Hoorcollege 6: Databases and analysis tools

Question 1

Welke twee databases zijn belangrijk voor biologen?

Answer 1

GenBank en Protein Data Bank

Question 2

Waar focussed GenBank zich voornamelijk op?

Answer 2

Protein and nucleotide sequences

Question 3

Waar focussed Protein Data Bank zich voornamelijk op?

Answer 3

3D structuur van eiwitten, nucleic acids en carbohydrates

Question 4

Hoe heet de overkoepelende databank waaronder 3 locaties vallen?

Answer 4

International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC)

Question 5

Wat zijn de 3 locaties van INSDC?

Answer 5

1) GenBank at the NCBI (USA); the European Nucleotide Archive (ENA) at the European Bioinformatics Institute (UK); and 3) the DNA Data Bank of Japan (DDBJ)