Microbio: Module 1 - Capsule 1 (par: Elizabeth Romero) Flashcards
La microbiologie comprend l’étude de quel 4 microorganismes?
- Virus
- Bactéries
- Champignons
- Parasites
En plus de l’étude de 4 microorganismes, lorsqu’on fait de la microbiologie on s’intéresse étudier quoi également?
L’immunologie et les maladies infectieuses
En plus des virus, des bactéries, des champignons et des parasites, quel est le microorganisme qui n’a pas été mentionné?
les prions, qui sont des particules protéiques mais qui n’englobent pas d’acides nucléiques (mais on les comprend pas encore tout à fait)
C’est quoi un virus?
Pathogène intracellulaire
obligatoire
Ils contiennent acides nucléiques dans une coque
(capside) et parfois un manteau de membrane lipidique (enveloppe)
De quelle taille sont les virus?
ce sont les microorganismes les plus petits (de 18 à 600nm )
Il y a combien d’espèces de virus décrites? Parmis celles-ci, combien d’entre-elles infectent l’homme et les animaux?
2000 espèces décrites, 650 infectant l’homme et les animaux
Que se passe-t-il lorsqu’un virus infecte une cellule?
il va soit mener à la destruction de la cellule ou à une relation chronique à long terme
Que `voit-on sur cette photo?
un bactériophage (un virus de bactérie)
Que voit-on sur la photo suivante?
Un virus qui pourrait être le coronavirus mais qui pourrait également être le virus de la grippe: ont tous les 2 une enveloppe lipidique et on voit ces espèces de protubérances de protéines virales qui dépassent de la membrane
Les champignons sont des procaryotes ou des eucaryotes?
eucaryotes
Quels sont les 3 types de champignons? Décrivez les.
-
unicellulaire (levures - réplication
asexuée) - filamenteux (les
- *moisissures**- réplication asexuée ou sexuée)
-
dimorphiques : sont capables d’être soit sous la forme de levures, ou soit sous la forme de moisissure, dépendamment des conditions de l’environnement (Histoplasma, blastomyces et
coccidioides)
(Photo: coloration gram d’un champignon (moisissure) qui s’appelle Aspergillus et on peut voir les filaments)
V ou F: On classe les types de moisissures en fonction de leur Gram
FAUX: elles n’ont pas une paroi de peptidoglycane comme les bactéries (les champignons sont en fait des organismes bien plus complexes que les bactéries)
Les parasites sont des procaryotes ou des eucaryotes?
eucaryotes (ce sont les microorganismes les + compliqués qu’on va voir)
Quelles sont les caractéristiques des parasites?
- Uni- ou multicellulaires
- protozoaires, helminthes, arthropodes
- tailles très différentes: de 4-5μm de diamètre à …10 m (comme le ver solitaire, voir photo)
- Cycle de vie complexe
- Relation permanente avec l’homme ou séries de stades de développement en progression chez l’hôte
Les bactéries sont des eucaryotes ou des procaryotes?
procaryotes
Que sont les bactéries?
organisme simple unicellulaire sans
membrane nucléaire (donc ils n’ont pas de noyau à proprement parler), ni les organelles complexes que nous on a (corps de golgi, réticulum endoplasmique, mitochondries, lysosomes)
Comment se reproduisent les bactéries?
par division asexuée (fission binaire)
On regroupe les bactéries en quelles 2 catégories? Comment?
Gram positif et Gram négatif (qu’on distingue par leur paroi de peptidoglycane):
- Gram - : paroi fine + membrane externe
- Gram + : paroi épaisse
_(_la paroi influence aussi la sensibilité à certains antibiotiques)
À part leur coloration Gram, quelles sont les 3 autres caractéristiques par lesquelles ont peut distinguer les diverses bactéries entre elles?
