Génétique bactérienne et résistance aux antiobio Flashcards
V-F
Les maladies infectieuses sont parmis les premières causes de mortalité mondialle
V
Même pourcentage que cancer
V-F
Le nombre de morts dûs aux infection a bcp diminué
V
Nommer trois maladies émergeantes particulièrement préoccupantes
Staph. Aureus résistant à la vancomicine
Tuberculose mult0résistante
Malaria multi-résistante
Quels sont les principaux mécanisme de résistance (3)
Altération de la perméabilité
Modification ou destruction de l’antibiotique avant son entrée
Modification ou changement de la cible
Quelles sont les principales cibles des antibiotiques (11)
Membrane Synthèse d'ATP Biosynthèse de l'Acide folique Paroi Synthèse des protéine (50S) Synthèse des protéine (30S) Isoleucine aminoacyl ARNt synthéthase Synthèse des protéine (facteur d'élongation EF-G) Polymérase à ARN Fragmente l'ADN Gyrases à ADN
Quels antibio ont pour cible la membrane (3)
Polymyxines (colistin)
Lipopeptides cycliques (daptomycine)
Bacitracine
Quels antibio ont pour cible la synthèse d’ATP
Diarylquinoline (bedaquiline)
Quels antibio ont pour cible la biosynthèse de l’Acide folique (2)
Triméthoprim
Sulfamide
Quels antibio ont pour cible la paroi (8)
B-lactames (Pénicillines Cephalosporines Monobactames Carbapénèmes)
Cyclosérine
Fosfomycine
Bacitracine
Glycopeptides (Vancomycine)
Quels antibio ont pour cible la synthèse des protéines (sous-unité 50S du ribosome) (7)
Macrolides (érythromycine) Lincosamides (clindamycine) Streptogramines (Synercid) Chloramphenicol Kétolides (Kétek) Oxazolidinones (linézolide) Pleuromutilines
Quels antibio ont pour cible la synthèse des protéines (sous-unité 30S du ribosome) (3)
Tétracyclines
Glycylcyclines
Aminoglycosides (streptomycine)
Quels antibio ont pour cible l’isoleucine aminoacyl ARNt synthétase
Mupirocin
Quels antibio ont pour cible la synthèse des protéines (Facteur d’élongation EF-G)
Acide fusidique
Quels antibio ont pour cible la polymérase à ARN (3)
Rifamicines (rifampin)
Actinomycine D
Fidaxomicin(Dificid)
Quels antibio ont pour cible la fragmentation de l’ADN (2)
Nitroimidazoles(Métronidazole)
Nitrofuran
Quels antibio ont pour cible la gyrase à ADN (3)
Quinolone
Fluoroquinone
Aminocoumarines
Quelle est la conséquence du plus petit génome des bactéries
Elles dépendent plus des facteurs de l’hôte pour leur reproduction
Quel est la forme du chromosome des bactérie
Circulaire
Habituellement les bactérie ont combien de chromosomes
1
Qu’est ce qu’un plasmide
Série de base similaire è un chomosome pouvant encoder de l’information pouvant procurer un avantage unique à la bactérie hôte
Ex: résistance ou virulence
V-F
Certaines bactérie vont partager leur info sur 2 chromosomes
V
V-F
Il peut y avoir plus d’un plasmide
V
Comment se nomme la reproduction des bactérie
Fission binaire
Comment se fait la répartition des chromosomes et des plasmides dans la fission binaire
La répartition des chromosomes est tjr égalle, mais pas celle des plasmides
V-F
La bactérie veut toujours minimiser ses dépenses énergétiques
V
Quelle est le moyen qu’elle a trouvé pour minimiser ses dépenses énergétiques
Activer ses gènes seulement au besoin, donc ça prend de la régulation pour quand même répondre rapidmeent aux stimulus
Quels sont les types de régulation (3)
Changement dans la séquence d’ADN
Changement dans le nombre de transcription (Régulation transcriptionnelle)
Changement dans la quantité de produit de gène actif (Régulation post-transcriptionnelle_
Quels sont les moyens de changement dans la séquence d’ADN (2)
Amplification de gène
Réarrangement de gène (mutations)
Quels sont les moyens de régulation transcriptionnelle (2)
Activateurs
Répresseurs
Quels sont les moyens de régulation post-transcriptionnelle (3)
Ajout de cofacteur ou groupe prostétique
Clivage protéolytique
Interactions avec d’autres macromolécules
À quoi correspond le promoteur (3)
Séquence d’ADN située en amont d’un gène ou groupe de gènes qui permet la transcription de ce gène en ARNm.
