Microbio: Module 1 - Capsule 1 (par: Elizabeth Romero) Flashcards
1
Q
La microbiologie comprend l’étude de quel 4 microorganismes?
A
- Virus
- Bactéries
- Champignons
- Parasites
2
Q
En plus de l’étude de 4 microorganismes, lorsqu’on fait de la microbiologie on s’intéresse étudier quoi également?
A
L’immunologie et les maladies infectieuses
3
Q
En plus des virus, des bactéries, des champignons et des parasites, quel est le microorganisme qui n’a pas été mentionné?
A
les prions, qui sont des particules protéiques mais qui n’englobent pas d’acides nucléiques (mais on les comprend pas encore tout à fait)
4
Q
C’est quoi un virus?
A
Pathogène intracellulaire
obligatoire
Ils contiennent acides nucléiques dans une coque
(capside) et parfois un manteau de membrane lipidique (enveloppe)
5
Q
De quelle taille sont les virus?
A
ce sont les microorganismes les plus petits (de 18 à 600nm )
6
Q
Il y a combien d’espèces de virus décrites? Parmis celles-ci, combien d’entre-elles infectent l’homme et les animaux?
A
2000 espèces décrites, 650 infectant l’homme et les animaux
7
Q
Que se passe-t-il lorsqu’un virus infecte une cellule?
A
il va soit mener à la destruction de la cellule ou à une relation chronique à long terme
8
Q
Que `voit-on sur cette photo?
A
un bactériophage (un virus de bactérie)
9
Q
Que voit-on sur la photo suivante?
A
Un virus qui pourrait être le coronavirus mais qui pourrait également être le virus de la grippe: ont tous les 2 une enveloppe lipidique et on voit ces espèces de protubérances de protéines virales qui dépassent de la membrane
10
Q
Les champignons sont des procaryotes ou des eucaryotes?
A
eucaryotes
11
Q
Quels sont les 3 types de champignons? Décrivez les.
A
-
unicellulaire (levures - réplication
asexuée) - filamenteux (les
- *moisissures**- réplication asexuée ou sexuée)
-
dimorphiques : sont capables d’être soit sous la forme de levures, ou soit sous la forme de moisissure, dépendamment des conditions de l’environnement (Histoplasma, blastomyces et
coccidioides)
(Photo: coloration gram d’un champignon (moisissure) qui s’appelle Aspergillus et on peut voir les filaments)
12
Q
V ou F: On classe les types de moisissures en fonction de leur Gram
A
FAUX: elles n’ont pas une paroi de peptidoglycane comme les bactéries (les champignons sont en fait des organismes bien plus complexes que les bactéries)
13
Q
Les parasites sont des procaryotes ou des eucaryotes?
A
eucaryotes (ce sont les microorganismes les + compliqués qu’on va voir)
14
Q
Quelles sont les caractéristiques des parasites?
A
- Uni- ou multicellulaires
- protozoaires, helminthes, arthropodes
- tailles très différentes: de 4-5μm de diamètre à …10 m (comme le ver solitaire, voir photo)
- Cycle de vie complexe
- Relation permanente avec l’homme ou séries de stades de développement en progression chez l’hôte
15
Q
Les bactéries sont des eucaryotes ou des procaryotes?
A
procaryotes
16
Q
Que sont les bactéries?
A
organisme simple unicellulaire sans
membrane nucléaire (donc ils n’ont pas de noyau à proprement parler), ni les organelles complexes que nous on a (corps de golgi, réticulum endoplasmique, mitochondries, lysosomes)
17
Q
Comment se reproduisent les bactéries?
A
par division asexuée (fission binaire)
18
Q
On regroupe les bactéries en quelles 2 catégories? Comment?
