Cours 5 Flashcards
Pourquoi étudier les molécules du CMH ? (3)
1 : Important pour la réponse immunitaire
2 : Impliquées dans les maladies auto-immunitaires
3 : Responsable du rejet de greffe
Quoi regarder pour étudier les molécules du CMH ? (3)
1 : Structure tridimensionnelle
2 : Régulation de l’expression
3 : Répertoire des peptides
De quoi sont constitués les CMH ? (4)
Un domaine membranaire distal
Un domaine membranaire proximal
Un segment transmembranaire
Une queue cytoplasmique
De quoi est composé le CMH de classe I ?
Haut gauche a2
Haut droit a1
Bas gauche a3
Bas droit B2M
De quoi est composé le CMH de classe II ?
Haut gauche a1
Haut droit B1
Bas gauche a2
Bas droit B2
Quelles sont les parties du CMH de classe I qui lient le peptide ?
a2 et a1
Quelles sont les parties du CMH II qui lient le peptide ?
a1 et B1
Quel est le rôle des protéines N-linked dans le CMH de classe I ? (4)
1 : Repliement; interactions avec les lectines
2 : Stabilité
3 : Associée au glycocalix
4 : Adhésion, traffic intracellulaire
Qu’est-ce qui est composé des glycoprotéine N-linked dans le CMH I ?
a2, a1, a3
Caractéristiques de la structure générale du CMH de classe I. (3)
1 : Comprend des glycoprotéines N-linked
2 : Chaîne lourde alpha encrée dans la membrane plasmique
3 : B2-microglobuline encodée hors du CMH et associé de façon non-covalente
Où se loge le peptide dans le CMH de classe I ?
Peptide antigénique logé dans une niche bordée d’une paire d’hélices alpha et d’un plancher de feuillets B anti-parallèles
Qu’est-ce que les domaines a3 et B2m ont de particulier dans le CMH de classe I %
Domaines a3 et B2m ont des structures tertiaires semblables aux domaines Ig et dont de ces molécules des membres de la super famille des immunoglobulines
Est-ce que immunoglobuline est synonyme d’anticorps ?
non
Quels sont les caractéristiques de la structure générale du CMH de classe II ?
1 : Glycoprotéine hétérodimérique
2 : Chaîne B2 et a2 transmembranaire
3 : Niche peptidique et domaines Ig
4 : Pas de B2m
Qu’est-ce qui se passe si on chauffe le CMH II ?
Les deux chaînes vont se dissocier
Comment est-ce que l’on a réussi à visualiser le CMH I ?
Il faut qu’il soit cristallisé pour ensuite faire de la diffraction aux rayons X
Pourquoi est-ce que les glycosylations N-linked ne sont pas visible sur la structure cristalline ?
Parce qu’elles sont mobiles, on ne peut pas les figer (on ne voit pas non plus le transmembranaire car on ne peut pas avoir des régions hydrophobes puisqu’elles vont s’agréger)
Quelle structure prend a1 et a2 du CMH I et a1 et Bi du CMH II ?
Ils forment 2 hélices alpha segmentées sur un feuillet de 8 brins beta anti-parallèles
Combien de temps est-il nécessaire à une cellule pour qu’elle puisse digérer le peptide pour le présenter aux cellules T ?
3 heures
Quel est l’effet du glutaraldéhyde sur les cellules ?
Arrêt du métabolisme
Qu’est-ce que l’expérience au glutaraldéhyde a montré ?
Il est absolument nécessaire que le peptide soit digéré pour être reconnu par les cellules T
Lequel des peptides qui lient le CMH I ou le CMH II sont les plus petits ?
CMH I
Pourquoi est-ce que les peptides qui se lient au CMH I sont plus petits ?
Dans la niche de classe I, les bouts sont fermés, donc ce n’est pas tout qui entre
À quoi ressemble le CMH I lorsque l’on regarde le peptide ?
Un hot dog classique, le peptide est bien englobé par les chaînes alpha et ne dépasse pas
À quoi ressemble le CMH II lorsque l’on regarde le peptide ?
Le peptide déborde
Est-ce que les gènes du complexe majeur d’histocompatibilité sont polymorphiques ?
Très
Est-ce que tous les a. a. sont sujet au polymorphisme dans le CMH I ?
Non, ex. le 35 a. a. est toujours le même pour tout le monde
Quels sont les chaînes qui peuvent varier avec le polymorphisme dans le CMH I ?
a1, a2 et a3
Est-ce que la variabilité entre les CMH augmente ou diminue au fil des années ?
Augmente
Où se trouvent précisément les polymorphisme et qu’est-ce que cela implique ? (principalement)
On réalise que tous les allèles polymorphiques sont dans la niche peptidique, on comprend donc que le polymorphisme vient jouer sur les peptides qui se lient dans la niche peptidique
Est-ce que toutes les cellules d’un individu expriment les mêmes CMH ?
Oui
Est-ce qu’il y a un réarrangement VDJ dans les CMH ?
Non
Comment est-ce que les polymorphismes sont arrivés au fil du temps ?
À cause de l’accumulation de mutations
Est-ce que la partie du peptide qui est en contact avec le CMH sera aussi en contact avec le TCR ?
Non, ce n’est pas tout le peptide qui est lié par le CMH ce qui laisse une partie du peptide que le TCR pourra reconnaître
Qu’est-ce qui se passe lorsque la niche peptidique est affecté par un polymorphisme ?
