vaginalis* et autres
• *lactobacilles** (collectivement: bacilles de Doderlein)

Le milieu vaginal est colonisé par
des lactobacilles à la puberté elles se fixent aux cellules de l’épithélium vaginal

Question 33

À quoi sert Lactobacillus acidophilus vaginalis?

Answer 33

le métabolisme du glycogène en acide lactique par cette bactérie est responsable du pH acide dans le vagin, ce qui en retour empêche la prolifération d’autres micro-organismes

Question 34

Qu’est-ce qu’il se passe s’il y a un dérrèglement de l’espèce Lactobacillus acidophilus vaginalis?

Answer 34

ça va causer une vaginite ou une vaginose (une sensation d’inconfort) et le débalancement du pH va permettre la colonisation par d’autres pathogènes comme:

• Infection par Gardenerella vaginalis (une bactérie)
• • Infection par Candida albicans (un mycète). _{Noter la présence sur la photo d’hyphes et de levures}

Question 35

Dans le système digestif, on a un très grand nombre de bactéries. Plus on va du haut vers le bas, plus on ________ la densité bactérienne

Answer 35

Dans le système digestif, on a un très grand nombre de bactéries. Plus on va du haut vers le bas, plus on augmente la densité bactérienne

Question 36

Au niveau de l’estomac, qu’est-ce qui prévient la croissance des bactéries

Answer 36

la barriere due au pH

Question 37

C’est à quel niveau du corps que l’on a la plus grande densité et diversité de bactéries? C’est où qu’on en a le moins?

Answer 37

• + grande diversité et quantité: gros intestin 10¹² bactéries par gramme et + de 1000 espèces
• - grande diversité et quantité: vagin

Question 38

Quel genre de bactéries on retrouve dans le gros intestin?

Answer 38

anaerobie Gram- et Gram+

Question 39

On élimine combien de bactéries par jour?

Answer 39

10³ / jour

Question 40

Quels sont les 3 effets bénéfiques de la microflore bactérienne?

Answer 40

• Empêche la colonisation par des agents pathogènes
• Aide à la digestion de la nourriture
• Produit certaines vitamines

Question 41

Comment les bactéries de la peau remplissent le rôle de la microflore d’e__mpêcher la colonisation par des agents pathogènes?

Answer 41

Certaines bactéries de la peau (Corynebacterium) peuvent produire des composés (acides gras) qui empêchent la colonisation par d’autres bactéries (empêche l’adhérence)

Question 42

Comment les bactéries de l’intestin remplissent le rôle de la microflore d’empêcher la colonisation par des agents pathogènes?

Answer 42

• des bactéries de l’intestin produisent des agents anti-bactériens, et des déchets métabolites qui empêchent la colonisation par d’autres bactéries
• dans l’intestin, le nombre de bactéries est si élevé que les niches écologiques sont déjà occupées = compétition

Question 43

Donnez un exemple de comment les bactéries remplissent le rôle de la microflore d’aider à la digestion de la nourriture

Answer 43

les bactéries du système digestif brisent les fibres alimentaires en des composés plus petits

Question 44

Donnez 4 exemples de vitamines produites par les bactéries.

Answer 44

• vitamine K
• B12
• riboflavine
• thiamine

Question 45

En plus des 3 rôles mentionnés précédemment (empêche la colonisation par des agents pathogènes, aide à la digestion de la nourriture, produit certaines vitamines), on sait maintenant que la microflore bactérienne fait quoi en plus?

Answer 45

communique avec notre système immunitaire et notre système nerveux

Question 46

Donnez un exemple illustrant le concept d’association transitoire de certaines bactéries avec le système digestif humain.

Answer 46

Clostridium tetani est isolé dans environ 25% des déchets fécaux humains. Les endospores sont
probablement absorbées avec l’eau et la nourriture, mais les bactéries en résultant ne colonisent pas le système digestif de façon efficace grâce à notre microflore

Question 47

Certains changements dans la flore intestinale ont été associés à des maladies comme quoi?

Answer 47

diabète de type 2 ou l’obésité

Question 48

Comment a-t-on découvert que certains changements dans la flore intestinale sont associés à des maladies comme le diabète de type 2 ou l’obésité?