A
Gram positif et Gram négatif (qu’on distingue par leur paroi de peptidoglycane):
- Gram - : paroi fine + membrane externe
- Gram + : paroi épaisse
_(_la paroi influence aussi la sensibilité à certains antibiotiques)
19
Q
À part leur coloration Gram, quelles sont les 3 autres caractéristiques par lesquelles ont peut distinguer les diverses bactéries entre elles?
A
- Taille : 1-20 μM
- forme : cocci, bâtonnets, spirochètes
- arrangement spatial : unique, en chaîne, en amas
20
Q
V ou F: Plusieurs milliers d’espèces différentes de bactéries vivent sur le corps humain et dans l’environnement
A
VRAI
21
Q
Comment les bactéries peuvent causer des maladies?
A
causées par la toxicité des produits bactériens (toxines) OU bien si envahissent
des tissus ou des fluides normalement stériles
22
Q
Quelle est la différence entre le noyau d’un eucaryote et d’un procaryote?
A
- eucaryote: noyau entouré d’une membrane
- procaryote: pas de membrane nucléaire (ADN dans le nucléoïde)
23
Q
Quelle est la différence entre les chromosomes d’une cellule eucaryote et d’une cellule procaryote?
A
- eucaryote: génome diploïde (2 copies, 2x 23 chromosomes ds son noyau, 2 milliards de pb) et filament d’une longueur de 990mm
- procaryote: génome haploïde : 1 seul chromosome circulaire, double brin, qui fait en moyenne 5 millions de pb (et si on le déroulait completement une longueur de 1.3 mm, soit 1000x le diamètre de la cellule procaryote elle-même) + plasmides pour certaines bactéries
24
Q
C’est quoi des plasmides?
A
petits bouts circulaires d’ADN que les bactéries peuvent s’échanger ou se transmettre entre elles : ils sont importants pcq souvent c’est eux qui vont transporter la résistance aux antibiotiques ou des facteurs de virulence
(les plasmides sont reproduits a chaque fois que la bactérie se divise alors ils ne sont pas perdus)
25
Quelle est la différence entre les **ribosomes** (structures servant pour la synthèse
des protéines) d'une cellule _eucaryote_ **_et_**d'une cellule _procaryote_?
- **_eu_**caryotes: **80S** (60S +40S)
- **_pro_**caryotes: **70S** (50S +30S) - ils sont donc plus petits
26
Quelle est la différence entre le **flagelle** d'une cellule _eucaryote_ _et_ d'une cellule _procaryote_?
- **_eu_**caryote: **complexe**, si présent (chez les protozoaires et les parasites)
- **_pro_**caryote: **simple**, si présent
27
Quelle est la différence entre la **respiration** d'une cellule _eucaryote_ _et_ d'une cellule _procaryote_?
- **_eu_**caryote: via les **mitochondries**
- **_pro_**caryotes: c'est au niveau de la **membrane cytoplasmique** qu'a lieu le transport des électrons/la production d'énergie
28
De quoi est formée la **membrane cytoplasmique** des _procaryotes_?
- **Bicouche lipidique + stéroïdes**
comme du cholestérol
- Contient des **enzymes**, **protéines de transport** (pour faire entrer et sortir des métabolites), **pompes d’ions** (pour maintenir le potentiel membranaire)
- **Intérieur**: protéines de
filaments comme l’**actine** (qui lui permet de remplir sa fonction de _maintient de structure_, puisqu'elle permet de former un _cytosquelette_)
29
Quelle est la particularité quant à la **fonction de la membrane cytoplasmique** des _procaryotes_?
La membrane cytoplasmique **comprend la
machinerie pour la production d’adénosine
triphosphate (ATP), source d’énergie** pour de
nombreuses enzymes de la cellules. Cette
machinerie est composée de _protéines pour le
transport d’électrons_, de _cytochromes_, etc.
30
Comment la membrane cytoplasmique des procaryotes permet de produire de l'énergie? Cette énergie va servir à quoi?
