CM10 Flashcards
quels sont les 4 types de biomarqueurs?
- biomarqueur de prédisposition
- biomarqueur de diagnostic
- biomarqueur pronostic
- biomarqueur prédictif
que permet un biomarqueur de prédisposition?
identifier les individus à risque de développer une maladie
que permet un biomarqueur diagnostic?
détecter la maladie
que permet un biomarqueur pronostic?
information sur le pronostic et le risque de récidive
que permet un biomarqueur prédictif
avoir une prédiction de la réponse au traitement
donne un exemple de biomarqueur de prédisposition
mutation des gènes BRCA-1 ou 2
donne un exemple de biomarqueur diagnostic
translocation BCR-ABL : Leucémie myéloïde chronique
donne un exemple de biomarqueur pronostic
ER+, PR+ = bon pronostic de cancer du sein
donne un exemple de biomarqueur prédictif
HER2+ : prédictif de la réponse au traitement
quelles sont les 4 classes de gènes de cancer (+ une supplémentaire)
- proto-oncogènes
- gènes suppresseurs de tumeurs
- gènes de l’apoptose
- gènes de réparation de l’ADN
(gènes d’interaction tumeur-hôte)
comment sait-on si un test à l’immunohistochimie est positif?
présence de brun = positif
qu’est-ce que la méthode FISH?
hibridation de sondes d’ADN complémentaires sur des chromosomes et visualisation par microscopie à fluorescence
que peut-on détecter grâce à FISH?
des mutations de grande taille:
- amplifications
- délétions
- translocations
quels sont les 4 types de sondes FISH?
- spécifique à un gène
- spécifique au centromère
- spécifique aux télomères
- spécifique au chromosome entier
que permet de voir le FISH?
- présence / absence du signal cible (et quantité)
- distribution spatiale de la cible
quels sont les 2 types de sondes FISH spécifiques à des réarrangements chromosomiques?
- sonde de fusion
- sonde de réparation
que peut-on voir avec une sonde de fusion?
2 gènes normalement sur des chromosomes différents vont se retrouver sur le même chromosome
que peut-on voir avec une sonde de séparation?
2 gènes normalement sur le même chromosome vont se retrouver sur 2 chromosomes différents
de quelle couleur sera généralement vue une superposition de sondes lors d’une fusion?
jaune
quel est le rôle du récepteur HER-2?
récepteur de facteurs de croissance
–> oncogène
les oncogènes ont un effet (dominant/récessif) dans la cellule
dominant
quels sont les différentes parties de la chaîne des facteurs de croissance qui peuvent être mutés dans un cancer?
- facteurs de croissance
- récepteurs de facteurs de croissance
- molécules de transduction du signal
- facteurs de transcription nucléaires
- régulateurs du cycle cellulaire (cyclines et CDK)
quels sont les 4 mécanismes d’activation des oncogènes?
- mutation ponctuelle
- amplification génique
- translocation
- surexpression (boucle autocrine)
donne un exemple d’oncogène qui subit une mutation ponctuelle et le cancer associé
RAS: cancer du pancréas/côlon
donne un exemple d’oncogène qui subit une amplification génique et le cancer associé
HER-2 : cancer du sein
donne un exemple d’oncogène qui subit une translocation et le cancer associé
translocation 8-14 du gène MYC: lymphome de Burkitt
translocation ABL-BCR: LMC
les cancers héréditaires représentent quelle proportion des cancers?
5-10%
héréditaire ou somatique:
toutes les cellules sont affectées
héréditaire
héréditaire ou somatique: mutation présente seulement dans la tumeur
somatique
quelles 2 fonctions prédominent dans les gènes altérés dans les cancers familiaux?
- suppresseurs de tumeurs
- réparation de l’ADN
les gènes suppresseurs de tumeurs ont un mode d’action (dominant/récessif) à l’échelon cellulaire
Récessif
quels sont les 2 types de gènes suppresseurs de tumeurs?
- gouverneur
- gardien
quelle est l’hypothèse de Knudson?
deux évènements génétiques sont requis pour inactiver le gène RB
–> distingue les formes sporadiques et familiales de rétinoblastome
dans quelle forme de rétinoblastome la tumeur apparaît souvent dans 1 seul oeil
forme sporadique
quelle est la fonction principale des gènes gouverneurs?
frein à la croissance cellulaire, contrôle la transition G1-S du cycle cellulaire
quel est le gène le plus fréquemment muté dans les cancers humains?
TP53
les cancers du sein héréditaires représentent quelle proportion des cancers du sein?
5%
quels sont les gènes à haut risque dans les cancers du sein héréditaires?