Séquence reconnue par l’ARN polymérase
Séquence requise pour amorcer la transcription du gène (ou d’un groupe de gènes consécutifs).
À quoi correspond un opérateur (2)
Séquence d’ADN adjacente à un gène ou groupe de gènes
Séquence reconnue par une protéine régulatrice
(qui agit comme répresseur ou activateur) contrôlant ainsi la transcription de ce gène ou groupe de gènes
Comment simplifier la relation entre le promoteur et l’opérateur
Promoteur + Opérateur = protéine
Protéine inhibant la transcription d’un gène (ou de plusieurs gènes) en se liant à une séquence spécifique de nucléotides de l’ADN (à un opérateur, par exemple).
Répresseur
Fait le contrôle négatif
Protéine qui stimule la transcription d’un gène ou d’un ensemble de gènes. Ces protéines reconnaissent généralement une séquence spécifique sur l’ADN située à proximité d’un promoteur.
Activateur
Fait le contrôle positif
V-F
Les répresseurs comme les activateurs sont inductibles et répressible
V
Comment fonctionne un répressuer
Le répresseur est lié au promoteur, la polymérase ne peut plus faire son travail. Cependant, si le répressuer est lié ailleurs (Avec une molécule qui serait un inducteur dans la situation) le promoteur n’est plus bloqué, l’ARNm peut donc être produit
Un promoteur pour contrôler un gène.
Régulation simple
Un seul promoteur pour réguler plusieurs gènes adjacents
Régulation dans un opéron
Une seule prots régulatrice(rép/act) pour contrôler plusieurs gènes situés à différents endroits du génome
Régulation par un régulon
Le contrôle de plusieurs gènes non contigus par un même stimulus
Régulation par un stimulon
Quels sont les moyens que la cellule utilise pour se muter (4)
Substitution
Délétion (Pertes de nucléotides)
Insertion
Réarrangement
Les mutations spontanées sont le résultat de…
D’erreur lors de la réplication
V-F
Les mutations spontanée sont rare
V
Les mutations induites sont causées par…
Une variété d’agents physiques, chimiques et biologiques (agents mutagènes)
Exemples de phénotypes causés par des mutations (4)
Non-utilisation du lactose
Morphologie allongée des bactéries
Capsules
Résistance
Efet observable d’une mutation
Phénotype
Qu’est ce qui est nécessaire pour avoir un effet sur une population
Présence d’un phénotype observable et qu’il soit sélectionnable
Comment se fait la sélection des phénotype
Par les antibios
V-F
Peu importe la dose du medx, les bactéries résistantes vont pouvoir se reproduire
F
Arrête à la CMI des bact résistantes
V-F
La concentration suboptimale des antibio durant le traitement peut sélectionner les mutants résistant
V
V-F
Les études indiquent qu’il faudrait réduire la durée de l’antiothérapie
F
On manque d’étude encore
Quels sont les sytèmes de réparation de l’ADN chez les bactéries (5)
- La réparation directe de l’ADN
- La réparation par excision
- La réparation par recombinaison
- La réponse SOS (peut stimuler le transfert horizontal de gènes)
- La réparation sujette à erreur (peut entraîner des mutations)
Qu’est ce qui entraine ces sytèmes de réparations
L’actions de certains antibio
De quelles façons il y a-t-il échange de genes chez les bactéries (3)
Transformation
Conjugaison
Transduction
En quoi consiste la transformation
La bactéries est transformée par son contact avec de l’ADN externe
V-F
La transformation est plus efficace entre bactérie d’une meme espece
V
Quelles sont les bactéries pour qui la transformation est naturelle (4)
- Bacillus sp.
- Haemophilus influenzae
- Neisseria sp.
- Streptococcus pneumoniae
En quoi consiste la conjugaison
Deux bactéries se lient avec un pili sexuel et une transmet un plasmide contenant des genes à l’autre
Virus qui parasitent uniquement les bactéries
Bactériophage
En quoi consiste la transduction
Transfert de gènes médié par les bactériophages. Empaquetage accidentel d’un génome pouvant se propager
Enveloppe protéique des bactériophages qui renferme leur matériel génétique
Capside
Quels sont les cycles de vie des bactériophages (3)
Lytique (tue l’hôte)
Lysogénique (Vivent en équilibre avec l’hôte)
Chronique (Sont tjr dans la bactérie et lui cause problème)
Que se pass-t-il lors de la lysogénisation
Le matériel génétique du phage s’intègre dans le chromosome de la bactérie et y est répliqué en même temps que le chromosome san affecter l’hote. Permet ainsi de propager son ADN sans tuer la cellule
Que se passe-t-il lors du cycle lytique
Un événement vient rompre le cycle lysogénique en permettant à l’ADN du phage de s’exciser du chromosome de l’hôte. Par la suite, de nouvelles particules de phage sont produites et sont libérées entrainant la lyse cellulaire et la mort de la bactérie dans le cadre du cycle lytique.
