Enzymologie Flashcards
Catalyse générale acide base
Echange de proton entre le subtrat ou un intermédiaire et des residus de l’enzyme (=presente pratiquement au moins 1 fois)
Catalyse covalente
Modification temporaire par covalence d’un groupe réactif du site actif au cours de la catalyse
Catalyse par ions metalliques
Ions métalliques utilisés comme catalyseur pour un certains nombres d’enzyme
Quels mécanisme d’enzymeChymotripsine
Effet de proximité puis general acide base et covalente
Catalyse par effet de proximité
Rapproche les reactifs et favorise leurs interractions (=l’une des premieres fonctions des enzymes)
Ph de demi-effetPepsine
4 = un residu ac. Aspartique ou ac. Glutamique (pka environ 4) dans le site actif
PhAcétylcholinestérase
Ph acide l’inactive et activité maximale à partir de ph 7,5-8 (plateau ensuite)
Ph demi effetAcéthylcholinestérase
6 = un residu d’histidine impliqué dans le site actif
Ph Chymotrypsine
Courbe avec un maximal et 2 points d’inflexion = 2 ph de demi-activation :- ph1 = 6 (du à un residu histidine) -ph2 = 9-10 (un residu chargé positivement = arginine ou histidine)
Oxydo-reductase
Transfert d’electrons
Transferases
Transfert groupe chimique d’un composé à un autre (ex : groupe methyle)
Hydrolase
Coupure de liaisons grace à l’apport d’eau
Lyase
Addition de groupe sur une double liaison ou formation de double liaison par soustraction de groupe
Isomérases
Transfert de groupe à l’intérieur d’une molécuke pour former un isomère
Ligases
Formation de liaison c-c, c-s, c-o, c-n rn utilisant l’énergie fourmie par la rupture d’une liaison pyrophosphate d’un trinucléotide (comme l’ATP)
Reaction catalysée
Chimitrypsine et trypsine
Hydrolyse des peptides alimentaire
Reaction catalysée
Kinase
Phosphorylation des proteines
Reaction catalysée
ATPase (myosine)
Hydrolyse de l’ATP
Site de fixation
Interraction
- Non spécifique
- Spécifique
Site de fixation
Chymotrypsine
Residu 189 serine + 2 Glycine 226 et 216 qui interragissent spécifiquement avec residus aromatique et hydrophobe
Site de fixation
Trypsine
Residu 189 Acide aspartique qui interragit spécifiquement avec des résidu basique
Site catalytique
Chimotrypsine
Catalyse le substrat en 2 etapes par la triade catalystique :
- Acylation
- Desacylation
Desacylation
Acyl-enzyme (intermediaire instable) attaqué par l’eau et formation du second intermediaire tétraédrique