- Taille : 1-20 μM
- forme : cocci, bâtonnets, spirochètes
- arrangement spatial : unique, en chaîne, en amas
V ou F: Plusieurs milliers d’espèces différentes de bactéries vivent sur le corps humain et dans l’environnement
VRAI
Comment les bactéries peuvent causer des maladies?
causées par la toxicité des produits bactériens (toxines) OU bien si envahissent
des tissus ou des fluides normalement stériles
Quelle est la différence entre le noyau d’un eucaryote et d’un procaryote?
- eucaryote: noyau entouré d’une membrane
- procaryote: pas de membrane nucléaire (ADN dans le nucléoïde)
Quelle est la différence entre les chromosomes d’une cellule eucaryote et d’une cellule procaryote?
- eucaryote: génome diploïde (2 copies, 2x 23 chromosomes ds son noyau, 2 milliards de pb) et filament d’une longueur de 990mm
- procaryote: génome haploïde : 1 seul chromosome circulaire, double brin, qui fait en moyenne 5 millions de pb (et si on le déroulait completement une longueur de 1.3 mm, soit 1000x le diamètre de la cellule procaryote elle-même) + plasmides pour certaines bactéries
C’est quoi des plasmides?
petits bouts circulaires d’ADN que les bactéries peuvent s’échanger ou se transmettre entre elles : ils sont importants pcq souvent c’est eux qui vont transporter la résistance aux antibiotiques ou des facteurs de virulence
(les plasmides sont reproduits a chaque fois que la bactérie se divise alors ils ne sont pas perdus)
Quelle est la différence entre les ribosomes (structures servant pour la synthèse
des protéines) d’une cellule eucaryote etd’une cellule procaryote?
- eucaryotes: 80S (60S +40S)
- procaryotes: 70S (50S +30S) - ils sont donc plus petits
Quelle est la différence entre le flagelle d’une cellule eucaryote et d’une cellule procaryote?
- eucaryote: complexe, si présent (chez les protozoaires et les parasites)
- procaryote: simple, si présent
Quelle est la différence entre la respiration d’une cellule eucaryote et d’une cellule procaryote?
- eucaryote: via les mitochondries
- procaryotes: c’est au niveau de la membrane cytoplasmique qu’a lieu le transport des électrons/la production d’énergie
De quoi est formée la membrane cytoplasmique des procaryotes?
-
Bicouche lipidique + stéroïdes
comme du cholestérol - Contient des enzymes, protéines de transport (pour faire entrer et sortir des métabolites), pompes d’ions (pour maintenir le potentiel membranaire)
-
Intérieur: protéines de
filaments comme l’actine (qui lui permet de remplir sa fonction de maintient de structure, puisqu’elle permet de former un cytosquelette)
Quelle est la particularité quant à la fonction de la membrane cytoplasmique des procaryotes?
La membrane cytoplasmique comprend la
machinerie pour la production d’adénosine
triphosphate (ATP), source d’énergie pour de
nombreuses enzymes de la cellules. Cette
machinerie est composée de protéines pour le
transport d’électrons, de cytochromes, etc.
Comment la membrane cytoplasmique des procaryotes permet de produire de l’énergie? Cette énergie va servir à quoi?
La concentration en protons (H+) n’est pas la
même de chaque côté de la membrane, (« potentiel »). Le passage de protons (H+) de l’extérieur vers l’intérieur fournit l’énergie pour :
- la production d’ATP
- le mouvement des flagelles
- pour des protéines assurant le transport de
métabolites (ex. lactose).
Qu’est-ce qui entoure les membranes cytoplasmique
de la plus part des procaryotes?
Le peptidoglycan (muréine) rigide
Que permet la paroi de peptidoglycane des bactéries?
Rigidité: détermine la forme (ça maintient une structure)
Quelles sont les 3 propriétés de la paroi de peptidoglycane qui vont faire la distinction entre une bactérie Gram + et une Gram -?