La concentration en protons (H+) n’est pas la
même de chaque côté de la membrane, (« potentiel »). Le **passage de protons (H+) de l’**_ex_**térieur vers l’**_in_**térieur** fournit l’énergie pour :
- la production d’_ATP_
- le mouvement des _flagelles_
- pour des _protéines assurant le transport_ de
métabolites (ex. lactose).
31
Qu'est-ce qui entoure les membranes cytoplasmique
de la plus part des procaryotes?
Le peptidoglycan (muréine) rigide
32
Que permet la paroi de peptidoglycane des bactéries?
**Rigidité**: _détermine la forme_ (ça maintient une structure)
33
Quelles sont les 3 propriétés de la paroi de peptidoglycane qui vont faire la distinction entre une bactérie Gram + et une Gram -?
- sa **structure**
- ses **composés**
- ses **fonctions**
34
V ou F: **toutes** les bactéries ont une paroi + une _membrane externe_
**FAUX**: seul les bactéries **Gram -** ont une membrane externe en plus de la paroi
35
Quelles sont les **2 portions** de la _paroi de peptoglycane_?
- **peptidique** : _séquence de 5 acide aminés_ (qui est conservée au sein des bactéries à qq exceptions près)
- **glucidique** : glycane = sucre = polysaccharide
36
La portion glucidique (de l'unité qui est répétée dans la structure de la paroi de peptoglycane) est formée de quelles 2 sous unités?
- N-acétyl glucosamine (NAG)
- N-acétyl-muramic acide (NAM)
37
Laquelle des 2 sous unités de la portion glucidique (de l'unité qui est répétée dans la structure de la paroi de peptoglycane) est attachée au peptide?
NAM
38
À quoi servent les chaînes d'acides aminés des portions peptidiques (de l'unité qui est répétée dans la structure de la paroi de peptoglycane)?
c'est à travers ces chaînes petidiques que les unités de peptidoglycane, les unité Nag-Nam vont etre **crosslinké** (liées de manière croisée) pour former ce filet que représente la paroi de peptidoglycane
39
Quelle est la **1ère étape** de la _synthèse de la paroi de peptidoglycane_?
La synthèse débute ds le cytoplasme avec la synthèse des précurseurs qui sont les unités dont on a parlé (qui sont le NAG et le NAM qui sont attachées au pentapeptide qui finit par D-ala D-ala)
40
Quelle est la **2e étape** de la _synthèse de la paroi de peptidoglycane_?
**On attache les unités** (NAM-NAG et la chaîne d'acides aminés) **à un transporteur lipidique qu'on appelle C55** (qui est la cible de la bacitracine). _Ceci permet le transport des ss unités NAM et NAG formées au site d'assemblage de la paroi_, c'est-à-dire à l'extérieur de la membrane cytoplasmique
41
Quelle est la **3e étape** de la _synthèse de la paroi de peptidoglycane_?
Une fois les unités (NAM-NAG et la chaîne d'acides aminés) rendues au site d'assemblage de la paroi, **les disaccahrides NAM et NAG s'assembler au polysacharide déja formé** (donc précurseur de la paroi de peptidoglycan déja en train de se former) _et_ **les peptides vont s'assembler egalement entre eux a laide d'une liason croisée formée par des ponts de pentaglycine** (donc 5 glycines vont relier ensemble les pentapeptides qui avaient été formées préalablement, donc associés au NAM) _ce préassemblage va couper la dernière alanine de ses chaines de pentapeptides_
42
Qu'est-ce qui est intéressant à remarquer lorsque l'on étudie les diverses étapes de la formation de la paroi de peptidoglycane?
toutes ces étapes sont catalysées par différent enzymes et _bcp des antibiotiques utilisés ciblent ces différents enzymes_ et **c'est très efficace puisque la synthèse de peptidoglycane n'a pas lieu dans les cellules eucaryotes** alors en théorie on n'a pas d'enzyme qui ressemble à celles des bactéries pour faire cette synthèse
43
Quelle est la particularité des **mycoplasmes**?
ils n'ont **pas de paroi cellulaire**
44
Quelles sont les **2 caractéristiques de la paroi cellulaire** propres aux bactéries _Gram +_?