Quels sont les deux type de transduction
Spécialisée
Généralisée
Est-ce-que dans les deux type de transduction le génome peut se propager
Non seulement spécialisée
Résultat de l’empaquetage accidentel uniquement de fragments de l’ADN de l’hôte (trait ouvert) à l’intérieur d’une capside de phage.
Transduction généralisée
Un génome hybride phage-bactérie est créé quand le génome du prophage est improprement excisé du génome de l’hôte puis empaqueté à l’intérieur du phage.
Transduction spécialisée
Quels sont les gènes transmis par transduction (5)
- la toxine de Corynebacterium diphteriae
- l’entérotoxine de certaines souches de E. coli
- la toxine du streptocoque responsable de la scarlatine
- certaines toxines de Clostridium botulinum
- certains gènes de résistance aux bêta-lactamines chez les Pseudomonas
Qu’est ce que la transposition
Mouvement de segments d’ADN à l’intérieur d’une même cellule.
Que requiert la transposition
Une proximité intracellulaire entre les endroits où le transfert à lieu
Quels sont les types de transposons (4)
Séquences d’insertion (IS) : transposons les plus simples
Transposons complexe (composites avec IS + autres gènes)
Phages transposables
Rétrotransposons
Pq les transposons complexes ont une importance médicale
Pcq peuvent encoder à l’intérieur de leur région centrale des gènes de toxines ou de résistance. Ils peuvent déplacer plusieurs gènes en même temps
Éléments génétique qui recrutent des gènes de résistance et les intègrent les uns à la suite des autres devant des promoteurs forts assurant l’expression de multiples gènes simultanément
Intégron
Ensemble des microbes de notre flore
Microbiote
Ensemble des génomes microbiens de notre flore
Microbiome
V-F
Microbiote est une partie essentielle de notre système immunitaire
V
Comment un bébé acquiert-il son microbiote (3)
Lors de sa sortie du vagin en contact avec résidus de selles
Lors de son allaitement
Lorsqu’il met des choses dans sa bouche
Quelles sont les conséquences possibles de perturbations répété du microbiote chez l’enfant (bébé prend souvent antibio) (8)
IBD Asthme Obésité DT1 Dermatite Sclerosis Cancer Autisme
Donner un exemple d’évolution verticale d’une bactérie
Mutation
Donner 3 exemples d’évolution horizontale
Conjugaison
Transformation
Transduction
Pourquoi les bactéries résistantes chez l’humains sont rareemnt retrouvé dans le sol
Pcq dans le sol ils manquent de mobilité et de sélection pour qu’il s’y développe plusieurs genres de résistance
Comment se nomme le système que la bactérie utilise pour protéger son génome
Système restriction/modification
Role des enzyme de restriction
Reconnait et coupe de courtes séquence d’ADN palindromique
Role des enzymes de modification
Ajoute un groupement méthyle à une séquence palyndromique, la protégeant ainsi des enzymes de restriction
Décrire le système de mémoire immunitaire des bactéries (CRISPR/Cas9)
On retrouve dans l’ADN des séquences CRISPR. Lorsqu’elles détectent un changement, la séquence est transcrite. L’ARN résultant va chercher la protéine de coupe Caas9 qui va détruire le génome viral
Nommer des produits pharmaceutique provenant de bactéries (4)
Hormones de croissance humaine
Insuline humaine
Vaccin contre hépatite B
Anticorps monoclonaux
Comment fonctionne la réaction d’amplification d’aDN par la polymérase
La 1e étape est de dénaturer(séparer en deux) le double brin d’ADN en le chauffant à 95degré
Ensuite il y a appariemment des amorces à 55deg
Le brin va finalement s’élonger (se compléter) à 72deg ce qui fait que nous avons doubler notre notre de brin d’ADN
On refait le cycle jusqu’à ce que l’on ai suffisamment de brin pour pouvoir les détecter
Pour quelle raison est utilisée la réaction d’amplification par la polymérase
Diagnostic rapide