- sa structure
- ses composés
- ses fonctions
V ou F: toutes les bactéries ont une paroi + une membrane externe
FAUX: seul les bactéries Gram - ont une membrane externe en plus de la paroi
Laquelle des 2 sous unités de la portion glucidique (de l’unité qui est répétée dans la structure de la paroi de peptoglycane) est attachée au peptide?
NAM
À quoi servent les chaînes d’acides aminés des portions peptidiques (de l’unité qui est répétée dans la structure de la paroi de peptoglycane)?
c’est à travers ces chaînes petidiques que les unités de peptidoglycane, les unité Nag-Nam vont etre crosslinké (liées de manière croisée) pour former ce filet que représente la paroi de peptidoglycane
Quelle est la 1ère étape de la synthèse de la paroi de peptidoglycane?
La synthèse débute ds le cytoplasme avec la synthèse des précurseurs qui sont les unités dont on a parlé (qui sont le NAG et le NAM qui sont attachées au pentapeptide qui finit par D-ala D-ala)
Quelle est la 2e étape de la synthèse de la paroi de peptidoglycane?
On attache les unités (NAM-NAG et la chaîne d’acides aminés) à un transporteur lipidique qu’on appelle C55 (qui est la cible de la bacitracine). Ceci permet le transport des ss unités NAM et NAG formées au site d’assemblage de la paroi, c’est-à-dire à l’extérieur de la membrane cytoplasmique
Quelle est la 3e étape de la synthèse de la paroi de peptidoglycane?
Une fois les unités (NAM-NAG et la chaîne d’acides aminés) rendues au site d’assemblage de la paroi, les disaccahrides NAM et NAG s’assembler au polysacharide déja formé (donc précurseur de la paroi de peptidoglycan déja en train de se former) et les peptides vont s’assembler egalement entre eux a laide d’une liason croisée formée par des ponts de pentaglycine (donc 5 glycines vont relier ensemble les pentapeptides qui avaient été formées préalablement, donc associés au NAM) ce préassemblage va couper la dernière alanine de ses chaines de pentapeptides
Qu’est-ce qui est intéressant à remarquer lorsque l’on étudie les diverses étapes de la formation de la paroi de peptidoglycane?
toutes ces étapes sont catalysées par différent enzymes et bcp des antibiotiques utilisés ciblent ces différents enzymes et c’est très efficace puisque la synthèse de peptidoglycane n’a pas lieu dans les cellules eucaryotes alors en théorie on n’a pas d’enzyme qui ressemble à celles des bactéries pour faire cette synthèse
Quelles sont les 2 caractéristiques de la paroi cellulaire propres aux bactéries Gram +?
- Peptidoglycane: couche dense mais suffisamment poreuse pour que les métabolites puissent passer; dégradée par les lysozymes
- présence (mais pas toujours) des acides teichoïques et lipo-teichoïques
Quelles sont les 5 caractéristiques de la paroi cellulaire propres aux bactéries Gram -?
- Pas d’acides teichoïques et lipo-teichoïques
- Espace périplasmique
- *- Membrane externe**
- LPS = lipopolysaccharide = endotoxine
- Porines
Que contient l’espace périplasmique des bactéries Gram -?
- des enzymes importantes pour le métabolisme
- peut aussi contenir des facteurs de virulence, pour les bactéries pathogéniques
Décrivez la structure de la membrane externe des bactéries Gram -.
Structure asymétrique:
- couche lipidique interne « classique » (principalement des phospholipides)
- couche externe composée essentiellement de LPS
À quoi servent les porines?
- permettent la diffusion passive des petites molécules
- contrôlent le transport de molécules plus grosses
Décrivez étape par étape comment fonctionne la coloration Gram.