- _Peptidoglycane_: **couche dense mais suffisamment poreuse** pour que les métabolites puissent passer; **dégradée par les lysozymes**
- présence (mais pas toujours) des **acides teichoïques et lipo-teichoïques**
45
Que sont les **acides teichoïques et lipo-teichoïques**?
**Antigènes de surface**, permettant de classer les bactéries en fonction de leur *sérotype*
_Impliqués dans la reconnaissance d’autres bactéries_, et l’attachement aux cellules de mammifères lors de l’infection (_« adhérence »_)
46
Quelles sont les **5 caractéristiques de la paroi cellulaire** propres aux bactéries _Gram -_?
- **Pas d’acides teichoïques et lipo-teichoïques**
- **Espace périplasmique**
* *- Membrane externe**
- **LPS** = lipopolysaccharide = endotoxine
- **Porines**
47
Que contient l'**espace périplasmique** des _bactéries Gram -_?
- des **enzymes importantes pour le métabolisme**
- peut aussi contenir des **facteurs de virulence**, _pour les bactéries pathogéniques_
48
À quoi sert la **membrane externe** des _bactéries Gram -_?
elle **maintient la structure bactérienne**, c'est une barrière assurant un **rôle de protection**
49
Décrivez la **structure** **de la membrane externe** des _bactéries Gram -_.
Structure **asymétrique**:
- couche lipidique _interne « classique »_ (principalement des phospholipides)
- couche _externe composée essentiellement de LPS_
50
À quoi servent les **LPS**?
Sont considérés comme des toxines bactériennes: stimulent la réponse immune. Causent fièvre et
choc septique.
51
À quoi servent les **porines**?
- permettent la **diffusion passive des petites molécules**
- **contrôlent le transport** de **molécules** plus **grosses**
52
Les paroi de peptidoglycane des Gram + et - sont poreuses: elles laissent passer les métabolites. Par contre, pourquoi peut-on affirmer que les bactéries Gram négatif (-) sont mieux protégées?
**la membrane externe** des bactéries gram - leur **confère une protection de plus** en servant de _barrière à des grosses molécules comme les lysozymes_ qui dégradent la paroi de peptidoglycan. La membrane externe _bloque également les molécules hydrophobes_ comme certains antimicrobiens
53
Décrivez étape par étape comment fonctionne la coloration Gram.
(Avant tout, il faut fixer les bactéries à la chaleur ou les sécher sur une lame)
1. on marque les bactéries au **crystal violet** (qui rentre dans les 2 types de bactéries)
2. On ajoute de la **Gram Iodine** (Elle va précipiter avc le crystal violet et former un plus gros complexe)
3. On utilise un **decolorizer (alcool ou acetone)** pour faire une sorte de lavage qui _ne fonctionne que sur les bactéries gram -_ pcq la paroi épaisse de peptidoglycane des bactéries gram + leur permet de résister à leur décoloration
4. On ajoute du **safranin red** : _ça rend les bactéries gram - roses_ alors que les gram + resteront violettes pcq la couleur violette domine
54
À quoi faut-il faire attention lorsque l'on utilise la méthode de coloration Gram?
elle ne marche pas sur :
- des **vieilles cultures bactériennes**
- les **mycobactéries** pcq elles n'ont _pas de paroi de peptidoglycane_
- des **cultures en mauvaise santé** (ex: traitées par des AB, qui cause une _dégradation de la paroi_)
55
Il y a des exceptions à la structure de la paroi de peptidoglycane, qui n'est pas conservée chez quelles 2 sortes de bactéries?
