Microbio: Module 1 - Capsule 3 (par: Elizabeth Romero) Flashcards
C’est quoi le postulat de Koch? Est-il encore admis de nos jours?
il stipule que, normalement, un organisme est responsable d’une maladie. Au départ c’était un grand progrès, mais aujourd’hui c’est un postulat qui a ses limites puisqu’on se rend compte que c’est pas forcément un microorganisme qui cause une maladie mais parfois c’est le dérrèglement de notre microbiote, de notre microflore (qui nous protège) qui va causer une maladie
Ces maladies sont pas forcément des infections, donc ces dérrégulations de notre microbiote vont avoir des impacts au niveau immunologique, métabolique, du système nerveux
C’est quoi le Human microbiome project, mis sur place en 2007?
étude multinationale de 5 ans pour analyser la composition génétique du microbiome vivant chez un adulte sain
Il consistait à faire une collection dans le nez, bouche, peau , intestin, vagin de volontaires
sains adultes
Lors du Human microbiome project (2007), qu’est-ce qui a été séquencé?
Séquençage de :
- la région du gène codant pour l’ARN ribosomal 16S
- du génome complet pour une partie des échantillons
On s’est aperçus de quoi en faisant le Human microbiome project (2007)?
Beaucoup de variations dans la composition des espèces et des gènes des individus et en fonction des sites corporels
La plupart des bactéries avec lesquelles nous vivons nous viennent de où, et on les retrouve donc où dans le corps humain?
La plupart des bactéries nous viennent de l’extérieur, donc elle sont retrouvées dans des lieux en contact avec le milieu exterieur (comme la peau et les muqueuses)
Un humain adulte comporte combien de cellules humaines VS combien de bactéries?
- environ 30 trillions cellules humaines (3x1013)
- environ 38 trillions de bactéries
On est plus fait de bactéries que de cellules humaines (+ grande part de cellules procaryotes que de cellules eucaryotes dans notre corps)
En plus des bactéries et des cellules humaines, que retrouve-t-on dans le corps humain, et qu’on est juste en train de découvrir. Pourquoi ces microorganismes sont importants?
Il y a également les bactériophages, qui ont un role important parce que ils régulent le microbiote
La population bactérienne est
dépendante de quoi?
l’environnement
L’humain a quel type de relation avec les bactéries?
relation symbiotique
À part l’environnement, qu’est-ce qui va influencer le microbiote
Il y a une évolution avec l’âge, avc leshormones, qui est normale et aussi laprise d’antibiotiques, ainsi quecertaines conditions comme la malnutrition ou l’obésité changent drastiquement la composition de notre microbiote central

Décrivez l’évolution de la population bactérienne de l’humain en fonction de l’âge (quelle bactérie domine à quel moment)
On voit qu’au départ on a beaucoup de protéobactérie et en vieillissant on en a très peu et on est principalement envahis de firmicutes

V ou F: le stade foetal est le moment où l’humain a la plus grande densité de bactéries.
FAUX: dans le ventre de notre mère on est dans un monde essentiellement stérile
l’exposition au microorganismes va se produire lors de l’accouchement (1ere colonisation). En qq années on va être completement envahis d’un microbiote ou d’une flore normale sur la peau, les narines, les cavités orales, les intestins et le tractus urogénital

V ou F: les individus n’ont rien en commun quant aux microbiote qui les compose.
FAUX: 95% des individus ont en commun un microbiome central pour chaque site spécifique, en particulier au niveau de la bouche et dans le nez, les intestins et sur la peau
C’est quoi un microbiome central?
c’est la notion que les bactéries sont représentées par peu d’espèces, qui sont les + nombreuses
C’est quoi un microbiome secondaire?
Un microbiome secondaire va etre constitué de beaucoup d’espèces qui vont être peu nombreuses et peu partagées entre les individus
La microflore bactérienne de la peau comporte combien de bactéries différentes?
1010
Les bactéries de la microflore bactérienne de la peau sont principalement aérobie ou anaérobie?
aérobies
Quelle est l’espèce de bactérie la plus répandue sur la microflore bactérienne de la peau?
Staphylococcus epidermidis
Quelle est la densité bactérienne sur la microflore de la peau?
plus de 1000 bactéries par cm2 (cette densité est beaucoup plus forte aux endroits humides)
Dans les zones humides de la peau (mentionnées précedemment) on retrouve quel type de bactérie?
Staphylococcus aureus
C’est quoi Propionibacterium acnes (renommé Cutibacterium acnes)?
une bactérie anaérobie, pousse sous la peau au cours de la puberté, conduisant à l’acné.

