Cours 4 - Introduction à génétique et cytogénétique médicales (complet)

Question 1

Quelles sont les deux grandes catégories de division des pathologies de l’hérédité?

Answer 1

1) Due à mutation génique : identifiée par biochimie ou biologie moléculaire
2) Due à chromosomes : visible morphologiquement et identifiée par cytogénétique

Question 2

Définir : gène, génotype, caractère, phénotype, syndrome, locus et allèle

Answer 2

Gène : segment d’ADN contenant info particulière

Génotype : ensemble des gènes d’un individu

Caractère : manifestation observable de l’expression d’un gène particulier

Phénotype : ensemble des manifestations observable de l’expression des gènes d’un individu

Syndrome : condition clinique dans laquelle on peut reconnaitre nombre important modifs phénotypiques constantes chez plusieurs individus

Locus : endroit occupé physiquement par une fonction génique sur un chromosome et son homologue

Allèle : l’une ou l’autre forme d’un gène occupant un locus défini sur une paire de chromosome déterminée

Question 3

Vrai/Faux : une maladie héréditaire est forcément congénitale

Answer 3

Faux, une maladie congénitale est présente à la naissance, or certaines maladies héréditaires peuvent apparaitre plus tard dans la vie

Question 4

Vrai/Faux : l’environnement et la constitution génétique d’un individu participent de manière variable à la différence entre celui-ci et ses pairs

Answer 4

Vrai

Question 5

Quels sont les deux mécanismes de modifications des nucléosomes, et leurs conséquence?

Answer 5

1) Complexe de remodelage : change conformation nucléosome, ce qui condense ou décondense ADN, la rendant plus ou moins accessible

2) Modifications chimiques ou épigénétiques des histones :
- Acétylation : ajout acyle, augmente accessibilité des gènes
- Méthylation : ajout méthyle, diminue accessibilité des gènes

Question 6

Nommer les 4 mutations vues en classe, et la conséquence sur la protéine

Answer 6

1) Indels de multiples de trois nucléotides : mutation ponctuelle, respect cadre de lecture, protéine non tronquée, perte/gain de fonction
2) Indels de non-multiples de trois : mutation frameshift, décalage du cadre de lecture, protéine tronquée, perte/gain de fonction
3) Mutation stop : insertion d’un codon stop, protéine tronquée, perte de fonction
4) Substitution : mutation faux-sens, remplacement nucléotide par un autre, respect cadre lecture, perte/gain de fonction

Question 7

Schématiser l’organisation des conséquences des mutations géniques sur les protéines

Answer 7

Voir diapo 30

Question 8

Décrire brièvement les deux exemples de maladies enzymatiques découlant de mutations

Answer 8

1) Maladies de surcharge : lorsque gène pour enzyme muté, substrat de cette enzyme s’accumule et surcharge cytoplasme (gonfle cellules)
2) Maladies d’anti-enzymes : lorsque gène contrant une enzyme est muté, produit de l’enzyme antagoniste s’accumule, comme maladie surcharge

Question 9

Définir codominance

Answer 9

Chacun des deux allèles d’une paire s’exprime comme un dominant lorsque présent, on a donc une sorte de coexpression.

Question 10

Comment différencier rapidement les maladies autosomales dominante et récessive sur un pedigree?

Answer 10

Dominante saute pas de génération, au moins une personne par génération l’a, tandis que récessive contraire.

Question 11

Vrai/Faux : une maladie récessive liée au chromosome X sera transmise par une mère porteuse (Aa) à tous ses enfants, qui seront tous atteints.

Answer 11

Faux, seuls les garçons seront atteints, vu que filles sont slm porteuses (Aa) de la maladie récessive

Question 12

Vrai/Faux : une maladie dominante liée au chromosome X sera transmise comme une maladie autosomale dominante

Answer 12

Vrai

Question 13

Qu’est-ce que l’empreinte parentale?

Answer 13

Activation sélective à la naissance d’un seul allèle du gène de l’enfant et inactivation de l’autre (expression monoallélique) par des phénomènes épigénétiques

Question 14

Vrai/Faux : la cytogénétique ne s’intéresse qu’aux chromosomes

Answer 14

Faux, aux cellules aussi

Question 15

Définir caryotype

Answer 15

Arrangement des chromosomes homologue d’un individu selon leur taille et leur forme

Question 16

Schématiser la morphologie d’un chromosome, doit inclure les deux bras, le centromère, les télomères et le satellite

Answer 16

Voir diapo 68

Question 17

À quoi fait référence la classification méta/subméta/acrocentrique?