Answer 48

On a fait une expérience de le transfert de flore
intestinale de souris obèses: ça a suffit pour induire l’obésité sans changer le mode de nutrition

Question 49

le transfert de flore intestinale de souris obèses a mené à quel progrès?

Answer 49

Les transplantations microbiotiques fécales (transferts de flore intestinale) sont maintenant approuvés dans plusieurs pays pour traiter certaines infections comme la C. Difficile, une infection nosocomiale provoquant des diarrhées et colites sévères pouvant être fatales; ces infections sont souvent contractées suite à des traitements antibiotiques qui détruisent la flore normale.

Question 50

V ou F: Le traitement à la vancomycine est le traitement le + efficace pour traiter le C. difficile

Answer 50

FAUX: Les transplantations microbiotiques fécales ont été démontrées comme étant plus efficace que le traitement antibiotique habituel à la vancomycine.

Question 51

Comment se font les transplantations microbiotiques fécales

Answer 51

peuvent se faire par infusion d’une préparation
microbiotique, administrée parlavement(enema), en utilisant uncolonoscope, ou unesonde gastrique (nasogastric tube)

Question 52

V ou F: il y a des restrictions génétiques génétiques très strictes quant aux donneurs pour des transplantations microbiotiques fécales.

Answer 52

FAUX : N’importe quelle
personne saine peut être un donneur adéquat (pas de restriction génétique)

Question 53

Donnez 2 exemples de maladies qui peuvent également être traitées par les transplantations microbiotiques fécales.

Answer 53

• syndrome du colon irritable (maladie de Crohn)
• colite ulcéreuse

Question 54

Quelle est la différence de traitement par transplantation microbiotique fécale entre le C. difficile et maladie de Crohn ou la colite ulcéreuse?

Answer 54

Il semble qu’une seule infusion soit nécessaire pour traiter C Difficile, mais de multiples infusions sont requises pour la maladie de Crohn ou la colite
ulcéreuse.

Question 55

Quels sont les effets de la prise d’antibiotiques sur la microflore?

Answer 55

• les membranes intestinales perdent leur colonisation bactérie positive donc ça libère de l’espace pour les bactéries potentiellement pathogènes
• impact sur la communication avec le système immunitaire

(lorsqu’on arrête de prendre des AB, on va avoir une flore normale qui va revenir toute seule sans avoir besoin de prendre de probiotiques)

Question 56

Les capsules probiotiques BioK+ sont composées de quoi?

Answer 56

d’une quantité importante de Lactobacillus acidophilus et Lactobacillus casei

Question 57

Qu’est ce qui est surprenant concernant la prise de capsules probiotiques après administration d’antibiotiques?

Answer 57

Normalement, toutes les bactéries quon va ingérer par notre bouche devraient passer par notre estomac et être détruites

Mais les études semblent démontrer que les probiotiques ça fonctionne quand on les mprends en même temps que les antibios: comme on voit sur la photo, ça va diminuer les symptômes de diarrhée et donc c’est maintenant recommandé à l’hôpital avec la prise d’antibiotiques et c’est surtout très efficace pour prévenir les diarrhées associées à C difficile

Question 58

Quelle est la conclusion des études quant à la prise de probiotiques pour traiter les diarrhées après administration d’antibiotiques?

Answer 58

• il y a une grande variabilité entre les études. Cause: composition du probiotique?
• Également à l’intérieur de chaque étude. Cause: différences individuelles dans la
  flore bactérienne?

Faudrait-il adapter le traitement à chaque patient?

(mais les études semblent qd même démontrer que les probiotiques ont un effet)

Question 59

Quelle est la nouvelle théorie quant à la variabilité des études sur la prise de probiotiques pour traiter les diarrhées après administration d’antibiotiques?

Answer 59

Ce serait causé par les bactériophages.

Ce serait pas tellement les bactéries qu’on nous donne, mais les bactériophages qui survivaient au pH de l’intestin et qui viendraient cibler spécifiquement certaines bactéries de notre intestin en les tuant et favoriserait ainsi la poppulation de nouveau par des bactéries positives