- mycobacterium
- mycoplasme
56
Décrivez la **structure de la paroi** des _mycobacterium_.
couche de pepotidoglycane entrelacé et
attaché avec un polymère d’**arabinogalactan** et entouré d’un manteau lipidique cireux
d’**acide mycolique**
57
V ou F: on utilise principalement la _coloration Gram_ pour identifier les **mycobactéries**
**FAUX**:À cause de la présence d'acide mycolique, les mycobactéries _vont résister à la coloration_ (elle ont une _paroi cellulaire imperméable,_ à l'inverse des autres bactéries dont on a parlé, qui ont une paroi poreuse) , on a plutôt recours à la **coloration acido-alcoolo-résistante (marquage acid-fast)** *(détails de cette coloration ne sont PAS à connaître)*
58
Décrivez la **structure de la paroi** des _mycoplasmes_.
n’ont **pas de paroi de peptidoglycane** et _incorpore les stéroïdes de l’hôte dans leurs membranes_
59
Quels sont les **3 domaines structuraux** des _lipopolysaccharides (LPS)_? Que fait chaque domaine?
- **Antigène O** (chaîne polysaccharidique): il est _reconnu de façon spécifique (_Il permet donc de distinguer différents sérotypes et différentes souches de bactéries) _par des anticorps_ (il va donc y avoir des réponses immunitaires contres ces antigènes)
- **Polysaccharide central** (Core
polysaccharide)
-Le **lipide A** _ancre le LPS dans la membrane
externe_. Il est responsable de l’_activité
endotoxine_.
60
Quelles sont les **5 structures externes occasionnelles** des _bactéries_?
- capsule
- biofilm
- flagelle
- fimbriae
- F pili (sex pili)
61
C'est quoi la **capsule** des bactéries?
Composé de _polysaccharide ou protéines_ important pour la **survie dans l’hôte au cours de l’infection** (elle permet aux bactéries d'échapper à la réponse immunitaire pcq ça les protège de la phagocytose, c'est un facteur de virulence qu'on va observer notamment chez *streptococcus pneumoniae* ou *bacillus anthracis)*
Peut permettre la **résistance aux détergents**, et **faciliter l’adhésion**.
Visualisation à l’encre de Chine (la capsule donne l'impression qu'il y a un halo qui les entoure)
62
C'est quoi le **biofilm** des bactéries?
structure de _polysaccharide_ (P. aeruginosa et S. aureus) _quand_ les bactéries sont regroupées _en grande quantité et bonne condition de croissance_.
**Protège la communauté contre les antibiotiques et les défenses de l’hôte**.
63
C'est quoi le **flagelle** des bactéries?
composé de _flagelline_, _hélicoïdale_, permet le
**déplacement par chimiotaxie**
(Le flagelle est un ligand pour les signaux de danger donc ca va induire l'inflammation)
64
C'est quoi les fimbriae (quelquefois appelé pili): « cheveux »?
- Plus **minces**
- composés de protéines **pilin**
- Aussi appelés : _adhésines_, _lectines_,
etc.
- Permettent l’**adhérence aux cellules de l’hôte**
- Lorsqu’ils sont présents, généralement
* *plusieurs centaines par bactérie**
- Seulement chez les **gram-_négatives_**
65
C'est quoi le **F pili (sex pili)**?
Appendice filamenteux à rôle sexuel: **Tube de transfert de partie de chromosome entre bactéries**
Appelé ainsi car il est _synthétisé grâce aux gènes contenus sur le plasmide F_
66
C'est quoi la **chimiotaxie _positive_**?
Si il y a un **gradient de qqch qui va attirer les bactéries** (_éléments nutritifs_: sucres, acides aminés), on va observer un mouvement dans cette direction
67
C'est quoi la **chimiotaxie _négative_**?
Si ya un gradient d'un **facteur qui repousse les bactéries** (Péroxyde d’hydrogène (H2O2), solvants (méthanol, éthanol…), acides, bases, débris bactériens), on va observer que la bactére s'éloigne clairement de cette substance
68
V ou F: La bactérie est immobile lorsqu'il n'y a pas de substance qui l'attire ou la repousse.
