"F0" - Hvad er en aminosyre? + aminosyrernes egenskaber

Question 1

Nævn de fire grupper aminosyrer generelt bliver inddelt i samt hvor mange der er i hver. Dertil hvor mange aminosyrer der i alt er.

Answer 1

Elektrisk ladede r-grupper(5 stk). Polær uladede r-grp(4 stk). Hydrofobe r-grupper(8 stk). Special tilfældene(4 stk). 21 stk i alt.

Question 2

Beskriv en aminosyre generelt. Hvad er den opbygget af samt dens størrelse kemisk set?

Answer 2

Kemisk set er det stort. Det er opbygget af en amin-grup(-NH2) og en carboxylsyre(-COOH). Består derudover af r-grupper/sidekæder/residues/funktionellegruppe(Kært barn har mange navne).

Question 3

Hvilke aminosyrer benyttes i dette kursus ifht stereokemi?

Answer 3

L-alfa-aminosyrer

Question 4

Hvilke grupper inddeler vi aminosyrer i ifht Karens slides og hvor mange er der i hver gruppe?

Answer 4

Ikke-polære, alifatiske r-grupper(7 stk), Aromatiske r-grupper(3 stk), Polær ikke-ladede r-grupper(5 stk), Positivt ladede r-grupper(De basiske. 3 stk) og Negativt ladede r-grupper(De sure. 2 stk).

Question 5

Hvilke bindinger er der i backbone i en aminosyrekæde?

Answer 5

Kovalentebindinger. Peptidbindinger

Question 6

Hvilke grupper integrerer med hinanden i en dannet aminosyrekæde? Dvs. peptidbindingerne er dannet, så hvad integrerer derefter?

Answer 6

r-grupperne/sidekæderne/residues/funktionellegrupper(Kært barn har mange navne).

Question 7

R-grupperne danner en rummelig del i et protein. Hvad kaldes den rummelige del også? Eller hvad danner den?

Answer 7

Proteinets konfirmation.

Question 8

Hvad er den mest stabile konfirmation for et protein når vi kigger på Gibbs’ fri energi?

Answer 8

Negativ deltaG værdi.

Question 9

Hvad et er nativt protein?

Answer 9

Det er når proteinet er i et hvilket som helst at dets funktionelle konfirmationer.

Question 10

Hvad er stabiliteten for et protein givet ved?

Answer 10

At bibeholde den native konfirmation

Question 11

Når aminosyreren sidder i en peptidkæde, hvad bestemmer så aminosyrens funktionalitet?

Answer 11

Dens r-gruppe.

Question 12

Hvad er aminosyrens pKa-værdier et udtryk for?

Answer 12

Pk1 beskriver -COOH. Pk2 beskriver -NH2. Pkr beskriver r-gruppen. Det er en beskrivelse af hvornår den bliver protoniseret og deprotoniseret. pI indikerer hvornår ladningen er = 0.

Question 13

Hvor findes de ladede aminosyrerester ofte?

Answer 13

På proteinets overflade

Question 14

Hvad vekselvirker de ladede aminosyrerester med?

Answer 14

Med vand og andre biologiske molekyler

Question 15

Hvad er de vigtigste bindinger de ladede aminosyrerester laver?

Answer 15

Binder de ikke-ladede r-grupper fx. saltbroer. Og hydrofobe effekt med vand.

Question 16

Hvor findes de polære rester?

Answer 16

Både inde i og uden på proteinet.

Question 17

Hvilke bindinger danner de polære rester?

Answer 17

Hydrogenbindinger med andre rester eller med vand(hydrofobe effekt).

Question 18

Hvad kendetegner de ikke ikke-polære rester ifht hydrofobitet?

Answer 18

De er hydrofobe dvs. de vekselvirker ikke favorabelt med vand

Question 19

Hvor sidder de ikke-polære rester oftest?

Answer 19

I kernen af proteinet. Kan dog også sidde i overfladen i nogle tilfælde.

Question 20

Hvilke kræfter stabiliseres de ikke-polære rester af primært?

Answer 20

Van der Waals.