- BRCA-1
- BRCA-2
- TP53
- PTEN
quelle est la fonction des gènes BRCA-1 et 2?
réparation de l’ADN: recombinaison homologue
quels sont les autres cancers associés à une mutation de BRCA-1?
- ovaires
- prostate
quels sont les autres cancers associés à une mutation de BRCA-2?
- ovaires
- pancréas
- prostate
quels sont les 3 mécanismes de réparation de l’ADN?
- mésappariement
- excision
- recombinaison
les mutations des mécanismes de réparation de l’ADN ont un mode d’action (dominant/récessif)
récessif
nomme des méthodes de détection des mutations
- séquençage Sanger
- PCR
- Séquençage nouvelle génération
pourquoi peut-on souvent observer de nombreuses apodoses dans l’histologie d’une masse maligne?
parce que les cellules prolifèrent rapidement et plus les cellules prolifèrent rapidement, moins il y a de nutriments disponibles –> apoptosis
quel est le but de l’effet Warburg?
générer des métabolites (précurseurs) pour la synthèse de composantes cellulaires lors de la division cellulaire
l’effet warburg est favorisé par quels gènes?
proto-oncogènes: RAS, MYC, récepteurs de facteurs de croissance
l’effet Warburg est opposé par quels gènes?
suppresseurs de tumeurs: TP53, PTEN
quelles sont les 2 variantes du lymphome de Burkitt?
- endémique (africaine)
- sporadique
quelles sont les similitudes entre les 2 variantes du lymphome de Burkitt?
- histologie
- altérations moléculaires
quelles sont les variantes entre les 2 variantes du lymphome de Burkitt?
- présentation clinique et virologique
quel est le mécanisme de la forme endémique du lymphome de Burkitt?
- infection par EBV
- prolifération des lymphocytes B
- émergence d’une lignée monoclonale qui reste en latence
- lors d’une infection ultérieure, diminution du SI, prolifération des LB mutants en dormance et accumulation de mutations : translocation MYC
quelle est la mutation qui cause le lymphome de Burkitt?
translocation 8;14 du gène MYC devant le promoteur de la chaîne lourde des immunoglobulines (devient + actif)
par quelles méthodes peut-on détecter des translocations?
- FISH
- PCR
- séquençage nouvelle génération
quelle mutation cause le lymphome folliculaire?
translocation 14;18 qui juxtapose BCL-2 avec le promoteur des immunoglobulines –> surexpression de facteurs anti-apoptotiques
quels sont les 3 mécanismes d’action des cancers causés par des agents infectieux?
- protéines virales oncogéniques
- inflammation chronique
- intégration virale dans le génome de l’hôte
quelle est la différence entre les protéines E6 et E7 du virus VPH des souches à haut risque et à bas risque
lient plus efficacement les protéines de l’hôte (p53, p21, etc)
qu’est-ce que le VEGF?
facteur de croissance vasculaire
par quelles cellules est produit le VEGF?
- cellules tumorales
- cellules stromales
- cellules inflammatoires
quelle proportion des patients qui se font diagnostiquer un cancer colorectal ont des métastases?
10%
quelle est la survie médiane des patients avec carcinome colorectal métastatique?
18-21 mois
dans la voie de signalisation EGFR dans le cancer colorectal, pourquoi le traitement anti-EGFR ne fonctionnait pas?
EGFR: récepteur de facteurs de croissance lié à la voie RAS
ne fonctionnait pas parce que mutation était au niveau de RAS qui était activée constitutivement
quelles sont les méthodes de détection des mutations ponctuelles?
- séquençage Sanger
- PCR
- séquençage nouvelle génération
vrai ou faux: les patients répondent généralement tous de la même façon aux traitements
Faux: grande variété dans les réponses thérapeutiques
que permet l’évaluation du statut mutationnel?
de prévoir la réponse au traitement
quels sont les différents types de SNG?
- séquençage du génome au complet
- séquençage de l’exome au complet
- séquençage ciblé (gènes d’intérêt)
quels sont les avantages et désavantages du séquençage du génome complet?
avantages:
- non biaisé
- détecte toutes les mutations
inconvénients:
- coût
- sensibilité limitée
quels sont les avantages et désavantages du séquençage de l’exome complet?
avantages:
- détecte tous les SNV, CNV
inconvénients:
- coûts
- sensibilité limitée
- pas de fusion
quels sont les avantages et désavantages du séquençage ciblé?
avantages:
- coûts
- rapide
- sensibilité
inconvénients:
- biais des gènes ciblés
pour quelles raisons peuvent êtres reconnues comme «non soi» les cellules tumorales?
- production de néo-antigènes
- protéines rares/peu exprimées de façon normale
- protéines virales oncogènes
