Cours 4 - Introduction à génétique et cytogénétique médicales (complet) Flashcards
Quelles sont les deux grandes catégories de division des pathologies de l’hérédité?
1) Due à mutation génique : identifiée par biochimie ou biologie moléculaire
2) Due à chromosomes : visible morphologiquement et identifiée par cytogénétique
Définir : gène, génotype, caractère, phénotype, syndrome, locus et allèle
Gène : segment d’ADN contenant info particulière
Génotype : ensemble des gènes d’un individu
Caractère : manifestation observable de l’expression d’un gène particulier
Phénotype : ensemble des manifestations observable de l’expression des gènes d’un individu
Syndrome : condition clinique dans laquelle on peut reconnaitre nombre important modifs phénotypiques constantes chez plusieurs individus
Locus : endroit occupé physiquement par une fonction génique sur un chromosome et son homologue
Allèle : l’une ou l’autre forme d’un gène occupant un locus défini sur une paire de chromosome déterminée
Vrai/Faux : une maladie héréditaire est forcément congénitale
Faux, une maladie congénitale est présente à la naissance, or certaines maladies héréditaires peuvent apparaitre plus tard dans la vie
Vrai/Faux : l’environnement et la constitution génétique d’un individu participent de manière variable à la différence entre celui-ci et ses pairs
Vrai
Quels sont les deux mécanismes de modifications des nucléosomes, et leurs conséquence?
1) Complexe de remodelage : change conformation nucléosome, ce qui condense ou décondense ADN, la rendant plus ou moins accessible
2) Modifications chimiques ou épigénétiques des histones :
- Acétylation : ajout acyle, augmente accessibilité des gènes
- Méthylation : ajout méthyle, diminue accessibilité des gènes
Nommer les 4 mutations vues en classe, et la conséquence sur la protéine
1) Indels de multiples de trois nucléotides : mutation ponctuelle, respect cadre de lecture, protéine non tronquée, perte/gain de fonction
2) Indels de non-multiples de trois : mutation frameshift, décalage du cadre de lecture, protéine tronquée, perte/gain de fonction
3) Mutation stop : insertion d’un codon stop, protéine tronquée, perte de fonction
4) Substitution : mutation faux-sens, remplacement nucléotide par un autre, respect cadre lecture, perte/gain de fonction
Schématiser l’organisation des conséquences des mutations géniques sur les protéines
Voir diapo 30
Décrire brièvement les deux exemples de maladies enzymatiques découlant de mutations
1) Maladies de surcharge : lorsque gène pour enzyme muté, substrat de cette enzyme s’accumule et surcharge cytoplasme (gonfle cellules)
2) Maladies d’anti-enzymes : lorsque gène contrant une enzyme est muté, produit de l’enzyme antagoniste s’accumule, comme maladie surcharge
Définir codominance
Chacun des deux allèles d’une paire s’exprime comme un dominant lorsque présent, on a donc une sorte de coexpression.
Comment différencier rapidement les maladies autosomales dominante et récessive sur un pedigree?
Dominante saute pas de génération, au moins une personne par génération l’a, tandis que récessive contraire.
Vrai/Faux : une maladie récessive liée au chromosome X sera transmise par une mère porteuse (Aa) à tous ses enfants, qui seront tous atteints.
Faux, seuls les garçons seront atteints, vu que filles sont slm porteuses (Aa) de la maladie récessive
Vrai/Faux : une maladie dominante liée au chromosome X sera transmise comme une maladie autosomale dominante
Vrai
Qu’est-ce que l’empreinte parentale?
Activation sélective à la naissance d’un seul allèle du gène de l’enfant et inactivation de l’autre (expression monoallélique) par des phénomènes épigénétiques
Vrai/Faux : la cytogénétique ne s’intéresse qu’aux chromosomes
Faux, aux cellules aussi
Définir caryotype
Arrangement des chromosomes homologue d’un individu selon leur taille et leur forme
Schématiser la morphologie d’un chromosome, doit inclure les deux bras, le centromère, les télomères et le satellite
Voir diapo 68
À quoi fait référence la classification méta/subméta/acrocentrique?
Position du centromère :
- Méta ; directement entre les deux bras
- Subméta ; bras court un peu plus court que bras long
- Acro ; bras court presqu’inexistant, avec satellites
Expliquer la formule chromosomique et la nomenclature des chromosomes
Formule chromosomique :
ex. 46, XX (46 chromosomes, gonosomes XX)
ex. 45, X (45 chromosomes, manque un gonosome)
ex. 47, XX, +18 (47 chromosomes, gonosomes XX, un chromosome de plus dans la 18e paire)
Nomenclature :
ex. Bande 17p13.1 (chromosome 17, bras court, localisation internationale)
Qu’est-ce que la ploïdie?
Nombre de copies de chaque chromosome
ex. haploïdie = 1 copie (x = 23 chromosomes)
ex. triploïdie = 3 copies (x = 69 chromosomes)
ex. aneuploïdie = +/- 1 chromosome (trisomie ou monosomie)
Nommer les 5 anomalies structurales des chromosomes
1) Translocations (déplacement d’un segment chromosomique sur une autre chromatide)
2) Isochromosomes (séparation des chromatides)
3) Inversions (échange de position entre deux segments chromosomiques par rapport au centrosome sur une même chromatide)
4) Délétions
5) Annulation (chromosome se met en forme ciculaire)
Vrai/Faux : pour faire une analyse caryotypique, il faut absolument une cellule en division, expliquer
Vrai, pcq sinon on observe pas les chromosomes en paires
Expliquer le principe de la technique FISH, ses utilisations et ses limites
Sonde moléculaire fluorescente s’hybride spécifiquement sur séquence complémentaire d’ADN génomique. Elle peut ensuite être observée au microscope.
Peuvent être :
- Spécifique de loci : identifier une région précise génome (utile trouver remaniements d’une région précise: translocations, microdélétions, inversions…)
- Peinture : ensemble de petites sondes qui couvrent tout génome (utile pour les translocations)
- Break-apart ou sonde de dysjonction (utile pour les translocations)
- Centromérique : s’hybride aux centromères (utile pour dénombrer chromosomes)
Limites :
- Peut pas déterminer région impliquée si insertion
Expliquer le principe de la technique CGH-array et ses limites
Compare nombre de molécules d’ADN d’un patient par rapport à un autre en établissant un ratio (1 = normal ; 0,5 = perte ; 1,5 = gain)
Limites :
- Peut causer mutations
- Détecte pas translocations/inversions équilibrées
- Détecte pas anomalies déséquilibrées présentes dans moins de 10-20% cellules
Expliquer le principe de la technique SNP-array et ses utilisations
Fixation d’oligonucléotides contenant un SNP sur une lame. Permet détecter disomies uniparentales (perte d’hétérozygotie avec duplication de l’allèle restant). Donne aussi variation du nombre de copies et le profil allélique.