Deux molécules de CMH II
différentes peuvent avoir des
séquences en acides aminés
différentes (polymorphisme), créant
ainsi des structures/formes différentes
dans la niche peptidique.
Les cavités (poches ou « pockets »)
ainsi créées ne peuvent pas accueillir
les mêmes acides aminés et les
peptides retrouvés dans la niche
seront donc différents.
Quels sont les différences entre les anticorps à la surface d’un LB et le CMH ?
1 : Recombinaison somatique vs encodé au niveau germinal
2 : Forte affinité vs faible affinité
3 : Association rapide vs association lente
4 : Très spécifique vs lie un large éventail de peptides différents
5 : Ags solubles ou associés vs ag solubles
6 : reconnait sucre, acides nucléiques, protéines, peptides, lipides et petites molécules vs peptides
Pourquoi est-ce que les molécules du CMH sont si diversifiées entre les individus ? (4)
1 : Plusieurs gènes du CMH I et plusieurs gènes du CMH II par chromosome (polygénie)
2 : Variabilité dans la séquences nucléotidique de tous les gènes (polymorphisme)
3 : Expression de deux haplotypes co-dominant (père-mère)
4 : Association des chaînes a et B de classe II en trans (parfois)
Qu’est-ce que l’association des chaînes a et B de classe II en trans ?
Paires mixtes entre la chaîne alpha d’un isotype de la mère et la chaîne B du même isotype, mais du père (et vice-versa)
Comment est-ce que le polymorphisme du CMH permet la survie de l’espèce ?
Permet une sélection naturelle des individus qui ont un CMH qui lie les pathogènes présent dans le milieu
Qu’est-ce qu’un haplotype ?
Combinaison d’allèles sur une série de gènes étroitement associés et donc généralement hérités en bloc
Qu’est-ce qu’un isotype ?
Gènes d’une même classe encodés à des locus différents
Qu’est-ce qu’un allèle dans la nomenclature du CMH ?
Gènes polymorphiques d’un même locus
Qu’est-ce qu’une souris syngénique ?
Croisés sur 20 générations pour être homozygote sur tous les locis
Qu’est-ce qui arrive lorsque l’on croise deux souris syngéniques ensemble au niveau du CMH ?
On pourrait obtenir une souris H-2b/k par exemple
Ainsi est-ce que l’expression de l’haplotype des CMH est dominante/récessive ou codominante ?
Codominante
Comment est-ce que cette codominance s’exprime au niveau du CMH de classe II ?
Paires mixtes résultant de
l’association en « trans » où
une chaîne de l’hétérodimère
provient du chromosome
du père et une chaîne
provient de la mère
Quel chromosome code pour les CMH chez l’humain ? Chez la souris ?
Humain : 6
Souris : 17
Est-ce que les haplotypes sont souvent identiques entre les individus ?
Non, jamais, sauf dans le cas de jumeaux identiques
Quels sont les deux restrictions pour que l’interaction TCR CMH fonctionne ?
1 : CMH du soi, complémentaire un TCR
2 : Ag complémentaire au TCR
Quelles cellules possèdent un CMH de classe I ?
Toutes les cellules (sauf érythrocytes)
Quelles cellules possèdent un CMH de classe II ?
Les cellules présentatrices d’Ag professionnelles comme les LB, macrophages, cellules épithéliales du thymus
Le CMH de classe I est impliqué dans…
La réponse antivirales du système immunitaire
Le CMH de classe II est impliqué dans…
L’activation de d’autres cellules du système immunitaire
Le CMH de classe I utilise la voie endogène ou exogène ?
Endogène
Le CMH de classe II utilise la voie endogène ou exogène ?
Exogène
Où se fait l’assemblage d’une partie du CMH I et l’ajout de son peptide ?
Au niveau du RER
Comment est-ce que le peptide est ajouté ? (Tout le processus)
La chaîne alpha qui compose le CMH I se lie à la calnexin qui replie la protéine correctement, la B2m prend ensuite la place de la calnexin, la tapasin, calreticulin et ERp57 permettent le repliement des ponts di-sulfures, ensuitele peptide est ajouté et le CMH de classe I quitte le RER pour se rendre à la membrane plasmique
Ou se passe la mise du peptide au niveau du CMH de classe II ?
Dans le RE
Processus d’externalisation du CMH II.
Le CMH II préformé est lié à un chanîne invariante qui sera dégradé en laissant un CLIP dans la niche peptidique du CMH II, lorsque le CMH II rencontre le peptide, le CLIP s’en va et le CMH II est externalisé
Quel est le rôle de HLA-DO dans l’externalisation du CMH II ?
Participe à la régulation
Quels sont les deux rôles de HLA-DM dans l’externalisation du CMH II ?
1 : Catalyse l’échange du CLIP avec le peptide
2 : S’assure que les CMH II qui lie le peptide soit capable d’aller jusqu’à la membrane de la cellule
À quoi sert la chaîne invariante ?
S’assure que les CMH ne prenne pas n’importe quel peptide à exprimé (peptides réservés au CMH I)
Comment est-ce que les cellules dendritiques activent les CD8 ?
Avec la cross présentation, présente un CMH I à partir d’Ag solubles
Est- ce que certaines molécules du CMH peuvent présenter des lipides ?
Oui
Que lie le CD1 ?
Les lipides
Est-ce que le CD1 est semblable au CMH I ?
Oui