**FAUX**: S'il n'y a absolument rien, on va avoir l'impression que la **bactérie se déplace par petits segments mais tourne plutot en rond**
69
V ou F: chaque bactérie n'a qu'un seul flagelle.
**FAUX**: Ici on a un exemple de la diversité des flagelles: au niveau de leur localisation, de leur nombre, et de leur longueur
70
Ce sont certaines _bactéries Gram + ou -_ qui font de la **sporulation**?
gram **+** (comme : bacillus, ou la bactérie anaérobie du genre clostridium), _jamais_ chez les gram -
71
C'est quoi la **sporogenèse**, ou la **sporulation**?
Transition état végétatif à état dormant
72
C'est quoi un **spore**?
La spore représente un _état déshydraté de la bactérie_, et peut lui **permettre de survivre pendant de longues périodes** (permet de résister tres longtemps à des conditions impropices à sa croissance)
73
Que **contient** un _spore_?
une **copie du génome bactérien**
| (chromosome)
74
Pourquoi les spores posent un problème de santé publiques?
pcq elles sont _très résistantes à la désinfection et à la cuisson_ alors on a plusieurs **intoxications alimentaires** dues à la présence de spores malgré la cuisson qui est lorsqu'on va stocker les aliments vont permettre au spores de sporuler et à ce moment là, la bactérie de reprendre sa croissance lorsque les signaux externes indiqueront que c'est un bon moment pour germer
(je sais que la phase est vrmt caca mais c'est exactement ce que la prof a dit... jsavais pas trop comment reformuler)
75
V ou F: on ne peut pas voir les spores au microscope
**FAUX**: Sur la photo ci-dessous, on voit des spores de Clostridium tetani, montrant leur **localisation terminale**. La zone moins colorée c'est les spores
76
Les _spores_ sont **nombreuses où**?
dans les sols
77
Les _spores_ peuvent causer des **infections dans le cas de quoi**?
dans le cas de **plaies ouvertes**
Ex: *Clostridium tetani*, *Clostridium perfringens* et *Bacillus anthracis* (anthrax).
78
C'est quoi la **germination**?
Le passage à l'état **végétatif**
79
Outre la coloration Gram, quand on regarde des bacétries au microscope, on va regarder leur forme et leur arrangement. Quelles sont les **3 formes de bactéries**?
- cocci
- bacilles
- spirochaetes
80
Quelles sont les **5 méthodes d'observation pour classifier et identifier** les _bactéries_?
- **différences **_macro_**scopiques** (colonies)
- **différences **_micro_**scopiques** (_taille_, _forme_, cocci, bâtonnets, courbé, ou spiralé), **coloration de Gram**
- **Signature métabolique**
- **Sérotypage**
- **Signature génétique**
81
C'est quoi une **colonie de bactéries**?
amas de bactéries qui se sont divisées par fission binaire et qui ont fromé une petite montagne
82
Lorsque l'on étudie la **signature métabolique** d'une bactérie, c'est quoi les 3 caractéristiques que l'on observe + précisément?
- Caractéristiques de croissances
- Anaérobie vs aérobie
- Production d’enzymes ou métabolites, besoin nutriments particuliers
83
à quoi sert le **sérotypage** de bactéries?
Différentes souches peuvent être distinguées par la **détection d’antigènes spécifiques**
84
C'est quoi la méthode de l'étude de la **signature génétique** des bactéries?
(Méthode la plus précise)
**détection de séquences d’ADN caractéristiques** par: hybridation ADN, Polymerase chain reaction (PCR), séquençage
85
V ou F: il faut absolument faire pousser des colonies pour étudier une bactérie en particulier
**FAUX**: on a maintenant des technologies très avancées qui utilisent la **spectrométrie de masse** pour identifier très rapidement les bactéries sans même avoir besoin de les faire pousser