(Avant tout, il faut fixer les bactéries à la chaleur ou les sécher sur une lame)
- on marque les bactéries au crystal violet (qui rentre dans les 2 types de bactéries)
- On ajoute de la Gram Iodine (Elle va précipiter avc le crystal violet et former un plus gros complexe)
- On utilise un decolorizer (alcool ou acetone) pour faire une sorte de lavage qui ne fonctionne que sur les bactéries gram - pcq la paroi épaisse de peptidoglycane des bactéries gram + leur permet de résister à leur décoloration
- On ajoute du safranin red : ça rend les bactéries gram - roses alors que les gram + resteront violettes pcq la couleur violette domine
Décrivez la structure de la paroi des mycobacterium.
couche de pepotidoglycane entrelacé et
attaché avec un polymère d’arabinogalactan et entouré d’un manteau lipidique cireux
d’acide mycolique
Quels sont les 3 domaines structuraux des lipopolysaccharides (LPS)? Que fait chaque domaine?
- Antigène O (chaîne polysaccharidique): il est _reconnu de façon spécifique (_Il permet donc de distinguer différents sérotypes et différentes souches de bactéries) par des anticorps (il va donc y avoir des réponses immunitaires contres ces antigènes)
-
Polysaccharide central (Core
polysaccharide)
-Le lipide A ancre le LPS dans la membrane
externe. Il est responsable de l’activité
endotoxine.
C’est quoi la capsule des bactéries?
Composé de polysaccharide ou protéines important pour la survie dans l’hôte au cours de l’infection (elle permet aux bactéries d’échapper à la réponse immunitaire pcq ça les protège de la phagocytose, c’est un facteur de virulence qu’on va observer notamment chez streptococcus pneumoniae ou bacillus anthracis)
Peut permettre la résistance aux détergents, et faciliter l’adhésion.
Visualisation à l’encre de Chine (la capsule donne l’impression qu’il y a un halo qui les entoure)
C’est quoi les fimbriae (quelquefois appelé pili): « cheveux »?
- Plus minces
- composés de protéines pilin
- Aussi appelés : adhésines, lectines,
etc. - Permettent l’adhérence aux cellules de l’hôte
- Lorsqu’ils sont présents, généralement
- *plusieurs centaines par bactérie**
- Seulement chez les gram-_négatives_
C’est quoi la chimiotaxie positive?
Si il y a un gradient de qqch qui va attirer les bactéries (éléments nutritifs: sucres, acides aminés), on va observer un mouvement dans cette direction
C’est quoi la chimiotaxie négative?
Si ya un gradient d’un facteur qui repousse les bactéries (Péroxyde d’hydrogène (H2O2), solvants (méthanol, éthanol…), acides, bases, débris bactériens), on va observer que la bactére s’éloigne clairement de cette substance
V ou F: La bactérie est immobile lorsqu’il n’y a pas de substance qui l’attire ou la repousse.
FAUX: S’il n’y a absolument rien, on va avoir l’impression que la bactérie se déplace par petits segments mais tourne plutot en rond
V ou F: chaque bactérie n’a qu’un seul flagelle.
FAUX: Ici on a un exemple de la diversité des flagelles: au niveau de leur localisation, de leur nombre, et de leur longueur
C’est quoi la sporogenèse, ou la sporulation?
Transition état végétatif à état dormant
C’est quoi un spore?
La spore représente un état déshydraté de la bactérie, et peut lui permettre de survivre pendant de longues périodes (permet de résister tres longtemps à des conditions impropices à sa croissance)
Que contient un spore?
une copie du génome bactérien
(chromosome)
V ou F: on ne peut pas voir les spores au microscope
FAUX: Sur la photo ci-dessous, on voit des spores de Clostridium tetani, montrant leur localisation terminale. La zone moins colorée c’est les spores
Outre la coloration Gram, quand on regarde des bacétries au microscope, on va regarder leur forme et leur arrangement. Quelles sont les 3 formes de bactéries?
- cocci
- bacilles
- spirochaetes
C’est quoi une colonie de bactéries?
amas de bactéries qui se sont divisées par fission binaire et qui ont fromé une petite montagne