Les mauvaises odeurs associées à la transpiration sont associées à quelles bactéries?
des bactéries qui vont fermenter les sucres et donner une odeur spéciale
En particulier ce serait associé à une bactérie qui s’appelle staphylococcus ominis
La microflore bactérienne du nez et de la bouche comportent combien de bactéries?
1010
La microflore bactérienne du nez et de la bouche comportent quels types de bactéries principalement?
Principalement bactéries anaérobies ou anaérobies
facultatives, de plusieurs sortes
que peut-on dire par rapport à la concentration de
bactéries dans la bouche?
elle peut être aussi importante que
dans le gros intestin
Quelles sont les bactéries anaérobies les plus fréquemment trouvées dans la microflore de la bouche et du nez?
sont des genres Peptostreptococcus, Actinomyces
Quelles sont les bactéries _aéro_bies les plus fréquemment trouvées dans la microflore de la bouche et du nez?
du genre Streptococcus, Haemophilus, Neisseria
V ou F: Ce sont principalement les espèces de bactéries anaérobies de la microflore de la bouche et du nez qui sont potentiellement pathogéniques?
FAUX: Ce sont principalement les espèces _aéro_bies qui sont potentiellement pathogéniques, dépendant de l’espèce précise et aussi de l’opportunité de pénétrer des régions normalement stériles du corps.
Jusqu’à l’apparition des dents, quelle est l’espèce de bactéries la plus courante dans la bouche?
Streptococcus salivarius
Après l’apparition des dents, quelle est l’espèce de bactérie la plus courante dans la bouche?
Streptococcus mutans (sur les dents seulement) et d’autres streptocoques (sur les gencives).
(dans la bouche, en particulier au niveau des dents, on a plusieurs espèces de streptococcus qui vont s’occuper de former la plaque dentaire)

Quelles sont les 3 types de bactéries qui composent la microflore du vagin avant la puberté?
- staphylocoques
- streptocoques
- entérobactéries
Après la puberté, quelle est l’espèce que l’on retrouve principalement dans la microflore bactérienne du vagin?
- Lactobacillus acidophilus vaginalis* et autres
- *lactobacilles** (collectivement: bacilles de Doderlein)
Le milieu vaginal est colonisé par
des lactobacilles à la puberté elles se fixent aux cellules de l’épithélium vaginal

À quoi sert Lactobacillus acidophilus vaginalis?
le métabolisme du glycogène en acide lactique par cette bactérie est responsable du pH acide dans le vagin, ce qui en retour empêche la prolifération d’autres micro-organismes
Qu’est-ce qu’il se passe s’il y a un dérrèglement de l’espèce Lactobacillus acidophilus vaginalis?
ça va causer une vaginite ou une vaginose (une sensation d’inconfort) et le débalancement du pH va permettre la colonisation par d’autres pathogènes comme:
- Infection par Gardenerella vaginalis (une bactérie)
- • Infection par Candida albicans (un mycète). Noter la présence sur la photo d’hyphes et de levures

Dans le système digestif, on a un très grand nombre de bactéries. Plus on va du haut vers le bas, plus on ________ la densité bactérienne
Dans le système digestif, on a un très grand nombre de bactéries. Plus on va du haut vers le bas, plus on augmente la densité bactérienne

Au niveau de l’estomac, qu’est-ce qui prévient la croissance des bactéries
la barriere due au pH

C’est à quel niveau du corps que l’on a la plus grande densité et diversité de bactéries? C’est où qu’on en a le moins?
- + grande diversité et quantité: gros intestin 1012 bactéries par gramme et + de 1000 espèces
- - grande diversité et quantité: vagin

