intra bio mol (2) Flashcards
sens de la polymérase
5’ vers 3’ TOUJOURS
combien d’origine de réplication ont les procaryotes
1 seul
combien d’origine de réplication ont les eucaryotes
plusieurs
Vrai ou faux, l’origine de réplication fait partie du réplicateur
Vrai
séquence propice à une origine de réplication
A-T
les deux sites de l’origine de réplication
9 mères et 13 mères
à quoi sert le site 9 mère
seul site spécifique de fixation
socle pour le complexe d’initiation
à quoi sert le site 13 mère
riche en A-T; lieu de séparation initiale du brin
3 roles des protéines initiatrices
- identifier ORI et s’y lier
- recruter protéines essentielles à la formation du complexe initiateur AVEC HÉLICASES
- (chez les procaryotes) commencer la séparation des brins
chez les procaryotes, quel protéine lie spécifiquement le site 9 mère
DnaA
Vrai ou faux, chez les eucaryotes ORI est toujours à partir d’une même séquence définie
Faux, chez les procaryotes seulement
les sites 9 mères et 13 mères peuvent ils fonctionner indépendamment
Non, toujours liés
9 mères permet fixation socle/ protéine initiatrice
13 mères est ou l’ouverture initiale se fait
quel est l’équivalent de la protéine initiatrice chez l’eucaryote
le complexe de reconnaissance de l’ORI (ORC)
role du ORC
RECONNAITRE
est ce que l’ORC entame ouverture des brins
NON jamais, ne fait que RECONNAITRE
séquence de départ défini de l’ORC
non
est ce que l’ORC peut se lier au site sans que l’ADN s’ouvre
OUI, attend la confirmation des check-points
séquence idéale (ORC)
- sans nucléosomes
- riche en AT ou ilots CpG
- séquence/ structure particuliere
- régions impliquées dans initiation de la transcription
Les ORC sont elles ouvertes/ déclenchées simultanément
Non, ouverture séquentielle
role de la topoisomérase
réduire la tension en clivant et reparant les noeuds
role hélicase
séparer les brins complémentaires d’ADN
role SSB
maintien la stabilité des brins ouverts par l’hélicase (empeche repliement sur eux-même et formation tete épingle)
fonctionnement de l’hélicase
6 s-u; lie toutes ATP et brins, fonctionne en continue très grande efficacité, pore centrale ou passe l’ADN
comment fonctionne les 6 s-u de l’hélicase
elles fonctionnent en décalée (hydrolyse l’ATP décalé)
les liaisons des SSB sont elles fortes ou faibles
faibles, car la polymérase doit etre en mesure des retirer, juste assez fortes pour empecher liaison sur elle meme
les deux types de topoisomérase
1: clive 1 brin
2: clive 2 brins
ou se situe la topoisomérase sur le brin
toujours devant la fourche de réplication afin d’empecher les cassures causées par la tension accumulée lors de la séparation des brins
lorsque les hélicases ont ouverts les brins (oeil de réplication) qu’arrive til ensuite
recrutement des primases (ARN polymérase) par les hélicases
pourquoi l’ARN polymérase initie la polymérisation et non une ADN poly
car la ADN ne peut pas commencer de novo; nécessite une amorce présentant un 3’ OH libre
qu’arrive til au ribonucléotides insérés par ARN poly
seront remplacés par des désoxyribonucléotides
role du poseur d’anneau
guide la polymérase et l’encourage à poursuivre plus longtemps son travail (empêche de s’éloigner et de se dissocier trop tôt)
comment on pose l’anneau
le poseur d’anneau hydrolyse ATP ce qui provoque ouverture anneau et son installation
Un anneau lié à une polymérase peut il être lié par un poseur d’anneau
Non, pas après sa liaison à l’ADN polymérase
quelles sont différentes ADN pol
procaryotes
- Pol I
- Pol III
eucaryotes
- Pol delta
- Pol epsilon
- Pol alpha
deux types de réparation de l’ADN effectuée sur eucaryotes par Pol delta et epsilon
- réparation excision base (BER)
ou de nucléotide (NER)
role Pol I
soutient Pol III (répare, change ARN en ADN)
role Pol III
polymérise brin procaryotes (est la principale)
role Pol delta
synthèse brin DISCONTINU et réparation NER, BER
role Pol epsilon
synthèse brin CONTINU et réparation BER, NER
role Pol alpha
change ARN en ADN (site de l’amorce)
comment l’ADN poly sait si la liaison est bonne
la rapidité des liens H et la stabilisation, sinon retire le nucléotide et cherche le bon 1/4
est ce que l’ADN poly distingue les rNTP des dNTP
oui, exclusion stérique, le OH sur ribose distingue du H
d’ou provient l’énergie de l’ADN polymérase
- bris liaison alpha/ beta- gamma (phosphodiester)
- bris liaison beta/ gamma (phosphoester)
ADN polymérase (3) parties de la main
- paume (site catalyseur)
- doigts (expose un nucléotide à la fois)
- pouce (maintient)
décrit le brin continu
dans le meme sens que la polymérase
décrit le brin discontinu
sens inverse de la polymérase
(fragments okazaki)
réplisome avance dans quel sens
dans le sens de la fourche (malgré caractère anti-parallèle de l’ADN)
les deux polymérases travaillent dans quel sens
5’ vers 3’
définie holoenzyme
enzyme associée à des partenaires qui favorisent son activité
ex: polymérase avec son anneau coulissant
quelles protéines forment l’holoenzyme du pol III
les 3 polymérases avec leur anneau et poseur d’anneau
comment se nomme le complexe holoenzyme et autres protéines
réplisome
Vrai ou faux, si 3 polymérases, elles fonctionnent toutes en même temps
Faux, 2 en même temps l’autre chill
comment se nomme la boucle qui permet à la polymérase de polymériser dans les deux sens
la boucle ADNsb
lorsque la polymérase se détache, reste elle liée au réplisome
oui, permet de recommencer la synthèse plus rapidement
les 3 polymérases des eucaryotes
delta, epsilon, alpha
qu’est ce qui retire les ARN de l’amorce
RNase H
la RNase H retire tout?
non sauf le dernier
qui retire le dernier RNase H
exonucléase 5’
qui remplace ARN par ADN
pol I chez bact. et pol alpha chez eucaryotes
role ADN ligase
former liaisons phosphodiesters
les étapes du retrait de l’amorce
- pol I/ pol alpha
- exonucléase 5
- ADN poly
- ligase
Vrai ou faux, lors de l’insertion d’une erreur, si la polymérase ne la voit pas en y revenant elle peut y revenir plus tard
faux, never
La distribution des histones se fait elle de façon égale?
Non, inégale “distributive inheritance”
Comment savons nous ou remettre les histones
les H3-H4 s’associent au réplisome et se réattache au meme endroit, les dimères H2 s’ajoutent ensuite
Les extrémités 3’ OH des chromosomes peuvent-ils être répliqués
Non= télomères/ télomérase (section répétitives aux extrémités)
