Hoorcollege 11: Breeding strategies and behavioral genomics

Question 1

Wat is behavioural genetics?

Answer 1

Onderzoek doen naar de genetische contributie aan gedragskenmerken

Question 2

Wat is behavioural genomics?

Answer 2

Onderzoek doen naar de genetische contributie aan gedragskenmerken op genoom niveau

Question 3

Wat zijn voorbeelden van complex traits?

Answer 3

auto-immuunziektes, gedrag, kanker, gewicht, lengte en metabolische-, neurologische-, cardiovasculaire- en psychiatrische aandoeningen

Question 4

Welke twee (belangrijkste) strategiën worden gebruikt om homogeniety te controleren in muizen?

Answer 4

Inbreeding en recombinant inbred strains

Question 5

Welke muizen worden gekruist bij inbreeding?

Answer 5

Broer/zus

Question 6

Waarom worden broer/zus gekruist?

Answer 6

weinig variatie in genetische compositie

Question 7

Wat houdt het percentage homozygositeit in?

Answer 7

Het percentage homozygositeit (hoeveel genen gerepresenteerd worden door één allel) kan voorspelt worden als een functie van het aantal generaties

Question 8

Wat houdt het inbreeding coefficient F in?

Answer 8

De kans dat twee allelen identiek zijn, op een willekeurige locus

Question 9

Hoe veel generaties moet je fokken om een breeding coefficient van 99% te krijgen?

Answer 9

20 generaties

Question 10

Wat is het risico van inbreeding?

Answer 10

Grotere kans op recessieve ziekte

Question 11

Wat gebeurd er bij recombinant inbred strains?

Answer 11

Dan worden twee inbred stammen gekruist en bestudeerd

Question 12

Om de resolutie van trait mapping nog meer te verbeteren werden F1 muizen van verschillende nesten met elkaar gekruist tot aan 10 generaties zodat er nog meer recombinatie ontstaat vanuit twee originele strains. Hoe heet dit proces

Answer 12

Advanced intercrossing

Question 13

Wat is het principe van complex traits?

Answer 13

Niet dat het fenotype ‘aanwezig’ of ‘afwezig’ is, maar dat het een soort continue schaal vertoont. Een ziekte kan zich bijv. ontwikkelen wanneer een bepaalde waarde de threshold overstijgt, hier geeft het ons dan meer informatie om de complex trait direct te meten, dan alleen te bepalen of iemand ‘affected’ is of niet. Daarnaast zal er een sterker statistische significantie merkbaar zijn bij genetische linkage analyse, die bepaald of een linkage aan- of afwezig is.

Question 14

Wat zijn quantitative trait loci

Answer 14

chromosomale gebieden met genen die kwantitatieve eigenschappen beïnvloeden

Question 15

Hoe noemen we de analyse waarbij de kwantitatieve eigenschappen tussen twee strains (kan vliegen/muizen zijn) worden berekend?

Answer 15

QTL mapping (quantitive trait loci mapping)