Quel genre de bactéries on retrouve dans le gros intestin?
anaerobie Gram- et Gram+
On élimine combien de bactéries par jour?
103 / jour
Quels sont les 3 effets bénéfiques de la microflore bactérienne?
- Empêche la colonisation par des agents pathogènes
- Aide à la digestion de la nourriture
- Produit certaines vitamines
Comment les bactéries de la peau remplissent le rôle de la microflore d’e__mpêcher la colonisation par des agents pathogènes?
Certaines bactéries de la peau (Corynebacterium) peuvent produire des composés (acides gras) qui empêchent la colonisation par d’autres bactéries (empêche l’adhérence)
Comment les bactéries de l’intestin remplissent le rôle de la microflore d’empêcher la colonisation par des agents pathogènes?
- des bactéries de l’intestin produisent des agents anti-bactériens, et des déchets métabolites qui empêchent la colonisation par d’autres bactéries
- dans l’intestin, le nombre de bactéries est si élevé que les niches écologiques sont déjà occupées = compétition
Donnez un exemple de comment les bactéries remplissent le rôle de la microflore d’aider à la digestion de la nourriture
les bactéries du système digestif brisent les fibres alimentaires en des composés plus petits
Donnez 4 exemples de vitamines produites par les bactéries.
- vitamine K
- B12
- riboflavine
- thiamine
En plus des 3 rôles mentionnés précédemment (empêche la colonisation par des agents pathogènes, aide à la digestion de la nourriture, produit certaines vitamines), on sait maintenant que la microflore bactérienne fait quoi en plus?
communique avec notre système immunitaire et notre système nerveux
Donnez un exemple illustrant le concept d’association transitoire de certaines bactéries avec le système digestif humain.
Clostridium tetani est isolé dans environ 25% des déchets fécaux humains. Les endospores sont
probablement absorbées avec l’eau et la nourriture, mais les bactéries en résultant ne colonisent pas le système digestif de façon efficace grâce à notre microflore
Certains changements dans la flore intestinale ont été associés à des maladies comme quoi?
diabète de type 2 ou l’obésité
Comment a-t-on découvert que certains changements dans la flore intestinale sont associés à des maladies comme le diabète de type 2 ou l’obésité?
On a fait une expérience de le transfert de flore
intestinale de souris obèses: ça a suffit pour induire l’obésité sans changer le mode de nutrition
le transfert de flore intestinale de souris obèses a mené à quel progrès?
Les transplantations microbiotiques fécales (transferts de flore intestinale) sont maintenant approuvés dans plusieurs pays pour traiter certaines infections comme la C. Difficile, une infection nosocomiale provoquant des diarrhées et colites sévères pouvant être fatales; ces infections sont souvent contractées suite à des traitements antibiotiques qui détruisent la flore normale.
V ou F: Le traitement à la vancomycine est le traitement le + efficace pour traiter le C. difficile
FAUX: Les transplantations microbiotiques fécales ont été démontrées comme étant plus efficace que le traitement antibiotique habituel à la vancomycine.
Comment se font les transplantations microbiotiques fécales
peuvent se faire par infusion d’une préparation
microbiotique, administrée parlavement(enema), en utilisant uncolonoscope, ou unesonde gastrique (nasogastric tube)
V ou F: il y a des restrictions génétiques génétiques très strictes quant aux donneurs pour des transplantations microbiotiques fécales.
FAUX : N’importe quelle
personne saine peut être un donneur adéquat (pas de restriction génétique)
Donnez 2 exemples de maladies qui peuvent également être traitées par les transplantations microbiotiques fécales.
- syndrome du colon irritable (maladie de Crohn)
- colite ulcéreuse
Quelle est la différence de traitement par transplantation microbiotique fécale entre le C. difficile et maladie de Crohn ou la colite ulcéreuse?
Il semble qu’une seule infusion soit nécessaire pour traiter C Difficile, mais de multiples infusions sont requises pour la maladie de Crohn ou la colite
ulcéreuse.
Quels sont les effets de la prise d’antibiotiques sur la microflore?
- les membranes intestinales perdent leur colonisation bactérie positive donc ça libère de l’espace pour les bactéries potentiellement pathogènes
- impact sur la communication avec le système immunitaire
(lorsqu’on arrête de prendre des AB, on va avoir une flore normale qui va revenir toute seule sans avoir besoin de prendre de probiotiques)

Les capsules probiotiques BioK+ sont composées de quoi?
d’une quantité importante de Lactobacillus acidophilus et Lactobacillus casei
Qu’est ce qui est surprenant concernant la prise de capsules probiotiques après administration d’antibiotiques?
Normalement, toutes les bactéries quon va ingérer par notre bouche devraient passer par notre estomac et être détruites
Mais les études semblent démontrer que les probiotiques ça fonctionne quand on les mprends en même temps que les antibios: comme on voit sur la photo, ça va diminuer les symptômes de diarrhée et donc c’est maintenant recommandé à l’hôpital avec la prise d’antibiotiques et c’est surtout très efficace pour prévenir les diarrhées associées à C difficile

Quelle est la conclusion des études quant à la prise de probiotiques pour traiter les diarrhées après administration d’antibiotiques?
- il y a une grande variabilité entre les études. Cause: composition du probiotique?
- Également à l’intérieur de chaque étude. Cause: différences individuelles dans la
flore bactérienne?
Faudrait-il adapter le traitement à chaque patient?
(mais les études semblent qd même démontrer que les probiotiques ont un effet)
Quelle est la nouvelle théorie quant à la variabilité des études sur la prise de probiotiques pour traiter les diarrhées après administration d’antibiotiques?
Ce serait causé par les bactériophages.
Ce serait pas tellement les bactéries qu’on nous donne, mais les bactériophages qui survivaient au pH de l’intestin et qui viendraient cibler spécifiquement certaines bactéries de notre intestin en les tuant et favoriserait ainsi la poppulation de nouveau par des bactéries positives