Answer 17

Position du centromère :

• Méta ; directement entre les deux bras
• Subméta ; bras court un peu plus court que bras long
• Acro ; bras court presqu’inexistant, avec satellites

Question 18

Expliquer la formule chromosomique et la nomenclature des chromosomes

Answer 18

Formule chromosomique :

ex. 46, XX (46 chromosomes, gonosomes XX)
ex. 45, X (45 chromosomes, manque un gonosome)
ex. 47, XX, +18 (47 chromosomes, gonosomes XX, un chromosome de plus dans la 18e paire)

Nomenclature :
ex. Bande 17p13.1 (chromosome 17, bras court, localisation internationale)

Question 19

Qu’est-ce que la ploïdie?

Answer 19

Nombre de copies de chaque chromosome

ex. haploïdie = 1 copie (x = 23 chromosomes)
ex. triploïdie = 3 copies (x = 69 chromosomes)
ex. aneuploïdie = +/- 1 chromosome (trisomie ou monosomie)

Question 20

Nommer les 5 anomalies structurales des chromosomes

Answer 20

1) Translocations (déplacement d’un segment chromosomique sur une autre chromatide)
2) Isochromosomes (séparation des chromatides)
3) Inversions (échange de position entre deux segments chromosomiques par rapport au centrosome sur une même chromatide)
4) Délétions
5) Annulation (chromosome se met en forme ciculaire)

Question 21

Vrai/Faux : pour faire une analyse caryotypique, il faut absolument une cellule en division, expliquer

Answer 21

Vrai, pcq sinon on observe pas les chromosomes en paires

Question 22

Expliquer le principe de la technique FISH, ses utilisations et ses limites

Answer 22

Sonde moléculaire fluorescente s’hybride spécifiquement sur séquence complémentaire d’ADN génomique. Elle peut ensuite être observée au microscope.

Peuvent être :

• Spécifique de loci : identifier une région précise génome (utile trouver remaniements d’une région précise: translocations, microdélétions, inversions…)
• Peinture : ensemble de petites sondes qui couvrent tout génome (utile pour les translocations)
• Break-apart ou sonde de dysjonction (utile pour les translocations)
• Centromérique : s’hybride aux centromères (utile pour dénombrer chromosomes)

Limites :
- Peut pas déterminer région impliquée si insertion

Question 23

Expliquer le principe de la technique CGH-array et ses limites

Answer 23

Compare nombre de molécules d’ADN d’un patient par rapport à un autre en établissant un ratio (1 = normal ; 0,5 = perte ; 1,5 = gain)

Limites :

• Peut causer mutations
• Détecte pas translocations/inversions équilibrées
• Détecte pas anomalies déséquilibrées présentes dans moins de 10-20% cellules

Question 24

Expliquer le principe de la technique SNP-array et ses utilisations

Answer 24

Fixation d’oligonucléotides contenant un SNP sur une lame. Permet détecter disomies uniparentales (perte d’hétérozygotie avec duplication de l’allèle restant). Donne aussi variation du nombre de copies et le profil allélique.

Question 25

Quelles sont les 5 situations présentées en classes pouvant faire l’objet d’analyse cytogénétique?

Answer 25

1) Conseil génétique et diagnostic prénatal
2) Retards mentaux familiaux
3) Problèmes d’avortements répétés
4) Problèmes d’infertilité
5) Cancers

Question 26

Donner des applications cliniques des du FISH et CGH-array

Answer 26

FISH :

• Anomalies constitutionnelles
• Translocations pathologiques (en oncologie, télomériques cryptiques, etc.)
• Diagnostic trisomies

CGH-array :

• Pathologies acquises (oncologie)
• Référence pour déséquilibres génomiques

Question 27

Décrire la trisomie 21 (formule chromosomique et symptômes)

Answer 27

47, XX, +21 ou 47, XY, +21

Symptômes :

• Grosse langue
• Fente palpébrale (espace entre paupière supérieure et œil) élargie
• Hypotonie musculaire générale
• Retards de développement mentaux et physiques
• Malformations cardiaques

Question 28

Décrire la trisomie 18, ou syndrome d’Edwards (formule chromosomique et symptômes)

Answer 28

47, XX, +18 ou 47, XY, +18

Symptômes :

• Petit poids de naissance
• Retard mental.
• Hypertonicité
• Microrétrognathisme (dysmorphie crânio-faciale)
• Mains botes
• Omphalocèle (défaut de fermeture de cavité abdominale)
• Mort précoce majorité des cas

Question 29

Décrire le syndrome de Turner (formule chromosomique et symptômes)

Answer 29

45, X

Symptômes : 
- Phénotype féminin
- Taille plus petite que la moyenne.
- Faible développement des
caractères sexuels secondaires
- Infertilité.

Question 30

Décrire le syndrome de Klinefelter (formule chromosomique et symptômes)

Answer 30

47, XXY

Symptômes :

• Phénotype masculin
• Grande taille
• Sous-développement caractères sexuels secondaires
• Gynécomastie (seins chez les hommes) .
• Hypogonadisme (testicules toujours petits et absence de lignée germinale)
• Infertilité.